MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli UTI89 chromosome

Total Repeats: 3238

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007946	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	91209057
2	NC_007946	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	91209058
3	NC_007946	CGCAG	2	10	8246	8255	20 %	0 %	40 %	40 %	162138515
4	NC_007946	GTGAA	2	10	8923	8932	40 %	20 %	40 %	0 %	162138515
5	NC_007946	CGTAC	2	10	9674	9683	20 %	20 %	20 %	40 %	91209065
6	NC_007946	CGCGC	2	10	10831	10840	0 %	0 %	40 %	60 %	91209067
7	NC_007946	GTTTC	2	10	11727	11736	0 %	60 %	20 %	20 %	91209069
8	NC_007946	GAATT	2	10	15980	15989	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007946	CTGGA	2	10	18097	18106	20 %	20 %	40 %	20 %	91209075
10	NC_007946	AATGT	2	10	18509	18518	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007946	ACCAC	2	10	18936	18945	40 %	0 %	0 %	60 %	91209076
12	NC_007946	TCCTT	2	10	19775	19784	0 %	60 %	0 %	40 %	91209076
13	NC_007946	CCGAT	2	10	20467	20476	20 %	20 %	20 %	40 %	91209077
14	NC_007946	GATGC	2	10	27241	27250	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007946	GCGAA	2	10	34360	34369	40 %	0 %	40 %	20 %	91209092
16	NC_007946	CCGTT	2	10	35254	35263	0 %	40 %	20 %	40 %	91209092
17	NC_007946	CACGG	2	10	35631	35640	20 %	0 %	40 %	40 %	91209092
18	NC_007946	GATGC	2	10	37333	37342	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007946	CGAAT	2	10	39084	39093	40 %	20 %	20 %	20 %	91209098
20	NC_007946	CCATG	2	10	40621	40630	20 %	20 %	20 %	40 %	91209099
21	NC_007946	CCGTA	2	10	42266	42275	20 %	20 %	20 %	40 %	91209100
22	NC_007946	TTAAA	2	10	43004	43013	60 %	40 %	0 %	0 %	91209100
23	NC_007946	ACCCA	2	10	43747	43756	40 %	0 %	0 %	60 %	91209101
24	NC_007946	TTTGA	2	10	45373	45382	20 %	60 %	20 %	0 %	162138512
25	NC_007946	CGGCG	2	10	45624	45633	0 %	0 %	60 %	40 %	162138512
26	NC_007946	AATCA	2	10	45906	45915	60 %	20 %	0 %	20 %	91209103
27	NC_007946	CGGTT	2	10	46861	46870	0 %	40 %	40 %	20 %	91209104
28	NC_007946	TGGCG	2	10	48553	48562	0 %	20 %	60 %	20 %	91209106
29	NC_007946	TGCAC	2	10	50315	50324	20 %	20 %	20 %	40 %	91209107
30	NC_007946	AACGT	2	10	54721	54730	40 %	20 %	20 %	20 %	91209112
31	NC_007946	GCGTC	2	10	57705	57714	0 %	20 %	40 %	40 %	91209115
32	NC_007946	ATGTT	2	10	58519	58528	20 %	60 %	20 %	0 %	91209116
33	NC_007946	TGCGT	2	10	59238	59247	0 %	40 %	40 %	20 %	91209116
34	NC_007946	AAAGT	2	10	65005	65014	60 %	20 %	20 %	0 %	91209119
35	NC_007946	CAGCG	2	10	68705	68714	20 %	0 %	40 %	40 %	91209122
36	NC_007946	TCGCG	2	10	69975	69984	0 %	20 %	40 %	40 %	91209122
37	NC_007946	TTTTC	2	10	74394	74403	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007946	AAAGC	2	10	74698	74707	60 %	0 %	20 %	20 %	91209127
39	NC_007946	CAGCA	2	10	75335	75344	40 %	0 %	20 %	40 %	91209128
40	NC_007946	TAGTG	2	10	79280	79289	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007946	TTGCT	2	10	79432	79441	0 %	60 %	20 %	20 %	91209132
42	NC_007946	GATGG	2	10	80168	80177	20 %	20 %	60 %	0 %	91209132
43	NC_007946	ATTTT	2	10	80996	81005	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007946	GGGAG	2	10	81160	81169	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007946	CGCCA	2	10	81224	81233	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_007946	ACCGG	2	10	82165	82174	20 %	0 %	40 %	40 %	91209134
47	NC_007946	CCTGG	2	10	82421	82430	0 %	20 %	40 %	40 %	91209134
48	NC_007946	ATGCG	2	10	83866	83875	20 %	20 %	40 %	20 %	91209135
49	NC_007946	GACCG	2	10	84688	84697	20 %	0 %	40 %	40 %	91209136
50	NC_007946	ATGTT	2	10	87234	87243	20 %	60 %	20 %	0 %	91209139
51	NC_007946	AAAAC	2	10	87649	87658	80 %	0 %	0 %	20 %	91209139
52	NC_007946	TGCAT	2	10	88176	88185	20 %	40 %	20 %	20 %	162138509
53	NC_007946	ATTCC	2	10	88346	88355	20 %	40 %	0 %	40 %	162138509
54	NC_007946	AGTTC	2	10	93439	93448	20 %	40 %	20 %	20 %	91209146
55	NC_007946	TGCCT	2	10	93539	93548	0 %	40 %	20 %	40 %	91209147
56	NC_007946	CGTGG	2	10	94812	94821	0 %	20 %	60 %	20 %	91209148
57	NC_007946	TATCG	2	10	95319	95328	20 %	40 %	20 %	20 %	91209148
58	NC_007946	GGGCT	2	10	99191	99200	0 %	20 %	60 %	20 %	91209151
59	NC_007946	GCCTG	2	10	99651	99660	0 %	20 %	40 %	40 %	91209152
60	NC_007946	TCTGG	2	10	100898	100907	0 %	40 %	40 %	20 %	91209153
61	NC_007946	ACCGT	2	10	101564	101573	20 %	20 %	20 %	40 %	91209153
62	NC_007946	ATCAG	2	10	103337	103346	40 %	20 %	20 %	20 %	91209155
63	NC_007946	AGCCG	2	10	105105	105114	20 %	0 %	40 %	40 %	91209156
64	NC_007946	GCGCA	2	10	107433	107442	20 %	0 %	40 %	40 %	91209158
65	NC_007946	CCGGC	2	10	111397	111406	0 %	0 %	40 %	60 %	91209162
66	NC_007946	TGGTC	2	10	111551	111560	0 %	40 %	40 %	20 %	91209162
67	NC_007946	CGCGG	2	10	114603	114612	0 %	0 %	60 %	40 %	91209165
68	NC_007946	CATCG	2	10	116860	116869	20 %	20 %	20 %	40 %	91209168
69	NC_007946	TAACG	2	10	117554	117563	40 %	20 %	20 %	20 %	91209168
70	NC_007946	ATGCC	2	10	118013	118022	20 %	20 %	20 %	40 %	91209168
71	NC_007946	AATGC	2	10	119296	119305	40 %	20 %	20 %	20 %	91209169
72	NC_007946	TCTGT	2	10	120243	120252	0 %	60 %	20 %	20 %	162138506
73	NC_007946	GCAGG	2	10	122675	122684	20 %	0 %	60 %	20 %	91209175
74	NC_007946	GTGTT	2	10	123884	123893	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007946	TCATT	2	10	127715	127724	20 %	60 %	0 %	20 %	91209179
76	NC_007946	AATTG	2	10	128041	128050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007946	CGAAG	2	10	128494	128503	40 %	0 %	40 %	20 %	162138505
78	NC_007946	ACACG	2	10	128627	128636	40 %	0 %	20 %	40 %	162138505
79	NC_007946	TCGCG	2	10	128888	128897	0 %	20 %	40 %	40 %	162138505
80	NC_007946	GCATC	2	10	128978	128987	20 %	20 %	20 %	40 %	162138505
81	NC_007946	GACTG	2	10	130296	130305	20 %	20 %	40 %	20 %	91209182
82	NC_007946	AGAGC	2	10	130706	130715	40 %	0 %	40 %	20 %	91209182
83	NC_007946	CTTCT	2	10	135968	135977	0 %	60 %	0 %	40 %	91209185
84	NC_007946	TCTGG	2	10	139335	139344	0 %	40 %	40 %	20 %	162138503
85	NC_007946	GGGCA	2	10	140746	140755	20 %	0 %	60 %	20 %	162138502
86	NC_007946	CAGCG	2	10	141025	141034	20 %	0 %	40 %	40 %	91209188
87	NC_007946	ACGAC	2	10	142305	142314	40 %	0 %	20 %	40 %	91209189
88	NC_007946	GCGCG	2	10	147064	147073	0 %	0 %	60 %	40 %	91209192
89	NC_007946	CCGTC	2	10	147855	147864	0 %	20 %	20 %	60 %	91209193
90	NC_007946	GTGAA	2	10	147865	147874	40 %	20 %	40 %	0 %	91209193
91	NC_007946	GTTCA	2	10	148252	148261	20 %	40 %	20 %	20 %	91209194
92	NC_007946	ATCCA	2	10	148578	148587	40 %	20 %	0 %	40 %	91209194
93	NC_007946	GTAAG	2	10	148791	148800	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007946	CTTTA	2	10	149841	149850	20 %	60 %	0 %	20 %	91209196
95	NC_007946	TCCTC	2	10	150511	150520	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_007946	TGGTG	2	10	153682	153691	0 %	40 %	60 %	0 %	91209201
97	NC_007946	GGGAG	2	10	153706	153715	20 %	0 %	80 %	0 %	91209201
98	NC_007946	CGCCA	2	10	156483	156492	20 %	0 %	20 %	60 %	91209204
99	NC_007946	ATTTT	2	10	156656	156665	20 %	80 %	0 %	0 %	91209204
100	NC_007946	GTTGG	2	10	156777	156786	0 %	40 %	60 %	0 %	91209204
101	NC_007946	CTGTA	2	10	157394	157403	20 %	40 %	20 %	20 %	91209205
102	NC_007946	TCCTG	2	10	157554	157563	0 %	40 %	20 %	40 %	91209205
103	NC_007946	ATTTT	2	10	157986	157995	20 %	80 %	0 %	0 %	91209206
104	NC_007946	CATAA	2	10	158253	158262	60 %	20 %	0 %	20 %	91209206
105	NC_007946	TTGTT	2	10	159065	159074	0 %	80 %	20 %	0 %	91209208
106	NC_007946	TTCAA	2	10	159215	159224	40 %	40 %	0 %	20 %	91209208
107	NC_007946	AATTT	2	10	163114	163123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007946	TATAT	2	10	163200	163209	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007946	GCGAG	2	10	164469	164478	20 %	0 %	60 %	20 %	91209212
110	NC_007946	TGGCG	2	10	164906	164915	0 %	20 %	60 %	20 %	91209212
111	NC_007946	ACCAC	2	10	167810	167819	40 %	0 %	0 %	60 %	91209216
112	NC_007946	GGCGT	2	10	169513	169522	0 %	20 %	60 %	20 %	91209217
113	NC_007946	CGACG	2	10	170552	170561	20 %	0 %	40 %	40 %	91209217
114	NC_007946	AAAAC	2	10	174437	174446	80 %	0 %	0 %	20 %	91209221
115	NC_007946	TGGTT	2	10	174694	174703	0 %	60 %	40 %	0 %	91209221
116	NC_007946	TGGTC	2	10	176817	176826	0 %	40 %	40 %	20 %	91209223
117	NC_007946	TGGCG	2	10	178062	178071	0 %	20 %	60 %	20 %	91209224
118	NC_007946	CGGCG	2	10	178692	178701	0 %	0 %	60 %	40 %	91209224
119	NC_007946	TTCCA	2	10	179303	179312	20 %	40 %	0 %	40 %	91209224
120	NC_007946	GACCG	2	10	179828	179837	20 %	0 %	40 %	40 %	91209225
121	NC_007946	GGTCC	2	10	183626	183635	0 %	20 %	40 %	40 %	91209229
122	NC_007946	ACGGG	2	10	185543	185552	20 %	0 %	60 %	20 %	91209231
123	NC_007946	TGCGC	2	10	187250	187259	0 %	20 %	40 %	40 %	91209232
124	NC_007946	GTGAT	2	10	187702	187711	20 %	40 %	40 %	0 %	91209232
125	NC_007946	GTGAT	2	10	187993	188002	20 %	40 %	40 %	0 %	91209232
126	NC_007946	TACGT	2	10	188238	188247	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_007946	TGGCC	2	10	189924	189933	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_007946	GCCAG	2	10	191670	191679	20 %	0 %	40 %	40 %	91209236
129	NC_007946	GGCGT	2	10	192508	192517	0 %	20 %	60 %	20 %	91209236
130	NC_007946	GTTCT	2	10	193111	193120	0 %	60 %	20 %	20 %	91209236
131	NC_007946	CTGAA	2	10	195103	195112	40 %	20 %	20 %	20 %	162138497
132	NC_007946	AAGCG	2	10	195167	195176	40 %	0 %	40 %	20 %	162138497
133	NC_007946	TGGTG	2	10	196950	196959	0 %	40 %	60 %	0 %	91209241
134	NC_007946	TGCAC	2	10	197076	197085	20 %	20 %	20 %	40 %	91209241
135	NC_007946	TGCGC	2	10	197469	197478	0 %	20 %	40 %	40 %	91209241
136	NC_007946	GTCTG	2	10	197634	197643	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007946	CATGG	2	10	199170	199179	20 %	20 %	40 %	20 %	91209243
138	NC_007946	CAGAT	2	10	200209	200218	40 %	20 %	20 %	20 %	91209244
139	NC_007946	ACTTT	2	10	200342	200351	20 %	60 %	0 %	20 %	91209244
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145	NC_007946	AGCCG	2	10	211354	211363	20 %	0 %	40 %	40 %	91209254
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147	NC_007946	TGCGC	2	10	220816	220825	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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151	NC_007946	CGGTT	2	10	228276	228285	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_007946	GGTGA	2	10	230582	230591	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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209	NC_007946	GCAAT	2	10	314432	314441	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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