MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli UTI89 plasmid pUTI89

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007941	GAGATG	2	12	6613	6624	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	91206255
2	NC_007941	GCGAAG	2	12	7160	7171	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	91206255
3	NC_007941	CTGGCG	2	12	9372	9383	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	91206257
4	NC_007941	CTGCGT	2	12	11364	11375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91206259
5	NC_007941	TTCTGG	2	12	12585	12596	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	91206260
6	NC_007941	TTATTG	2	12	18210	18221	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	91206270
7	NC_007941	TATTTT	2	12	18874	18885	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007941	TCAAAA	2	12	33182	33193	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	91206283
9	NC_007941	GCACCT	2	12	34432	34443	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007941	CAGGAG	2	12	35279	35290	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	91206285
11	NC_007941	TAAGAA	2	12	38717	38728	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	91206288
12	NC_007941	TGCCTA	2	12	41710	41721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91206290
13	NC_007941	AATAAA	2	12	43135	43146	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007941	TATCCA	2	12	46199	46210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91206295
15	NC_007941	GTGTCA	2	12	46397	46408	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	91206295
16	NC_007941	ATAAAA	2	12	48882	48893	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007941	AAAACA	2	12	49404	49415	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007941	GATTTT	2	12	50418	50429	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007941	GACAGC	2	12	50598	50609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91206301
20	NC_007941	GGAAAA	2	12	54175	54186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91206308
21	NC_007941	AACTTA	2	12	57556	57567	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91206312
22	NC_007941	ACCGGA	2	12	63860	63871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91206323
23	NC_007941	TCAGCA	2	12	67996	68007	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91206333
24	NC_007941	TACCGC	2	12	68426	68437	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	91206333
25	NC_007941	CTGCTA	5	30	69305	69334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91206335
26	NC_007941	GGCGCT	2	12	71440	71451	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	229577731
27	NC_007941	CAGGTG	2	12	71471	71482	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	229577731
28	NC_007941	GTGGCG	2	12	71561	71572	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	229577731
29	NC_007941	GCCGGA	2	12	71812	71823	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	229577731
30	NC_007941	CACTGG	2	12	73206	73217	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	91206340
31	NC_007941	TGGCAG	2	12	73882	73893	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	91206341
32	NC_007941	CTCTGA	2	12	74721	74732	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007941	CTCTGA	2	12	74739	74750	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007941	TGGAAA	2	12	86512	86523	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	91206362
35	NC_007941	GTCAAC	2	12	95909	95920	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91206374
36	NC_007941	TCTGTT	2	12	96168	96179	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	91206375
37	NC_007941	GATTAT	2	12	96337	96348	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	91206376
38	NC_007941	GGCAGG	2	12	96807	96818	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	91206377
39	NC_007941	ACAGTT	2	12	98801	98812	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91206378
40	NC_007941	TTGGTG	2	12	99947	99958	0 %	50 %	50 %	0 %	91206378
41	NC_007941	AGTTTA	2	12	101051	101062	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	91206379
42	NC_007941	ATGTGG	2	12	108028	108039	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	91206383
43	NC_007941	TGGGGC	2	12	108334	108345	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	91206383
44	NC_007941	TGCCCT	2	12	109127	109138	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	91206383
45	NC_007941	AACACG	2	12	110575	110586	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	91206385
46	NC_007941	TGGGGA	2	12	110842	110853	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	91206385
47	NC_007941	CTGATT	2	12	111327	111338	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.