MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UTI89 plasmid pUTI89

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007941	GAGATG	2	12	6613	6624	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	91206255
2	NC_007941	GCGAAG	2	12	7160	7171	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	91206255
3	NC_007941	CTGGCG	2	12	9372	9383	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	91206257
4	NC_007941	CTGCGT	2	12	11364	11375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91206259
5	NC_007941	TTCTGG	2	12	12585	12596	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	91206260
6	NC_007941	TTATTG	2	12	18210	18221	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	91206270
7	NC_007941	TCAAAA	2	12	33182	33193	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	91206283
8	NC_007941	CAGGAG	2	12	35279	35290	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	91206285
9	NC_007941	TAAGAA	2	12	38717	38728	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	91206288
10	NC_007941	TGCCTA	2	12	41710	41721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91206290
11	NC_007941	TATCCA	2	12	46199	46210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91206295
12	NC_007941	GTGTCA	2	12	46397	46408	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	91206295
13	NC_007941	GACAGC	2	12	50598	50609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91206301
14	NC_007941	GGAAAA	2	12	54175	54186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91206308
15	NC_007941	AACTTA	2	12	57556	57567	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91206312
16	NC_007941	ACCGGA	2	12	63860	63871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91206323
17	NC_007941	TCAGCA	2	12	67996	68007	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91206333
18	NC_007941	TACCGC	2	12	68426	68437	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	91206333
19	NC_007941	CTGCTA	5	30	69305	69334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91206335
20	NC_007941	GGCGCT	2	12	71440	71451	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	229577731
21	NC_007941	CAGGTG	2	12	71471	71482	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	229577731
22	NC_007941	GTGGCG	2	12	71561	71572	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	229577731
23	NC_007941	GCCGGA	2	12	71812	71823	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	229577731
24	NC_007941	CACTGG	2	12	73206	73217	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	91206340
25	NC_007941	TGGCAG	2	12	73882	73893	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	91206341
26	NC_007941	TGGAAA	2	12	86512	86523	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	91206362
27	NC_007941	GTCAAC	2	12	95909	95920	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91206374
28	NC_007941	TCTGTT	2	12	96168	96179	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	91206375
29	NC_007941	GATTAT	2	12	96337	96348	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	91206376
30	NC_007941	GGCAGG	2	12	96807	96818	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	91206377
31	NC_007941	ACAGTT	2	12	98801	98812	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91206378
32	NC_007941	TTGGTG	2	12	99947	99958	0 %	50 %	50 %	0 %	91206378
33	NC_007941	AGTTTA	2	12	101051	101062	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	91206379
34	NC_007941	ATGTGG	2	12	108028	108039	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	91206383
35	NC_007941	TGGGGC	2	12	108334	108345	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	91206383
36	NC_007941	TGCCCT	2	12	109127	109138	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	91206383
37	NC_007941	AACACG	2	12	110575	110586	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	91206385
38	NC_007941	TGGGGA	2	12	110842	110853	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	91206385

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.