MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UTI89 plasmid pUTI89

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007941	CCTGT	2	10	2589	2598	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_007941	GCCCC	2	10	2744	2753	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3	NC_007941	TTGTT	2	10	15362	15371	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007941	TATTT	2	10	18649	18658	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007941	GTGTA	2	10	20039	20048	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007941	AATTT	2	10	22799	22808	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007941	TACTC	2	10	32711	32720	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_007941	GGCTG	2	10	37178	37187	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_007941	CAGGG	2	10	37478	37487	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007941	TCTAT	2	10	41462	41471	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007941	TAAAA	2	10	41968	41977	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007941	CAAGT	2	10	42554	42563	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007941	CATAA	3	15	44078	44092	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007941	CATAA	2	10	45258	45267	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007941	AAGGA	2	10	47559	47568	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007941	TACCA	2	10	48551	48560	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_007941	ATGTG	2	10	52971	52980	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007941	GTTCA	2	10	54685	54694	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007941	CGTAC	2	10	55147	55156	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_007941	CTTTT	2	10	56524	56533	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007941	AAGGT	2	10	64602	64611	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007941	GGCAC	2	10	64775	64784	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_007941	ATCAC	2	10	74680	74689	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_007941	GGCGG	2	10	74818	74827	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007941	GTGAT	2	10	77690	77699	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007941	CGATT	2	10	77736	77745	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007941	ATGAA	2	10	85636	85645	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.