MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UTI89 plasmid pUTI89

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007941	TGCTC	2	10	3744	3753	0 %	40 %	20 %	40 %	91206250
2	NC_007941	AGGCC	2	10	3933	3942	20 %	0 %	40 %	40 %	91206251
3	NC_007941	GCTGC	2	10	10235	10244	0 %	20 %	40 %	40 %	91206258
4	NC_007941	CCCGG	2	10	11275	11284	0 %	0 %	40 %	60 %	91206258
5	NC_007941	GAAAA	2	10	22318	22327	80 %	0 %	20 %	0 %	91206273
6	NC_007941	CAGAC	2	10	23724	23733	40 %	0 %	20 %	40 %	91206274
7	NC_007941	TAACG	2	10	23856	23865	40 %	20 %	20 %	20 %	91206274
8	NC_007941	TTCAG	2	10	24303	24312	20 %	40 %	20 %	20 %	91206274
9	NC_007941	CAGAG	2	10	29478	29487	40 %	0 %	40 %	20 %	91206279
10	NC_007941	TCAGT	2	10	29600	29609	20 %	40 %	20 %	20 %	91206279
11	NC_007941	AACAA	2	10	31273	31282	80 %	0 %	0 %	20 %	91206282
12	NC_007941	CGTGT	2	10	32332	32341	0 %	40 %	40 %	20 %	91206282
13	NC_007941	TACTG	2	10	32489	32498	20 %	40 %	20 %	20 %	91206282
14	NC_007941	GGCAA	2	10	32507	32516	40 %	0 %	40 %	20 %	91206282
15	NC_007941	GTTCG	2	10	35297	35306	0 %	40 %	40 %	20 %	91206285
16	NC_007941	AAGGT	2	10	35646	35655	40 %	20 %	40 %	0 %	91206285
17	NC_007941	AGCGC	2	10	36046	36055	20 %	0 %	40 %	40 %	91206286
18	NC_007941	TCAAA	2	10	36684	36693	60 %	20 %	0 %	20 %	91206286
19	NC_007941	ATCCC	2	10	38683	38692	20 %	20 %	0 %	60 %	91206288
20	NC_007941	TAACT	2	10	39245	39254	40 %	40 %	0 %	20 %	91206288
21	NC_007941	CTGTG	2	10	39720	39729	0 %	40 %	40 %	20 %	91206288
22	NC_007941	GTAAT	2	10	47834	47843	40 %	40 %	20 %	0 %	91206297
23	NC_007941	TCAGC	2	10	48314	48323	20 %	20 %	20 %	40 %	91206298
24	NC_007941	CGATG	2	10	51717	51726	20 %	20 %	40 %	20 %	91206303
25	NC_007941	CTTCC	2	10	52864	52873	0 %	40 %	0 %	60 %	91206306
26	NC_007941	TGATG	2	10	53614	53623	20 %	40 %	40 %	0 %	91206307
27	NC_007941	AGTTA	2	10	56947	56956	40 %	40 %	20 %	0 %	91206311
28	NC_007941	CTGTT	2	10	57335	57344	0 %	60 %	20 %	20 %	91206312
29	NC_007941	ATGTG	2	10	58187	58196	20 %	40 %	40 %	0 %	91206312
30	NC_007941	AATGC	2	10	58251	58260	40 %	20 %	20 %	20 %	91206312
31	NC_007941	ACCTT	2	10	60930	60939	20 %	40 %	0 %	40 %	91206316
32	NC_007941	CGCGG	2	10	61945	61954	0 %	0 %	60 %	40 %	91206319
33	NC_007941	ACGGG	2	10	61996	62005	20 %	0 %	60 %	20 %	91206319
34	NC_007941	CCGGC	2	10	62609	62618	0 %	0 %	40 %	60 %	91206320
35	NC_007941	GCTGG	2	10	62641	62650	0 %	20 %	60 %	20 %	91206320
36	NC_007941	CGCCA	2	10	63671	63680	20 %	0 %	20 %	60 %	91206323
37	NC_007941	CCGCC	2	10	64307	64316	0 %	0 %	20 %	80 %	91206323
38	NC_007941	ACCGT	2	10	65065	65074	20 %	20 %	20 %	40 %	91206324
39	NC_007941	TGTAC	2	10	65300	65309	20 %	40 %	20 %	20 %	91206325
40	NC_007941	ATGTT	2	10	66053	66062	20 %	60 %	20 %	0 %	91206327
41	NC_007941	GGCGG	2	10	66137	66146	0 %	0 %	80 %	20 %	91206327
42	NC_007941	CCGGG	2	10	67355	67364	0 %	0 %	60 %	40 %	91206333
43	NC_007941	GGCGG	2	10	69414	69423	0 %	0 %	80 %	20 %	91206335
44	NC_007941	ACTGA	2	10	72866	72875	40 %	20 %	20 %	20 %	91206340
45	NC_007941	AGGGA	2	10	76027	76036	40 %	0 %	60 %	0 %	91206346
46	NC_007941	CCGTG	2	10	81332	81341	0 %	20 %	40 %	40 %	91206354
47	NC_007941	AAATG	2	10	83275	83284	60 %	20 %	20 %	0 %	91206356
48	NC_007941	TCAGT	2	10	84327	84336	20 %	40 %	20 %	20 %	91206358
49	NC_007941	ATTCT	2	10	84870	84879	20 %	60 %	0 %	20 %	91206360
50	NC_007941	ATGCA	2	10	85236	85245	40 %	20 %	20 %	20 %	91206360
51	NC_007941	TCTGA	2	10	86673	86682	20 %	40 %	20 %	20 %	91206362
52	NC_007941	GAAGC	2	10	89621	89630	40 %	0 %	40 %	20 %	91206364
53	NC_007941	TGTTC	2	10	90248	90257	0 %	60 %	20 %	20 %	91206365
54	NC_007941	AGTCC	2	10	90313	90322	20 %	20 %	20 %	40 %	91206365
55	NC_007941	GTGCT	2	10	90687	90696	0 %	40 %	40 %	20 %	91206366
56	NC_007941	CAGAA	2	10	95626	95635	60 %	0 %	20 %	20 %	91206374
57	NC_007941	GCTGG	2	10	98205	98214	0 %	20 %	60 %	20 %	91206378
58	NC_007941	GCAGT	2	10	99806	99815	20 %	20 %	40 %	20 %	91206378
59	NC_007941	CACGG	2	10	103699	103708	20 %	0 %	40 %	40 %	91206382
60	NC_007941	GTGCT	2	10	104150	104159	0 %	40 %	40 %	20 %	91206382
61	NC_007941	GCTGG	2	10	105367	105376	0 %	20 %	60 %	20 %	91206383
62	NC_007941	GACCT	2	10	105513	105522	20 %	20 %	20 %	40 %	91206383
63	NC_007941	ACCGG	2	10	106991	107000	20 %	0 %	40 %	40 %	91206383
64	NC_007941	ACCGG	2	10	109691	109700	20 %	0 %	40 %	40 %	91206383
65	NC_007941	GCCGT	2	10	109762	109771	0 %	20 %	40 %	40 %	91206383
66	NC_007941	ACCTG	2	10	110300	110309	20 %	20 %	20 %	40 %	91206383
67	NC_007941	TCTGG	2	10	110637	110646	0 %	40 %	40 %	20 %	91206385
68	NC_007941	CCGGG	2	10	113794	113803	0 %	0 %	60 %	40 %	91206389
69	NC_007941	AAAAC	2	10	113990	113999	80 %	0 %	0 %	20 %	91206390

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.