MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli UTI89 plasmid pUTI89

Total Repeats: 345

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007941	GCCA	2	8	418	425	25 %	0 %	25 %	50 %	91206246
2	NC_007941	AGGC	2	8	475	482	25 %	0 %	50 %	25 %	91206246
3	NC_007941	GAAA	2	8	1052	1059	75 %	0 %	25 %	0 %	91206247
4	NC_007941	TGGC	2	8	1156	1163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007941	GCTC	2	8	1355	1362	0 %	25 %	25 %	50 %	91206248
6	NC_007941	TACC	2	8	1780	1787	25 %	25 %	0 %	50 %	91206249
7	NC_007941	CCGA	2	8	1823	1830	25 %	0 %	25 %	50 %	91206249
8	NC_007941	AAAC	2	8	1918	1925	75 %	0 %	0 %	25 %	91206249
9	NC_007941	CAGA	2	8	2015	2022	50 %	0 %	25 %	25 %	91206249
10	NC_007941	CATT	2	8	2559	2566	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007941	GACA	2	8	2600	2607	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007941	CTGG	2	8	2828	2835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007941	ATCA	2	8	3003	3010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007941	GCTG	2	8	3405	3412	0 %	25 %	50 %	25 %	91206250
15	NC_007941	GAAA	2	8	4232	4239	75 %	0 %	25 %	0 %	91206252
16	NC_007941	GCTG	2	8	4274	4281	0 %	25 %	50 %	25 %	91206253
17	NC_007941	TGAA	2	8	4931	4938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007941	CTGC	2	8	5791	5798	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007941	GCCT	2	8	5851	5858	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007941	TTGA	2	8	6139	6146	25 %	50 %	25 %	0 %	91206255
21	NC_007941	CGCT	2	8	6350	6357	0 %	25 %	25 %	50 %	91206255
22	NC_007941	CTGG	2	8	7488	7495	0 %	25 %	50 %	25 %	91206255
23	NC_007941	CTGG	2	8	7689	7696	0 %	25 %	50 %	25 %	91206255
24	NC_007941	GCTG	2	8	7859	7866	0 %	25 %	50 %	25 %	91206255
25	NC_007941	ATGA	2	8	8138	8145	50 %	25 %	25 %	0 %	91206256
26	NC_007941	GGGC	2	8	8981	8988	0 %	0 %	75 %	25 %	91206257
27	NC_007941	GGCG	2	8	9068	9075	0 %	0 %	75 %	25 %	91206257
28	NC_007941	TGGT	2	8	9408	9415	0 %	50 %	50 %	0 %	91206257
29	NC_007941	GCCT	2	8	9666	9673	0 %	25 %	25 %	50 %	91206257
30	NC_007941	GAGG	2	8	10031	10038	25 %	0 %	75 %	0 %	91206257
31	NC_007941	TTGA	2	8	10214	10221	25 %	50 %	25 %	0 %	91206258
32	NC_007941	GGAG	2	8	10384	10391	25 %	0 %	75 %	0 %	91206258
33	NC_007941	TCAG	2	8	10419	10426	25 %	25 %	25 %	25 %	91206258
34	NC_007941	GCTG	2	8	11122	11129	0 %	25 %	50 %	25 %	91206258
35	NC_007941	GGCG	2	8	11356	11363	0 %	0 %	75 %	25 %	91206259
36	NC_007941	GACG	2	8	14071	14078	25 %	0 %	50 %	25 %	91206262
37	NC_007941	TGGC	2	8	14517	14524	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007941	CAGC	2	8	15431	15438	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007941	GCCA	2	8	15647	15654	25 %	0 %	25 %	50 %	91206263
40	NC_007941	CCTG	2	8	15710	15717	0 %	25 %	25 %	50 %	91206263
41	NC_007941	CTTG	2	8	15760	15767	0 %	50 %	25 %	25 %	91206263
42	NC_007941	CAGA	2	8	16140	16147	50 %	0 %	25 %	25 %	91206264
43	NC_007941	GCCC	2	8	16172	16179	0 %	0 %	25 %	75 %	91206264
44	NC_007941	GTAA	2	8	16197	16204	50 %	25 %	25 %	0 %	91206264
45	NC_007941	CCAC	2	8	16211	16218	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_007941	TTCC	2	8	16376	16383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007941	TCTT	2	8	16453	16460	0 %	75 %	0 %	25 %	91206265
48	NC_007941	GGAT	2	8	17036	17043	25 %	25 %	50 %	0 %	91206267
49	NC_007941	AATG	2	8	17211	17218	50 %	25 %	25 %	0 %	91206267
50	NC_007941	GCTG	2	8	17345	17352	0 %	25 %	50 %	25 %	91206268
51	NC_007941	GGCT	2	8	17478	17485	0 %	25 %	50 %	25 %	91206268
52	NC_007941	GACG	2	8	17528	17535	25 %	0 %	50 %	25 %	91206268
53	NC_007941	CCGG	2	8	17536	17543	0 %	0 %	50 %	50 %	91206268
54	NC_007941	AAAG	2	8	18280	18287	75 %	0 %	25 %	0 %	91206270
55	NC_007941	TTGC	2	8	18537	18544	0 %	50 %	25 %	25 %	91206271
56	NC_007941	CTGT	2	8	18621	18628	0 %	50 %	25 %	25 %	91206271
57	NC_007941	TTCT	2	8	18986	18993	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007941	TAGA	2	8	19344	19351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007941	AAAT	2	8	19630	19637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007941	GTAC	2	8	19971	19978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007941	AAAC	2	8	20059	20066	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007941	CTGG	2	8	20116	20123	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007941	ACGT	2	8	20735	20742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007941	GCCG	2	8	20803	20810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007941	CAAG	2	8	20888	20895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007941	CATT	2	8	21028	21035	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007941	TAAT	2	8	21052	21059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007941	AATA	2	8	21068	21075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007941	CAGA	2	8	21164	21171	50 %	0 %	25 %	25 %	91206272
70	NC_007941	CTGA	2	8	21213	21220	25 %	25 %	25 %	25 %	91206272
71	NC_007941	GACA	2	8	22240	22247	50 %	0 %	25 %	25 %	91206273
72	NC_007941	GGAG	2	8	22710	22717	25 %	0 %	75 %	0 %	91206273
73	NC_007941	TAAT	2	8	22876	22883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007941	TGGC	2	8	23336	23343	0 %	25 %	50 %	25 %	91206274
75	NC_007941	AAAT	2	8	23772	23779	75 %	25 %	0 %	0 %	91206274
76	NC_007941	AATT	2	8	23843	23850	50 %	50 %	0 %	0 %	91206274
77	NC_007941	ATCG	2	8	24087	24094	25 %	25 %	25 %	25 %	91206274
78	NC_007941	CAGC	2	8	24759	24766	25 %	0 %	25 %	50 %	91206274
79	NC_007941	ACCC	2	8	25132	25139	25 %	0 %	0 %	75 %	91206274
80	NC_007941	AAAT	2	8	25532	25539	75 %	25 %	0 %	0 %	91206275
81	NC_007941	GATG	2	8	25901	25908	25 %	25 %	50 %	0 %	91206275
82	NC_007941	TTGT	2	8	26677	26684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007941	ATCC	2	8	27147	27154	25 %	25 %	0 %	50 %	91206276
84	NC_007941	CTGA	2	8	28279	28286	25 %	25 %	25 %	25 %	91206278
85	NC_007941	GCCT	2	8	28730	28737	0 %	25 %	25 %	50 %	91206279
86	NC_007941	TCAG	2	8	29359	29366	25 %	25 %	25 %	25 %	91206279
87	NC_007941	GGAA	2	8	30261	30268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007941	TTAC	2	8	30440	30447	25 %	50 %	0 %	25 %	91206280
89	NC_007941	GGGC	2	8	30465	30472	0 %	0 %	75 %	25 %	91206280
90	NC_007941	GTCT	2	8	30496	30503	0 %	50 %	25 %	25 %	91206280
91	NC_007941	GCAA	2	8	30876	30883	50 %	0 %	25 %	25 %	91206281
92	NC_007941	CAGG	2	8	30927	30934	25 %	0 %	50 %	25 %	91206281
93	NC_007941	GCTG	2	8	30988	30995	0 %	25 %	50 %	25 %	91206281
94	NC_007941	TGGC	2	8	31204	31211	0 %	25 %	50 %	25 %	91206282
95	NC_007941	CTGG	2	8	32358	32365	0 %	25 %	50 %	25 %	91206282
96	NC_007941	GTAT	2	8	32897	32904	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007941	CTCG	2	8	33235	33242	0 %	25 %	25 %	50 %	91206283
98	NC_007941	CTGG	2	8	33560	33567	0 %	25 %	50 %	25 %	91206284
99	NC_007941	CGGC	2	8	34548	34555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007941	ATGC	2	8	34598	34605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007941	CTGA	2	8	34651	34658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_007941	CATC	2	8	34818	34825	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007941	TCGC	2	8	35199	35206	0 %	25 %	25 %	50 %	91206285
104	NC_007941	ATTC	2	8	35254	35261	25 %	50 %	0 %	25 %	91206285
105	NC_007941	GCTG	2	8	35766	35773	0 %	25 %	50 %	25 %	91206285
106	NC_007941	CTCA	2	8	36261	36268	25 %	25 %	0 %	50 %	91206286
107	NC_007941	TCAG	2	8	36512	36519	25 %	25 %	25 %	25 %	91206286
108	NC_007941	CAGA	2	8	36711	36718	50 %	0 %	25 %	25 %	91206286
109	NC_007941	CGCC	2	8	36895	36902	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_007941	GCTG	2	8	37071	37078	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007941	GCCA	2	8	37586	37593	25 %	0 %	25 %	50 %	91206287
112	NC_007941	TTGC	2	8	38027	38034	0 %	50 %	25 %	25 %	91206287
113	NC_007941	AGCC	2	8	38457	38464	25 %	0 %	25 %	50 %	91206288
114	NC_007941	TTCC	2	8	39180	39187	0 %	50 %	0 %	50 %	91206288
115	NC_007941	CTGT	2	8	39557	39564	0 %	50 %	25 %	25 %	91206288
116	NC_007941	GATA	2	8	39636	39643	50 %	25 %	25 %	0 %	91206288
117	NC_007941	GTCC	2	8	40010	40017	0 %	25 %	25 %	50 %	91206288
118	NC_007941	CAGC	2	8	40672	40679	25 %	0 %	25 %	50 %	229577730
119	NC_007941	GCAA	2	8	40696	40703	50 %	0 %	25 %	25 %	229577730
120	NC_007941	ATTT	2	8	41183	41190	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007941	TACT	2	8	41439	41446	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007941	CTCC	2	8	41513	41520	0 %	25 %	0 %	75 %	91206290
123	NC_007941	TCAT	2	8	41906	41913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007941	TCAT	2	8	41960	41967	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007941	TCAT	2	8	42048	42055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_007941	GATG	2	8	42120	42127	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007941	AAAT	2	8	42292	42299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007941	AGAT	2	8	43280	43287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007941	CCAG	2	8	43408	43415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007941	GTAA	2	8	43937	43944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007941	ATTT	2	8	43957	43964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007941	CATG	2	8	44062	44069	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007941	CAAA	2	8	44364	44371	75 %	0 %	0 %	25 %	91206292
134	NC_007941	AGTG	2	8	44619	44626	25 %	25 %	50 %	0 %	91206293
135	NC_007941	TGGA	2	8	44738	44745	25 %	25 %	50 %	0 %	91206293
136	NC_007941	GTGC	2	8	44779	44786	0 %	25 %	50 %	25 %	91206293
137	NC_007941	CGCC	2	8	44797	44804	0 %	0 %	25 %	75 %	91206293
138	NC_007941	CTGG	2	8	45070	45077	0 %	25 %	50 %	25 %	91206293
139	NC_007941	TCAC	2	8	45386	45393	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007941	GAAT	2	8	46165	46172	50 %	25 %	25 %	0 %	91206295
141	NC_007941	CCCA	2	8	46177	46184	25 %	0 %	0 %	75 %	91206295
142	NC_007941	GGTA	2	8	46335	46342	25 %	25 %	50 %	0 %	91206295
143	NC_007941	ACTG	2	8	46538	46545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_007941	ACTT	2	8	46611	46618	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007941	TCAT	2	8	46762	46769	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_007941	GTCT	2	8	46956	46963	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_007941	GTCG	2	8	47393	47400	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.