MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UTI89 plasmid pUTI89

Total Repeats: 265

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007941	GCCA	2	8	418	425	25 %	0 %	25 %	50 %	91206246
2	NC_007941	AGGC	2	8	475	482	25 %	0 %	50 %	25 %	91206246
3	NC_007941	GAAA	2	8	1052	1059	75 %	0 %	25 %	0 %	91206247
4	NC_007941	GCTC	2	8	1355	1362	0 %	25 %	25 %	50 %	91206248
5	NC_007941	TACC	2	8	1780	1787	25 %	25 %	0 %	50 %	91206249
6	NC_007941	CCGA	2	8	1823	1830	25 %	0 %	25 %	50 %	91206249
7	NC_007941	AAAC	2	8	1918	1925	75 %	0 %	0 %	25 %	91206249
8	NC_007941	CAGA	2	8	2015	2022	50 %	0 %	25 %	25 %	91206249
9	NC_007941	GCTG	2	8	3405	3412	0 %	25 %	50 %	25 %	91206250
10	NC_007941	GAAA	2	8	4232	4239	75 %	0 %	25 %	0 %	91206252
11	NC_007941	GCTG	2	8	4274	4281	0 %	25 %	50 %	25 %	91206253
12	NC_007941	TTGA	2	8	6139	6146	25 %	50 %	25 %	0 %	91206255
13	NC_007941	CGCT	2	8	6350	6357	0 %	25 %	25 %	50 %	91206255
14	NC_007941	CTGG	2	8	7488	7495	0 %	25 %	50 %	25 %	91206255
15	NC_007941	CTGG	2	8	7689	7696	0 %	25 %	50 %	25 %	91206255
16	NC_007941	GCTG	2	8	7859	7866	0 %	25 %	50 %	25 %	91206255
17	NC_007941	ATGA	2	8	8138	8145	50 %	25 %	25 %	0 %	91206256
18	NC_007941	GGGC	2	8	8981	8988	0 %	0 %	75 %	25 %	91206257
19	NC_007941	GGCG	2	8	9068	9075	0 %	0 %	75 %	25 %	91206257
20	NC_007941	TGGT	2	8	9408	9415	0 %	50 %	50 %	0 %	91206257
21	NC_007941	GCCT	2	8	9666	9673	0 %	25 %	25 %	50 %	91206257
22	NC_007941	GAGG	2	8	10031	10038	25 %	0 %	75 %	0 %	91206257
23	NC_007941	TTGA	2	8	10214	10221	25 %	50 %	25 %	0 %	91206258
24	NC_007941	GGAG	2	8	10384	10391	25 %	0 %	75 %	0 %	91206258
25	NC_007941	TCAG	2	8	10419	10426	25 %	25 %	25 %	25 %	91206258
26	NC_007941	GCTG	2	8	11122	11129	0 %	25 %	50 %	25 %	91206258
27	NC_007941	GGCG	2	8	11356	11363	0 %	0 %	75 %	25 %	91206259
28	NC_007941	GACG	2	8	14071	14078	25 %	0 %	50 %	25 %	91206262
29	NC_007941	GCCA	2	8	15647	15654	25 %	0 %	25 %	50 %	91206263
30	NC_007941	CCTG	2	8	15710	15717	0 %	25 %	25 %	50 %	91206263
31	NC_007941	CTTG	2	8	15760	15767	0 %	50 %	25 %	25 %	91206263
32	NC_007941	CAGA	2	8	16140	16147	50 %	0 %	25 %	25 %	91206264
33	NC_007941	GCCC	2	8	16172	16179	0 %	0 %	25 %	75 %	91206264
34	NC_007941	GTAA	2	8	16197	16204	50 %	25 %	25 %	0 %	91206264
35	NC_007941	TCTT	2	8	16453	16460	0 %	75 %	0 %	25 %	91206265
36	NC_007941	GGAT	2	8	17036	17043	25 %	25 %	50 %	0 %	91206267
37	NC_007941	AATG	2	8	17211	17218	50 %	25 %	25 %	0 %	91206267
38	NC_007941	GCTG	2	8	17345	17352	0 %	25 %	50 %	25 %	91206268
39	NC_007941	GGCT	2	8	17478	17485	0 %	25 %	50 %	25 %	91206268
40	NC_007941	GACG	2	8	17528	17535	25 %	0 %	50 %	25 %	91206268
41	NC_007941	CCGG	2	8	17536	17543	0 %	0 %	50 %	50 %	91206268
42	NC_007941	AAAG	2	8	18280	18287	75 %	0 %	25 %	0 %	91206270
43	NC_007941	TTGC	2	8	18537	18544	0 %	50 %	25 %	25 %	91206271
44	NC_007941	CTGT	2	8	18621	18628	0 %	50 %	25 %	25 %	91206271
45	NC_007941	CAGA	2	8	21164	21171	50 %	0 %	25 %	25 %	91206272
46	NC_007941	CTGA	2	8	21213	21220	25 %	25 %	25 %	25 %	91206272
47	NC_007941	GACA	2	8	22240	22247	50 %	0 %	25 %	25 %	91206273
48	NC_007941	GGAG	2	8	22710	22717	25 %	0 %	75 %	0 %	91206273
49	NC_007941	TGGC	2	8	23336	23343	0 %	25 %	50 %	25 %	91206274
50	NC_007941	AAAT	2	8	23772	23779	75 %	25 %	0 %	0 %	91206274
51	NC_007941	AATT	2	8	23843	23850	50 %	50 %	0 %	0 %	91206274
52	NC_007941	ATCG	2	8	24087	24094	25 %	25 %	25 %	25 %	91206274
53	NC_007941	CAGC	2	8	24759	24766	25 %	0 %	25 %	50 %	91206274
54	NC_007941	ACCC	2	8	25132	25139	25 %	0 %	0 %	75 %	91206274
55	NC_007941	AAAT	2	8	25532	25539	75 %	25 %	0 %	0 %	91206275
56	NC_007941	GATG	2	8	25901	25908	25 %	25 %	50 %	0 %	91206275
57	NC_007941	ATCC	2	8	27147	27154	25 %	25 %	0 %	50 %	91206276
58	NC_007941	CTGA	2	8	28279	28286	25 %	25 %	25 %	25 %	91206278
59	NC_007941	GCCT	2	8	28730	28737	0 %	25 %	25 %	50 %	91206279
60	NC_007941	TCAG	2	8	29359	29366	25 %	25 %	25 %	25 %	91206279
61	NC_007941	TTAC	2	8	30440	30447	25 %	50 %	0 %	25 %	91206280
62	NC_007941	GGGC	2	8	30465	30472	0 %	0 %	75 %	25 %	91206280
63	NC_007941	GTCT	2	8	30496	30503	0 %	50 %	25 %	25 %	91206280
64	NC_007941	GCAA	2	8	30876	30883	50 %	0 %	25 %	25 %	91206281
65	NC_007941	CAGG	2	8	30927	30934	25 %	0 %	50 %	25 %	91206281
66	NC_007941	GCTG	2	8	30988	30995	0 %	25 %	50 %	25 %	91206281
67	NC_007941	TGGC	2	8	31204	31211	0 %	25 %	50 %	25 %	91206282
68	NC_007941	CTGG	2	8	32358	32365	0 %	25 %	50 %	25 %	91206282
69	NC_007941	CTCG	2	8	33235	33242	0 %	25 %	25 %	50 %	91206283
70	NC_007941	CTGG	2	8	33560	33567	0 %	25 %	50 %	25 %	91206284
71	NC_007941	TCGC	2	8	35199	35206	0 %	25 %	25 %	50 %	91206285
72	NC_007941	ATTC	2	8	35254	35261	25 %	50 %	0 %	25 %	91206285
73	NC_007941	GCTG	2	8	35766	35773	0 %	25 %	50 %	25 %	91206285
74	NC_007941	CTCA	2	8	36261	36268	25 %	25 %	0 %	50 %	91206286
75	NC_007941	TCAG	2	8	36512	36519	25 %	25 %	25 %	25 %	91206286
76	NC_007941	CAGA	2	8	36711	36718	50 %	0 %	25 %	25 %	91206286
77	NC_007941	GCCA	2	8	37586	37593	25 %	0 %	25 %	50 %	91206287
78	NC_007941	TTGC	2	8	38027	38034	0 %	50 %	25 %	25 %	91206287
79	NC_007941	AGCC	2	8	38457	38464	25 %	0 %	25 %	50 %	91206288
80	NC_007941	TTCC	2	8	39180	39187	0 %	50 %	0 %	50 %	91206288
81	NC_007941	CTGT	2	8	39557	39564	0 %	50 %	25 %	25 %	91206288
82	NC_007941	GATA	2	8	39636	39643	50 %	25 %	25 %	0 %	91206288
83	NC_007941	GTCC	2	8	40010	40017	0 %	25 %	25 %	50 %	91206288
84	NC_007941	CAGC	2	8	40672	40679	25 %	0 %	25 %	50 %	229577730
85	NC_007941	GCAA	2	8	40696	40703	50 %	0 %	25 %	25 %	229577730
86	NC_007941	CTCC	2	8	41513	41520	0 %	25 %	0 %	75 %	91206290
87	NC_007941	CAAA	2	8	44364	44371	75 %	0 %	0 %	25 %	91206292
88	NC_007941	AGTG	2	8	44619	44626	25 %	25 %	50 %	0 %	91206293
89	NC_007941	TGGA	2	8	44738	44745	25 %	25 %	50 %	0 %	91206293
90	NC_007941	GTGC	2	8	44779	44786	0 %	25 %	50 %	25 %	91206293
91	NC_007941	CGCC	2	8	44797	44804	0 %	0 %	25 %	75 %	91206293
92	NC_007941	CTGG	2	8	45070	45077	0 %	25 %	50 %	25 %	91206293
93	NC_007941	GAAT	2	8	46165	46172	50 %	25 %	25 %	0 %	91206295
94	NC_007941	CCCA	2	8	46177	46184	25 %	0 %	0 %	75 %	91206295
95	NC_007941	GGTA	2	8	46335	46342	25 %	25 %	50 %	0 %	91206295
96	NC_007941	CAGT	2	8	47639	47646	25 %	25 %	25 %	25 %	91206297
97	NC_007941	ATAA	2	8	47702	47709	75 %	25 %	0 %	0 %	91206297
98	NC_007941	TGGC	2	8	47812	47819	0 %	25 %	50 %	25 %	91206297
99	NC_007941	TCAG	2	8	48104	48111	25 %	25 %	25 %	25 %	91206297
100	NC_007941	CTGG	2	8	48115	48122	0 %	25 %	50 %	25 %	91206297
101	NC_007941	CCGG	2	8	48137	48144	0 %	0 %	50 %	50 %	91206297
102	NC_007941	AGTG	2	8	51264	51271	25 %	25 %	50 %	0 %	91206303
103	NC_007941	TCGC	2	8	51379	51386	0 %	25 %	25 %	50 %	91206303
104	NC_007941	GTCA	2	8	51514	51521	25 %	25 %	25 %	25 %	91206303
105	NC_007941	CAGG	2	8	51578	51585	25 %	0 %	50 %	25 %	91206303
106	NC_007941	TGCT	2	8	52293	52300	0 %	50 %	25 %	25 %	91206305
107	NC_007941	TCAT	2	8	52332	52339	25 %	50 %	0 %	25 %	91206306
108	NC_007941	TTCA	2	8	52727	52734	25 %	50 %	0 %	25 %	91206306
109	NC_007941	ATGG	2	8	53283	53290	25 %	25 %	50 %	0 %	91206307
110	NC_007941	ATTT	2	8	54290	54297	25 %	75 %	0 %	0 %	91206308
111	NC_007941	GCCT	2	8	54328	54335	0 %	25 %	25 %	50 %	91206308
112	NC_007941	TCAG	2	8	54394	54401	25 %	25 %	25 %	25 %	91206308
113	NC_007941	TGGA	2	8	54407	54414	25 %	25 %	50 %	0 %	91206308
114	NC_007941	AATG	2	8	54515	54522	50 %	25 %	25 %	0 %	91206308
115	NC_007941	GTGA	2	8	55859	55866	25 %	25 %	50 %	0 %	91206309
116	NC_007941	AGAA	2	8	56094	56101	75 %	0 %	25 %	0 %	91206309
117	NC_007941	CAGC	2	8	56275	56282	25 %	0 %	25 %	50 %	91206310
118	NC_007941	CAAA	2	8	56658	56665	75 %	0 %	0 %	25 %	91206311
119	NC_007941	ATTA	2	8	56705	56712	50 %	50 %	0 %	0 %	91206311
120	NC_007941	GGAC	2	8	56759	56766	25 %	0 %	50 %	25 %	91206311
121	NC_007941	TGGA	2	8	56816	56823	25 %	25 %	50 %	0 %	91206311
122	NC_007941	TCGT	2	8	57504	57511	0 %	50 %	25 %	25 %	91206312
123	NC_007941	CGGG	2	8	57716	57723	0 %	0 %	75 %	25 %	91206312
124	NC_007941	CAGT	2	8	57788	57795	25 %	25 %	25 %	25 %	91206312
125	NC_007941	GTAT	2	8	58820	58827	25 %	50 %	25 %	0 %	91206314
126	NC_007941	GCTG	2	8	59045	59052	0 %	25 %	50 %	25 %	91206314
127	NC_007941	TTCA	2	8	59458	59465	25 %	50 %	0 %	25 %	91206314
128	NC_007941	TTTG	2	8	59847	59854	0 %	75 %	25 %	0 %	91206315
129	NC_007941	GGCT	2	8	59909	59916	0 %	25 %	50 %	25 %	91206315
130	NC_007941	CCAG	2	8	60175	60182	25 %	0 %	25 %	50 %	91206315
131	NC_007941	TGCC	2	8	60295	60302	0 %	25 %	25 %	50 %	91206315
132	NC_007941	CTGA	2	8	60485	60492	25 %	25 %	25 %	25 %	91206316
133	NC_007941	GCCA	2	8	60532	60539	25 %	0 %	25 %	50 %	91206316
134	NC_007941	CGAA	2	8	60888	60895	50 %	0 %	25 %	25 %	91206316
135	NC_007941	GACG	2	8	61302	61309	25 %	0 %	50 %	25 %	91206316
136	NC_007941	CTGG	2	8	61479	61486	0 %	25 %	50 %	25 %	91206316
137	NC_007941	CCGT	2	8	61516	61523	0 %	25 %	25 %	50 %	91206316
138	NC_007941	CGGG	2	8	61873	61880	0 %	0 %	75 %	25 %	91206319
139	NC_007941	ACTG	2	8	62314	62321	25 %	25 %	25 %	25 %	91206320
140	NC_007941	GCAG	2	8	62756	62763	25 %	0 %	50 %	25 %	91206320
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.