MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli UTI89 plasmid pUTI89

Total Repeats: 221

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007941	GC	3	6	1892	1897	0 %	0 %	50 %	50 %	91206249
2	NC_007941	TC	3	6	2376	2381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007941	CT	3	6	2943	2948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007941	TC	4	8	3194	3201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007941	TC	3	6	3618	3623	0 %	50 %	0 %	50 %	91206250
6	NC_007941	CG	3	6	3736	3741	0 %	0 %	50 %	50 %	91206250
7	NC_007941	CG	3	6	5267	5272	0 %	0 %	50 %	50 %	91206254
8	NC_007941	TG	4	8	5915	5922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007941	CT	3	6	6083	6088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007941	GC	3	6	6208	6213	0 %	0 %	50 %	50 %	91206255
11	NC_007941	CG	3	6	6282	6287	0 %	0 %	50 %	50 %	91206255
12	NC_007941	GC	3	6	6367	6372	0 %	0 %	50 %	50 %	91206255
13	NC_007941	GC	3	6	6916	6921	0 %	0 %	50 %	50 %	91206255
14	NC_007941	GC	3	6	7118	7123	0 %	0 %	50 %	50 %	91206255
15	NC_007941	GC	3	6	7471	7476	0 %	0 %	50 %	50 %	91206255
16	NC_007941	CG	3	6	8190	8195	0 %	0 %	50 %	50 %	91206256
17	NC_007941	CT	3	6	9489	9494	0 %	50 %	0 %	50 %	91206257
18	NC_007941	AG	3	6	10184	10189	50 %	0 %	50 %	0 %	91206258
19	NC_007941	GC	3	6	10779	10784	0 %	0 %	50 %	50 %	91206258
20	NC_007941	CT	3	6	12105	12110	0 %	50 %	0 %	50 %	91206259
21	NC_007941	GC	3	6	12156	12161	0 %	0 %	50 %	50 %	91206259
22	NC_007941	CG	3	6	12405	12410	0 %	0 %	50 %	50 %	91206259
23	NC_007941	GT	4	8	12905	12912	0 %	50 %	50 %	0 %	91206260
24	NC_007941	GC	3	6	13601	13606	0 %	0 %	50 %	50 %	91206261
25	NC_007941	GA	3	6	13634	13639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007941	AT	3	6	13903	13908	50 %	50 %	0 %	0 %	91206262
27	NC_007941	GC	4	8	14378	14385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007941	TA	3	6	14572	14577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007941	TC	3	6	15045	15050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007941	GC	3	6	16347	16352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007941	GC	3	6	17447	17452	0 %	0 %	50 %	50 %	91206268
32	NC_007941	GC	3	6	17495	17500	0 %	0 %	50 %	50 %	91206268
33	NC_007941	AT	3	6	18353	18358	50 %	50 %	0 %	0 %	91206271
34	NC_007941	TC	3	6	18414	18419	0 %	50 %	0 %	50 %	91206271
35	NC_007941	AT	4	8	18591	18598	50 %	50 %	0 %	0 %	91206271
36	NC_007941	AT	3	6	19312	19317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007941	GA	3	6	19786	19791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007941	AC	3	6	19825	19830	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007941	TG	3	6	20313	20318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007941	GC	3	6	20456	20461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007941	CA	3	6	20726	20731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007941	GC	3	6	20785	20790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007941	GT	3	6	21391	21396	0 %	50 %	50 %	0 %	91206272
44	NC_007941	CT	3	6	21738	21743	0 %	50 %	0 %	50 %	91206272
45	NC_007941	AT	3	6	23679	23684	50 %	50 %	0 %	0 %	91206274
46	NC_007941	CG	3	6	24161	24166	0 %	0 %	50 %	50 %	91206274
47	NC_007941	AC	3	6	24197	24202	50 %	0 %	0 %	50 %	91206274
48	NC_007941	GC	3	6	24369	24374	0 %	0 %	50 %	50 %	91206274
49	NC_007941	CT	3	6	24751	24756	0 %	50 %	0 %	50 %	91206274
50	NC_007941	CG	3	6	25149	25154	0 %	0 %	50 %	50 %	91206274
51	NC_007941	TC	3	6	25228	25233	0 %	50 %	0 %	50 %	91206275
52	NC_007941	AC	3	6	25604	25609	50 %	0 %	0 %	50 %	91206275
53	NC_007941	CA	3	6	26157	26162	50 %	0 %	0 %	50 %	91206275
54	NC_007941	CG	3	6	26995	27000	0 %	0 %	50 %	50 %	91206276
55	NC_007941	TC	3	6	27182	27187	0 %	50 %	0 %	50 %	91206276
56	NC_007941	CA	3	6	27188	27193	50 %	0 %	0 %	50 %	91206276
57	NC_007941	AT	3	6	27824	27829	50 %	50 %	0 %	0 %	91206278
58	NC_007941	AG	3	6	29342	29347	50 %	0 %	50 %	0 %	91206279
59	NC_007941	CT	3	6	29794	29799	0 %	50 %	0 %	50 %	91206279
60	NC_007941	CA	3	6	29827	29832	50 %	0 %	0 %	50 %	91206279
61	NC_007941	GC	3	6	30292	30297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007941	AC	3	6	32914	32919	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007941	GA	3	6	33092	33097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007941	AG	3	6	34151	34156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007941	AG	3	6	34161	34166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007941	TC	4	8	35264	35271	0 %	50 %	0 %	50 %	91206285
67	NC_007941	CG	3	6	35493	35498	0 %	0 %	50 %	50 %	91206285
68	NC_007941	TC	3	6	35607	35612	0 %	50 %	0 %	50 %	91206285
69	NC_007941	CA	3	6	37542	37547	50 %	0 %	0 %	50 %	91206287
70	NC_007941	AT	3	6	37997	38002	50 %	50 %	0 %	0 %	91206287
71	NC_007941	GT	3	6	38571	38576	0 %	50 %	50 %	0 %	91206288
72	NC_007941	CG	3	6	38748	38753	0 %	0 %	50 %	50 %	91206288
73	NC_007941	GC	3	6	39617	39622	0 %	0 %	50 %	50 %	91206288
74	NC_007941	TC	3	6	39771	39776	0 %	50 %	0 %	50 %	91206288
75	NC_007941	AT	3	6	40273	40278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007941	AT	3	6	41172	41177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007941	AT	3	6	41235	41240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007941	TA	3	6	41408	41413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007941	AC	3	6	41737	41742	50 %	0 %	0 %	50 %	91206290
80	NC_007941	GT	3	6	42132	42137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007941	AT	3	6	42188	42193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007941	AT	3	6	42411	42416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007941	TA	3	6	42462	42467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007941	TA	3	6	43463	43468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007941	AG	3	6	43822	43827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007941	CG	3	6	44378	44383	0 %	0 %	50 %	50 %	91206292
87	NC_007941	TA	3	6	45231	45236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007941	TC	3	6	45429	45434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007941	CT	3	6	45799	45804	0 %	50 %	0 %	50 %	91206295
90	NC_007941	CA	3	6	46097	46102	50 %	0 %	0 %	50 %	91206295
91	NC_007941	GT	3	6	46519	46524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007941	AT	3	6	46882	46887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007941	GA	3	6	48175	48180	50 %	0 %	50 %	0 %	91206297
94	NC_007941	GA	4	8	48439	48446	50 %	0 %	50 %	0 %	91206298
95	NC_007941	AT	3	6	48489	48494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007941	TG	4	8	49223	49230	0 %	50 %	50 %	0 %	91206299
97	NC_007941	GC	3	6	50499	50504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007941	AT	3	6	50524	50529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007941	AG	4	8	50818	50825	50 %	0 %	50 %	0 %	91206302
100	NC_007941	GC	3	6	51337	51342	0 %	0 %	50 %	50 %	91206303
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107	NC_007941	TG	3	6	54878	54883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007941	GA	3	6	55484	55489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007941	GC	3	6	55710	55715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007941	CA	3	6	55719	55724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007941	CA	3	6	56599	56604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007941	CG	3	6	57597	57602	0 %	0 %	50 %	50 %	91206312
113	NC_007941	TA	3	6	57690	57695	50 %	50 %	0 %	0 %	91206312
114	NC_007941	AG	3	6	57752	57757	50 %	0 %	50 %	0 %	91206312
115	NC_007941	TA	3	6	57837	57842	50 %	50 %	0 %	0 %	91206312
116	NC_007941	TA	3	6	58435	58440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007941	CA	4	8	58462	58469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_007941	GT	3	6	58644	58649	0 %	50 %	50 %	0 %	91206313
119	NC_007941	TG	3	6	59258	59263	0 %	50 %	50 %	0 %	91206314
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121	NC_007941	CT	3	6	59919	59924	0 %	50 %	0 %	50 %	91206315
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123	NC_007941	CA	3	6	61082	61087	50 %	0 %	0 %	50 %	91206316
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129	NC_007941	CA	3	6	63578	63583	50 %	0 %	0 %	50 %	91206322
130	NC_007941	TG	3	6	64247	64252	0 %	50 %	50 %	0 %	91206323
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.