MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UTI89 plasmid pUTI89

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007941	GC	3	6	1892	1897	0 %	0 %	50 %	50 %	91206249
2	NC_007941	TC	3	6	3618	3623	0 %	50 %	0 %	50 %	91206250
3	NC_007941	CG	3	6	3736	3741	0 %	0 %	50 %	50 %	91206250
4	NC_007941	CG	3	6	5267	5272	0 %	0 %	50 %	50 %	91206254
5	NC_007941	GC	3	6	6208	6213	0 %	0 %	50 %	50 %	91206255
6	NC_007941	CG	3	6	6282	6287	0 %	0 %	50 %	50 %	91206255
7	NC_007941	GC	3	6	6367	6372	0 %	0 %	50 %	50 %	91206255
8	NC_007941	GC	3	6	6916	6921	0 %	0 %	50 %	50 %	91206255
9	NC_007941	GC	3	6	7118	7123	0 %	0 %	50 %	50 %	91206255
10	NC_007941	GC	3	6	7471	7476	0 %	0 %	50 %	50 %	91206255
11	NC_007941	CG	3	6	8190	8195	0 %	0 %	50 %	50 %	91206256
12	NC_007941	CT	3	6	9489	9494	0 %	50 %	0 %	50 %	91206257
13	NC_007941	AG	3	6	10184	10189	50 %	0 %	50 %	0 %	91206258
14	NC_007941	GC	3	6	10779	10784	0 %	0 %	50 %	50 %	91206258
15	NC_007941	CT	3	6	12105	12110	0 %	50 %	0 %	50 %	91206259
16	NC_007941	GC	3	6	12156	12161	0 %	0 %	50 %	50 %	91206259
17	NC_007941	CG	3	6	12405	12410	0 %	0 %	50 %	50 %	91206259
18	NC_007941	GT	4	8	12905	12912	0 %	50 %	50 %	0 %	91206260
19	NC_007941	GC	3	6	13601	13606	0 %	0 %	50 %	50 %	91206261
20	NC_007941	AT	3	6	13903	13908	50 %	50 %	0 %	0 %	91206262
21	NC_007941	GC	3	6	17447	17452	0 %	0 %	50 %	50 %	91206268
22	NC_007941	GC	3	6	17495	17500	0 %	0 %	50 %	50 %	91206268
23	NC_007941	AT	3	6	18353	18358	50 %	50 %	0 %	0 %	91206271
24	NC_007941	TC	3	6	18414	18419	0 %	50 %	0 %	50 %	91206271
25	NC_007941	AT	4	8	18591	18598	50 %	50 %	0 %	0 %	91206271
26	NC_007941	GT	3	6	21391	21396	0 %	50 %	50 %	0 %	91206272
27	NC_007941	CT	3	6	21738	21743	0 %	50 %	0 %	50 %	91206272
28	NC_007941	AT	3	6	23679	23684	50 %	50 %	0 %	0 %	91206274
29	NC_007941	CG	3	6	24161	24166	0 %	0 %	50 %	50 %	91206274
30	NC_007941	AC	3	6	24197	24202	50 %	0 %	0 %	50 %	91206274
31	NC_007941	GC	3	6	24369	24374	0 %	0 %	50 %	50 %	91206274
32	NC_007941	CT	3	6	24751	24756	0 %	50 %	0 %	50 %	91206274
33	NC_007941	CG	3	6	25149	25154	0 %	0 %	50 %	50 %	91206274
34	NC_007941	TC	3	6	25228	25233	0 %	50 %	0 %	50 %	91206275
35	NC_007941	AC	3	6	25604	25609	50 %	0 %	0 %	50 %	91206275
36	NC_007941	CA	3	6	26157	26162	50 %	0 %	0 %	50 %	91206275
37	NC_007941	CG	3	6	26995	27000	0 %	0 %	50 %	50 %	91206276
38	NC_007941	TC	3	6	27182	27187	0 %	50 %	0 %	50 %	91206276
39	NC_007941	CA	3	6	27188	27193	50 %	0 %	0 %	50 %	91206276
40	NC_007941	AT	3	6	27824	27829	50 %	50 %	0 %	0 %	91206278
41	NC_007941	AG	3	6	29342	29347	50 %	0 %	50 %	0 %	91206279
42	NC_007941	CT	3	6	29794	29799	0 %	50 %	0 %	50 %	91206279
43	NC_007941	CA	3	6	29827	29832	50 %	0 %	0 %	50 %	91206279
44	NC_007941	TC	4	8	35264	35271	0 %	50 %	0 %	50 %	91206285
45	NC_007941	CG	3	6	35493	35498	0 %	0 %	50 %	50 %	91206285
46	NC_007941	TC	3	6	35607	35612	0 %	50 %	0 %	50 %	91206285
47	NC_007941	CA	3	6	37542	37547	50 %	0 %	0 %	50 %	91206287
48	NC_007941	AT	3	6	37997	38002	50 %	50 %	0 %	0 %	91206287
49	NC_007941	GT	3	6	38571	38576	0 %	50 %	50 %	0 %	91206288
50	NC_007941	CG	3	6	38748	38753	0 %	0 %	50 %	50 %	91206288
51	NC_007941	GC	3	6	39617	39622	0 %	0 %	50 %	50 %	91206288
52	NC_007941	TC	3	6	39771	39776	0 %	50 %	0 %	50 %	91206288
53	NC_007941	AC	3	6	41737	41742	50 %	0 %	0 %	50 %	91206290
54	NC_007941	CG	3	6	44378	44383	0 %	0 %	50 %	50 %	91206292
55	NC_007941	CT	3	6	45799	45804	0 %	50 %	0 %	50 %	91206295
56	NC_007941	CA	3	6	46097	46102	50 %	0 %	0 %	50 %	91206295
57	NC_007941	GA	3	6	48175	48180	50 %	0 %	50 %	0 %	91206297
58	NC_007941	GA	4	8	48439	48446	50 %	0 %	50 %	0 %	91206298
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60	NC_007941	AG	4	8	50818	50825	50 %	0 %	50 %	0 %	91206302
61	NC_007941	GC	3	6	51337	51342	0 %	0 %	50 %	50 %	91206303
62	NC_007941	AG	3	6	52171	52176	50 %	0 %	50 %	0 %	91206305
63	NC_007941	GC	3	6	52217	52222	0 %	0 %	50 %	50 %	91206305
64	NC_007941	TC	3	6	52493	52498	0 %	50 %	0 %	50 %	91206306
65	NC_007941	GT	3	6	53784	53789	0 %	50 %	50 %	0 %	91206307
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68	NC_007941	CG	3	6	57597	57602	0 %	0 %	50 %	50 %	91206312
69	NC_007941	TA	3	6	57690	57695	50 %	50 %	0 %	0 %	91206312
70	NC_007941	AG	3	6	57752	57757	50 %	0 %	50 %	0 %	91206312
71	NC_007941	TA	3	6	57837	57842	50 %	50 %	0 %	0 %	91206312
72	NC_007941	GT	3	6	58644	58649	0 %	50 %	50 %	0 %	91206313
73	NC_007941	TG	3	6	59258	59263	0 %	50 %	50 %	0 %	91206314
74	NC_007941	CT	3	6	59743	59748	0 %	50 %	0 %	50 %	91206315
75	NC_007941	CT	3	6	59919	59924	0 %	50 %	0 %	50 %	91206315
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77	NC_007941	CA	3	6	61082	61087	50 %	0 %	0 %	50 %	91206316
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81	NC_007941	CT	3	6	63264	63269	0 %	50 %	0 %	50 %	91206322
82	NC_007941	GC	3	6	63318	63323	0 %	0 %	50 %	50 %	91206322
83	NC_007941	CA	3	6	63578	63583	50 %	0 %	0 %	50 %	91206322
84	NC_007941	TG	3	6	64247	64252	0 %	50 %	50 %	0 %	91206323
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87	NC_007941	GC	3	6	65532	65537	0 %	0 %	50 %	50 %	91206325
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90	NC_007941	CG	3	6	67214	67219	0 %	0 %	50 %	50 %	91206333
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92	NC_007941	GC	3	6	68597	68602	0 %	0 %	50 %	50 %	91206334
93	NC_007941	TG	3	6	68788	68793	0 %	50 %	50 %	0 %	91206334
94	NC_007941	CG	3	6	69067	69072	0 %	0 %	50 %	50 %	91206334
95	NC_007941	GC	3	6	70194	70199	0 %	0 %	50 %	50 %	91206337
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98	NC_007941	CG	3	6	71464	71469	0 %	0 %	50 %	50 %	229577731
99	NC_007941	TG	3	6	72741	72746	0 %	50 %	50 %	0 %	229577731
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102	NC_007941	GT	4	8	74315	74322	0 %	50 %	50 %	0 %	91206342
103	NC_007941	GT	3	6	74328	74333	0 %	50 %	50 %	0 %	91206342
104	NC_007941	TG	3	6	78394	78399	0 %	50 %	50 %	0 %	91206349
105	NC_007941	GA	3	6	78580	78585	50 %	0 %	50 %	0 %	91206349
106	NC_007941	TA	3	6	78588	78593	50 %	50 %	0 %	0 %	91206349
107	NC_007941	AG	3	6	78912	78917	50 %	0 %	50 %	0 %	91206349
108	NC_007941	CT	3	6	79749	79754	0 %	50 %	0 %	50 %	91206351
109	NC_007941	CT	3	6	80222	80227	0 %	50 %	0 %	50 %	91206353
110	NC_007941	AT	3	6	80434	80439	50 %	50 %	0 %	0 %	91206353
111	NC_007941	GC	3	6	81378	81383	0 %	0 %	50 %	50 %	91206354
112	NC_007941	GC	3	6	82441	82446	0 %	0 %	50 %	50 %	91206355
113	NC_007941	CG	3	6	83136	83141	0 %	0 %	50 %	50 %	91206356
114	NC_007941	GT	3	6	84441	84446	0 %	50 %	50 %	0 %	91206358
115	NC_007941	AT	3	6	84896	84901	50 %	50 %	0 %	0 %	91206360
116	NC_007941	TA	3	6	84991	84996	50 %	50 %	0 %	0 %	91206360
117	NC_007941	CG	3	6	86254	86259	0 %	0 %	50 %	50 %	91206362
118	NC_007941	CA	3	6	86570	86575	50 %	0 %	0 %	50 %	91206362
119	NC_007941	GT	3	6	86690	86695	0 %	50 %	50 %	0 %	91206362
120	NC_007941	GC	3	6	87278	87283	0 %	0 %	50 %	50 %	91206362
121	NC_007941	AG	3	6	87284	87289	50 %	0 %	50 %	0 %	91206362
122	NC_007941	TG	3	6	87547	87552	0 %	50 %	50 %	0 %	91206362
123	NC_007941	CA	3	6	88172	88177	50 %	0 %	0 %	50 %	91206362
124	NC_007941	AG	3	6	88491	88496	50 %	0 %	50 %	0 %	91206362
125	NC_007941	AT	3	6	90661	90666	50 %	50 %	0 %	0 %	91206366
126	NC_007941	AT	3	6	90822	90827	50 %	50 %	0 %	0 %	91206366
127	NC_007941	AC	3	6	91031	91036	50 %	0 %	0 %	50 %	91206367
128	NC_007941	GA	3	6	91088	91093	50 %	0 %	50 %	0 %	91206367
129	NC_007941	CA	3	6	92621	92626	50 %	0 %	0 %	50 %	91206368
130	NC_007941	TA	3	6	94469	94474	50 %	50 %	0 %	0 %	91206371
131	NC_007941	CT	3	6	95075	95080	0 %	50 %	0 %	50 %	91206372
132	NC_007941	TC	3	6	95486	95491	0 %	50 %	0 %	50 %	91206373
133	NC_007941	AC	3	6	95919	95924	50 %	0 %	0 %	50 %	91206374
134	NC_007941	AT	3	6	96225	96230	50 %	50 %	0 %	0 %	91206375
135	NC_007941	AT	4	8	96365	96372	50 %	50 %	0 %	0 %	91206376
136	NC_007941	CA	3	6	96790	96795	50 %	0 %	0 %	50 %	91206377
137	NC_007941	GT	3	6	97722	97727	0 %	50 %	50 %	0 %	91206377
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141	NC_007941	CA	3	6	99522	99527	50 %	0 %	0 %	50 %	91206378
142	NC_007941	TA	3	6	101077	101082	50 %	50 %	0 %	0 %	91206379
143	NC_007941	CT	3	6	101104	101109	0 %	50 %	0 %	50 %	91206379
144	NC_007941	TC	3	6	102551	102556	0 %	50 %	0 %	50 %	91206381
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.