MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UTI89 plasmid pUTI89

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007941	T	6	6	3234	3239	0 %	100 %	0 %	0 %	91206250
2	NC_007941	A	6	6	5172	5177	100 %	0 %	0 %	0 %	91206254
3	NC_007941	A	6	6	6343	6348	100 %	0 %	0 %	0 %	91206255
4	NC_007941	A	6	6	7977	7982	100 %	0 %	0 %	0 %	91206255
5	NC_007941	G	6	6	13319	13324	0 %	0 %	100 %	0 %	91206261
6	NC_007941	A	6	6	13361	13366	100 %	0 %	0 %	0 %	91206261
7	NC_007941	A	6	6	13924	13929	100 %	0 %	0 %	0 %	91206262
8	NC_007941	C	7	7	17905	17911	0 %	0 %	0 %	100 %	91206269
9	NC_007941	C	6	6	18005	18010	0 %	0 %	0 %	100 %	91206269
10	NC_007941	G	6	6	18347	18352	0 %	0 %	100 %	0 %	91206271
11	NC_007941	T	7	7	18506	18512	0 %	100 %	0 %	0 %	91206271
12	NC_007941	A	8	8	21618	21625	100 %	0 %	0 %	0 %	91206272
13	NC_007941	A	7	7	21641	21647	100 %	0 %	0 %	0 %	91206272
14	NC_007941	A	6	6	23009	23014	100 %	0 %	0 %	0 %	91206274
15	NC_007941	A	6	6	23026	23031	100 %	0 %	0 %	0 %	91206274
16	NC_007941	A	6	6	25909	25914	100 %	0 %	0 %	0 %	91206275
17	NC_007941	T	6	6	28843	28848	0 %	100 %	0 %	0 %	91206279
18	NC_007941	T	6	6	29875	29880	0 %	100 %	0 %	0 %	91206279
19	NC_007941	A	7	7	33154	33160	100 %	0 %	0 %	0 %	91206283
20	NC_007941	C	6	6	33389	33394	0 %	0 %	0 %	100 %	91206283
21	NC_007941	A	6	6	35873	35878	100 %	0 %	0 %	0 %	91206285
22	NC_007941	C	6	6	36470	36475	0 %	0 %	0 %	100 %	91206286
23	NC_007941	T	6	6	38479	38484	0 %	100 %	0 %	0 %	91206288
24	NC_007941	G	6	6	39778	39783	0 %	0 %	100 %	0 %	91206288
25	NC_007941	A	7	7	40812	40818	100 %	0 %	0 %	0 %	229577730
26	NC_007941	A	6	6	40865	40870	100 %	0 %	0 %	0 %	229577730
27	NC_007941	A	8	8	41617	41624	100 %	0 %	0 %	0 %	91206290
28	NC_007941	A	7	7	41721	41727	100 %	0 %	0 %	0 %	91206290
29	NC_007941	T	6	6	45545	45550	0 %	100 %	0 %	0 %	91206295
30	NC_007941	T	8	8	46306	46313	0 %	100 %	0 %	0 %	91206295
31	NC_007941	T	6	6	46446	46451	0 %	100 %	0 %	0 %	91206296
32	NC_007941	T	6	6	49208	49213	0 %	100 %	0 %	0 %	91206299
33	NC_007941	A	6	6	49708	49713	100 %	0 %	0 %	0 %	91206300
34	NC_007941	C	6	6	49740	49745	0 %	0 %	0 %	100 %	91206300
35	NC_007941	G	6	6	51368	51373	0 %	0 %	100 %	0 %	91206303
36	NC_007941	T	6	6	52099	52104	0 %	100 %	0 %	0 %	91206305
37	NC_007941	A	6	6	53342	53347	100 %	0 %	0 %	0 %	91206307
38	NC_007941	A	7	7	53523	53529	100 %	0 %	0 %	0 %	91206307
39	NC_007941	A	6	6	54183	54188	100 %	0 %	0 %	0 %	91206308
40	NC_007941	A	6	6	54475	54480	100 %	0 %	0 %	0 %	91206308
41	NC_007941	A	6	6	54540	54545	100 %	0 %	0 %	0 %	91206308
42	NC_007941	T	6	6	56468	56473	0 %	100 %	0 %	0 %	91206310
43	NC_007941	A	6	6	56987	56992	100 %	0 %	0 %	0 %	91206311
44	NC_007941	A	6	6	57137	57142	100 %	0 %	0 %	0 %	91206311
45	NC_007941	A	6	6	57675	57680	100 %	0 %	0 %	0 %	91206312
46	NC_007941	A	6	6	58112	58117	100 %	0 %	0 %	0 %	91206312
47	NC_007941	A	6	6	58227	58232	100 %	0 %	0 %	0 %	91206312
48	NC_007941	A	6	6	59279	59284	100 %	0 %	0 %	0 %	91206314
49	NC_007941	T	6	6	60354	60359	0 %	100 %	0 %	0 %	91206315
50	NC_007941	G	6	6	61759	61764	0 %	0 %	100 %	0 %	91206318
51	NC_007941	A	6	6	62429	62434	100 %	0 %	0 %	0 %	91206320
52	NC_007941	A	7	7	64944	64950	100 %	0 %	0 %	0 %	91206324
53	NC_007941	C	6	6	65952	65957	0 %	0 %	0 %	100 %	91206327
54	NC_007941	T	6	6	66043	66048	0 %	100 %	0 %	0 %	91206327
55	NC_007941	T	6	6	66464	66469	0 %	100 %	0 %	0 %	91206330
56	NC_007941	A	6	6	66484	66489	100 %	0 %	0 %	0 %	91206330
57	NC_007941	A	6	6	67286	67291	100 %	0 %	0 %	0 %	91206333
58	NC_007941	A	7	7	67718	67724	100 %	0 %	0 %	0 %	91206333
59	NC_007941	A	6	6	67887	67892	100 %	0 %	0 %	0 %	91206333
60	NC_007941	G	6	6	68981	68986	0 %	0 %	100 %	0 %	91206334
61	NC_007941	T	6	6	69344	69349	0 %	100 %	0 %	0 %	91206335
62	NC_007941	T	6	6	69757	69762	0 %	100 %	0 %	0 %	91206336
63	NC_007941	A	6	6	69777	69782	100 %	0 %	0 %	0 %	91206336
64	NC_007941	A	6	6	70385	70390	100 %	0 %	0 %	0 %	91206337
65	NC_007941	T	6	6	75147	75152	0 %	100 %	0 %	0 %	91206344
66	NC_007941	A	6	6	75167	75172	100 %	0 %	0 %	0 %	91206344
67	NC_007941	A	7	7	75421	75427	100 %	0 %	0 %	0 %	91206345
68	NC_007941	A	6	6	75477	75482	100 %	0 %	0 %	0 %	91206345
69	NC_007941	T	6	6	77075	77080	0 %	100 %	0 %	0 %	91206347
70	NC_007941	T	6	6	77384	77389	0 %	100 %	0 %	0 %	91206347
71	NC_007941	T	6	6	78780	78785	0 %	100 %	0 %	0 %	91206349
72	NC_007941	T	6	6	78981	78986	0 %	100 %	0 %	0 %	91206349
73	NC_007941	T	7	7	79488	79494	0 %	100 %	0 %	0 %	91206351
74	NC_007941	A	6	6	79991	79996	100 %	0 %	0 %	0 %	91206352
75	NC_007941	A	6	6	80000	80005	100 %	0 %	0 %	0 %	91206352
76	NC_007941	A	6	6	80699	80704	100 %	0 %	0 %	0 %	91206353
77	NC_007941	T	7	7	80733	80739	0 %	100 %	0 %	0 %	91206354
78	NC_007941	G	6	6	82233	82238	0 %	0 %	100 %	0 %	91206355
79	NC_007941	T	6	6	84446	84451	0 %	100 %	0 %	0 %	91206358
80	NC_007941	A	6	6	84861	84866	100 %	0 %	0 %	0 %	91206360
81	NC_007941	T	6	6	85043	85048	0 %	100 %	0 %	0 %	91206360
82	NC_007941	A	6	6	85178	85183	100 %	0 %	0 %	0 %	91206360
83	NC_007941	A	6	6	85424	85429	100 %	0 %	0 %	0 %	91206361
84	NC_007941	A	7	7	86490	86496	100 %	0 %	0 %	0 %	91206362
85	NC_007941	G	6	6	87025	87030	0 %	0 %	100 %	0 %	91206362
86	NC_007941	A	6	6	88620	88625	100 %	0 %	0 %	0 %	91206363
87	NC_007941	C	6	6	88641	88646	0 %	0 %	0 %	100 %	91206363
88	NC_007941	T	6	6	88781	88786	0 %	100 %	0 %	0 %	91206363
89	NC_007941	A	6	6	90539	90544	100 %	0 %	0 %	0 %	91206365
90	NC_007941	T	6	6	90906	90911	0 %	100 %	0 %	0 %	91206366
91	NC_007941	T	6	6	92231	92236	0 %	100 %	0 %	0 %	91206368
92	NC_007941	A	6	6	93165	93170	100 %	0 %	0 %	0 %	91206368
93	NC_007941	C	6	6	93847	93852	0 %	0 %	0 %	100 %	91206370
94	NC_007941	A	6	6	94014	94019	100 %	0 %	0 %	0 %	91206370
95	NC_007941	T	7	7	94494	94500	0 %	100 %	0 %	0 %	91206371
96	NC_007941	T	6	6	94789	94794	0 %	100 %	0 %	0 %	91206371
97	NC_007941	T	7	7	95331	95337	0 %	100 %	0 %	0 %	91206373
98	NC_007941	T	6	6	96115	96120	0 %	100 %	0 %	0 %	91206375
99	NC_007941	T	6	6	96183	96188	0 %	100 %	0 %	0 %	91206375
100	NC_007941	A	6	6	96293	96298	100 %	0 %	0 %	0 %	91206375
101	NC_007941	A	6	6	96315	96320	100 %	0 %	0 %	0 %	91206376
102	NC_007941	T	6	6	96382	96387	0 %	100 %	0 %	0 %	91206376
103	NC_007941	T	6	6	96408	96413	0 %	100 %	0 %	0 %	91206376
104	NC_007941	G	6	6	96595	96600	0 %	0 %	100 %	0 %	91206376
105	NC_007941	T	6	6	97013	97018	0 %	100 %	0 %	0 %	91206377
106	NC_007941	C	6	6	97434	97439	0 %	0 %	0 %	100 %	91206377
107	NC_007941	G	6	6	97486	97491	0 %	0 %	100 %	0 %	91206377
108	NC_007941	A	6	6	98132	98137	100 %	0 %	0 %	0 %	91206378
109	NC_007941	T	6	6	98603	98608	0 %	100 %	0 %	0 %	91206378
110	NC_007941	G	6	6	99926	99931	0 %	0 %	100 %	0 %	91206378
111	NC_007941	A	7	7	101028	101034	100 %	0 %	0 %	0 %	91206379
112	NC_007941	A	6	6	101416	101421	100 %	0 %	0 %	0 %	91206380
113	NC_007941	C	6	6	102412	102417	0 %	0 %	0 %	100 %	91206381
114	NC_007941	A	6	6	102585	102590	100 %	0 %	0 %	0 %	91206381
115	NC_007941	T	7	7	103232	103238	0 %	100 %	0 %	0 %	91206382
116	NC_007941	A	6	6	103618	103623	100 %	0 %	0 %	0 %	91206382
117	NC_007941	T	6	6	104568	104573	0 %	100 %	0 %	0 %	91206382
118	NC_007941	G	6	6	105049	105054	0 %	0 %	100 %	0 %	91206382
119	NC_007941	G	7	7	105561	105567	0 %	0 %	100 %	0 %	91206383
120	NC_007941	A	6	6	107395	107400	100 %	0 %	0 %	0 %	91206383
121	NC_007941	A	6	6	108091	108096	100 %	0 %	0 %	0 %	91206383
122	NC_007941	G	6	6	110146	110151	0 %	0 %	100 %	0 %	91206383
123	NC_007941	T	6	6	111252	111257	0 %	100 %	0 %	0 %	91206385
124	NC_007941	G	6	6	111695	111700	0 %	0 %	100 %	0 %	91206386
125	NC_007941	T	6	6	112175	112180	0 %	100 %	0 %	0 %	91206386
126	NC_007941	A	6	6	112214	112219	100 %	0 %	0 %	0 %	91206386
127	NC_007941	A	7	7	112495	112501	100 %	0 %	0 %	0 %	91206387
128	NC_007941	A	6	6	112682	112687	100 %	0 %	0 %	0 %	91206387
129	NC_007941	A	6	6	112890	112895	100 %	0 %	0 %	0 %	91206387
130	NC_007941	G	6	6	113105	113110	0 %	0 %	100 %	0 %	91206388
131	NC_007941	C	6	6	113909	113914	0 %	0 %	0 %	100 %	91206389
132	NC_007941	A	6	6	114048	114053	100 %	0 %	0 %	0 %	91206390

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.