MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Rickettsia bellii RML369-C chromosome

Total Repeats: 703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007940	ATTATA	2	12	326	337	50 %	50 %	0 %	0 %	91204816
2	NC_007940	GAACAA	2	12	1532	1543	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	91204818
3	NC_007940	TTATAA	2	12	2585	2596	50 %	50 %	0 %	0 %	91204819
4	NC_007940	AAGATA	2	12	3496	3507	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	91204820
5	NC_007940	CTAATA	2	12	4507	4518	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91204820
6	NC_007940	GCATTA	2	12	4845	4856	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91204820
7	NC_007940	TTTCTT	2	12	8904	8915	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	91204824
8	NC_007940	CAAGAG	2	12	9066	9077	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	91204824
9	NC_007940	CTAATA	2	12	9399	9410	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91204825
10	NC_007940	CCTTTT	2	12	10262	10273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91204826
11	NC_007940	TCACTA	2	12	11089	11100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91204826
12	NC_007940	TATAGG	2	12	21403	21414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204837
13	NC_007940	TTTTAA	2	12	21422	21433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204837
14	NC_007940	ATAAAC	2	12	26679	26690	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_007940	CAAGAA	2	12	28912	28923	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	91204845
16	NC_007940	TTTAAA	2	12	29638	29649	50 %	50 %	0 %	0 %	91204845
17	NC_007940	ACTCAG	2	12	31052	31063	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91204845
18	NC_007940	TTTCTT	2	12	32249	32260	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007940	TGCATT	2	12	33788	33799	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	91204848
20	NC_007940	TAAACA	2	12	34929	34940	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	91204849
21	NC_007940	AATTCT	2	12	35671	35682	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	91204850
22	NC_007940	GATTTA	2	12	43274	43285	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	91204854
23	NC_007940	AAATAA	2	12	43671	43682	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	91204855
24	NC_007940	AATGAA	2	12	48790	48801	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	91204861
25	NC_007940	TATGAT	2	12	49061	49072	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	91204861
26	NC_007940	CATTAA	2	12	53828	53839	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91204867
27	NC_007940	GATTTT	2	12	54498	54509	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	91204869
28	NC_007940	TTAATT	2	12	54807	54818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204869
29	NC_007940	TTAAAT	2	12	56499	56510	50 %	50 %	0 %	0 %	91204870
30	NC_007940	TAAAAC	2	12	61296	61307	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	91204874
31	NC_007940	TACAAG	2	12	62901	62912	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	91204877
32	NC_007940	CAATCT	2	12	64256	64267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91204879
33	NC_007940	ATTTTC	2	12	70148	70159	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	91204884
34	NC_007940	ATGGTA	2	12	70881	70892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204885
35	NC_007940	ATATTT	2	12	70960	70971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204885
36	NC_007940	AAGATG	2	12	72731	72742	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	91204886
37	NC_007940	AGAGGC	2	12	72954	72965	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	91204886
38	NC_007940	GCGGTG	2	12	74687	74698	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	91204886
39	NC_007940	AAAAAG	2	12	75898	75909	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	91204888
40	NC_007940	AATATT	2	12	77116	77127	50 %	50 %	0 %	0 %	91204889
41	NC_007940	CCTTTA	2	12	77735	77746	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	91204889
42	NC_007940	AAGATT	2	12	87690	87701	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	91204895
43	NC_007940	TGAAAA	2	12	87860	87871	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	91204895
44	NC_007940	TAATTT	2	12	89363	89374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204895
45	NC_007940	AAGATA	2	12	91473	91484	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	91204896
46	NC_007940	CCTGAT	2	12	91817	91828	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91204896
47	NC_007940	ATTTAT	2	12	93545	93556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204897
48	NC_007940	ATTAAT	2	12	93976	93987	50 %	50 %	0 %	0 %	91204897
49	NC_007940	AGCAGT	2	12	97204	97215	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91204900
50	NC_007940	ATGCTA	2	12	98330	98341	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91204902
51	NC_007940	GCCATT	2	12	100078	100089	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007940	GCTGAA	2	12	101885	101896	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_007940	TTAACA	2	12	102279	102290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91204904
54	NC_007940	AAATAA	2	12	103410	103421	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007940	TACTGC	2	12	111246	111257	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91204913
56	NC_007940	TTATTG	2	12	114255	114266	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	91204915
57	NC_007940	TAATGC	2	12	117327	117338	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91204917
58	NC_007940	TTCATT	2	12	126527	126538	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	91204924
59	NC_007940	TTTTAA	2	12	133343	133354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007940	GTTTAT	2	12	133366	133377	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007940	TGAAAA	2	12	138172	138183	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	91204933
62	NC_007940	TCTGAT	2	12	139143	139154	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	91204935
63	NC_007940	ACAGAT	2	12	141589	141600	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	91204939
64	NC_007940	TTTCTT	2	12	144497	144508	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	91204941
65	NC_007940	TTTTAT	2	12	144511	144522	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	91204941
66	NC_007940	CTTAAA	2	12	145252	145263	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91204942
67	NC_007940	AACAAA	2	12	146653	146664	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	91204944
68	NC_007940	TAACAA	2	12	150771	150782	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	91204947
69	NC_007940	TTTATT	2	12	154521	154532	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	91204950
70	NC_007940	TTCCTG	2	12	154886	154897	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	91204950
71	NC_007940	CTTCTG	2	12	155690	155701	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	91204950
72	NC_007940	CCATAC	2	12	157621	157632	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	91204954
73	NC_007940	ATTGCT	2	12	157740	157751	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	91204954
74	NC_007940	TAAAGT	2	12	159506	159517	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	91204955
75	NC_007940	ATCTTT	2	12	163289	163300	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	91204958
76	NC_007940	ATTTAT	2	12	163881	163892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204960
77	NC_007940	AATATT	2	12	164504	164515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007940	ATTTTA	2	12	164597	164608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007940	AATATA	2	12	165317	165328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91204961
80	NC_007940	ATTTTA	2	12	166019	166030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91204962
81	NC_007940	TAACAA	2	12	166853	166864	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	91204962
82	NC_007940	ACTGGT	2	12	171541	171552	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	91204964
83	NC_007940	ACAGCA	2	12	173170	173181	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	91204964
84	NC_007940	CAACTA	2	12	174399	174410	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	91204964
85	NC_007940	CTAATG	2	12	174683	174694	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91204964
86	NC_007940	TCCCGC	2	12	176018	176029	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	91204965
87	NC_007940	TAATAT	2	12	176740	176751	50 %	50 %	0 %	0 %	91204966
88	NC_007940	ATTTTT	2	12	179499	179510	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007940	TTTTAA	2	12	187668	187679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007940	TTTGCA	2	12	188539	188550	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	91204977
91	NC_007940	ATAAAA	2	12	188925	188936	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	91204977
92	NC_007940	AAAAAT	2	12	191507	191518	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	91204978
93	NC_007940	ATCAAG	2	12	192974	192985	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	91204979
94	NC_007940	TATTCA	2	12	193711	193722	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	91204980
95	NC_007940	GAAAAA	2	12	196614	196625	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	91204982
96	NC_007940	AGAACC	2	12	197756	197767	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	91204983
97	NC_007940	GGTAAA	2	12	197886	197897	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	91204983
98	NC_007940	AAAAAG	2	12	198017	198028	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	91204983
99	NC_007940	AAAGTT	2	12	198078	198089	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	91204983
100	NC_007940	AAATAA	2	12	198583	198594	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007940	ATGATA	2	12	199369	199380	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007940	AATTAT	2	12	201210	201221	50 %	50 %	0 %	0 %	91204985
103	NC_007940	ACAACC	2	12	204344	204355	50 %	0 %	0 %	50 %	91204987
104	NC_007940	ATTTTG	2	12	205997	206008	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	91204988
105	NC_007940	TTGCTA	2	12	209336	209347	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	91204992
106	NC_007940	AATTTG	2	12	210467	210478	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	91204994
107	NC_007940	TAATAT	2	12	213347	213358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007940	ACTGCT	2	12	214986	214997	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007940	TTGCTG	2	12	215110	215121	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	91204999
110	NC_007940	GGTACA	2	12	216108	216119	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91204999
111	NC_007940	TAATCC	2	12	216164	216175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91204999
112	NC_007940	GGTAAT	2	12	216621	216632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91204999
113	NC_007940	AAAAAT	2	12	218678	218689	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	91205000
114	NC_007940	TAGAAC	2	12	219232	219243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	91205001
115	NC_007940	TGCTTC	2	12	220789	220800	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	91205002
116	NC_007940	TTAAAC	2	12	221586	221597	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91205002
117	NC_007940	TATTTT	2	12	224032	224043	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007940	ATTCTG	2	12	224895	224906	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	91205005
119	NC_007940	TTTAAG	2	12	226426	226437	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	91205006
120	NC_007940	TTGCTT	2	12	227893	227904	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	91205008
121	NC_007940	ATTAAT	2	12	233628	233639	50 %	50 %	0 %	0 %	91205012
122	NC_007940	TGTTAT	2	12	236471	236482	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	91205013
123	NC_007940	AATCAT	2	12	238054	238065	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91205015
124	NC_007940	TTTAAG	2	12	242892	242903	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	91205019
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230	NC_007940	TCAAGA	2	12	472866	472877	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	91205236
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235	NC_007940	TAAGGC	2	12	484717	484728	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91205243
236	NC_007940	CTCCTT	2	12	485397	485408	0 %	50 %	0 %	50 %	91205243
237	NC_007940	ATGCAT	2	12	485506	485517	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91205243
238	NC_007940	TACCGG	2	12	491918	491929	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	91205249
239	NC_007940	TTTTAG	2	12	492632	492643	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	91205249
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241	NC_007940	AATCAT	2	12	495412	495423	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91205254
242	NC_007940	AAGATC	2	12	496028	496039	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	91205254
243	NC_007940	TCTGCA	2	12	498842	498853	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91205256
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353	NC_007940	TTAAAA	2	12	744990	745001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
354	NC_007940	GAAATA	2	12	759174	759185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	91205495
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