MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia bellii RML369-C chromosome

Total Repeats: 319

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007940	GCAAG	2	10	6481	6490	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007940	ATTAT	2	10	8673	8682	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007940	ATTAT	2	10	9825	9834	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007940	ATCTT	2	10	20599	20608	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007940	TTATA	2	10	20641	20650	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007940	AAGAA	2	10	21609	21618	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007940	ATATA	2	10	21623	21632	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007940	AATTT	2	10	31999	32008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007940	GAGTA	2	10	35487	35496	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007940	TATAA	2	10	38624	38633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007940	AAATA	2	10	61035	61044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007940	TTAAA	2	10	74795	74804	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007940	CGTTC	2	10	89790	89799	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_007940	ATTAT	2	10	109807	109816	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007940	AGTCA	2	10	110274	110283	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007940	ATGAA	2	10	114406	114415	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007940	ATAAA	2	10	119313	119322	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007940	ATTAT	2	10	128210	128219	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007940	ATTAT	2	10	129942	129951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007940	ATTTT	2	10	137145	137154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007940	AATTA	2	10	139004	139013	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007940	CAAAT	2	10	139042	139051	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007940	TAAGC	2	10	142761	142770	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007940	AATTT	2	10	144969	144978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007940	AGTTT	2	10	150995	151004	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007940	TCATT	2	10	158871	158880	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007940	TTATA	2	10	159994	160003	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007940	ATAAA	2	10	162831	162840	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007940	ATTAC	2	10	169399	169408	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_007940	AAGAA	2	10	182259	182268	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007940	ATATA	2	10	182273	182282	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007940	AATGA	2	10	186718	186727	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007940	AACAA	2	10	204038	204047	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007940	GAACT	2	10	205650	205659	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007940	ACTTA	2	10	210792	210801	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007940	ATATA	2	10	210947	210956	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007940	TTATT	2	10	226928	226937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007940	ATTAT	2	10	239967	239976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007940	AAGAA	2	10	241119	241128	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007940	ATATA	2	10	241133	241142	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007940	AAATT	2	10	245123	245132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007940	TAAAA	2	10	245911	245920	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007940	CGCTC	2	10	251230	251239	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_007940	TGTAT	2	10	251297	251306	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007940	TAGCA	2	10	252940	252949	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007940	TTATA	2	10	254544	254553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007940	ATTAT	2	10	255872	255881	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007940	ATTAT	2	10	258207	258216	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007940	GTATC	2	10	258406	258415	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007940	TACAA	2	10	261299	261308	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_007940	TTATA	2	10	278827	278836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007940	TTAAA	2	10	288265	288274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007940	AAGAA	2	10	297599	297608	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007940	ATATA	2	10	297613	297622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007940	CTAAT	2	10	314156	314165	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007940	AAGAA	2	10	316248	316257	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007940	ATATA	2	10	316262	316271	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007940	AAGAA	2	10	325967	325976	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007940	ATATA	2	10	325981	325990	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007940	TCATT	2	10	354793	354802	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007940	GATAG	2	10	362658	362667	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007940	TATAG	2	10	368660	368669	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007940	AAGAA	2	10	368906	368915	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007940	ATATA	2	10	368920	368929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007940	ACATA	2	10	370863	370872	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_007940	ATTAA	2	10	374489	374498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007940	ATTAA	2	10	378716	378725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007940	AAGAA	2	10	380255	380264	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007940	ATATA	2	10	380269	380278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007940	TTAAC	2	10	381616	381625	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007940	AATTT	2	10	386974	386983	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007940	TCAAT	2	10	390036	390045	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_007940	TTAAT	2	10	392858	392867	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007940	TAAAA	2	10	393358	393367	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007940	TCGCT	2	10	402986	402995	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_007940	TCATT	2	10	403201	403210	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007940	ATATT	2	10	403707	403716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007940	TTATT	2	10	408595	408604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007940	TTAAA	2	10	408729	408738	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007940	TCTAT	2	10	417455	417464	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_007940	AAAAC	2	10	417633	417642	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_007940	TAGCA	2	10	419134	419143	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_007940	ATCCC	2	10	421300	421309	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
84	NC_007940	TGCAA	2	10	421385	421394	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_007940	CGCTC	2	10	422619	422628	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_007940	GCTTG	2	10	423622	423631	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_007940	AATTT	2	10	424309	424318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007940	TAATA	2	10	428844	428853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007940	AAATT	2	10	431897	431906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007940	AAACC	2	10	450639	450648	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_007940	TGTGT	2	10	455800	455809	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007940	TTAAA	2	10	462802	462811	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007940	AAAGT	2	10	468860	468869	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007940	TAATG	2	10	470627	470636	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007940	AGTGT	2	10	474817	474826	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007940	TGCTT	2	10	487769	487778	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007940	CATAG	2	10	488739	488748	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_007940	CAATT	2	10	494977	494986	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_007940	TTAAG	2	10	500033	500042	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007940	ATTTT	2	10	500058	500067	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007940	TAAAT	2	10	503084	503093	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007940	ATTTA	2	10	505317	505326	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007940	TTAAT	2	10	505589	505598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007940	TAAAA	2	10	506086	506095	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007940	AAGTG	2	10	506185	506194	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007940	GATAT	2	10	509793	509802	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007940	GAATA	2	10	510707	510716	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007940	ATTAT	2	10	527365	527374	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007940	AAAAT	2	10	527944	527953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007940	TAAAA	2	10	537597	537606	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007940	TCGTG	2	10	538833	538842	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007940	AAGAA	2	10	539704	539713	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007940	ATATA	2	10	539718	539727	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007940	TCATT	2	10	541693	541702	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_007940	ATATA	2	10	546711	546720	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007940	TATAA	2	10	550080	550089	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007940	TTTTA	2	10	559580	559589	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007940	AATCG	2	10	564751	564760	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_007940	ACTTT	2	10	566923	566932	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_007940	CGCTC	2	10	571682	571691	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_007940	AAATG	2	10	584239	584248	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007940	TAATA	2	10	590512	590521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007940	TTTAA	2	10	600122	600131	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007940	AAACA	2	10	602168	602177	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_007940	TTATA	2	10	608719	608728	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007940	TAATT	2	10	609006	609015	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007940	TAGTT	2	10	616454	616463	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007940	TCAAA	2	10	617451	617460	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007940	CGCTC	2	10	619629	619638	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_007940	AGAAA	2	10	625920	625929	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007940	AATTT	2	10	626105	626114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007940	TGTTT	2	10	639306	639315	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007940	GCCTT	2	10	640125	640134	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_007940	ATTTT	2	10	653729	653738	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007940	TTTCT	2	10	655196	655205	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_007940	TAATA	2	10	655284	655293	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007940	TGATT	2	10	655370	655379	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007940	AGTTT	2	10	667448	667457	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007940	TTATC	2	10	668628	668637	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007940	ATATT	2	10	671017	671026	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007940	ATTTT	2	10	672907	672916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007940	CTTGG	2	10	697749	697758	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_007940	ATTTA	2	10	700310	700319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007940	GAAAA	2	10	700456	700465	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007940	TTTTC	2	10	713551	713560	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_007940	TTTTG	2	10	713719	713728	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007940	AATTT	2	10	745177	745186	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007940	TAAAC	2	10	746592	746601	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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291	NC_007940	TAAAA	2	10	1379017	1379026	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_007940	TCATT	2	10	1379306	1379315	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
293	NC_007940	AAATG	2	10	1386737	1386746	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
294	NC_007940	ATAAA	2	10	1388029	1388038	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_007940	TAAAA	2	10	1389527	1389536	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_007940	TAATT	2	10	1395942	1395951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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319	NC_007940	TAAAA	2	10	1516305	1516314	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.