MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia bellii RML369-C chromosome

Total Repeats: 1167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007940	GTATT	2	10	176	185	20 %	60 %	20 %	0 %	91204816
2	NC_007940	ATATT	2	10	431	440	40 %	60 %	0 %	0 %	91204816
3	NC_007940	AAAGT	2	10	1033	1042	60 %	20 %	20 %	0 %	91204817
4	NC_007940	AACAG	2	10	1609	1618	60 %	0 %	20 %	20 %	91204818
5	NC_007940	TTGTT	2	10	2308	2317	0 %	80 %	20 %	0 %	91204819
6	NC_007940	TATTC	2	10	2874	2883	20 %	60 %	0 %	20 %	91204820
7	NC_007940	TTTAA	2	10	3780	3789	40 %	60 %	0 %	0 %	91204820
8	NC_007940	TAAAT	2	10	4817	4826	60 %	40 %	0 %	0 %	91204820
9	NC_007940	GTAGT	2	10	5158	5167	20 %	40 %	40 %	0 %	91204820
10	NC_007940	ATGCA	2	10	5817	5826	40 %	20 %	20 %	20 %	91204820
11	NC_007940	CAGAA	2	10	6588	6597	60 %	0 %	20 %	20 %	91204822
12	NC_007940	TTTCA	2	10	8431	8440	20 %	60 %	0 %	20 %	91204823
13	NC_007940	TTTAA	2	10	11847	11856	40 %	60 %	0 %	0 %	91204827
14	NC_007940	ATCTA	2	10	14196	14205	40 %	40 %	0 %	20 %	91204830
15	NC_007940	TACTC	2	10	15312	15321	20 %	40 %	0 %	40 %	91204831
16	NC_007940	TTGGG	2	10	16183	16192	0 %	40 %	60 %	0 %	91204832
17	NC_007940	AAATA	2	10	16414	16423	80 %	20 %	0 %	0 %	91204832
18	NC_007940	ACTTA	2	10	17284	17293	40 %	40 %	0 %	20 %	91204832
19	NC_007940	ATATA	2	10	17587	17596	60 %	40 %	0 %	0 %	91204833
20	NC_007940	ACTAA	2	10	20480	20489	60 %	20 %	0 %	20 %	91204836
21	NC_007940	GGTTA	2	10	21174	21183	20 %	40 %	40 %	0 %	91204837
22	NC_007940	TAAGA	2	10	21220	21229	60 %	20 %	20 %	0 %	91204837
23	NC_007940	CAAAA	2	10	22222	22231	80 %	0 %	0 %	20 %	91204838
24	NC_007940	AAAGC	2	10	22428	22437	60 %	0 %	20 %	20 %	91204838
25	NC_007940	TTTAA	2	10	22791	22800	40 %	60 %	0 %	0 %	91204838
26	NC_007940	TATGG	2	10	23852	23861	20 %	40 %	40 %	0 %	91204839
27	NC_007940	TAAAC	2	10	26992	27001	60 %	20 %	0 %	20 %	91204843
28	NC_007940	ATTTA	2	10	27508	27517	40 %	60 %	0 %	0 %	91204843
29	NC_007940	GATGA	2	10	30664	30673	40 %	20 %	40 %	0 %	91204845
30	NC_007940	CTTAT	2	10	30773	30782	20 %	60 %	0 %	20 %	91204845
31	NC_007940	AACTC	2	10	31348	31357	40 %	20 %	0 %	40 %	91204846
32	NC_007940	GTATG	2	10	34472	34481	20 %	40 %	40 %	0 %	91204849
33	NC_007940	TATTT	2	10	36081	36090	20 %	80 %	0 %	0 %	91204850
34	NC_007940	TAATT	2	10	39348	39357	40 %	60 %	0 %	0 %	91204853
35	NC_007940	TAATT	2	10	39543	39552	40 %	60 %	0 %	0 %	91204853
36	NC_007940	ATAAA	2	10	40052	40061	80 %	20 %	0 %	0 %	91204853
37	NC_007940	ATTTT	2	10	40463	40472	20 %	80 %	0 %	0 %	91204853
38	NC_007940	ATTTA	2	10	41688	41697	40 %	60 %	0 %	0 %	91204853
39	NC_007940	GTTTA	2	10	43123	43132	20 %	60 %	20 %	0 %	91204854
40	NC_007940	AGATT	2	10	43450	43459	40 %	40 %	20 %	0 %	91204855
41	NC_007940	TAATA	2	10	48513	48522	60 %	40 %	0 %	0 %	91204860
42	NC_007940	CTGCT	2	10	49887	49896	0 %	40 %	20 %	40 %	91204862
43	NC_007940	ACAAG	2	10	50416	50425	60 %	0 %	20 %	20 %	91204862
44	NC_007940	TAAAA	2	10	52926	52935	80 %	20 %	0 %	0 %	91204866
45	NC_007940	ATTAT	2	10	55986	55995	40 %	60 %	0 %	0 %	91204870
46	NC_007940	GAAAA	2	10	56070	56079	80 %	0 %	20 %	0 %	91204870
47	NC_007940	AAAAC	2	10	59303	59312	80 %	0 %	0 %	20 %	91204872
48	NC_007940	AAATG	2	10	59986	59995	60 %	20 %	20 %	0 %	91204872
49	NC_007940	ATGGA	2	10	60448	60457	40 %	20 %	40 %	0 %	91204872
50	NC_007940	CTTTT	2	10	63909	63918	0 %	80 %	0 %	20 %	91204878
51	NC_007940	TTTTA	2	10	65172	65181	20 %	80 %	0 %	0 %	91204880
52	NC_007940	TTTAT	2	10	65821	65830	20 %	80 %	0 %	0 %	91204880
53	NC_007940	TATAA	2	10	67233	67242	60 %	40 %	0 %	0 %	91204881
54	NC_007940	TTATC	2	10	68695	68704	20 %	60 %	0 %	20 %	91204882
55	NC_007940	ATATT	2	10	68959	68968	40 %	60 %	0 %	0 %	91204882
56	NC_007940	TTCTT	2	10	69508	69517	0 %	80 %	0 %	20 %	91204883
57	NC_007940	TTTTA	2	10	70250	70259	20 %	80 %	0 %	0 %	91204884
58	NC_007940	ATTAT	2	10	71471	71480	40 %	60 %	0 %	0 %	91204885
59	NC_007940	TGGTA	2	10	72282	72291	20 %	40 %	40 %	0 %	91204886
60	NC_007940	CTTGG	2	10	73454	73463	0 %	40 %	40 %	20 %	91204886
61	NC_007940	ATTTT	2	10	75181	75190	20 %	80 %	0 %	0 %	91204887
62	NC_007940	AGGAA	2	10	75833	75842	60 %	0 %	40 %	0 %	91204888
63	NC_007940	TATCT	2	10	80136	80145	20 %	60 %	0 %	20 %	91204890
64	NC_007940	ACGAT	2	10	80539	80548	40 %	20 %	20 %	20 %	91204890
65	NC_007940	TTGAT	2	10	80675	80684	20 %	60 %	20 %	0 %	91204890
66	NC_007940	AGTTT	2	10	80884	80893	20 %	60 %	20 %	0 %	91204890
67	NC_007940	AGTAA	2	10	81715	81724	60 %	20 %	20 %	0 %	91204891
68	NC_007940	TAAAA	2	10	82485	82494	80 %	20 %	0 %	0 %	91204891
69	NC_007940	GTAAT	2	10	82955	82964	40 %	40 %	20 %	0 %	91204891
70	NC_007940	TTTAA	2	10	83726	83735	40 %	60 %	0 %	0 %	91204892
71	NC_007940	CTAAT	2	10	85834	85843	40 %	40 %	0 %	20 %	91204894
72	NC_007940	GTAAA	2	10	85864	85873	60 %	20 %	20 %	0 %	91204894
73	NC_007940	TTTTA	2	10	88817	88826	20 %	80 %	0 %	0 %	91204895
74	NC_007940	CTTGC	2	10	91015	91024	0 %	40 %	20 %	40 %	91204896
75	NC_007940	CTTTA	2	10	91507	91516	20 %	60 %	0 %	20 %	91204896
76	NC_007940	ATTTT	2	10	92955	92964	20 %	80 %	0 %	0 %	91204896
77	NC_007940	TAATT	2	10	95490	95499	40 %	60 %	0 %	0 %	91204899
78	NC_007940	TAAAT	2	10	96489	96498	60 %	40 %	0 %	0 %	91204899
79	NC_007940	TTATT	2	10	97473	97482	20 %	80 %	0 %	0 %	91204900
80	NC_007940	CTTTC	2	10	98304	98313	0 %	60 %	0 %	40 %	91204902
81	NC_007940	ACTAG	2	10	99284	99293	40 %	20 %	20 %	20 %	91204902
82	NC_007940	TTACT	2	10	99604	99613	20 %	60 %	0 %	20 %	91204902
83	NC_007940	TTTAT	2	10	99691	99700	20 %	80 %	0 %	0 %	91204902
84	NC_007940	GAATA	2	10	100615	100624	60 %	20 %	20 %	0 %	91204903
85	NC_007940	AAATG	2	10	103150	103159	60 %	20 %	20 %	0 %	91204905
86	NC_007940	TAAAA	2	10	103803	103812	80 %	20 %	0 %	0 %	91204906
87	NC_007940	GCTAA	2	10	104110	104119	40 %	20 %	20 %	20 %	91204906
88	NC_007940	AAGAT	2	10	104883	104892	60 %	20 %	20 %	0 %	91204907
89	NC_007940	TGCTT	2	10	105774	105783	0 %	60 %	20 %	20 %	91204908
90	NC_007940	TGAAA	2	10	105858	105867	60 %	20 %	20 %	0 %	91204908
91	NC_007940	GCAAT	2	10	107240	107249	40 %	20 %	20 %	20 %	91204910
92	NC_007940	CTTAT	2	10	110010	110019	20 %	60 %	0 %	20 %	91204912
93	NC_007940	CAAAA	2	10	110654	110663	80 %	0 %	0 %	20 %	91204913
94	NC_007940	TAGTT	2	10	111084	111093	20 %	60 %	20 %	0 %	91204913
95	NC_007940	TATTT	2	10	114278	114287	20 %	80 %	0 %	0 %	91204915
96	NC_007940	TGCGT	2	10	116834	116843	0 %	40 %	40 %	20 %	91204917
97	NC_007940	AAAGC	2	10	119803	119812	60 %	0 %	20 %	20 %	91204920
98	NC_007940	GTAAT	2	10	120098	120107	40 %	40 %	20 %	0 %	91204920
99	NC_007940	ATTTT	2	10	121234	121243	20 %	80 %	0 %	0 %	91204921
100	NC_007940	ATAGA	2	10	124011	124020	60 %	20 %	20 %	0 %	91204923
101	NC_007940	CATTT	2	10	124521	124530	20 %	60 %	0 %	20 %	91204923
102	NC_007940	GTTTC	2	10	126634	126643	0 %	60 %	20 %	20 %	91204924
103	NC_007940	TCACT	2	10	126946	126955	20 %	40 %	0 %	40 %	91204924
104	NC_007940	ATTAT	2	10	127092	127101	40 %	60 %	0 %	0 %	91204924
105	NC_007940	TGATC	2	10	128553	128562	20 %	40 %	20 %	20 %	91204926
106	NC_007940	TTTTA	2	10	130320	130329	20 %	80 %	0 %	0 %	91204927
107	NC_007940	GTAAA	2	10	130419	130428	60 %	20 %	20 %	0 %	91204927
108	NC_007940	ATTAT	2	10	131107	131116	40 %	60 %	0 %	0 %	91204927
109	NC_007940	TTGTA	2	10	131380	131389	20 %	60 %	20 %	0 %	91204928
110	NC_007940	TGATT	2	10	131445	131454	20 %	60 %	20 %	0 %	91204928
111	NC_007940	ATCGC	2	10	133913	133922	20 %	20 %	20 %	40 %	91204929
112	NC_007940	TTTGG	2	10	136353	136362	0 %	60 %	40 %	0 %	91204932
113	NC_007940	GGCAA	2	10	137998	138007	40 %	0 %	40 %	20 %	91204933
114	NC_007940	CGCTC	2	10	138329	138338	0 %	20 %	20 %	60 %	91204934
115	NC_007940	TAACA	2	10	140591	140600	60 %	20 %	0 %	20 %	91204938
116	NC_007940	GATCA	2	10	140826	140835	40 %	20 %	20 %	20 %	91204938
117	NC_007940	TAAAT	2	10	142452	142461	60 %	40 %	0 %	0 %	91204939
118	NC_007940	AACTA	2	10	145541	145550	60 %	20 %	0 %	20 %	91204943
119	NC_007940	ATTAT	2	10	147891	147900	40 %	60 %	0 %	0 %	91204945
120	NC_007940	TATAT	2	10	147995	148004	40 %	60 %	0 %	0 %	91204945
121	NC_007940	ATTTA	2	10	149811	149820	40 %	60 %	0 %	0 %	91204946
122	NC_007940	TAACT	2	10	153807	153816	40 %	40 %	0 %	20 %	91204950
123	NC_007940	TTTTC	2	10	155083	155092	0 %	80 %	0 %	20 %	91204950
124	NC_007940	ACTTT	2	10	155743	155752	20 %	60 %	0 %	20 %	91204950
125	NC_007940	CATTT	2	10	157782	157791	20 %	60 %	0 %	20 %	91204954
126	NC_007940	AGAGT	2	10	159063	159072	40 %	20 %	40 %	0 %	91204955
127	NC_007940	TTTAT	2	10	160927	160936	20 %	80 %	0 %	0 %	91204956
128	NC_007940	GTTCT	2	10	161264	161273	0 %	60 %	20 %	20 %	91204956
129	NC_007940	TATAT	2	10	163986	163995	40 %	60 %	0 %	0 %	91204960
130	NC_007940	GTCAA	2	10	164637	164646	40 %	20 %	20 %	20 %	91204961
131	NC_007940	GCGGG	2	10	164786	164795	0 %	0 %	80 %	20 %	91204961
132	NC_007940	AGTCT	2	10	166340	166349	20 %	40 %	20 %	20 %	91204962
133	NC_007940	TAAAT	2	10	166497	166506	60 %	40 %	0 %	0 %	91204962
134	NC_007940	TACAG	2	10	169788	169797	40 %	20 %	20 %	20 %	91204964
135	NC_007940	CCGAT	2	10	169835	169844	20 %	20 %	20 %	40 %	91204964
136	NC_007940	AGCAA	2	10	170032	170041	60 %	0 %	20 %	20 %	91204964
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138	NC_007940	CAACT	2	10	175224	175233	40 %	20 %	0 %	40 %	91204964
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