MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pMP118

Total Repeats: 209

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007930	AAAGA	2	10	1163	1172	80 %	0 %	20 %	0 %	90962710
2	NC_007930	ATTTG	2	10	2822	2831	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007930	TAAAT	2	10	4182	4191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007930	AATAT	2	10	5055	5064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007930	ACAAA	2	10	6156	6165	80 %	0 %	0 %	20 %	90962712
6	NC_007930	CTATA	2	10	6879	6888	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007930	TTTTC	2	10	11204	11213	0 %	80 %	0 %	20 %	90962715
8	NC_007930	TTCAT	2	10	12210	12219	20 %	60 %	0 %	20 %	90962716
9	NC_007930	CTAAG	2	10	14075	14084	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007930	GAATA	2	10	15306	15315	60 %	20 %	20 %	0 %	90962718
11	NC_007930	TAAGA	2	10	16489	16498	60 %	20 %	20 %	0 %	90962720
12	NC_007930	AAAAG	2	10	17944	17953	80 %	0 %	20 %	0 %	90962721
13	NC_007930	AATGA	2	10	20093	20102	60 %	20 %	20 %	0 %	90962722
14	NC_007930	AAGTA	2	10	20533	20542	60 %	20 %	20 %	0 %	90962724
15	NC_007930	ACTTT	2	10	20874	20883	20 %	60 %	0 %	20 %	90962724
16	NC_007930	TGTAA	2	10	21829	21838	40 %	40 %	20 %	0 %	90962725
17	NC_007930	ATCAA	2	10	25298	25307	60 %	20 %	0 %	20 %	90962727
18	NC_007930	TTGAA	2	10	29324	29333	40 %	40 %	20 %	0 %	90962731
19	NC_007930	ATTCT	2	10	29731	29740	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007930	GTTCT	2	10	31726	31735	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007930	AAAGT	2	10	32299	32308	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007930	TTTGG	2	10	32858	32867	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007930	AAAGA	2	10	34185	34194	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007930	AAAGT	2	10	34204	34213	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007930	AAAAT	2	10	36217	36226	80 %	20 %	0 %	0 %	90962732
26	NC_007930	TTATT	2	10	36580	36589	20 %	80 %	0 %	0 %	90962732
27	NC_007930	ATAAA	2	10	38344	38353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007930	TAAAG	2	10	41798	41807	60 %	20 %	20 %	0 %	90962734
29	NC_007930	ATATA	2	10	42143	42152	60 %	40 %	0 %	0 %	90962735
30	NC_007930	AAGAA	2	10	42809	42818	80 %	0 %	20 %	0 %	90962735
31	NC_007930	CAAAA	2	10	43369	43378	80 %	0 %	0 %	20 %	90962735
32	NC_007930	TGATG	2	10	47470	47479	20 %	40 %	40 %	0 %	90962737
33	NC_007930	ATTTA	2	10	48856	48865	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007930	GATAA	2	10	48900	48909	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007930	TTTAG	2	10	49264	49273	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007930	AACAA	2	10	49304	49313	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007930	ATTTT	2	10	50748	50757	20 %	80 %	0 %	0 %	90962740
38	NC_007930	AAGAT	2	10	52406	52415	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007930	CAAAC	2	10	53416	53425	60 %	0 %	0 %	40 %	90962743
40	NC_007930	AAAAT	2	10	54953	54962	80 %	20 %	0 %	0 %	90962745
41	NC_007930	GCAAT	2	10	58144	58153	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007930	CTTCT	2	10	58205	58214	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_007930	TTGAC	2	10	61140	61149	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007930	TAAAA	2	10	62722	62731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007930	AAATA	2	10	62775	62784	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007930	ATTAT	2	10	63458	63467	40 %	60 %	0 %	0 %	90962751
47	NC_007930	TTTTA	2	10	64141	64150	20 %	80 %	0 %	0 %	90962752
48	NC_007930	AAGTT	2	10	64415	64424	40 %	40 %	20 %	0 %	90962753
49	NC_007930	AACAG	2	10	65308	65317	60 %	0 %	20 %	20 %	90962753
50	NC_007930	TACAT	2	10	66009	66018	40 %	40 %	0 %	20 %	90962754
51	NC_007930	GTTTT	2	10	67078	67087	0 %	80 %	20 %	0 %	90962755
52	NC_007930	ATAAA	2	10	68834	68843	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007930	TTGTC	2	10	68897	68906	0 %	60 %	20 %	20 %	90962756
54	NC_007930	AAATT	2	10	69395	69404	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007930	AATAT	2	10	72583	72592	60 %	40 %	0 %	0 %	90962760
56	NC_007930	ATAAA	2	10	72999	73008	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007930	AGTAA	2	10	73532	73541	60 %	20 %	20 %	0 %	90962761
58	NC_007930	GGAAT	2	10	74694	74703	40 %	20 %	40 %	0 %	90962762
59	NC_007930	AATTC	2	10	75947	75956	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_007930	ATTTT	2	10	76312	76321	20 %	80 %	0 %	0 %	90962763
61	NC_007930	AATTG	2	10	77859	77868	40 %	40 %	20 %	0 %	90962764
62	NC_007930	AAATT	2	10	81942	81951	60 %	40 %	0 %	0 %	90962768
63	NC_007930	AAGAT	2	10	83006	83015	60 %	20 %	20 %	0 %	90962769
64	NC_007930	AATGA	2	10	83387	83396	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007930	AAACT	2	10	83965	83974	60 %	20 %	0 %	20 %	90962771
66	NC_007930	AGATT	2	10	87441	87450	40 %	40 %	20 %	0 %	90962776
67	NC_007930	CATTG	2	10	88805	88814	20 %	40 %	20 %	20 %	90962777
68	NC_007930	ATTGA	2	10	89747	89756	40 %	40 %	20 %	0 %	90962778
69	NC_007930	ATTTT	2	10	92564	92573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007930	TTCAT	2	10	93709	93718	20 %	60 %	0 %	20 %	90962782
71	NC_007930	TAGTT	2	10	96749	96758	20 %	60 %	20 %	0 %	90962786
72	NC_007930	ATCTT	2	10	98328	98337	20 %	60 %	0 %	20 %	90962786
73	NC_007930	TTTGA	2	10	99974	99983	20 %	60 %	20 %	0 %	90962789
74	NC_007930	CCATA	2	10	100166	100175	40 %	20 %	0 %	40 %	90962789
75	NC_007930	ACTTA	2	10	100815	100824	40 %	40 %	0 %	20 %	90962789
76	NC_007930	ATATC	2	10	101077	101086	40 %	40 %	0 %	20 %	90962789
77	NC_007930	TTGAT	2	10	102375	102384	20 %	60 %	20 %	0 %	90962790
78	NC_007930	AACTA	2	10	102589	102598	60 %	20 %	0 %	20 %	90962790
79	NC_007930	TATTT	2	10	104827	104836	20 %	80 %	0 %	0 %	90962790
80	NC_007930	TTAAT	2	10	105905	105914	40 %	60 %	0 %	0 %	90962791
81	NC_007930	TCTCC	2	10	106287	106296	0 %	40 %	0 %	60 %	90962791
82	NC_007930	CTCTT	2	10	107193	107202	0 %	60 %	0 %	40 %	90962791
83	NC_007930	TTTCT	2	10	108092	108101	0 %	80 %	0 %	20 %	90962793
84	NC_007930	CTCAC	2	10	110018	110027	20 %	20 %	0 %	60 %	90962795
85	NC_007930	TTTGA	2	10	111194	111203	20 %	60 %	20 %	0 %	90962797
86	NC_007930	TAATT	2	10	112088	112097	40 %	60 %	0 %	0 %	90962797
87	NC_007930	CTTTT	2	10	113254	113263	0 %	80 %	0 %	20 %	90962797
88	NC_007930	AATAT	2	10	115170	115179	60 %	40 %	0 %	0 %	90962799
89	NC_007930	ATTTG	2	10	119824	119833	20 %	60 %	20 %	0 %	90962802
90	NC_007930	TTTTC	2	10	119902	119911	0 %	80 %	0 %	20 %	90962802
91	NC_007930	TCTTT	2	10	121223	121232	0 %	80 %	0 %	20 %	90962803
92	NC_007930	TGGAT	2	10	123290	123299	20 %	40 %	40 %	0 %	90962805
93	NC_007930	ATGTC	2	10	124167	124176	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_007930	AAATG	2	10	125483	125492	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007930	GTATG	2	10	126902	126911	20 %	40 %	40 %	0 %	90962806
96	NC_007930	AAAAG	2	10	127113	127122	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007930	TATTT	2	10	128992	129001	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007930	TCATA	2	10	129929	129938	40 %	40 %	0 %	20 %	90962807
99	NC_007930	TCTCT	2	10	130122	130131	0 %	60 %	0 %	40 %	90962808
100	NC_007930	TAATA	2	10	131437	131446	60 %	40 %	0 %	0 %	90962809
101	NC_007930	TTTGT	2	10	134257	134266	0 %	80 %	20 %	0 %	90962812
102	NC_007930	TAAAA	2	10	135374	135383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007930	AAATA	2	10	136556	136565	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007930	TAAAA	2	10	138065	138074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007930	TTTTC	2	10	139562	139571	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_007930	ACTTA	2	10	140880	140889	40 %	40 %	0 %	20 %	90962820
107	NC_007930	ATTAA	2	10	141028	141037	60 %	40 %	0 %	0 %	90962820
108	NC_007930	ATTTT	2	10	141563	141572	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007930	TGATA	2	10	143769	143778	40 %	40 %	20 %	0 %	90962824
110	NC_007930	TGATC	2	10	144943	144952	20 %	40 %	20 %	20 %	90962826
111	NC_007930	TCAAT	2	10	145099	145108	40 %	40 %	0 %	20 %	90962827
112	NC_007930	TCTTT	2	10	146740	146749	0 %	80 %	0 %	20 %	90962829
113	NC_007930	CTTTT	2	10	146859	146868	0 %	80 %	0 %	20 %	90962830
114	NC_007930	ATCAC	2	10	147303	147312	40 %	20 %	0 %	40 %	90962831
115	NC_007930	TCTTT	2	10	148395	148404	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_007930	AATTT	2	10	148810	148819	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007930	GTTGA	2	10	148940	148949	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007930	ATTTT	2	10	149485	149494	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007930	TAAAT	2	10	149592	149601	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007930	TGTTT	2	10	149859	149868	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007930	TTTAC	2	10	150223	150232	20 %	60 %	0 %	20 %	90962833
122	NC_007930	ATTTA	2	10	150881	150890	40 %	60 %	0 %	0 %	90962835
123	NC_007930	TATAA	2	10	151150	151159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007930	ACATT	2	10	151411	151420	40 %	40 %	0 %	20 %	90962836
125	NC_007930	ATTAA	2	10	152516	152525	60 %	40 %	0 %	0 %	90962837
126	NC_007930	TGTCT	2	10	152976	152985	0 %	60 %	20 %	20 %	90962837
127	NC_007930	ATTTT	2	10	154677	154686	20 %	80 %	0 %	0 %	90962841
128	NC_007930	CCGTA	2	10	155944	155953	20 %	20 %	20 %	40 %	90962841
129	NC_007930	GCAAA	2	10	157042	157051	60 %	0 %	20 %	20 %	90962841
130	NC_007930	ATTGT	20	100	157416	157515	20 %	60 %	20 %	0 %	90962842
131	NC_007930	AATTC	2	10	157994	158003	40 %	40 %	0 %	20 %	90962843
132	NC_007930	TTTTA	2	10	159783	159792	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007930	TTATA	2	10	159943	159952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007930	ATTAA	2	10	160410	160419	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007930	TTTTA	2	10	161594	161603	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007930	TCCAT	2	10	163291	163300	20 %	40 %	0 %	40 %	90962848
137	NC_007930	ATACA	2	10	163415	163424	60 %	20 %	0 %	20 %	90962848
138	NC_007930	GTAAT	2	10	163627	163636	40 %	40 %	20 %	0 %	90962848
139	NC_007930	TTTGA	2	10	164063	164072	20 %	60 %	20 %	0 %	90962848
140	NC_007930	TTAAA	2	10	164813	164822	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007930	ATTTT	2	10	164981	164990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007930	AAAAC	2	10	165270	165279	80 %	0 %	0 %	20 %	90962849
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.