MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pMP118

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007930	AAAGA	2	10	1163	1172	80 %	0 %	20 %	0 %	90962710
2	NC_007930	ACAAA	2	10	6156	6165	80 %	0 %	0 %	20 %	90962712
3	NC_007930	TTTTC	2	10	11204	11213	0 %	80 %	0 %	20 %	90962715
4	NC_007930	TTCAT	2	10	12210	12219	20 %	60 %	0 %	20 %	90962716
5	NC_007930	GAATA	2	10	15306	15315	60 %	20 %	20 %	0 %	90962718
6	NC_007930	TAAGA	2	10	16489	16498	60 %	20 %	20 %	0 %	90962720
7	NC_007930	AAAAG	2	10	17944	17953	80 %	0 %	20 %	0 %	90962721
8	NC_007930	AATGA	2	10	20093	20102	60 %	20 %	20 %	0 %	90962722
9	NC_007930	AAGTA	2	10	20533	20542	60 %	20 %	20 %	0 %	90962724
10	NC_007930	ACTTT	2	10	20874	20883	20 %	60 %	0 %	20 %	90962724
11	NC_007930	TGTAA	2	10	21829	21838	40 %	40 %	20 %	0 %	90962725
12	NC_007930	ATCAA	2	10	25298	25307	60 %	20 %	0 %	20 %	90962727
13	NC_007930	TTGAA	2	10	29324	29333	40 %	40 %	20 %	0 %	90962731
14	NC_007930	AAAAT	2	10	36217	36226	80 %	20 %	0 %	0 %	90962732
15	NC_007930	TTATT	2	10	36580	36589	20 %	80 %	0 %	0 %	90962732
16	NC_007930	TAAAG	2	10	41798	41807	60 %	20 %	20 %	0 %	90962734
17	NC_007930	ATATA	2	10	42143	42152	60 %	40 %	0 %	0 %	90962735
18	NC_007930	AAGAA	2	10	42809	42818	80 %	0 %	20 %	0 %	90962735
19	NC_007930	CAAAA	2	10	43369	43378	80 %	0 %	0 %	20 %	90962735
20	NC_007930	TGATG	2	10	47470	47479	20 %	40 %	40 %	0 %	90962737
21	NC_007930	ATTTT	2	10	50748	50757	20 %	80 %	0 %	0 %	90962740
22	NC_007930	CAAAC	2	10	53416	53425	60 %	0 %	0 %	40 %	90962743
23	NC_007930	AAAAT	2	10	54953	54962	80 %	20 %	0 %	0 %	90962745
24	NC_007930	ATTAT	2	10	63458	63467	40 %	60 %	0 %	0 %	90962751
25	NC_007930	TTTTA	2	10	64141	64150	20 %	80 %	0 %	0 %	90962752
26	NC_007930	AAGTT	2	10	64415	64424	40 %	40 %	20 %	0 %	90962753
27	NC_007930	AACAG	2	10	65308	65317	60 %	0 %	20 %	20 %	90962753
28	NC_007930	TACAT	2	10	66009	66018	40 %	40 %	0 %	20 %	90962754
29	NC_007930	GTTTT	2	10	67078	67087	0 %	80 %	20 %	0 %	90962755
30	NC_007930	TTGTC	2	10	68897	68906	0 %	60 %	20 %	20 %	90962756
31	NC_007930	AATAT	2	10	72583	72592	60 %	40 %	0 %	0 %	90962760
32	NC_007930	AGTAA	2	10	73532	73541	60 %	20 %	20 %	0 %	90962761
33	NC_007930	GGAAT	2	10	74694	74703	40 %	20 %	40 %	0 %	90962762
34	NC_007930	ATTTT	2	10	76312	76321	20 %	80 %	0 %	0 %	90962763
35	NC_007930	AATTG	2	10	77859	77868	40 %	40 %	20 %	0 %	90962764
36	NC_007930	AAATT	2	10	81942	81951	60 %	40 %	0 %	0 %	90962768
37	NC_007930	AAGAT	2	10	83006	83015	60 %	20 %	20 %	0 %	90962769
38	NC_007930	AAACT	2	10	83965	83974	60 %	20 %	0 %	20 %	90962771
39	NC_007930	AGATT	2	10	87441	87450	40 %	40 %	20 %	0 %	90962776
40	NC_007930	CATTG	2	10	88805	88814	20 %	40 %	20 %	20 %	90962777
41	NC_007930	ATTGA	2	10	89747	89756	40 %	40 %	20 %	0 %	90962778
42	NC_007930	TTCAT	2	10	93709	93718	20 %	60 %	0 %	20 %	90962782
43	NC_007930	TAGTT	2	10	96749	96758	20 %	60 %	20 %	0 %	90962786
44	NC_007930	ATCTT	2	10	98328	98337	20 %	60 %	0 %	20 %	90962786
45	NC_007930	TTTGA	2	10	99974	99983	20 %	60 %	20 %	0 %	90962789
46	NC_007930	CCATA	2	10	100166	100175	40 %	20 %	0 %	40 %	90962789
47	NC_007930	ACTTA	2	10	100815	100824	40 %	40 %	0 %	20 %	90962789
48	NC_007930	ATATC	2	10	101077	101086	40 %	40 %	0 %	20 %	90962789
49	NC_007930	TTGAT	2	10	102375	102384	20 %	60 %	20 %	0 %	90962790
50	NC_007930	AACTA	2	10	102589	102598	60 %	20 %	0 %	20 %	90962790
51	NC_007930	TATTT	2	10	104827	104836	20 %	80 %	0 %	0 %	90962790
52	NC_007930	TTAAT	2	10	105905	105914	40 %	60 %	0 %	0 %	90962791
53	NC_007930	TCTCC	2	10	106287	106296	0 %	40 %	0 %	60 %	90962791
54	NC_007930	CTCTT	2	10	107193	107202	0 %	60 %	0 %	40 %	90962791
55	NC_007930	TTTCT	2	10	108092	108101	0 %	80 %	0 %	20 %	90962793
56	NC_007930	CTCAC	2	10	110018	110027	20 %	20 %	0 %	60 %	90962795
57	NC_007930	TTTGA	2	10	111194	111203	20 %	60 %	20 %	0 %	90962797
58	NC_007930	TAATT	2	10	112088	112097	40 %	60 %	0 %	0 %	90962797
59	NC_007930	CTTTT	2	10	113254	113263	0 %	80 %	0 %	20 %	90962797
60	NC_007930	AATAT	2	10	115170	115179	60 %	40 %	0 %	0 %	90962799
61	NC_007930	ATTTG	2	10	119824	119833	20 %	60 %	20 %	0 %	90962802
62	NC_007930	TTTTC	2	10	119902	119911	0 %	80 %	0 %	20 %	90962802
63	NC_007930	TCTTT	2	10	121223	121232	0 %	80 %	0 %	20 %	90962803
64	NC_007930	TGGAT	2	10	123290	123299	20 %	40 %	40 %	0 %	90962805
65	NC_007930	GTATG	2	10	126902	126911	20 %	40 %	40 %	0 %	90962806
66	NC_007930	TCATA	2	10	129929	129938	40 %	40 %	0 %	20 %	90962807
67	NC_007930	TCTCT	2	10	130122	130131	0 %	60 %	0 %	40 %	90962808
68	NC_007930	TAATA	2	10	131437	131446	60 %	40 %	0 %	0 %	90962809
69	NC_007930	TTTGT	2	10	134257	134266	0 %	80 %	20 %	0 %	90962812
70	NC_007930	ACTTA	2	10	140880	140889	40 %	40 %	0 %	20 %	90962820
71	NC_007930	ATTAA	2	10	141028	141037	60 %	40 %	0 %	0 %	90962820
72	NC_007930	TGATA	2	10	143769	143778	40 %	40 %	20 %	0 %	90962824
73	NC_007930	TGATC	2	10	144943	144952	20 %	40 %	20 %	20 %	90962826
74	NC_007930	TCAAT	2	10	145099	145108	40 %	40 %	0 %	20 %	90962827
75	NC_007930	TCTTT	2	10	146740	146749	0 %	80 %	0 %	20 %	90962829
76	NC_007930	CTTTT	2	10	146859	146868	0 %	80 %	0 %	20 %	90962830
77	NC_007930	ATCAC	2	10	147303	147312	40 %	20 %	0 %	40 %	90962831
78	NC_007930	TTTAC	2	10	150223	150232	20 %	60 %	0 %	20 %	90962833
79	NC_007930	ATTTA	2	10	150881	150890	40 %	60 %	0 %	0 %	90962835
80	NC_007930	ACATT	2	10	151411	151420	40 %	40 %	0 %	20 %	90962836
81	NC_007930	ATTAA	2	10	152516	152525	60 %	40 %	0 %	0 %	90962837
82	NC_007930	TGTCT	2	10	152976	152985	0 %	60 %	20 %	20 %	90962837
83	NC_007930	ATTTT	2	10	154677	154686	20 %	80 %	0 %	0 %	90962841
84	NC_007930	CCGTA	2	10	155944	155953	20 %	20 %	20 %	40 %	90962841
85	NC_007930	GCAAA	2	10	157042	157051	60 %	0 %	20 %	20 %	90962841
86	NC_007930	ATTGT	20	100	157416	157515	20 %	60 %	20 %	0 %	90962842
87	NC_007930	AATTC	2	10	157994	158003	40 %	40 %	0 %	20 %	90962843
88	NC_007930	TCCAT	2	10	163291	163300	20 %	40 %	0 %	40 %	90962848
89	NC_007930	ATACA	2	10	163415	163424	60 %	20 %	0 %	20 %	90962848
90	NC_007930	GTAAT	2	10	163627	163636	40 %	40 %	20 %	0 %	90962848
91	NC_007930	TTTGA	2	10	164063	164072	20 %	60 %	20 %	0 %	90962848
92	NC_007930	AAAAC	2	10	165270	165279	80 %	0 %	0 %	20 %	90962849
93	NC_007930	ATTCA	2	10	169154	169163	40 %	40 %	0 %	20 %	90962851
94	NC_007930	TTTAT	2	10	170797	170806	20 %	80 %	0 %	0 %	90962852
95	NC_007930	TTCTT	2	10	171774	171783	0 %	80 %	0 %	20 %	90962853
96	NC_007930	ATTGC	2	10	173951	173960	20 %	40 %	20 %	20 %	90962855
97	NC_007930	TTTCC	2	10	174161	174170	0 %	60 %	0 %	40 %	90962855
98	NC_007930	CTAAT	2	10	175179	175188	40 %	40 %	0 %	20 %	90962856
99	NC_007930	TTACC	2	10	175890	175899	20 %	40 %	0 %	40 %	90962856
100	NC_007930	ATAAA	2	10	176870	176879	80 %	20 %	0 %	0 %	90962857
101	NC_007930	TGACA	2	10	180715	180724	40 %	20 %	20 %	20 %	90962861
102	NC_007930	ATTTA	2	10	181955	181964	40 %	60 %	0 %	0 %	90962862
103	NC_007930	AGCAA	2	10	182907	182916	60 %	0 %	20 %	20 %	90962864
104	NC_007930	TTTAG	2	10	191051	191060	20 %	60 %	20 %	0 %	90962874
105	NC_007930	ATCCA	2	10	192109	192118	40 %	20 %	0 %	40 %	90962875
106	NC_007930	ATCTT	2	10	193826	193835	20 %	60 %	0 %	20 %	90962875
107	NC_007930	AATAA	2	10	195688	195697	80 %	20 %	0 %	0 %	90962876
108	NC_007930	AGCAA	2	10	196910	196919	60 %	0 %	20 %	20 %	90962876
109	NC_007930	AAAAG	2	10	198274	198283	80 %	0 %	20 %	0 %	90962877
110	NC_007930	CATAC	2	10	199719	199728	40 %	20 %	0 %	40 %	90962881
111	NC_007930	TTTTC	2	10	199786	199795	0 %	80 %	0 %	20 %	90962881
112	NC_007930	AACTT	2	10	200153	200162	40 %	40 %	0 %	20 %	90962881
113	NC_007930	ATTGA	2	10	202304	202313	40 %	40 %	20 %	0 %	90962882
114	NC_007930	CAATA	2	10	202447	202456	60 %	20 %	0 %	20 %	90962882
115	NC_007930	GCCAC	2	10	202907	202916	20 %	0 %	20 %	60 %	90962882
116	NC_007930	TTTGA	2	10	207418	207427	20 %	60 %	20 %	0 %	90962893
117	NC_007930	TTACT	2	10	207861	207870	20 %	60 %	0 %	20 %	90962894
118	NC_007930	TATTT	2	10	209964	209973	20 %	80 %	0 %	0 %	90962898
119	NC_007930	TTGTA	2	10	211995	212004	20 %	60 %	20 %	0 %	90962900
120	NC_007930	ATCTA	2	10	212432	212441	40 %	40 %	0 %	20 %	90962901
121	NC_007930	TTTTC	2	10	212635	212644	0 %	80 %	0 %	20 %	90962901
122	NC_007930	TGCAA	2	10	213671	213680	40 %	20 %	20 %	20 %	90962903
123	NC_007930	TCAAA	2	10	214237	214246	60 %	20 %	0 %	20 %	90962904
124	NC_007930	AAATA	2	10	216046	216055	80 %	20 %	0 %	0 %	90962905
125	NC_007930	GATTG	2	10	216104	216113	20 %	40 %	40 %	0 %	90962905
126	NC_007930	CATTA	2	10	216292	216301	40 %	40 %	0 %	20 %	90962905
127	NC_007930	AAATT	2	10	219504	219513	60 %	40 %	0 %	0 %	90962908
128	NC_007930	GAATG	2	10	222912	222921	40 %	20 %	40 %	0 %	90962912
129	NC_007930	TTAAA	2	10	222939	222948	60 %	40 %	0 %	0 %	90962912
130	NC_007930	TACAT	2	10	224192	224201	40 %	40 %	0 %	20 %	90962913
131	NC_007930	AAATT	2	10	225895	225904	60 %	40 %	0 %	0 %	90962914
132	NC_007930	CCAAA	2	10	229400	229409	60 %	0 %	0 %	40 %	90962918
133	NC_007930	CCCCA	2	10	229491	229500	20 %	0 %	0 %	80 %	90962918
134	NC_007930	TGAAA	2	10	230913	230922	60 %	20 %	20 %	0 %	90962919
135	NC_007930	TTCTT	2	10	233201	233210	0 %	80 %	0 %	20 %	90962921
136	NC_007930	AATTG	2	10	233803	233812	40 %	40 %	20 %	0 %	90962922
137	NC_007930	ATCTA	2	10	235384	235393	40 %	40 %	0 %	20 %	90962925
138	NC_007930	CTGAT	2	10	240627	240636	20 %	40 %	20 %	20 %	90962928
139	NC_007930	TTGAC	2	10	240713	240722	20 %	40 %	20 %	20 %	90962929

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.