MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pMP118

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007930	TAAT	2	8	866	873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007930	TTAA	2	8	903	910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007930	CTAT	2	8	953	960	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007930	GGAA	2	8	1034	1041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007930	TAAT	2	8	2339	2346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007930	CACT	2	8	2492	2499	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007930	AAGT	2	8	2934	2941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007930	TAAA	2	8	3024	3031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007930	TAGA	2	8	3046	3053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007930	ATTT	2	8	3268	3275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007930	ATTG	2	8	3340	3347	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007930	TTTC	2	8	3646	3653	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007930	GAAA	2	8	3812	3819	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007930	TGGT	2	8	3860	3867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007930	AATT	2	8	3960	3967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007930	GATC	2	8	4127	4134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007930	TAAT	2	8	4232	4239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007930	ACTA	2	8	5246	5253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007930	AGGT	2	8	5292	5299	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007930	ATAA	2	8	6528	6535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007930	ATTT	2	8	6727	6734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007930	GTTA	2	8	8135	8142	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007930	ATAA	2	8	13007	13014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007930	AGTA	2	8	13045	13052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007930	ATTT	2	8	13994	14001	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007930	AAAT	2	8	14142	14149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007930	AATT	2	8	14182	14189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007930	TTTA	2	8	17195	17202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007930	AGTA	2	8	17219	17226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007930	TTTA	2	8	17273	17280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007930	AAAT	2	8	21705	21712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007930	AGTC	2	8	21722	21729	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007930	GGCT	2	8	21755	21762	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007930	AGAA	2	8	21774	21781	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007930	AAAT	2	8	22848	22855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007930	TTAA	2	8	24659	24666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007930	AAAG	2	8	24764	24771	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007930	AGAA	2	8	24862	24869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007930	AGGT	2	8	26037	26044	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007930	TTGA	2	8	27098	27105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007930	AATT	2	8	30311	30318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007930	GGTA	2	8	30859	30866	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007930	TTTA	2	8	30915	30922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007930	GTTT	2	8	31362	31369	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007930	GAAA	2	8	31461	31468	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007930	AATT	2	8	31553	31560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007930	ATCT	2	8	32311	32318	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007930	TGAA	2	8	32522	32529	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007930	TCAA	2	8	32742	32749	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007930	TTTC	2	8	32902	32909	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007930	GAAA	2	8	33366	33373	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007930	TTAG	2	8	33460	33467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007930	TGGA	2	8	33666	33673	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007930	GATG	2	8	34398	34405	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007930	CTGA	2	8	34759	34766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007930	ATCA	2	8	34824	34831	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007930	TTAG	2	8	34951	34958	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007930	GAAA	2	8	34965	34972	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007930	GAAA	2	8	35427	35434	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007930	TTAG	2	8	35521	35528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007930	TAAA	2	8	42070	42077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007930	ATAG	2	8	47558	47565	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007930	ATTT	2	8	49349	49356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007930	AATA	2	8	51931	51938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007930	TTAT	2	8	52100	52107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007930	TAAA	2	8	52189	52196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007930	ATAA	2	8	52268	52275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007930	TGGG	2	8	54823	54830	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007930	AATA	2	8	56778	56785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007930	TTTA	2	8	56973	56980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007930	ATTA	2	8	57012	57019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007930	GTGG	2	8	57125	57132	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007930	CCAA	2	8	57767	57774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007930	GAAA	2	8	58811	58818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007930	GGTT	2	8	58833	58840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007930	TAAC	2	8	60246	60253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007930	AACA	2	8	61446	61453	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_007930	AAAT	2	8	61474	61481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007930	AAAG	2	8	61777	61784	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007930	ATAA	2	8	61972	61979	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007930	TAAA	2	8	62827	62834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007930	GAGT	2	8	65713	65720	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007930	AAAG	2	8	65829	65836	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007930	AAAC	2	8	65844	65851	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007930	ATAA	2	8	66570	66577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007930	TTCA	2	8	67413	67420	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007930	TAAA	2	8	67948	67955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007930	TCAA	2	8	68165	68172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007930	TAAA	2	8	69106	69113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007930	GTCA	2	8	69339	69346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007930	ATTA	2	8	69347	69354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007930	TATT	2	8	69377	69384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007930	AAGT	2	8	71878	71885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007930	CCAC	2	8	74391	74398	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_007930	ATAA	2	8	74606	74613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007930	AATT	2	8	75937	75944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007930	ATTA	2	8	76984	76991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007930	CATT	2	8	83278	83285	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_007930	CTTA	2	8	83399	83406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_007930	TATT	2	8	85531	85538	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007930	TACT	2	8	89990	89997	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_007930	TAAT	2	8	92068	92075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007930	GATT	2	8	92673	92680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007930	TGCT	2	8	93915	93922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007930	TACG	2	8	96582	96589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_007930	CTTT	2	8	96627	96634	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007930	TGTA	2	8	99604	99611	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007930	TAAT	2	8	104887	104894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007930	CTTT	2	8	122525	122532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_007930	CGTT	17	68	122623	122690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007930	TAAA	2	8	125918	125925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007930	TTAT	2	8	125936	125943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007930	CTAG	2	8	126015	126022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007930	ACAA	2	8	126166	126173	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_007930	TCAG	2	8	127355	127362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_007930	TAAA	2	8	127828	127835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007930	ATCA	2	8	128710	128717	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007930	TATT	2	8	133222	133229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007930	TTTA	2	8	134859	134866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007930	CTGT	2	8	135425	135432	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_007930	TCTT	2	8	135455	135462	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007930	CTAT	2	8	135522	135529	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007930	AATC	2	8	135641	135648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007930	TATT	2	8	135669	135676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007930	GATT	2	8	135749	135756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007930	ATTA	2	8	135965	135972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007930	TTAT	2	8	136528	136535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007930	CTTT	2	8	138396	138403	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007930	ATTT	2	8	138434	138441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007930	CTTG	2	8	138469	138476	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_007930	ATTT	2	8	138795	138802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007930	TTTA	2	8	138834	138841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007930	ATTT	2	8	139931	139938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007930	ACTA	2	8	141821	141828	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_007930	ATTT	2	8	141892	141899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007930	ATCA	2	8	142575	142582	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007930	AAAG	2	8	142763	142770	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007930	ACAA	2	8	143981	143988	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007930	ATTA	2	8	144718	144725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007930	TTTC	2	8	147727	147734	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007930	GGTT	2	8	147825	147832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007930	TCAA	2	8	147882	147889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_007930	TTGA	2	8	147892	147899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007930	AGAT	2	8	148908	148915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007930	CTAG	2	8	149284	149291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_007930	TAAA	2	8	149447	149454	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007930	TTAA	2	8	149523	149530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007930	ATAA	2	8	149611	149618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007930	CTTA	2	8	150750	150757	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_007930	ATTA	2	8	151052	151059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007930	TAAA	2	8	151680	151687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007930	TTTA	2	8	151767	151774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007930	TATT	2	8	152070	152077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_007930	TCAA	2	8	152159	152166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.