MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pMP118

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007930	TG	3	6	1009	1014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007930	AG	3	6	3427	3432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007930	AT	3	6	3889	3894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007930	TG	3	6	4115	4120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007930	GA	3	6	4747	4752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007930	TA	4	8	5122	5129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007930	AT	3	6	5136	5141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007930	TA	4	8	5168	5175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007930	AT	3	6	5176	5181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007930	TA	4	8	6520	6527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007930	TA	3	6	6542	6547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007930	TA	3	6	6581	6586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007930	AT	3	6	8635	8640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007930	TA	3	6	8670	8675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007930	AT	3	6	11363	11368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007930	TA	4	8	11372	11379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007930	AT	3	6	11420	11425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007930	GT	3	6	11522	11527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007930	TA	3	6	12042	12047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007930	TA	3	6	13910	13915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007930	AT	3	6	13972	13977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007930	TA	3	6	14012	14017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007930	AT	3	6	15365	15370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007930	TA	3	6	17127	17132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007930	AG	3	6	17315	17320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007930	AT	3	6	27079	27084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007930	TA	3	6	27126	27131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007930	TA	3	6	27229	27234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007930	AT	3	6	29759	29764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007930	AT	3	6	30536	30541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007930	AT	3	6	30625	30630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007930	AT	3	6	30691	30696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007930	TA	4	8	31098	31105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007930	TA	3	6	31147	31152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007930	AT	3	6	31154	31159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007930	GA	3	6	31620	31625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007930	TA	3	6	33659	33664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007930	TA	3	6	34175	34180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007930	TA	3	6	34582	34587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007930	GA	3	6	34683	34688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007930	TA	3	6	34882	34887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007930	AT	3	6	35208	35213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007930	TA	3	6	44732	44737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007930	TA	3	6	48885	48890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007930	GA	3	6	49191	49196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007930	AT	3	6	52203	52208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007930	TA	3	6	53821	53826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007930	TA	3	6	56924	56929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007930	TA	3	6	57667	57672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007930	TA	3	6	60009	60014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007930	TA	3	6	60198	60203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007930	GT	3	6	60579	60584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007930	TA	3	6	61122	61127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007930	AC	3	6	61927	61932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007930	AT	3	6	62802	62807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007930	TA	3	6	63573	63578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007930	GT	3	6	65657	65662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007930	TA	3	6	66540	66545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007930	AC	3	6	67301	67306	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007930	AT	3	6	67570	67575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007930	TC	3	6	67874	67879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007930	AG	3	6	68037	68042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007930	TA	3	6	68064	68069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007930	TG	3	6	68323	68328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007930	TA	3	6	72964	72969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007930	AT	3	6	74469	74474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007930	AT	4	8	76963	76970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007930	AT	4	8	83362	83369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007930	GA	3	6	84217	84222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007930	TA	3	6	91458	91463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007930	AG	3	6	92123	92128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007930	TA	3	6	92240	92245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007930	AT	3	6	92275	92280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007930	TA	3	6	93044	93049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007930	TA	3	6	93419	93424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007930	TG	3	6	107459	107464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007930	AT	3	6	123439	123444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007930	AT	3	6	125474	125479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007930	TA	3	6	128296	128301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007930	GA	3	6	128446	128451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007930	AC	3	6	128701	128706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007930	TA	3	6	130828	130833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007930	TA	3	6	130882	130887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007930	TA	3	6	134964	134969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007930	CT	3	6	135985	135990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007930	CA	3	6	136582	136587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007930	GA	3	6	139330	139335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007930	CT	3	6	139882	139887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007930	TG	3	6	139982	139987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007930	TG	3	6	140005	140010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007930	TC	3	6	141782	141787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007930	GT	3	6	141805	141810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007930	AC	3	6	141812	141817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007930	AC	3	6	141886	141891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007930	TC	3	6	141946	141951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007930	AC	3	6	142241	142246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007930	AT	3	6	143383	143388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007930	AT	3	6	148279	148284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007930	AT	3	6	148963	148968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007930	AT	3	6	149178	149183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007930	CT	3	6	149238	149243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007930	AT	3	6	149307	149312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007930	AT	3	6	150125	150130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007930	AT	3	6	150476	150481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007930	AT	3	6	151022	151027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007930	TA	3	6	151139	151144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007930	AT	3	6	152016	152021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007930	AG	3	6	152275	152280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007930	TA	3	6	157738	157743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007930	TA	3	6	159683	159688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007930	TC	3	6	162456	162461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007930	CT	3	6	162468	162473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007930	AT	3	6	167216	167221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007930	TA	3	6	167294	167299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007930	TA	3	6	167534	167539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007930	AT	4	8	168364	168371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007930	TA	3	6	168985	168990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007930	AT	4	8	174317	174324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007930	AT	3	6	176284	176289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007930	TA	3	6	178796	178801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007930	AC	3	6	180102	180107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007930	AT	3	6	180137	180142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007930	AT	3	6	187468	187473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007930	TC	3	6	189232	189237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007930	AT	3	6	194435	194440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007930	GT	3	6	194585	194590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007930	AT	4	8	197328	197335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007930	TC	3	6	203019	203024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007930	TC	3	6	205615	205620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007930	AT	3	6	205918	205923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007930	TA	3	6	205960	205965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007930	AC	3	6	206726	206731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_007930	AT	3	6	207033	207038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007930	CT	3	6	207293	207298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007930	AT	3	6	208333	208338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007930	AT	3	6	214976	214981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007930	AT	3	6	215423	215428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007930	AT	3	6	215453	215458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007930	TA	3	6	215625	215630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007930	TA	3	6	218635	218640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007930	AT	3	6	224290	224295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007930	CT	3	6	226073	226078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007930	TA	3	6	231395	231400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007930	TC	3	6	231595	231600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_007930	TA	4	8	231638	231645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007930	TA	3	6	237047	237052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007930	AT	3	6	241662	241667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007930	AT	4	8	241730	241737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007930	TA	3	6	242152	242157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.