MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 chromosome

Total Repeats: 781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007929	ATTTAG	2	12	8	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	90960991
2	NC_007929	AGGCTG	2	12	884	895	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	90960991
3	NC_007929	TTAACT	2	12	1655	1666	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	90960992
4	NC_007929	CCAGAT	2	12	5009	5020	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	90960995
5	NC_007929	CTGATG	2	12	5991	6002	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	90960995
6	NC_007929	CAAGCT	2	12	7700	7711	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	90960996
7	NC_007929	TGAAGA	2	12	7927	7938	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	90960996
8	NC_007929	GTGATG	2	12	8385	8396	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	90960996
9	NC_007929	CGAAAA	2	12	8884	8895	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	90960996
10	NC_007929	AAAGAT	2	12	15062	15073	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	90961002
11	NC_007929	TATCAA	2	12	17892	17903	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	90961004
12	NC_007929	CTTTAT	2	12	19805	19816	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	90961006
13	NC_007929	CAAAAA	2	12	21721	21732	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	90961007
14	NC_007929	GATTAT	2	12	27282	27293	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	90961012
15	NC_007929	CGACAG	2	12	28882	28893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90961014
16	NC_007929	CTAACT	2	12	29037	29048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90961014
17	NC_007929	TGAAGA	2	12	33840	33851	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	90961017
18	NC_007929	GCACAA	2	12	39864	39875	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	90961022
19	NC_007929	ATTTTA	2	12	39996	40007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90961022
20	NC_007929	ATTGAT	2	12	42172	42183	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	90961024
21	NC_007929	TGCTTC	2	12	44432	44443	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	90961026
22	NC_007929	GTGAAA	2	12	51784	51795	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	90961032
23	NC_007929	TTGTAA	2	12	52672	52683	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	90961034
24	NC_007929	GATATG	2	12	52950	52961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90961034
25	NC_007929	TTTATG	2	12	60894	60905	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	90961040
26	NC_007929	ATTTTT	2	12	63174	63185	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	90961041
27	NC_007929	AGCTAG	2	12	63189	63200	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	90961041
28	NC_007929	CAAAAC	2	12	64734	64745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90961043
29	NC_007929	AATAAA	2	12	72377	72388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	90961050
30	NC_007929	CGATAA	2	12	73598	73609	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	90961051
31	NC_007929	TTCTTT	2	12	80175	80186	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	90961052
32	NC_007929	TTAAAG	2	12	80603	80614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	90961053
33	NC_007929	ATTAAA	2	12	84671	84682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90961055
34	NC_007929	TCAAAT	2	12	84869	84880	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	90961055
35	NC_007929	GCAATT	2	12	87408	87419	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	90961056
36	NC_007929	CATTTA	2	12	88749	88760	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	90961058
37	NC_007929	GCATTA	2	12	89299	89310	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	90961059
38	NC_007929	ATAAAG	2	12	95580	95591	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	90961064
39	NC_007929	GATAAA	2	12	99890	99901	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	90961067
40	NC_007929	TCATTA	2	12	102441	102452	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	90961070
41	NC_007929	GTTCTT	2	12	103108	103119	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	90961071
42	NC_007929	TACGTT	2	12	103837	103848	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	90961072
43	NC_007929	GCTGGT	2	12	107998	108009	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	90961076
44	NC_007929	TAGTTG	2	12	109552	109563	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	90961078
45	NC_007929	ATTATG	2	12	111516	111527	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	90961079
46	NC_007929	CAAATG	2	12	112432	112443	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	90961080
47	NC_007929	TTCGAG	2	12	113335	113346	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	90961080
48	NC_007929	TGATAA	2	12	115324	115335	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	90961083
49	NC_007929	CAATTT	2	12	123044	123055	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	90961089
50	NC_007929	GCAGTA	2	12	123615	123626	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	90961090
51	NC_007929	GGTATT	2	12	126364	126375	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	90961094
52	NC_007929	CAGGTG	2	12	127754	127765	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	90961095
53	NC_007929	TTGCAA	2	12	130790	130801	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	90961097
54	NC_007929	CAATTT	2	12	132506	132517	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	90961099
55	NC_007929	TTTAGT	2	12	133002	133013	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	90961099
56	NC_007929	TGTTAG	2	12	135776	135787	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	90961101
57	NC_007929	AAAATT	2	12	146678	146689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90961113
58	NC_007929	CCAGCA	2	12	146991	147002	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	90961113
59	NC_007929	TTGCAG	2	12	147810	147821	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	90961114
60	NC_007929	ACAGTA	2	12	147863	147874	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	90961114
61	NC_007929	AGTTAA	2	12	147955	147966	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	90961114
62	NC_007929	TACAAA	2	12	148130	148141	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	90961114
63	NC_007929	TAGCAA	2	12	150753	150764	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	90961117
64	NC_007929	TTTGTT	2	12	151942	151953	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	90961118
65	NC_007929	ATCTTC	2	12	154229	154240	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	90961121
66	NC_007929	AGCTAA	2	12	156660	156671	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	90961122
67	NC_007929	CACAAG	2	12	179110	179121	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	90961136
68	NC_007929	AGAAGG	2	12	179556	179567	50 %	0 %	50 %	0 %	90961137
69	NC_007929	GCACCA	2	12	179626	179637	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	90961137
70	NC_007929	TACAGA	2	12	180195	180206	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	90961137
71	NC_007929	AGCTAA	2	12	180288	180299	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	90961137
72	NC_007929	ACTGGG	2	12	182825	182836	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	90961139
73	NC_007929	AAATTA	2	12	185955	185966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90961143
74	NC_007929	TAAAGA	2	12	186281	186292	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	90961144
75	NC_007929	AAGAAA	2	12	187859	187870	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	90961145
76	NC_007929	AGATTT	2	12	188113	188124	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	90961145
77	NC_007929	AATAGT	2	12	189828	189839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	90961147
78	NC_007929	GCATTT	2	12	190368	190379	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	90961147
79	NC_007929	AAAATG	2	12	203285	203296	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	90961158
80	NC_007929	TCTAAA	2	12	206844	206855	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	90961162
81	NC_007929	ATGAGA	2	12	207238	207249	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	90961162
82	NC_007929	ATTTTT	2	12	211171	211182	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	90961167
83	NC_007929	AAAATT	2	12	212525	212536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90961168
84	NC_007929	TGTTTC	2	12	212789	212800	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	90961168
85	NC_007929	TAAATC	2	12	216569	216580	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	90961171
86	NC_007929	ATGTTC	2	12	225160	225171	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	90961173
87	NC_007929	TGAAGG	2	12	226312	226323	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	90961174
88	NC_007929	AAGATA	2	12	230182	230193	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	90961175
89	NC_007929	GCTGTT	2	12	231354	231365	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	90961176
90	NC_007929	GTGGCG	2	12	231990	232001	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	90961177
91	NC_007929	AACTGC	2	12	240557	240568	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	90961180
92	NC_007929	TTAAAG	2	12	241693	241704	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	90961180
93	NC_007929	CAGGTA	2	12	242182	242193	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	90961180
94	NC_007929	ACAAGA	2	12	244570	244581	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	90961184
95	NC_007929	AACGTG	2	12	245451	245462	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	90961184
96	NC_007929	ACAATG	2	12	246413	246424	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	90961184
97	NC_007929	ATGGAA	2	12	248391	248402	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	90961186
98	NC_007929	GAAAAT	2	12	248684	248695	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	90961187
99	NC_007929	AGAAAT	2	12	250304	250315	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	90961188
100	NC_007929	TAGTGA	2	12	254068	254079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90961189
101	NC_007929	ACTTTG	2	12	259141	259152	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	90961192
102	NC_007929	CAAAGT	2	12	259210	259221	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	90961192
103	NC_007929	TAAAAA	2	12	260295	260306	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	90961193
104	NC_007929	GTAAAT	2	12	265280	265291	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	90961195
105	NC_007929	TTAAAT	2	12	265885	265896	50 %	50 %	0 %	0 %	90961195
106	NC_007929	AAAGAC	2	12	272732	272743	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	90961200
107	NC_007929	GTAGAA	2	12	273393	273404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	90961201
108	NC_007929	GAAAAT	2	12	274131	274142	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	90961202
109	NC_007929	AAAATT	2	12	276381	276392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90961204
110	NC_007929	TTTACC	2	12	280858	280869	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	90961208
111	NC_007929	GAATAT	2	12	282569	282580	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	90961209
112	NC_007929	ATAGAA	2	12	282781	282792	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	90961209
113	NC_007929	TAGCAG	2	12	283304	283315	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	90961210
114	NC_007929	AAAAGT	2	12	285061	285072	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	90961213
115	NC_007929	GAAAAA	2	12	285638	285649	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	90961213
116	NC_007929	TAACTT	2	12	290354	290365	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	90961218
117	NC_007929	TAAAGC	2	12	290433	290444	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	90961218
118	NC_007929	GGTTTA	2	12	291251	291262	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	90961219
119	NC_007929	TTAAAT	2	12	292254	292265	50 %	50 %	0 %	0 %	90961221
120	NC_007929	TTCATT	2	12	292674	292685	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	90961222
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462	NC_007929	TTCCGA	2	12	1091379	1091390	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	90962043
463	NC_007929	AGTTAC	2	12	1092709	1092720	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	90962046
464	NC_007929	TTTTTC	2	12	1093988	1093999	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	90962047
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