MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 chromosome

Total Repeats: 1485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007929	AGCTA	2	10	237	246	40 %	20 %	20 %	20 %	90960991
2	NC_007929	CGAGC	2	10	1345	1354	20 %	0 %	40 %	40 %	90960991
3	NC_007929	CTTCT	2	10	2361	2370	0 %	60 %	0 %	40 %	90960992
4	NC_007929	TACTA	2	10	2759	2768	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007929	AGAAA	2	10	4466	4475	80 %	0 %	20 %	0 %	90960995
6	NC_007929	TATGG	2	10	4913	4922	20 %	40 %	40 %	0 %	90960995
7	NC_007929	GCAAA	2	10	5606	5615	60 %	0 %	20 %	20 %	90960995
8	NC_007929	CTATG	2	10	6514	6523	20 %	40 %	20 %	20 %	90960996
9	NC_007929	GAAAA	2	10	7289	7298	80 %	0 %	20 %	0 %	90960996
10	NC_007929	AAAGT	2	10	8577	8586	60 %	20 %	20 %	0 %	90960996
11	NC_007929	TTTTA	2	10	9046	9055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007929	AGAAT	2	10	10674	10683	60 %	20 %	20 %	0 %	90961000
13	NC_007929	ATCTG	2	10	10755	10764	20 %	40 %	20 %	20 %	90961000
14	NC_007929	CTAGT	2	10	11935	11944	20 %	40 %	20 %	20 %	90961001
15	NC_007929	GAAGA	2	10	12073	12082	60 %	0 %	40 %	0 %	90961001
16	NC_007929	ACCAA	2	10	13881	13890	60 %	0 %	0 %	40 %	90961002
17	NC_007929	ACTTT	2	10	16237	16246	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007929	GTAAT	2	10	16500	16509	40 %	40 %	20 %	0 %	90961003
19	NC_007929	CAAGA	2	10	16751	16760	60 %	0 %	20 %	20 %	90961003
20	NC_007929	TAGCA	2	10	17458	17467	40 %	20 %	20 %	20 %	90961004
21	NC_007929	TACTT	2	10	20778	20787	20 %	60 %	0 %	20 %	90961006
22	NC_007929	ATTTT	2	10	21928	21937	20 %	80 %	0 %	0 %	90961007
23	NC_007929	TGAAA	2	10	24175	24184	60 %	20 %	20 %	0 %	90961009
24	NC_007929	CCTTT	2	10	24555	24564	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_007929	TAAAA	2	10	26229	26238	80 %	20 %	0 %	0 %	90961011
26	NC_007929	TCTGA	2	10	26851	26860	20 %	40 %	20 %	20 %	90961012
27	NC_007929	GAAAG	2	10	27807	27816	60 %	0 %	40 %	0 %	90961012
28	NC_007929	TATAG	2	10	28233	28242	40 %	40 %	20 %	0 %	90961013
29	NC_007929	CAAGG	2	10	28278	28287	40 %	0 %	40 %	20 %	90961013
30	NC_007929	CGATG	2	10	29132	29141	20 %	20 %	40 %	20 %	90961014
31	NC_007929	TTTCT	2	10	30747	30756	0 %	80 %	0 %	20 %	90961015
32	NC_007929	ACTTC	2	10	31441	31450	20 %	40 %	0 %	40 %	90961015
33	NC_007929	TTGGC	2	10	32045	32054	0 %	40 %	40 %	20 %	90961016
34	NC_007929	CATGC	2	10	34821	34830	20 %	20 %	20 %	40 %	90961018
35	NC_007929	ATTAG	2	10	35820	35829	40 %	40 %	20 %	0 %	90961020
36	NC_007929	TCTTT	2	10	36477	36486	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007929	ATTTA	2	10	37691	37700	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007929	AATCT	2	10	37913	37922	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007929	ATTAA	2	10	37943	37952	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007929	TTTTA	2	10	38030	38039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007929	AGATT	2	10	38113	38122	40 %	40 %	20 %	0 %	90961021
42	NC_007929	TAGCT	2	10	39647	39656	20 %	40 %	20 %	20 %	90961022
43	NC_007929	ATTTT	2	10	39777	39786	20 %	80 %	0 %	0 %	90961022
44	NC_007929	CGATG	2	10	40995	41004	20 %	20 %	40 %	20 %	90961023
45	NC_007929	AGTTA	2	10	41319	41328	40 %	40 %	20 %	0 %	90961023
46	NC_007929	TAGCT	2	10	42093	42102	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007929	ATTAA	2	10	42157	42166	60 %	40 %	0 %	0 %	90961024
48	NC_007929	ATTTA	2	10	43192	43201	40 %	60 %	0 %	0 %	90961025
49	NC_007929	ACTTG	2	10	43288	43297	20 %	40 %	20 %	20 %	90961025
50	NC_007929	ACATG	2	10	43348	43357	40 %	20 %	20 %	20 %	90961025
51	NC_007929	GAATT	2	10	43605	43614	40 %	40 %	20 %	0 %	90961025
52	NC_007929	TCAAG	2	10	46975	46984	40 %	20 %	20 %	20 %	90961027
53	NC_007929	TTTGG	2	10	52212	52221	0 %	60 %	40 %	0 %	90961032
54	NC_007929	ATGAT	2	10	52735	52744	40 %	40 %	20 %	0 %	90961034
55	NC_007929	GAAAG	2	10	53630	53639	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007929	ACTAA	2	10	54466	54475	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007929	CGTAA	2	10	55285	55294	40 %	20 %	20 %	20 %	90961036
58	NC_007929	GTCAA	2	10	56766	56775	40 %	20 %	20 %	20 %	90961037
59	NC_007929	GATCA	2	10	56851	56860	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_007929	TCTTT	3	15	58312	58326	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007929	ATTTT	2	10	58523	58532	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007929	CACTG	2	10	58829	58838	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_007929	GGTCT	2	10	58974	58983	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007929	GAGCA	2	10	59043	59052	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_007929	TCGTT	2	10	59900	59909	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_007929	TCGGT	2	10	61141	61150	0 %	40 %	40 %	20 %	90961040
67	NC_007929	TACTT	2	10	61350	61359	20 %	60 %	0 %	20 %	90961040
68	NC_007929	CAAAA	2	10	63162	63171	80 %	0 %	0 %	20 %	90961041
69	NC_007929	TAAAA	2	10	63593	63602	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007929	ATGAT	2	10	66785	66794	40 %	40 %	20 %	0 %	90961045
71	NC_007929	TGCAT	2	10	67013	67022	20 %	40 %	20 %	20 %	90961045
72	NC_007929	TAACT	2	10	68040	68049	40 %	40 %	0 %	20 %	90961047
73	NC_007929	TTGAT	2	10	68720	68729	20 %	60 %	20 %	0 %	90961047
74	NC_007929	TTGAT	2	10	69656	69665	20 %	60 %	20 %	0 %	90961047
75	NC_007929	TAACT	2	10	69963	69972	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_007929	GTTTT	2	10	71567	71576	0 %	80 %	20 %	0 %	90961050
77	NC_007929	AATCT	2	10	72478	72487	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007929	AGCTA	2	10	73883	73892	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007929	GTATA	2	10	74190	74199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007929	TCGTG	2	10	75603	75612	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_007929	GGGAG	2	10	76813	76822	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007929	CTAAG	2	10	80669	80678	40 %	20 %	20 %	20 %	90961053
83	NC_007929	TCCAA	2	10	81081	81090	40 %	20 %	0 %	40 %	90961053
84	NC_007929	TCCAT	2	10	81989	81998	20 %	40 %	0 %	40 %	90961053
85	NC_007929	AAATA	2	10	82279	82288	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007929	TTTTA	2	10	86281	86290	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007929	AAATG	2	10	87879	87888	60 %	20 %	20 %	0 %	90961057
88	NC_007929	GGTGC	2	10	88087	88096	0 %	20 %	60 %	20 %	90961057
89	NC_007929	GAAAG	2	10	89439	89448	60 %	0 %	40 %	0 %	90961059
90	NC_007929	TAAAG	2	10	89946	89955	60 %	20 %	20 %	0 %	90961059
91	NC_007929	TGAAT	2	10	91077	91086	40 %	40 %	20 %	0 %	90961061
92	NC_007929	AAATT	2	10	95017	95026	60 %	40 %	0 %	0 %	90961064
93	NC_007929	CAATT	2	10	95201	95210	40 %	40 %	0 %	20 %	90961064
94	NC_007929	TAGCA	2	10	97137	97146	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007929	TTGCA	2	10	97346	97355	20 %	40 %	20 %	20 %	90961065
96	NC_007929	ATACA	2	10	100811	100820	60 %	20 %	0 %	20 %	90961069
97	NC_007929	GTTTT	2	10	106006	106015	0 %	80 %	20 %	0 %	90961074
98	NC_007929	AATGA	2	10	106837	106846	60 %	20 %	20 %	0 %	90961075
99	NC_007929	ATTAA	2	10	107686	107695	60 %	40 %	0 %	0 %	90961076
100	NC_007929	TTTTA	2	10	109041	109050	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007929	TATAT	2	10	111031	111040	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007929	ATTAT	2	10	113469	113478	40 %	60 %	0 %	0 %	90961081
103	NC_007929	AATTT	2	10	113884	113893	40 %	60 %	0 %	0 %	90961081
104	NC_007929	AAACA	2	10	114613	114622	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007929	TGAAT	2	10	116347	116356	40 %	40 %	20 %	0 %	90961083
106	NC_007929	AGACA	2	10	117346	117355	60 %	0 %	20 %	20 %	90961083
107	NC_007929	CAAGT	2	10	117513	117522	40 %	20 %	20 %	20 %	90961083
108	NC_007929	GAATG	2	10	119234	119243	40 %	20 %	40 %	0 %	90961086
109	NC_007929	ATTAT	2	10	120142	120151	40 %	60 %	0 %	0 %	90961088
110	NC_007929	ATTAT	2	10	121869	121878	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007929	ATTAA	2	10	122635	122644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007929	AAGAT	2	10	122908	122917	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007929	GATTA	2	10	125944	125953	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007929	ATAAA	2	10	127631	127640	80 %	20 %	0 %	0 %	90961094
115	NC_007929	ACTTT	2	10	131573	131582	20 %	60 %	0 %	20 %	90961098
116	NC_007929	TAAAA	2	10	134624	134633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007929	TGAAT	2	10	134741	134750	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007929	GTTTT	2	10	134880	134889	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007929	AAAAT	2	10	135076	135085	80 %	20 %	0 %	0 %	90961101
120	NC_007929	AAGTG	2	10	135635	135644	40 %	20 %	40 %	0 %	90961101
121	NC_007929	AACTT	2	10	136960	136969	40 %	40 %	0 %	20 %	90961103
122	NC_007929	AACAT	2	10	137977	137986	60 %	20 %	0 %	20 %	90961104
123	NC_007929	TTTAA	2	10	139323	139332	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007929	TGACA	2	10	140694	140703	40 %	20 %	20 %	20 %	90961107
125	NC_007929	TGAAA	2	10	141152	141161	60 %	20 %	20 %	0 %	90961108
126	NC_007929	TTGAA	2	10	141409	141418	40 %	40 %	20 %	0 %	90961108
127	NC_007929	GCCAC	2	10	141713	141722	20 %	0 %	20 %	60 %	90961108
128	NC_007929	TAGGA	2	10	145796	145805	40 %	20 %	40 %	0 %	90961112
129	NC_007929	AAAAT	2	10	145807	145816	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007929	ATTAC	2	10	146588	146597	40 %	40 %	0 %	20 %	90961113
131	NC_007929	AAAAT	2	10	146659	146668	80 %	20 %	0 %	0 %	90961113
132	NC_007929	ACTAA	2	10	149958	149967	60 %	20 %	0 %	20 %	90961116
133	NC_007929	AAAGA	2	10	150434	150443	80 %	0 %	20 %	0 %	90961117
134	NC_007929	ATATA	2	10	150921	150930	60 %	40 %	0 %	0 %	90961117
135	NC_007929	TATCG	2	10	150953	150962	20 %	40 %	20 %	20 %	90961117
136	NC_007929	AATAA	2	10	151569	151578	80 %	20 %	0 %	0 %	90961117
137	NC_007929	GTTAC	2	10	152597	152606	20 %	40 %	20 %	20 %	90961119
138	NC_007929	TGTAT	2	10	152649	152658	20 %	60 %	20 %	0 %	90961119
139	NC_007929	AAGAT	2	10	152675	152684	60 %	20 %	20 %	0 %	90961119
140	NC_007929	GTACC	2	10	153866	153875	20 %	20 %	20 %	40 %	90961120
141	NC_007929	ACCAT	2	10	154794	154803	40 %	20 %	0 %	40 %	90961121
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