MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 chromosome

Total Repeats: 5583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007929	GCTA	2	8	70	77	25 %	25 %	25 %	25 %	90960991
2	NC_007929	ACAA	2	8	600	607	75 %	0 %	0 %	25 %	90960991
3	NC_007929	ACTA	2	8	1080	1087	50 %	25 %	0 %	25 %	90960991
4	NC_007929	GAAA	2	8	1148	1155	75 %	0 %	25 %	0 %	90960991
5	NC_007929	AACA	2	8	1800	1807	75 %	0 %	0 %	25 %	90960992
6	NC_007929	TTGC	2	8	2048	2055	0 %	50 %	25 %	25 %	90960992
7	NC_007929	TCAA	2	8	2344	2351	50 %	25 %	0 %	25 %	90960992
8	NC_007929	GTAG	2	8	2964	2971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007929	AAAG	2	8	3069	3076	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007929	AGAC	2	8	3110	3117	50 %	0 %	25 %	25 %	90960993
11	NC_007929	ATTA	2	8	3512	3519	50 %	50 %	0 %	0 %	90960994
12	NC_007929	TTTG	2	8	3650	3657	0 %	75 %	25 %	0 %	90960994
13	NC_007929	TTTA	2	8	3742	3749	25 %	75 %	0 %	0 %	90960994
14	NC_007929	ACAA	2	8	3809	3816	75 %	0 %	0 %	25 %	90960994
15	NC_007929	TTGA	2	8	4038	4045	25 %	50 %	25 %	0 %	90960994
16	NC_007929	TGAG	2	8	4264	4271	25 %	25 %	50 %	0 %	90960994
17	NC_007929	TTAA	2	8	4368	4375	50 %	50 %	0 %	0 %	90960994
18	NC_007929	TAAT	2	8	5379	5386	50 %	50 %	0 %	0 %	90960995
19	NC_007929	ACAA	2	8	5506	5513	75 %	0 %	0 %	25 %	90960995
20	NC_007929	TAGA	2	8	5877	5884	50 %	25 %	25 %	0 %	90960995
21	NC_007929	TTCG	2	8	5904	5911	0 %	50 %	25 %	25 %	90960995
22	NC_007929	GAAT	3	12	6597	6608	50 %	25 %	25 %	0 %	90960996
23	NC_007929	GTTA	2	8	6943	6950	25 %	50 %	25 %	0 %	90960996
24	NC_007929	AAAG	2	8	7552	7559	75 %	0 %	25 %	0 %	90960996
25	NC_007929	AGAT	2	8	7663	7670	50 %	25 %	25 %	0 %	90960996
26	NC_007929	TAAT	2	8	8199	8206	50 %	50 %	0 %	0 %	90960996
27	NC_007929	ATTA	2	8	8824	8831	50 %	50 %	0 %	0 %	90960996
28	NC_007929	TTAC	2	8	9233	9240	25 %	50 %	0 %	25 %	90960997
29	NC_007929	TTGG	2	8	9755	9762	0 %	50 %	50 %	0 %	90960998
30	NC_007929	GACG	2	8	9767	9774	25 %	0 %	50 %	25 %	90960998
31	NC_007929	TCAA	2	8	9979	9986	50 %	25 %	0 %	25 %	90960998
32	NC_007929	CAAA	2	8	11764	11771	75 %	0 %	0 %	25 %	90961001
33	NC_007929	ATGC	2	8	11913	11920	25 %	25 %	25 %	25 %	90961001
34	NC_007929	TGTA	2	8	11998	12005	25 %	50 %	25 %	0 %	90961001
35	NC_007929	AAGT	2	8	12799	12806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007929	CAAT	2	8	12814	12821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007929	GTTA	2	8	12999	13006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007929	AACA	2	8	13351	13358	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007929	GTAC	2	8	13602	13609	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007929	CTTT	2	8	13791	13798	0 %	75 %	0 %	25 %	90961002
41	NC_007929	GTAT	2	8	14043	14050	25 %	50 %	25 %	0 %	90961002
42	NC_007929	TTCC	2	8	14247	14254	0 %	50 %	0 %	50 %	90961002
43	NC_007929	GTAG	2	8	14456	14463	25 %	25 %	50 %	0 %	90961002
44	NC_007929	ACCT	2	8	14889	14896	25 %	25 %	0 %	50 %	90961002
45	NC_007929	ATTT	2	8	15496	15503	25 %	75 %	0 %	0 %	90961002
46	NC_007929	AGTG	2	8	15703	15710	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007929	TAGA	2	8	16256	16263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007929	ATTT	2	8	16297	16304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007929	TAAA	2	8	16310	16317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007929	ATAA	2	8	16378	16385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007929	ATAA	2	8	16836	16843	75 %	25 %	0 %	0 %	90961003
52	NC_007929	TAAA	2	8	16850	16857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007929	CTTT	2	8	17222	17229	0 %	75 %	0 %	25 %	90961004
54	NC_007929	TAAG	2	8	17814	17821	50 %	25 %	25 %	0 %	90961004
55	NC_007929	TTTC	2	8	18114	18121	0 %	75 %	0 %	25 %	90961004
56	NC_007929	ATGA	2	8	19108	19115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007929	AATT	2	8	19283	19290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007929	TAAC	2	8	20033	20040	50 %	25 %	0 %	25 %	90961006
59	NC_007929	TTAT	2	8	20098	20105	25 %	75 %	0 %	0 %	90961006
60	NC_007929	ATTG	2	8	21590	21597	25 %	50 %	25 %	0 %	90961007
61	NC_007929	TATT	2	8	21625	21632	25 %	75 %	0 %	0 %	90961007
62	NC_007929	AATT	2	8	22426	22433	50 %	50 %	0 %	0 %	90961007
63	NC_007929	ATTA	2	8	22496	22503	50 %	50 %	0 %	0 %	90961007
64	NC_007929	AATT	2	8	23056	23063	50 %	50 %	0 %	0 %	90961008
65	NC_007929	AAGA	2	8	23188	23195	75 %	0 %	25 %	0 %	90961008
66	NC_007929	AATA	2	8	23280	23287	75 %	25 %	0 %	0 %	90961008
67	NC_007929	GATT	2	8	23486	23493	25 %	50 %	25 %	0 %	90961009
68	NC_007929	AATT	2	8	24217	24224	50 %	50 %	0 %	0 %	90961009
69	NC_007929	TGAC	2	8	24422	24429	25 %	25 %	25 %	25 %	90961009
70	NC_007929	AAAG	2	8	24595	24602	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007929	TAAA	2	8	24737	24744	75 %	25 %	0 %	0 %	90961010
72	NC_007929	TAAT	2	8	24851	24858	50 %	50 %	0 %	0 %	90961010
73	NC_007929	AGCC	2	8	24964	24971	25 %	0 %	25 %	50 %	90961010
74	NC_007929	TTGA	2	8	25066	25073	25 %	50 %	25 %	0 %	90961010
75	NC_007929	AACT	2	8	25287	25294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007929	TGGT	2	8	25483	25490	0 %	50 %	50 %	0 %	90961011
77	NC_007929	TGCT	2	8	25559	25566	0 %	50 %	25 %	25 %	90961011
78	NC_007929	ATTT	2	8	25589	25596	25 %	75 %	0 %	0 %	90961011
79	NC_007929	ATTT	2	8	26084	26091	25 %	75 %	0 %	0 %	90961011
80	NC_007929	TGAC	2	8	26390	26397	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007929	GAAA	2	8	26580	26587	75 %	0 %	25 %	0 %	90961012
82	NC_007929	AGAA	2	8	27264	27271	75 %	0 %	25 %	0 %	90961012
83	NC_007929	GTTG	2	8	27564	27571	0 %	50 %	50 %	0 %	90961012
84	NC_007929	ATTA	2	8	27756	27763	50 %	50 %	0 %	0 %	90961012
85	NC_007929	AATG	2	8	27984	27991	50 %	25 %	25 %	0 %	90961013
86	NC_007929	AAAT	2	8	28493	28500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007929	ATTA	2	8	28745	28752	50 %	50 %	0 %	0 %	90961014
88	NC_007929	TGTT	2	8	29161	29168	0 %	75 %	25 %	0 %	90961014
89	NC_007929	TAAA	2	8	29489	29496	75 %	25 %	0 %	0 %	90961014
90	NC_007929	AAGT	2	8	30115	30122	50 %	25 %	25 %	0 %	90961015
91	NC_007929	AATG	2	8	30184	30191	50 %	25 %	25 %	0 %	90961015
92	NC_007929	TTAG	2	8	31117	31124	25 %	50 %	25 %	0 %	90961015
93	NC_007929	GATA	2	8	31268	31275	50 %	25 %	25 %	0 %	90961015
94	NC_007929	TTAA	2	8	31484	31491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007929	AATT	2	8	31800	31807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007929	AGAT	2	8	31947	31954	50 %	25 %	25 %	0 %	90961016
97	NC_007929	AAAC	2	8	32119	32126	75 %	0 %	0 %	25 %	90961016
98	NC_007929	GCAT	2	8	32642	32649	25 %	25 %	25 %	25 %	90961016
99	NC_007929	AATT	2	8	32771	32778	50 %	50 %	0 %	0 %	90961017
100	NC_007929	ATAA	2	8	33067	33074	75 %	25 %	0 %	0 %	90961017
101	NC_007929	ATTA	2	8	34010	34017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007929	GTAA	2	8	34727	34734	50 %	25 %	25 %	0 %	90961018
103	NC_007929	AAAG	2	8	34948	34955	75 %	0 %	25 %	0 %	90961018
104	NC_007929	GAAA	2	8	35248	35255	75 %	0 %	25 %	0 %	90961019
105	NC_007929	TGGC	2	8	35431	35438	0 %	25 %	50 %	25 %	90961019
106	NC_007929	ATTC	2	8	35490	35497	25 %	50 %	0 %	25 %	90961019
107	NC_007929	AAGC	2	8	36221	36228	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007929	GTTA	2	8	36305	36312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007929	CATC	2	8	36637	36644	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007929	CCAT	2	8	37020	37027	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007929	CTTG	2	8	37280	37287	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_007929	TTAT	2	8	37860	37867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007929	CAAT	2	8	38269	38276	50 %	25 %	0 %	25 %	90961021
114	NC_007929	TAAT	2	8	38878	38885	50 %	50 %	0 %	0 %	90961022
115	NC_007929	AATG	2	8	40121	40128	50 %	25 %	25 %	0 %	90961022
116	NC_007929	CTAT	2	8	41068	41075	25 %	50 %	0 %	25 %	90961023
117	NC_007929	TATT	2	8	41202	41209	25 %	75 %	0 %	0 %	90961023
118	NC_007929	GCCA	2	8	41623	41630	25 %	0 %	25 %	50 %	90961023
119	NC_007929	GAAA	2	8	41988	41995	75 %	0 %	25 %	0 %	90961023
120	NC_007929	TAGT	2	8	42350	42357	25 %	50 %	25 %	0 %	90961024
121	NC_007929	GTAA	2	8	42736	42743	50 %	25 %	25 %	0 %	90961024
122	NC_007929	AGAA	2	8	44660	44667	75 %	0 %	25 %	0 %	90961026
123	NC_007929	ATTC	2	8	45386	45393	25 %	50 %	0 %	25 %	90961026
124	NC_007929	AAAG	2	8	45521	45528	75 %	0 %	25 %	0 %	90961026
125	NC_007929	ATTT	2	8	46228	46235	25 %	75 %	0 %	0 %	90961027
126	NC_007929	AAGT	2	8	46265	46272	50 %	25 %	25 %	0 %	90961027
127	NC_007929	CAGT	2	8	46327	46334	25 %	25 %	25 %	25 %	90961027
128	NC_007929	TAAT	2	8	46415	46422	50 %	50 %	0 %	0 %	90961027
129	NC_007929	GATT	2	8	47031	47038	25 %	50 %	25 %	0 %	90961027
130	NC_007929	TGAA	2	8	47072	47079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007929	TTCT	2	8	47109	47116	0 %	75 %	0 %	25 %	90961028
132	NC_007929	AAAT	2	8	47248	47255	75 %	25 %	0 %	0 %	90961028
133	NC_007929	TTAA	2	8	47397	47404	50 %	50 %	0 %	0 %	90961028
134	NC_007929	AATT	2	8	48159	48166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007929	GATG	2	8	48981	48988	25 %	25 %	50 %	0 %	90961029
136	NC_007929	AAAG	2	8	49166	49173	75 %	0 %	25 %	0 %	90961029
137	NC_007929	ATTA	2	8	49187	49194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007929	AATT	2	8	50084	50091	50 %	50 %	0 %	0 %	90961030
139	NC_007929	ATCA	2	8	50278	50285	50 %	25 %	0 %	25 %	90961030
140	NC_007929	ATTA	2	8	50569	50576	50 %	50 %	0 %	0 %	90961030
141	NC_007929	AGAT	2	8	50600	50607	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007929	AATT	2	8	50807	50814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007929	GAAA	2	8	51134	51141	75 %	0 %	25 %	0 %	90961031
144	NC_007929	TTGC	2	8	51576	51583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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146	NC_007929	GACT	2	8	52057	52064	25 %	25 %	25 %	25 %	90961032
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