MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 chromosome

Total Repeats: 4209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007929	TAA	2	6	1381	1386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007929	CAA	2	6	1404	1409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007929	CTA	2	6	1472	1477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007929	TAC	2	6	1479	1484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007929	AAT	2	6	1495	1500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007929	AGG	2	6	1516	1521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007929	TTA	2	6	2694	2699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007929	ATC	2	6	2788	2793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007929	ACA	2	6	2799	2804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007929	GTC	2	6	2881	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007929	AGG	2	6	6432	6437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007929	ATT	2	6	9065	9070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007929	AGG	2	6	9200	9205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007929	AGG	2	6	9535	9540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007929	GAG	2	6	10107	10112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007929	CTT	2	6	11290	11295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007929	TAA	2	6	11323	11328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007929	AAT	2	6	11343	11348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007929	GAA	2	6	11356	11361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007929	ATT	2	6	12560	12565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007929	AAT	2	6	12638	12643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007929	ATG	2	6	12708	12713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007929	TAG	2	6	12848	12853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007929	TCT	2	6	12894	12899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007929	ACC	2	6	12934	12939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_007929	CTA	2	6	12982	12987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007929	TTC	2	6	13015	13020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007929	CAA	2	6	13113	13118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007929	CAA	2	6	13131	13136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007929	GGA	2	6	13149	13154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007929	CTC	2	6	13186	13191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_007929	TAA	2	6	13232	13237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007929	CAT	2	6	13252	13257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007929	CAA	2	6	13261	13266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007929	CTG	2	6	13276	13281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007929	AAT	2	6	13335	13340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007929	AAC	2	6	13381	13386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007929	ACA	2	6	13436	13441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007929	AAG	2	6	13450	13455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007929	ATT	2	6	13473	13478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007929	TAA	2	6	13490	13495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007929	ACT	2	6	13565	13570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007929	ATT	2	6	13591	13596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007929	TTG	2	6	15657	15662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007929	CAT	3	9	15891	15899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007929	ATT	2	6	15971	15976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007929	TAT	2	6	16045	16050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007929	TTA	2	6	16075	16080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007929	ACA	2	6	16098	16103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007929	TTA	2	6	16229	16234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007929	ATT	2	6	16249	16254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007929	TAA	2	6	16398	16403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007929	ATT	3	9	16443	16451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007929	AGG	2	6	16452	16457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007929	ATT	2	6	16458	16463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007929	TAA	2	6	18851	18856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007929	AAT	2	6	18881	18886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007929	TTA	2	6	19027	19032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007929	ACT	2	6	19068	19073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007929	TAA	2	6	19086	19091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007929	TTA	2	6	19304	19309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007929	ATA	2	6	19734	19739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007929	CAA	2	6	23304	23309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007929	AGT	2	6	24549	24554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007929	TAG	2	6	24588	24593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007929	AAT	2	6	24606	24611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007929	TAA	3	9	24646	24654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007929	ATA	2	6	25302	25307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007929	TAA	2	6	26242	26247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007929	TGA	2	6	26289	26294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007929	TAT	2	6	26320	26325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007929	ACA	2	6	26432	26437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007929	ACA	2	6	28462	28467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007929	GTT	2	6	28509	28514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007929	TAA	2	6	31478	31483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007929	GAT	2	6	31593	31598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007929	AGG	2	6	31599	31604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007929	TGT	3	9	31647	31655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007929	AAT	2	6	31693	31698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007929	TGA	2	6	31814	31819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007929	TAA	2	6	33971	33976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007929	ATT	2	6	35187	35192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007929	ATG	2	6	35216	35221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007929	TAT	2	6	35755	35760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007929	TGA	2	6	35789	35794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007929	AAT	2	6	36240	36245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007929	CTA	2	6	36337	36342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007929	ACA	2	6	36443	36448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007929	AAC	2	6	36498	36503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007929	TAC	2	6	36596	36601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007929	TGT	2	6	36689	36694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007929	GTA	2	6	36715	36720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007929	ATG	2	6	36736	36741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007929	GTT	2	6	36839	36844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007929	GTA	2	6	36892	36897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007929	GTG	2	6	36982	36987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007929	ACC	2	6	37056	37061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_007929	GTT	2	6	37063	37068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007929	ATC	2	6	37113	37118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007929	TCT	2	6	37124	37129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007929	AGC	2	6	37137	37142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007929	TAA	2	6	37181	37186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007929	AGC	2	6	37194	37199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007929	AGT	2	6	37317	37322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007929	TTA	2	6	37372	37377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007929	TAA	2	6	37406	37411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007929	TAG	2	6	37640	37645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007929	GTT	2	6	37701	37706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007929	TCC	2	6	37739	37744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_007929	AGA	2	6	37795	37800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007929	CCA	2	6	37806	37811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_007929	AAT	2	6	38004	38009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007929	AAG	2	6	38529	38534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007929	TAG	2	6	42109	42114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007929	TAG	2	6	43116	43121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007929	AGG	2	6	43124	43129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007929	ATT	2	6	47968	47973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007929	CAT	2	6	47990	47995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007929	GAA	2	6	48019	48024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007929	CAC	2	6	48050	48055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_007929	ATT	2	6	48077	48082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007929	AGA	2	6	48127	48132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007929	GAA	2	6	48169	48174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007929	GTT	2	6	48258	48263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007929	TTA	3	9	48324	48332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007929	GTT	2	6	50655	50660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007929	TAA	2	6	50735	50740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007929	TAA	2	6	50757	50762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007929	ATA	2	6	50780	50785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007929	TGT	2	6	51509	51514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007929	AGT	2	6	51526	51531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007929	AAC	2	6	54522	54527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007929	ATA	2	6	54593	54598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007929	CAG	2	6	54609	54614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007929	AGA	3	9	54628	54636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007929	ACG	2	6	54651	54656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007929	CTT	2	6	56131	56136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007929	AGA	2	6	56216	56221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007929	CCT	2	6	56263	56268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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141	NC_007929	TTA	2	6	56943	56948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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