MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB18 chromosome

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007925	TGGATC	2	12	2449	2460	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_007925	GAACCA	2	12	31348	31359	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007925	GCCTCC	2	12	44802	44813	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_007925	TGGGGG	2	12	47752	47763	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007925	TTGGCC	2	12	50178	50189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007925	CCGCGC	2	12	58795	58806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007925	TGCGGC	2	12	58947	58958	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007925	GACGCG	2	12	99602	99613	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007925	CGAACG	2	12	136937	136948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007925	GCACGC	2	12	141075	141086	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007925	CCAGAT	2	12	141461	141472	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007925	GTCGAT	2	12	141731	141742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_007925	GCGCGA	2	12	199401	199412	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007925	CGTTGA	2	12	221874	221885	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_007925	GGGGGT	2	12	226714	226725	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007925	CACCGA	2	12	227524	227535	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007925	CGTTGC	2	12	246866	246877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007925	AGCTTC	2	12	250232	250243	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007925	CGTTTT	2	12	296513	296524	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_007925	CGGAGA	2	12	310589	310600	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007925	GGGGGT	2	12	328490	328501	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007925	CTGCAA	2	12	337093	337104	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007925	GGGGGT	2	12	365098	365109	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007925	GCTGAC	3	18	400324	400341	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007925	TTTCGG	2	12	409307	409318	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007925	GCCGGC	2	12	512149	512160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007925	CCGCGG	2	12	512238	512249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007925	GCAATG	2	12	545214	545225	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_007925	ACCCCC	2	12	569726	569737	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
30	NC_007925	GCGCCG	2	12	604261	604272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007925	TGTGGT	2	12	614839	614850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007925	TCGGCG	2	12	676561	676572	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007925	ATTAAT	2	12	734059	734070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007925	CGAGCG	2	12	789665	789676	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007925	AGCGGC	2	12	791481	791492	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007925	GGGGGT	2	12	806958	806969	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007925	TCGGCC	2	12	814636	814647	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007925	CCCGCG	2	12	865086	865097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_007925	CGCTTG	2	12	865258	865269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007925	TAGAAA	2	12	870262	870273	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007925	CCCGGC	2	12	903775	903786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_007925	CGCTTC	2	12	922668	922679	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007925	AAAATC	2	12	928569	928580	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007925	TTCCGC	2	12	996372	996383	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007925	CACCCC	2	12	1002717	1002728	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
46	NC_007925	GGGGGT	2	12	1003489	1003500	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007925	CGGCGC	2	12	1080567	1080578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007925	CGTGCG	2	12	1092236	1092247	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007925	TGATCT	2	12	1098843	1098854	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007925	CGATCT	2	12	1109868	1109879	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007925	AGGCCG	2	12	1139533	1139544	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007925	GGCGCT	2	12	1139861	1139872	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007925	TCGCCG	2	12	1190008	1190019	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007925	GCCGCG	2	12	1224942	1224953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007925	TGCCGA	2	12	1225046	1225057	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007925	TCGCCG	2	12	1225134	1225145	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007925	CTTTAT	3	18	1226578	1226595	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007925	GGGGGT	2	12	1241579	1241590	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007925	ACCCCC	2	12	1241679	1241690	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
60	NC_007925	CGTCGC	2	12	1256908	1256919	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007925	ACGGCG	2	12	1324195	1324206	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007925	TCCGCT	2	12	1341121	1341132	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007925	GGTCGA	2	12	1384131	1384142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007925	TGGCGC	2	12	1466678	1466689	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007925	GGGGGT	2	12	1498237	1498248	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007925	ACCCCC	2	12	1509790	1509801	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
67	NC_007925	GCCGTC	2	12	1514242	1514253	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007925	CTACGC	2	12	1516359	1516370	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007925	GGGAGA	3	18	1533255	1533272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007925	CGCTCC	2	12	1534393	1534404	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_007925	ACCCCC	2	12	1541410	1541421	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
72	NC_007925	CTGCGG	2	12	1546962	1546973	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007925	CGGCGC	2	12	1559663	1559674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007925	TTGCCG	2	12	1596642	1596653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007925	GGTAAT	2	12	1611008	1611019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007925	CCGCGC	2	12	1615466	1615477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_007925	GGGCGC	2	12	1623851	1623862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007925	GCCCAC	2	12	1624148	1624159	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_007925	ACGCCT	2	12	1685349	1685360	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007925	AAAAGC	2	12	1697778	1697789	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_007925	GCCAGG	2	12	1699197	1699208	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007925	CGCGAT	2	12	1714711	1714722	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007925	TGCCGC	2	12	1716177	1716188	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007925	CGAGAT	2	12	1719140	1719151	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_007925	GTGGGC	2	12	1731764	1731775	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007925	ATCTCG	2	12	1803085	1803096	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007925	GATCCT	2	12	1803256	1803267	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007925	GGCCCG	2	12	1819619	1819630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007925	CGATGA	2	12	1825463	1825474	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_007925	GAGCGG	2	12	1843942	1843953	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_007925	TGCGGC	2	12	1878611	1878622	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007925	GGCAAC	2	12	1881152	1881163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007925	ACCGGG	2	12	1907081	1907092	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007925	GCAACG	2	12	1973593	1973604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007925	AGCGCG	2	12	1995550	1995561	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007925	GTCTTG	2	12	2024585	2024596	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_007925	GCAGCC	2	12	2025331	2025342	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007925	GCGCCG	2	12	2028788	2028799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007925	GGACCG	2	12	2063713	2063724	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007925	TCGCGG	2	12	2069570	2069581	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007925	TCCGCA	2	12	2094981	2094992	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007925	CCGCGA	2	12	2167004	2167015	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007925	GACGTG	2	12	2185595	2185606	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_007925	AGCGCC	2	12	2227113	2227124	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007925	GCGACG	2	12	2252066	2252077	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007925	AACCAA	2	12	2313088	2313099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007925	ACCCCC	3	18	2329621	2329638	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
108	NC_007925	AGGGGG	2	12	2329653	2329664	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007925	CTGAAC	2	12	2340203	2340214	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007925	CTGGTA	2	12	2365355	2365366	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_007925	GGGGGT	2	12	2427619	2427630	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007925	CCGGCT	2	12	2516077	2516088	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007925	ACGGTC	2	12	2518302	2518313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007925	CGCGAG	2	12	2549602	2549613	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007925	CCGTCT	2	12	2558617	2558628	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007925	GCCGGC	2	12	2584467	2584478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007925	AATAGC	2	12	2605799	2605810	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_007925	ACCGCG	2	12	2625086	2625097	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007925	CGGCCG	2	12	2632107	2632118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007925	TGAAAT	2	12	2644704	2644715	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007925	ATGCGG	2	12	2671645	2671656	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_007925	ACGCGC	2	12	2706859	2706870	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007925	TTGGAG	2	12	2755726	2755737	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007925	GAGCGC	2	12	2794675	2794686	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007925	TCACCA	2	12	2822272	2822283	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007925	GACGCC	2	12	2897495	2897506	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007925	GCCGCT	2	12	2941146	2941157	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007925	CCGTCG	2	12	2979931	2979942	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007925	GGGAGC	2	12	2979965	2979976	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_007925	TGGGCC	2	12	2989542	2989553	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007925	TTTCGG	2	12	3022502	3022513	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_007925	GGCGTC	2	12	3026796	3026807	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007925	GTCGCG	2	12	3026817	3026828	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007925	CTTGGC	2	12	3033946	3033957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007925	AGTACG	2	12	3081935	3081946	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_007925	AGTTCG	2	12	3081951	3081962	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_007925	ATTGAT	2	12	3179538	3179549	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007925	GCGCGG	2	12	3208001	3208012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007925	GCCAAA	2	12	3209828	3209839	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007925	TCGATC	2	12	3210060	3210071	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007925	AGAACT	2	12	3228398	3228409	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_007925	GGGATC	2	12	3233458	3233469	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_007925	GCCGGC	2	12	3277866	3277877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_007925	CGCGGC	2	12	3297721	3297732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_007925	TTTGAC	2	12	3360349	3360360	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_007925	CGCGAC	2	12	3376402	3376413	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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149	NC_007925	CCGCGC	2	12	3400145	3400156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_007925	TCGTGC	2	12	3437739	3437750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_007925	GCGGCA	2	12	3448837	3448848	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_007925	CGGACC	2	12	3475804	3475815	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
153	NC_007925	TCCCCG	2	12	3481407	3481418	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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156	NC_007925	CAACCA	2	12	3533145	3533156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_007925	CGCTGG	2	12	3601652	3601663	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_007925	TGGGGG	2	12	3608181	3608192	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_007925	CAGTGC	2	12	3618258	3618269	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_007925	CACAAA	2	12	3635277	3635288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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163	NC_007925	CGGATG	2	12	3688596	3688607	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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242	NC_007925	GAAACA	2	12	5364283	5364294	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
243	NC_007925	CAAAAT	2	12	5365320	5365331	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
244	NC_007925	GAAAGC	2	12	5425078	5425089	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
245	NC_007925	ATGGCG	2	12	5501521	5501532	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.