MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB18 chromosome

Total Repeats: 4034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007925	GCCGC	2	10	1054	1063	0 %	0 %	40 %	60 %	90421529
2	NC_007925	GCAAG	2	10	1480	1489	40 %	0 %	40 %	20 %	90421529
3	NC_007925	ACCAC	2	10	2073	2082	40 %	0 %	0 %	60 %	90421529
4	NC_007925	GCGCC	2	10	3932	3941	0 %	0 %	40 %	60 %	90421531
5	NC_007925	TCGGC	2	10	4099	4108	0 %	20 %	40 %	40 %	90421531
6	NC_007925	CGGCC	2	10	5207	5216	0 %	0 %	40 %	60 %	90421532
7	NC_007925	CGGCA	2	10	5355	5364	20 %	0 %	40 %	40 %	90421532
8	NC_007925	CACGA	2	10	6150	6159	40 %	0 %	20 %	40 %	90421532
9	NC_007925	GTGCT	2	10	7448	7457	0 %	40 %	40 %	20 %	90421533
10	NC_007925	GCCGC	2	10	8989	8998	0 %	0 %	40 %	60 %	90421533
11	NC_007925	GCGAT	2	10	10431	10440	20 %	20 %	40 %	20 %	90421535
12	NC_007925	AATCG	2	10	12483	12492	40 %	20 %	20 %	20 %	90421537
13	NC_007925	CCCAG	2	10	12644	12653	20 %	0 %	20 %	60 %	90421537
14	NC_007925	GCCGG	2	10	16127	16136	0 %	0 %	60 %	40 %	90421540
15	NC_007925	TCCGG	2	10	17334	17343	0 %	20 %	40 %	40 %	90421542
16	NC_007925	GTCGC	2	10	21209	21218	0 %	20 %	40 %	40 %	90421545
17	NC_007925	GTTGC	3	15	21303	21317	0 %	40 %	40 %	20 %	90421545
18	NC_007925	CGCGC	2	10	21649	21658	0 %	0 %	40 %	60 %	90421546
19	NC_007925	TGGCG	2	10	26531	26540	0 %	20 %	60 %	20 %	90421550
20	NC_007925	CGGCG	2	10	27866	27875	0 %	0 %	60 %	40 %	90421551
21	NC_007925	CCACA	2	10	28402	28411	40 %	0 %	0 %	60 %	90421551
22	NC_007925	CGCGG	2	10	29245	29254	0 %	0 %	60 %	40 %	90421551
23	NC_007925	ACCGC	2	10	29743	29752	20 %	0 %	20 %	60 %	90421552
24	NC_007925	GCCGC	2	10	31499	31508	0 %	0 %	40 %	60 %	90421553
25	NC_007925	GCGCC	2	10	32531	32540	0 %	0 %	40 %	60 %	90421553
26	NC_007925	GCCCT	2	10	34103	34112	0 %	20 %	20 %	60 %	90421557
27	NC_007925	GCGCC	2	10	35295	35304	0 %	0 %	40 %	60 %	90421558
28	NC_007925	GCCGC	2	10	35952	35961	0 %	0 %	40 %	60 %	90421558
29	NC_007925	GTCCG	2	10	38860	38869	0 %	20 %	40 %	40 %	90421560
30	NC_007925	TGATC	2	10	40070	40079	20 %	40 %	20 %	20 %	90421562
31	NC_007925	CCGCG	2	10	42799	42808	0 %	0 %	40 %	60 %	90421565
32	NC_007925	GTGCT	2	10	45129	45138	0 %	40 %	40 %	20 %	90421567
33	NC_007925	GGCGA	2	10	48147	48156	20 %	0 %	60 %	20 %	90421570
34	NC_007925	TGCGC	2	10	54397	54406	0 %	20 %	40 %	40 %	90421575
35	NC_007925	GCCCG	2	10	56109	56118	0 %	0 %	40 %	60 %	90421576
36	NC_007925	GCCGC	2	10	58099	58108	0 %	0 %	40 %	60 %	90421577
37	NC_007925	GCGCC	2	10	59712	59721	0 %	0 %	40 %	60 %	90421579
38	NC_007925	CGGCT	2	10	60635	60644	0 %	20 %	40 %	40 %	90421580
39	NC_007925	GGCCA	2	10	63658	63667	20 %	0 %	40 %	40 %	90421583
40	NC_007925	ACCGC	2	10	67977	67986	20 %	0 %	20 %	60 %	90421588
41	NC_007925	TCGGC	2	10	69464	69473	0 %	20 %	40 %	40 %	90421589
42	NC_007925	TCGGC	2	10	71317	71326	0 %	20 %	40 %	40 %	90421590
43	NC_007925	CGCGG	2	10	71599	71608	0 %	0 %	60 %	40 %	90421590
44	NC_007925	TCGCG	2	10	73730	73739	0 %	20 %	40 %	40 %	90421592
45	NC_007925	CGCGG	2	10	74153	74162	0 %	0 %	60 %	40 %	90421592
46	NC_007925	CGGCG	2	10	74772	74781	0 %	0 %	60 %	40 %	90421593
47	NC_007925	CGCGA	2	10	76396	76405	20 %	0 %	40 %	40 %	90421593
48	NC_007925	GGTCG	2	10	76909	76918	0 %	20 %	60 %	20 %	90421595
49	NC_007925	TGACG	2	10	77161	77170	20 %	20 %	40 %	20 %	90421595
50	NC_007925	CTGAT	2	10	78551	78560	20 %	40 %	20 %	20 %	90421597
51	NC_007925	GCGCA	2	10	79486	79495	20 %	0 %	40 %	40 %	90421598
52	NC_007925	CGCGG	2	10	79500	79509	0 %	0 %	60 %	40 %	90421598
53	NC_007925	GAGCC	2	10	79540	79549	20 %	0 %	40 %	40 %	90421598
54	NC_007925	TGCGC	2	10	80342	80351	0 %	20 %	40 %	40 %	90421598
55	NC_007925	GGCGC	2	10	81171	81180	0 %	0 %	60 %	40 %	90421599
56	NC_007925	GCGCC	2	10	84740	84749	0 %	0 %	40 %	60 %	90421603
57	NC_007925	GTGAA	2	10	86856	86865	40 %	20 %	40 %	0 %	90421605
58	NC_007925	CGGCG	2	10	90129	90138	0 %	0 %	60 %	40 %	90421607
59	NC_007925	CGGCG	2	10	90239	90248	0 %	0 %	60 %	40 %	90421607
60	NC_007925	CGCGG	2	10	90905	90914	0 %	0 %	60 %	40 %	90421608
61	NC_007925	ACCGC	2	10	90952	90961	20 %	0 %	20 %	60 %	90421608
62	NC_007925	CGGCG	2	10	97044	97053	0 %	0 %	60 %	40 %	90421613
63	NC_007925	AAGCG	2	10	98576	98585	40 %	0 %	40 %	20 %	90421614
64	NC_007925	CGGCG	2	10	100162	100171	0 %	0 %	60 %	40 %	90421616
65	NC_007925	ACGCC	2	10	102745	102754	20 %	0 %	20 %	60 %	90421619
66	NC_007925	TGCGC	2	10	109336	109345	0 %	20 %	40 %	40 %	90421624
67	NC_007925	ATCGG	2	10	110211	110220	20 %	20 %	40 %	20 %	90421624
68	NC_007925	CGGCT	2	10	111941	111950	0 %	20 %	40 %	40 %	90421625
69	NC_007925	ACCAC	2	10	113861	113870	40 %	0 %	0 %	60 %	90421627
70	NC_007925	CGACC	2	10	116565	116574	20 %	0 %	20 %	60 %	90421630
71	NC_007925	CGGCG	2	10	117738	117747	0 %	0 %	60 %	40 %	90421631
72	NC_007925	CGCGG	2	10	119377	119386	0 %	0 %	60 %	40 %	90421632
73	NC_007925	GCGAT	2	10	119582	119591	20 %	20 %	40 %	20 %	90421632
74	NC_007925	GCCGC	2	10	120597	120606	0 %	0 %	40 %	60 %	90421633
75	NC_007925	CGCGC	2	10	120787	120796	0 %	0 %	40 %	60 %	90421633
76	NC_007925	CCGCG	2	10	121498	121507	0 %	0 %	40 %	60 %	90421634
77	NC_007925	ATGCC	2	10	123335	123344	20 %	20 %	20 %	40 %	90421635
78	NC_007925	AGGTC	2	10	123345	123354	20 %	20 %	40 %	20 %	90421635
79	NC_007925	TCGCG	2	10	129078	129087	0 %	20 %	40 %	40 %	90421642
80	NC_007925	GCCGC	2	10	129228	129237	0 %	0 %	40 %	60 %	90421642
81	NC_007925	ATCCT	2	10	130097	130106	20 %	40 %	0 %	40 %	90421642
82	NC_007925	GCCCG	2	10	130582	130591	0 %	0 %	40 %	60 %	90421643
83	NC_007925	CCAGG	2	10	133592	133601	20 %	0 %	40 %	40 %	90421646
84	NC_007925	GCCCC	2	10	133820	133829	0 %	0 %	20 %	80 %	90421646
85	NC_007925	CGTGG	2	10	140228	140237	0 %	20 %	60 %	20 %	90421651
86	NC_007925	CAGGG	2	10	144382	144391	20 %	0 %	60 %	20 %	90421654
87	NC_007925	GCAAC	2	10	146259	146268	40 %	0 %	20 %	40 %	90421656
88	NC_007925	CCACG	2	10	146452	146461	20 %	0 %	20 %	60 %	90421656
89	NC_007925	TTTGC	2	10	147184	147193	0 %	60 %	20 %	20 %	90421657
90	NC_007925	GTCGA	2	10	147413	147422	20 %	20 %	40 %	20 %	90421657
91	NC_007925	AGCGC	2	10	149084	149093	20 %	0 %	40 %	40 %	90421659
92	NC_007925	GCACA	2	10	149994	150003	40 %	0 %	20 %	40 %	90421660
93	NC_007925	CCCGA	2	10	151559	151568	20 %	0 %	20 %	60 %	90421662
94	NC_007925	CGACC	2	10	157531	157540	20 %	0 %	20 %	60 %	90421666
95	NC_007925	GCCGC	2	10	158075	158084	0 %	0 %	40 %	60 %	90421666
96	NC_007925	CTGCT	2	10	160704	160713	0 %	40 %	20 %	40 %	90421669
97	NC_007925	TCTTG	2	10	160839	160848	0 %	60 %	20 %	20 %	90421669
98	NC_007925	GCGCG	2	10	164347	164356	0 %	0 %	60 %	40 %	90421673
99	NC_007925	TGTCC	2	10	164536	164545	0 %	40 %	20 %	40 %	90421673
100	NC_007925	CCGTT	2	10	165424	165433	0 %	40 %	20 %	40 %	90421673
101	NC_007925	GGACC	2	10	165511	165520	20 %	0 %	40 %	40 %	90421673
102	NC_007925	CTGAT	2	10	166492	166501	20 %	40 %	20 %	20 %	90421673
103	NC_007925	CGGAC	2	10	166724	166733	20 %	0 %	40 %	40 %	90421674
104	NC_007925	GCGCC	2	10	172585	172594	0 %	0 %	40 %	60 %	90421680
105	NC_007925	GCCGA	2	10	173112	173121	20 %	0 %	40 %	40 %	90421680
106	NC_007925	CGGCC	2	10	176473	176482	0 %	0 %	40 %	60 %	90421684
107	NC_007925	CCGCG	2	10	177424	177433	0 %	0 %	40 %	60 %	90421685
108	NC_007925	CCGCG	2	10	177673	177682	0 %	0 %	40 %	60 %	90421685
109	NC_007925	GCTGT	2	10	179963	179972	0 %	40 %	40 %	20 %	90421689
110	NC_007925	GCGCC	2	10	180286	180295	0 %	0 %	40 %	60 %	90421689
111	NC_007925	CGGCG	2	10	181284	181293	0 %	0 %	60 %	40 %	90421690
112	NC_007925	GCGCC	2	10	182076	182085	0 %	0 %	40 %	60 %	90421690
113	NC_007925	GCGCG	2	10	188739	188748	0 %	0 %	60 %	40 %	90421696
114	NC_007925	CCGCG	2	10	188804	188813	0 %	0 %	40 %	60 %	90421696
115	NC_007925	ATCTT	2	10	189908	189917	20 %	60 %	0 %	20 %	90421698
116	NC_007925	CGCGG	2	10	193705	193714	0 %	0 %	60 %	40 %	90421700
117	NC_007925	GAGTT	2	10	193753	193762	20 %	40 %	40 %	0 %	228918239
118	NC_007925	TCGAT	2	10	196325	196334	20 %	40 %	20 %	20 %	90421703
119	NC_007925	GCGCG	2	10	199177	199186	0 %	0 %	60 %	40 %	90421704
120	NC_007925	CTGGC	2	10	200168	200177	0 %	20 %	40 %	40 %	90421705
121	NC_007925	CGCGC	2	10	200341	200350	0 %	0 %	40 %	60 %	90421706
122	NC_007925	TGCGC	2	10	200729	200738	0 %	20 %	40 %	40 %	90421706
123	NC_007925	CCGAG	2	10	201745	201754	20 %	0 %	40 %	40 %	90421707
124	NC_007925	GTCCG	2	10	202750	202759	0 %	20 %	40 %	40 %	90421709
125	NC_007925	CGAGC	2	10	203189	203198	20 %	0 %	40 %	40 %	90421710
126	NC_007925	AGCAC	2	10	206587	206596	40 %	0 %	20 %	40 %	90421715
127	NC_007925	CGGTG	2	10	207358	207367	0 %	20 %	60 %	20 %	90421715
128	NC_007925	AGGTC	2	10	208981	208990	20 %	20 %	40 %	20 %	90421715
129	NC_007925	GCCGG	2	10	209385	209394	0 %	0 %	60 %	40 %	90421716
130	NC_007925	TGCGG	2	10	212184	212193	0 %	20 %	60 %	20 %	90421718
131	NC_007925	GGCGA	2	10	213044	213053	20 %	0 %	60 %	20 %	90421719
132	NC_007925	TCCAG	2	10	214721	214730	20 %	20 %	20 %	40 %	90421720
133	NC_007925	GCTCG	2	10	215688	215697	0 %	20 %	40 %	40 %	90421722
134	NC_007925	GGCGC	2	10	215698	215707	0 %	0 %	60 %	40 %	90421722
135	NC_007925	TCGGT	2	10	216507	216516	0 %	40 %	40 %	20 %	90421723
136	NC_007925	CGCGC	2	10	217091	217100	0 %	0 %	40 %	60 %	90421723
137	NC_007925	GCGCG	2	10	218560	218569	0 %	0 %	60 %	40 %	90421723
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