MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB18 chromosome

Total Repeats: 13497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007925	CGAA	2	8	263	270	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007925	GGAT	2	8	849	856	25 %	25 %	50 %	0 %	90421529
3	NC_007925	CGCC	2	8	1023	1030	0 %	0 %	25 %	75 %	90421529
4	NC_007925	GCCG	2	8	1535	1542	0 %	0 %	50 %	50 %	90421529
5	NC_007925	CTCG	2	8	1642	1649	0 %	25 %	25 %	50 %	90421529
6	NC_007925	GTCC	2	8	1871	1878	0 %	25 %	25 %	50 %	90421529
7	NC_007925	CGCT	2	8	2033	2040	0 %	25 %	25 %	50 %	90421529
8	NC_007925	TTGC	2	8	2370	2377	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007925	CGAC	2	8	2611	2618	25 %	0 %	25 %	50 %	90421530
10	NC_007925	GATC	2	8	2891	2898	25 %	25 %	25 %	25 %	90421530
11	NC_007925	GTCG	2	8	3146	3153	0 %	25 %	50 %	25 %	90421530
12	NC_007925	CAGC	2	8	4226	4233	25 %	0 %	25 %	50 %	90421531
13	NC_007925	CTGG	2	8	4313	4320	0 %	25 %	50 %	25 %	90421531
14	NC_007925	TGGA	2	8	4461	4468	25 %	25 %	50 %	0 %	90421531
15	NC_007925	TCCA	2	8	5145	5152	25 %	25 %	0 %	50 %	90421532
16	NC_007925	CGCC	2	8	5279	5286	0 %	0 %	25 %	75 %	90421532
17	NC_007925	CGAT	2	8	5536	5543	25 %	25 %	25 %	25 %	90421532
18	NC_007925	GGCC	2	8	6390	6397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007925	CCCG	2	8	6611	6618	0 %	0 %	25 %	75 %	90421533
20	NC_007925	GGCC	2	8	6802	6809	0 %	0 %	50 %	50 %	90421533
21	NC_007925	GCCG	2	8	8816	8823	0 %	0 %	50 %	50 %	90421533
22	NC_007925	AGGC	2	8	9110	9117	25 %	0 %	50 %	25 %	90421534
23	NC_007925	CCAT	2	8	9709	9716	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007925	GCGA	2	8	9803	9810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007925	TCGA	2	8	10219	10226	25 %	25 %	25 %	25 %	90421535
26	NC_007925	CGGG	2	8	10581	10588	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007925	GCCC	2	8	10590	10597	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_007925	CCGG	2	8	10634	10641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007925	GCCG	2	8	10713	10720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007925	GTGG	2	8	10813	10820	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007925	ATCG	2	8	11163	11170	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007925	GCGG	2	8	11411	11418	0 %	0 %	75 %	25 %	90421536
33	NC_007925	CGCC	2	8	11443	11450	0 %	0 %	25 %	75 %	90421536
34	NC_007925	CGGC	2	8	11578	11585	0 %	0 %	50 %	50 %	90421537
35	NC_007925	GCGA	2	8	11866	11873	25 %	0 %	50 %	25 %	90421537
36	NC_007925	CGAT	2	8	13528	13535	25 %	25 %	25 %	25 %	90421537
37	NC_007925	CGGC	2	8	13934	13941	0 %	0 %	50 %	50 %	90421538
38	NC_007925	CCGG	2	8	13950	13957	0 %	0 %	50 %	50 %	90421538
39	NC_007925	GATC	2	8	15539	15546	25 %	25 %	25 %	25 %	90421539
40	NC_007925	GTAC	2	8	15892	15899	25 %	25 %	25 %	25 %	90421540
41	NC_007925	CGGT	2	8	16020	16027	0 %	25 %	50 %	25 %	90421540
42	NC_007925	CCTT	2	8	16203	16210	0 %	50 %	0 %	50 %	90421540
43	NC_007925	TCGG	2	8	17016	17023	0 %	25 %	50 %	25 %	90421542
44	NC_007925	CGAG	2	8	17392	17399	25 %	0 %	50 %	25 %	90421542
45	NC_007925	CGAG	2	8	17865	17872	25 %	0 %	50 %	25 %	90421543
46	NC_007925	GGCC	2	8	18348	18355	0 %	0 %	50 %	50 %	90421543
47	NC_007925	GCCG	2	8	18954	18961	0 %	0 %	50 %	50 %	90421543
48	NC_007925	GACC	2	8	20230	20237	25 %	0 %	25 %	50 %	90421544
49	NC_007925	CGAC	2	8	20671	20678	25 %	0 %	25 %	50 %	90421545
50	NC_007925	AATC	2	8	21554	21561	50 %	25 %	0 %	25 %	90421546
51	NC_007925	CGGC	2	8	22613	22620	0 %	0 %	50 %	50 %	90421547
52	NC_007925	AGTG	2	8	22854	22861	25 %	25 %	50 %	0 %	90421547
53	NC_007925	CGCC	2	8	22985	22992	0 %	0 %	25 %	75 %	90421547
54	NC_007925	CCGA	2	8	23049	23056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007925	CTGC	2	8	23078	23085	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007925	GCAC	2	8	23653	23660	25 %	0 %	25 %	50 %	90421548
57	NC_007925	CTCC	2	8	24265	24272	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_007925	TTTG	2	8	25724	25731	0 %	75 %	25 %	0 %	90421549
59	NC_007925	CGCT	2	8	27327	27334	0 %	25 %	25 %	50 %	90421550
60	NC_007925	CGAA	2	8	27564	27571	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007925	GCTC	2	8	27585	27592	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007925	TCGG	2	8	28053	28060	0 %	25 %	50 %	25 %	90421551
63	NC_007925	GGCC	2	8	28183	28190	0 %	0 %	50 %	50 %	90421551
64	NC_007925	CCGA	2	8	28366	28373	25 %	0 %	25 %	50 %	90421551
65	NC_007925	GGTC	2	8	29257	29264	0 %	25 %	50 %	25 %	90421551
66	NC_007925	CGGC	2	8	29302	29309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007925	GGCG	2	8	29551	29558	0 %	0 %	75 %	25 %	90421552
68	NC_007925	CCGG	2	8	30083	30090	0 %	0 %	50 %	50 %	90421552
69	NC_007925	CGGC	2	8	30178	30185	0 %	0 %	50 %	50 %	90421552
70	NC_007925	GACC	2	8	30805	30812	25 %	0 %	25 %	50 %	90421552
71	NC_007925	AGCG	2	8	30852	30859	25 %	0 %	50 %	25 %	90421552
72	NC_007925	CAGC	2	8	30905	30912	25 %	0 %	25 %	50 %	90421552
73	NC_007925	CGGT	2	8	31080	31087	0 %	25 %	50 %	25 %	90421552
74	NC_007925	CGGG	2	8	31404	31411	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007925	CACC	2	8	32130	32137	25 %	0 %	0 %	75 %	90421553
76	NC_007925	CGAG	2	8	32267	32274	25 %	0 %	50 %	25 %	90421553
77	NC_007925	TCCA	2	8	32515	32522	25 %	25 %	0 %	50 %	90421553
78	NC_007925	TCGG	2	8	32572	32579	0 %	25 %	50 %	25 %	90421553
79	NC_007925	CGGC	2	8	32890	32897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007925	CCCA	2	8	33271	33278	25 %	0 %	0 %	75 %	90421554
81	NC_007925	TCGA	2	8	33708	33715	25 %	25 %	25 %	25 %	90421556
82	NC_007925	GAAC	2	8	34050	34057	50 %	0 %	25 %	25 %	90421557
83	NC_007925	CGAC	2	8	34188	34195	25 %	0 %	25 %	50 %	90421557
84	NC_007925	GGCG	2	8	34561	34568	0 %	0 %	75 %	25 %	90421557
85	NC_007925	TCGG	2	8	34859	34866	0 %	25 %	50 %	25 %	90421558
86	NC_007925	CAGG	2	8	34911	34918	25 %	0 %	50 %	25 %	90421558
87	NC_007925	ATCG	2	8	36295	36302	25 %	25 %	25 %	25 %	90421558
88	NC_007925	GCCG	2	8	36693	36700	0 %	0 %	50 %	50 %	90421559
89	NC_007925	GTGG	2	8	37383	37390	0 %	25 %	75 %	0 %	90421559
90	NC_007925	GTCG	2	8	37407	37414	0 %	25 %	50 %	25 %	90421559
91	NC_007925	CTTC	2	8	37628	37635	0 %	50 %	0 %	50 %	90421559
92	NC_007925	GCCC	2	8	37925	37932	0 %	0 %	25 %	75 %	90421559
93	NC_007925	GCCA	2	8	38784	38791	25 %	0 %	25 %	50 %	90421560
94	NC_007925	CGGC	2	8	39089	39096	0 %	0 %	50 %	50 %	90421561
95	NC_007925	GATC	2	8	39369	39376	25 %	25 %	25 %	25 %	90421561
96	NC_007925	ACGA	2	8	39473	39480	50 %	0 %	25 %	25 %	90421561
97	NC_007925	CCGG	2	8	39989	39996	0 %	0 %	50 %	50 %	90421562
98	NC_007925	CGAG	2	8	40377	40384	25 %	0 %	50 %	25 %	90421563
99	NC_007925	GCAC	2	8	40574	40581	25 %	0 %	25 %	50 %	90421563
100	NC_007925	CGGT	2	8	40910	40917	0 %	25 %	50 %	25 %	90421563
101	NC_007925	GCTG	2	8	41061	41068	0 %	25 %	50 %	25 %	90421563
102	NC_007925	ACCG	2	8	41341	41348	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007925	GGCC	2	8	41440	41447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_007925	AGCA	2	8	41474	41481	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007925	CGGC	2	8	41786	41793	0 %	0 %	50 %	50 %	90421564
106	NC_007925	CCGA	2	8	43505	43512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007925	CTCG	2	8	43757	43764	0 %	25 %	25 %	50 %	90421566
108	NC_007925	CTGG	2	8	43922	43929	0 %	25 %	50 %	25 %	90421566
109	NC_007925	GATC	2	8	44129	44136	25 %	25 %	25 %	25 %	90421566
110	NC_007925	CGGC	2	8	44182	44189	0 %	0 %	50 %	50 %	90421566
111	NC_007925	ACCG	2	8	44379	44386	25 %	0 %	25 %	50 %	90421566
112	NC_007925	GGCG	2	8	44448	44455	0 %	0 %	75 %	25 %	90421566
113	NC_007925	GCTG	2	8	44575	44582	0 %	25 %	50 %	25 %	90421566
114	NC_007925	CAGG	2	8	46645	46652	25 %	0 %	50 %	25 %	90421569
115	NC_007925	TCCG	2	8	46656	46663	0 %	25 %	25 %	50 %	90421569
116	NC_007925	CGGC	2	8	46823	46830	0 %	0 %	50 %	50 %	90421569
117	NC_007925	CCGA	2	8	47111	47118	25 %	0 %	25 %	50 %	90421569
118	NC_007925	CGGG	2	8	47770	47777	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007925	CCGG	2	8	48380	48387	0 %	0 %	50 %	50 %	90421570
120	NC_007925	CCGA	2	8	48765	48772	25 %	0 %	25 %	50 %	90421570
121	NC_007925	GAAT	2	8	49440	49447	50 %	25 %	25 %	0 %	90421570
122	NC_007925	AGAT	2	8	49503	49510	50 %	25 %	25 %	0 %	90421570
123	NC_007925	CGAT	2	8	49668	49675	25 %	25 %	25 %	25 %	90421570
124	NC_007925	ATCG	2	8	50092	50099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007925	CGGC	2	8	50394	50401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007925	CCGT	2	8	50469	50476	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007925	CCAG	2	8	51653	51660	25 %	0 %	25 %	50 %	90421572
128	NC_007925	GTCG	2	8	52194	52201	0 %	25 %	50 %	25 %	90421573
129	NC_007925	CGGC	2	8	52579	52586	0 %	0 %	50 %	50 %	90421573
130	NC_007925	GCCG	2	8	53452	53459	0 %	0 %	50 %	50 %	90421574
131	NC_007925	GCCC	2	8	53481	53488	0 %	0 %	25 %	75 %	90421574
132	NC_007925	GGCC	2	8	53817	53824	0 %	0 %	50 %	50 %	90421574
133	NC_007925	CCCG	2	8	54246	54253	0 %	0 %	25 %	75 %	90421575
134	NC_007925	GACG	2	8	55068	55075	25 %	0 %	50 %	25 %	90421576
135	NC_007925	GATC	2	8	55179	55186	25 %	25 %	25 %	25 %	90421576
136	NC_007925	AGCC	2	8	55325	55332	25 %	0 %	25 %	50 %	90421576
137	NC_007925	GCCG	2	8	55566	55573	0 %	0 %	50 %	50 %	90421576
138	NC_007925	CCGA	2	8	55699	55706	25 %	0 %	25 %	50 %	90421576
139	NC_007925	GCCG	2	8	55740	55747	0 %	0 %	50 %	50 %	90421576
140	NC_007925	CAGC	2	8	55779	55786	25 %	0 %	25 %	50 %	90421576
141	NC_007925	GCCG	2	8	56301	56308	0 %	0 %	50 %	50 %	90421576
142	NC_007925	CGGC	2	8	56638	56645	0 %	0 %	50 %	50 %	90421577
143	NC_007925	AACC	2	8	57061	57068	50 %	0 %	0 %	50 %	90421577
144	NC_007925	GCCG	2	8	57214	57221	0 %	0 %	50 %	50 %	90421577
145	NC_007925	GCGG	2	8	57583	57590	0 %	0 %	75 %	25 %	90421577
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