MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB18 chromosome

Total Repeats: 11196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007925	GGAT	2	8	849	856	25 %	25 %	50 %	0 %	90421529
2	NC_007925	CGCC	2	8	1023	1030	0 %	0 %	25 %	75 %	90421529
3	NC_007925	GCCG	2	8	1535	1542	0 %	0 %	50 %	50 %	90421529
4	NC_007925	CTCG	2	8	1642	1649	0 %	25 %	25 %	50 %	90421529
5	NC_007925	GTCC	2	8	1871	1878	0 %	25 %	25 %	50 %	90421529
6	NC_007925	CGCT	2	8	2033	2040	0 %	25 %	25 %	50 %	90421529
7	NC_007925	CGAC	2	8	2611	2618	25 %	0 %	25 %	50 %	90421530
8	NC_007925	GATC	2	8	2891	2898	25 %	25 %	25 %	25 %	90421530
9	NC_007925	GTCG	2	8	3146	3153	0 %	25 %	50 %	25 %	90421530
10	NC_007925	CAGC	2	8	4226	4233	25 %	0 %	25 %	50 %	90421531
11	NC_007925	CTGG	2	8	4313	4320	0 %	25 %	50 %	25 %	90421531
12	NC_007925	TGGA	2	8	4461	4468	25 %	25 %	50 %	0 %	90421531
13	NC_007925	TCCA	2	8	5145	5152	25 %	25 %	0 %	50 %	90421532
14	NC_007925	CGCC	2	8	5279	5286	0 %	0 %	25 %	75 %	90421532
15	NC_007925	CGAT	2	8	5536	5543	25 %	25 %	25 %	25 %	90421532
16	NC_007925	CCCG	2	8	6611	6618	0 %	0 %	25 %	75 %	90421533
17	NC_007925	GGCC	2	8	6802	6809	0 %	0 %	50 %	50 %	90421533
18	NC_007925	GCCG	2	8	8816	8823	0 %	0 %	50 %	50 %	90421533
19	NC_007925	AGGC	2	8	9110	9117	25 %	0 %	50 %	25 %	90421534
20	NC_007925	TCGA	2	8	10219	10226	25 %	25 %	25 %	25 %	90421535
21	NC_007925	GCGG	2	8	11411	11418	0 %	0 %	75 %	25 %	90421536
22	NC_007925	CGCC	2	8	11443	11450	0 %	0 %	25 %	75 %	90421536
23	NC_007925	CGGC	2	8	11578	11585	0 %	0 %	50 %	50 %	90421537
24	NC_007925	GCGA	2	8	11866	11873	25 %	0 %	50 %	25 %	90421537
25	NC_007925	CGAT	2	8	13528	13535	25 %	25 %	25 %	25 %	90421537
26	NC_007925	CGGC	2	8	13934	13941	0 %	0 %	50 %	50 %	90421538
27	NC_007925	CCGG	2	8	13950	13957	0 %	0 %	50 %	50 %	90421538
28	NC_007925	GATC	2	8	15539	15546	25 %	25 %	25 %	25 %	90421539
29	NC_007925	GTAC	2	8	15892	15899	25 %	25 %	25 %	25 %	90421540
30	NC_007925	CGGT	2	8	16020	16027	0 %	25 %	50 %	25 %	90421540
31	NC_007925	CCTT	2	8	16203	16210	0 %	50 %	0 %	50 %	90421540
32	NC_007925	TCGG	2	8	17016	17023	0 %	25 %	50 %	25 %	90421542
33	NC_007925	CGAG	2	8	17392	17399	25 %	0 %	50 %	25 %	90421542
34	NC_007925	CGAG	2	8	17865	17872	25 %	0 %	50 %	25 %	90421543
35	NC_007925	GGCC	2	8	18348	18355	0 %	0 %	50 %	50 %	90421543
36	NC_007925	GCCG	2	8	18954	18961	0 %	0 %	50 %	50 %	90421543
37	NC_007925	GACC	2	8	20230	20237	25 %	0 %	25 %	50 %	90421544
38	NC_007925	CGAC	2	8	20671	20678	25 %	0 %	25 %	50 %	90421545
39	NC_007925	AATC	2	8	21554	21561	50 %	25 %	0 %	25 %	90421546
40	NC_007925	CGGC	2	8	22613	22620	0 %	0 %	50 %	50 %	90421547
41	NC_007925	AGTG	2	8	22854	22861	25 %	25 %	50 %	0 %	90421547
42	NC_007925	CGCC	2	8	22985	22992	0 %	0 %	25 %	75 %	90421547
43	NC_007925	GCAC	2	8	23653	23660	25 %	0 %	25 %	50 %	90421548
44	NC_007925	TTTG	2	8	25724	25731	0 %	75 %	25 %	0 %	90421549
45	NC_007925	CGCT	2	8	27327	27334	0 %	25 %	25 %	50 %	90421550
46	NC_007925	TCGG	2	8	28053	28060	0 %	25 %	50 %	25 %	90421551
47	NC_007925	GGCC	2	8	28183	28190	0 %	0 %	50 %	50 %	90421551
48	NC_007925	CCGA	2	8	28366	28373	25 %	0 %	25 %	50 %	90421551
49	NC_007925	GGTC	2	8	29257	29264	0 %	25 %	50 %	25 %	90421551
50	NC_007925	GGCG	2	8	29551	29558	0 %	0 %	75 %	25 %	90421552
51	NC_007925	CCGG	2	8	30083	30090	0 %	0 %	50 %	50 %	90421552
52	NC_007925	CGGC	2	8	30178	30185	0 %	0 %	50 %	50 %	90421552
53	NC_007925	GACC	2	8	30805	30812	25 %	0 %	25 %	50 %	90421552
54	NC_007925	AGCG	2	8	30852	30859	25 %	0 %	50 %	25 %	90421552
55	NC_007925	CAGC	2	8	30905	30912	25 %	0 %	25 %	50 %	90421552
56	NC_007925	CGGT	2	8	31080	31087	0 %	25 %	50 %	25 %	90421552
57	NC_007925	CACC	2	8	32130	32137	25 %	0 %	0 %	75 %	90421553
58	NC_007925	CGAG	2	8	32267	32274	25 %	0 %	50 %	25 %	90421553
59	NC_007925	TCCA	2	8	32515	32522	25 %	25 %	0 %	50 %	90421553
60	NC_007925	TCGG	2	8	32572	32579	0 %	25 %	50 %	25 %	90421553
61	NC_007925	CCCA	2	8	33271	33278	25 %	0 %	0 %	75 %	90421554
62	NC_007925	TCGA	2	8	33708	33715	25 %	25 %	25 %	25 %	90421556
63	NC_007925	GAAC	2	8	34050	34057	50 %	0 %	25 %	25 %	90421557
64	NC_007925	CGAC	2	8	34188	34195	25 %	0 %	25 %	50 %	90421557
65	NC_007925	GGCG	2	8	34561	34568	0 %	0 %	75 %	25 %	90421557
66	NC_007925	TCGG	2	8	34859	34866	0 %	25 %	50 %	25 %	90421558
67	NC_007925	CAGG	2	8	34911	34918	25 %	0 %	50 %	25 %	90421558
68	NC_007925	ATCG	2	8	36295	36302	25 %	25 %	25 %	25 %	90421558
69	NC_007925	GCCG	2	8	36693	36700	0 %	0 %	50 %	50 %	90421559
70	NC_007925	GTGG	2	8	37383	37390	0 %	25 %	75 %	0 %	90421559
71	NC_007925	GTCG	2	8	37407	37414	0 %	25 %	50 %	25 %	90421559
72	NC_007925	CTTC	2	8	37628	37635	0 %	50 %	0 %	50 %	90421559
73	NC_007925	GCCC	2	8	37925	37932	0 %	0 %	25 %	75 %	90421559
74	NC_007925	GCCA	2	8	38784	38791	25 %	0 %	25 %	50 %	90421560
75	NC_007925	CGGC	2	8	39089	39096	0 %	0 %	50 %	50 %	90421561
76	NC_007925	GATC	2	8	39369	39376	25 %	25 %	25 %	25 %	90421561
77	NC_007925	ACGA	2	8	39473	39480	50 %	0 %	25 %	25 %	90421561
78	NC_007925	CCGG	2	8	39989	39996	0 %	0 %	50 %	50 %	90421562
79	NC_007925	CGAG	2	8	40377	40384	25 %	0 %	50 %	25 %	90421563
80	NC_007925	GCAC	2	8	40574	40581	25 %	0 %	25 %	50 %	90421563
81	NC_007925	CGGT	2	8	40910	40917	0 %	25 %	50 %	25 %	90421563
82	NC_007925	GCTG	2	8	41061	41068	0 %	25 %	50 %	25 %	90421563
83	NC_007925	CGGC	2	8	41786	41793	0 %	0 %	50 %	50 %	90421564
84	NC_007925	CTCG	2	8	43757	43764	0 %	25 %	25 %	50 %	90421566
85	NC_007925	CTGG	2	8	43922	43929	0 %	25 %	50 %	25 %	90421566
86	NC_007925	GATC	2	8	44129	44136	25 %	25 %	25 %	25 %	90421566
87	NC_007925	CGGC	2	8	44182	44189	0 %	0 %	50 %	50 %	90421566
88	NC_007925	ACCG	2	8	44379	44386	25 %	0 %	25 %	50 %	90421566
89	NC_007925	GGCG	2	8	44448	44455	0 %	0 %	75 %	25 %	90421566
90	NC_007925	GCTG	2	8	44575	44582	0 %	25 %	50 %	25 %	90421566
91	NC_007925	CAGG	2	8	46645	46652	25 %	0 %	50 %	25 %	90421569
92	NC_007925	TCCG	2	8	46656	46663	0 %	25 %	25 %	50 %	90421569
93	NC_007925	CGGC	2	8	46823	46830	0 %	0 %	50 %	50 %	90421569
94	NC_007925	CCGA	2	8	47111	47118	25 %	0 %	25 %	50 %	90421569
95	NC_007925	CCGG	2	8	48380	48387	0 %	0 %	50 %	50 %	90421570
96	NC_007925	CCGA	2	8	48765	48772	25 %	0 %	25 %	50 %	90421570
97	NC_007925	GAAT	2	8	49440	49447	50 %	25 %	25 %	0 %	90421570
98	NC_007925	AGAT	2	8	49503	49510	50 %	25 %	25 %	0 %	90421570
99	NC_007925	CGAT	2	8	49668	49675	25 %	25 %	25 %	25 %	90421570
100	NC_007925	CCAG	2	8	51653	51660	25 %	0 %	25 %	50 %	90421572
101	NC_007925	GTCG	2	8	52194	52201	0 %	25 %	50 %	25 %	90421573
102	NC_007925	CGGC	2	8	52579	52586	0 %	0 %	50 %	50 %	90421573
103	NC_007925	GCCG	2	8	53452	53459	0 %	0 %	50 %	50 %	90421574
104	NC_007925	GCCC	2	8	53481	53488	0 %	0 %	25 %	75 %	90421574
105	NC_007925	GGCC	2	8	53817	53824	0 %	0 %	50 %	50 %	90421574
106	NC_007925	CCCG	2	8	54246	54253	0 %	0 %	25 %	75 %	90421575
107	NC_007925	GACG	2	8	55068	55075	25 %	0 %	50 %	25 %	90421576
108	NC_007925	GATC	2	8	55179	55186	25 %	25 %	25 %	25 %	90421576
109	NC_007925	AGCC	2	8	55325	55332	25 %	0 %	25 %	50 %	90421576
110	NC_007925	GCCG	2	8	55566	55573	0 %	0 %	50 %	50 %	90421576
111	NC_007925	CCGA	2	8	55699	55706	25 %	0 %	25 %	50 %	90421576
112	NC_007925	GCCG	2	8	55740	55747	0 %	0 %	50 %	50 %	90421576
113	NC_007925	CAGC	2	8	55779	55786	25 %	0 %	25 %	50 %	90421576
114	NC_007925	GCCG	2	8	56301	56308	0 %	0 %	50 %	50 %	90421576
115	NC_007925	CGGC	2	8	56638	56645	0 %	0 %	50 %	50 %	90421577
116	NC_007925	AACC	2	8	57061	57068	50 %	0 %	0 %	50 %	90421577
117	NC_007925	GCCG	2	8	57214	57221	0 %	0 %	50 %	50 %	90421577
118	NC_007925	GCGG	2	8	57583	57590	0 %	0 %	75 %	25 %	90421577
119	NC_007925	CCGG	2	8	57666	57673	0 %	0 %	50 %	50 %	90421577
120	NC_007925	CCGA	2	8	57773	57780	25 %	0 %	25 %	50 %	90421577
121	NC_007925	GCCA	2	8	58067	58074	25 %	0 %	25 %	50 %	90421577
122	NC_007925	GCCT	2	8	58722	58729	0 %	25 %	25 %	50 %	90421578
123	NC_007925	CGGT	2	8	58784	58791	0 %	25 %	50 %	25 %	90421578
124	NC_007925	GCCG	2	8	59054	59061	0 %	0 %	50 %	50 %	90421579
125	NC_007925	CGGC	2	8	59109	59116	0 %	0 %	50 %	50 %	90421579
126	NC_007925	CGAT	2	8	59468	59475	25 %	25 %	25 %	25 %	90421579
127	NC_007925	GCCG	2	8	59512	59519	0 %	0 %	50 %	50 %	90421579
128	NC_007925	GGCC	2	8	59847	59854	0 %	0 %	50 %	50 %	90421579
129	NC_007925	CCGA	2	8	61064	61071	25 %	0 %	25 %	50 %	90421580
130	NC_007925	GATC	2	8	62189	62196	25 %	25 %	25 %	25 %	90421581
131	NC_007925	GGCC	2	8	63073	63080	0 %	0 %	50 %	50 %	90421582
132	NC_007925	CGGC	2	8	63521	63528	0 %	0 %	50 %	50 %	90421583
133	NC_007925	CGCC	2	8	64008	64015	0 %	0 %	25 %	75 %	90421583
134	NC_007925	GGCG	2	8	64119	64126	0 %	0 %	75 %	25 %	90421583
135	NC_007925	CGGG	2	8	64412	64419	0 %	0 %	75 %	25 %	90421584
136	NC_007925	GAAG	2	8	64598	64605	50 %	0 %	50 %	0 %	90421584
137	NC_007925	GCCG	2	8	64728	64735	0 %	0 %	50 %	50 %	90421584
138	NC_007925	GCCC	2	8	64953	64960	0 %	0 %	25 %	75 %	90421584
139	NC_007925	CTGG	2	8	65036	65043	0 %	25 %	50 %	25 %	90421584
140	NC_007925	GAGG	2	8	66046	66053	25 %	0 %	75 %	0 %	90421586
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142	NC_007925	GATT	2	8	66220	66227	25 %	50 %	25 %	0 %	90421586
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