MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 chromosome

Total Repeats: 3241

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007908	TGGAT	2	10	203	212	20 %	40 %	40 %	0 %	89898823
2	NC_007908	ACCAC	2	10	1313	1322	40 %	0 %	0 %	60 %	89898823
3	NC_007908	ACAAG	2	10	1535	1544	60 %	0 %	20 %	20 %	89898824
4	NC_007908	CTTCG	2	10	2051	2060	0 %	40 %	20 %	40 %	89898824
5	NC_007908	CCAAG	2	10	2180	2189	40 %	0 %	20 %	40 %	89898824
6	NC_007908	TGAGC	2	10	3475	3484	20 %	20 %	40 %	20 %	89898825
7	NC_007908	GCGCT	2	10	4751	4760	0 %	20 %	40 %	40 %	89898825
8	NC_007908	CAACT	2	10	6537	6546	40 %	20 %	0 %	40 %	89898827
9	NC_007908	CCTGG	2	10	8286	8295	0 %	20 %	40 %	40 %	89898828
10	NC_007908	AGGCC	2	10	11211	11220	20 %	0 %	40 %	40 %	89898830
11	NC_007908	CAACG	2	10	12539	12548	40 %	0 %	20 %	40 %	89898832
12	NC_007908	GGTTG	2	10	17802	17811	0 %	40 %	60 %	0 %	89898837
13	NC_007908	GGGCC	2	10	18193	18202	0 %	0 %	60 %	40 %	89898837
14	NC_007908	CATGC	2	10	18725	18734	20 %	20 %	20 %	40 %	89898838
15	NC_007908	CGTGA	2	10	20564	20573	20 %	20 %	40 %	20 %	89898839
16	NC_007908	GCGCC	2	10	24487	24496	0 %	0 %	40 %	60 %	89898844
17	NC_007908	CGGCG	2	10	26307	26316	0 %	0 %	60 %	40 %	89898846
18	NC_007908	GGCGC	2	10	27084	27093	0 %	0 %	60 %	40 %	89898846
19	NC_007908	CCGCT	2	10	29697	29706	0 %	20 %	20 %	60 %	89898850
20	NC_007908	GTTGC	2	10	30171	30180	0 %	40 %	40 %	20 %	89898850
21	NC_007908	AGCGT	2	10	30946	30955	20 %	20 %	40 %	20 %	89898850
22	NC_007908	GTGGC	2	10	31961	31970	0 %	20 %	60 %	20 %	89898850
23	NC_007908	CGCTG	2	10	32702	32711	0 %	20 %	40 %	40 %	89898850
24	NC_007908	CGCTG	2	10	33749	33758	0 %	20 %	40 %	40 %	89898851
25	NC_007908	TGGCC	2	10	36197	36206	0 %	20 %	40 %	40 %	89898853
26	NC_007908	GGCCG	2	10	40073	40082	0 %	0 %	60 %	40 %	89898858
27	NC_007908	AGCCC	2	10	41370	41379	20 %	0 %	20 %	60 %	89898859
28	NC_007908	GCGCT	2	10	42826	42835	0 %	20 %	40 %	40 %	89898860
29	NC_007908	CCCAG	2	10	45003	45012	20 %	0 %	20 %	60 %	89898862
30	NC_007908	CGGCG	2	10	46591	46600	0 %	0 %	60 %	40 %	89898865
31	NC_007908	GGCCG	2	10	52205	52214	0 %	0 %	60 %	40 %	89898871
32	NC_007908	CGGGC	2	10	57008	57017	0 %	0 %	60 %	40 %	89898875
33	NC_007908	GACCC	3	15	58045	58059	20 %	0 %	20 %	60 %	89898877
34	NC_007908	CCGGA	2	10	58304	58313	20 %	0 %	40 %	40 %	89898877
35	NC_007908	CGACC	2	10	59361	59370	20 %	0 %	20 %	60 %	89898878
36	NC_007908	GCAGG	2	10	60357	60366	20 %	0 %	60 %	20 %	89898879
37	NC_007908	ATGCC	2	10	61542	61551	20 %	20 %	20 %	40 %	89898881
38	NC_007908	CCCAT	2	10	62800	62809	20 %	20 %	0 %	60 %	89898881
39	NC_007908	ATTCC	2	10	64059	64068	20 %	40 %	0 %	40 %	89898883
40	NC_007908	CGCGG	2	10	64738	64747	0 %	0 %	60 %	40 %	89898884
41	NC_007908	GGGCA	2	10	68954	68963	20 %	0 %	60 %	20 %	89898888
42	NC_007908	GCCCA	2	10	69678	69687	20 %	0 %	20 %	60 %	89898888
43	NC_007908	AGCCC	2	10	71588	71597	20 %	0 %	20 %	60 %	89898891
44	NC_007908	TCATT	2	10	74006	74015	20 %	60 %	0 %	20 %	89898895
45	NC_007908	GGCCT	2	10	74886	74895	0 %	20 %	40 %	40 %	89898896
46	NC_007908	CAGAA	2	10	75269	75278	60 %	0 %	20 %	20 %	89898897
47	NC_007908	AGACC	2	10	75773	75782	40 %	0 %	20 %	40 %	89898897
48	NC_007908	CCGGG	2	10	77172	77181	0 %	0 %	60 %	40 %	89898899
49	NC_007908	CGCAA	2	10	79414	79423	40 %	0 %	20 %	40 %	89898901
50	NC_007908	TTGCC	2	10	79572	79581	0 %	40 %	20 %	40 %	89898901
51	NC_007908	TCAGC	2	10	79627	79636	20 %	20 %	20 %	40 %	89898901
52	NC_007908	GATCG	2	10	79694	79703	20 %	20 %	40 %	20 %	89898901
53	NC_007908	AGGGT	2	10	80363	80372	20 %	20 %	60 %	0 %	89898901
54	NC_007908	GGGAA	2	10	81497	81506	40 %	0 %	60 %	0 %	89898902
55	NC_007908	GCGCC	2	10	87241	87250	0 %	0 %	40 %	60 %	89898907
56	NC_007908	GCACC	2	10	87766	87775	20 %	0 %	20 %	60 %	89898907
57	NC_007908	TGATG	2	10	88806	88815	20 %	40 %	40 %	0 %	89898909
58	NC_007908	GCCCA	2	10	89915	89924	20 %	0 %	20 %	60 %	89898909
59	NC_007908	GGTTT	2	10	90200	90209	0 %	60 %	40 %	0 %	89898909
60	NC_007908	CAAGC	2	10	94876	94885	40 %	0 %	20 %	40 %	89898913
61	NC_007908	GCGCC	2	10	95038	95047	0 %	0 %	40 %	60 %	89898914
62	NC_007908	AAGGC	2	10	95298	95307	40 %	0 %	40 %	20 %	89898914
63	NC_007908	TGGTG	2	10	97658	97667	0 %	40 %	60 %	0 %	89898915
64	NC_007908	CTTTT	2	10	99919	99928	0 %	80 %	0 %	20 %	89898918
65	NC_007908	GTCGA	2	10	101332	101341	20 %	20 %	40 %	20 %	89898919
66	NC_007908	ATTGA	2	10	107716	107725	40 %	40 %	20 %	0 %	89898925
67	NC_007908	TGGCC	2	10	110434	110443	0 %	20 %	40 %	40 %	89898928
68	NC_007908	GGCCG	2	10	110481	110490	0 %	0 %	60 %	40 %	89898928
69	NC_007908	GGCGG	2	10	111079	111088	0 %	0 %	80 %	20 %	89898929
70	NC_007908	TGCTG	2	10	114375	114384	0 %	40 %	40 %	20 %	89898933
71	NC_007908	AAAAG	2	10	114397	114406	80 %	0 %	20 %	0 %	89898933
72	NC_007908	GGCCT	2	10	115755	115764	0 %	20 %	40 %	40 %	89898935
73	NC_007908	CGCCT	2	10	115784	115793	0 %	20 %	20 %	60 %	89898935
74	NC_007908	TGGTG	2	10	115872	115881	0 %	40 %	60 %	0 %	89898935
75	NC_007908	GGCGC	2	10	116669	116678	0 %	0 %	60 %	40 %	89898935
76	NC_007908	GGCGT	2	10	118791	118800	0 %	20 %	60 %	20 %	89898937
77	NC_007908	GCGCG	2	10	120303	120312	0 %	0 %	60 %	40 %	89898938
78	NC_007908	CGGCC	2	10	120360	120369	0 %	0 %	40 %	60 %	89898938
79	NC_007908	GTGCG	2	10	121800	121809	0 %	20 %	60 %	20 %	89898939
80	NC_007908	GGCGC	2	10	122500	122509	0 %	0 %	60 %	40 %	89898940
81	NC_007908	TGCGC	2	10	128055	128064	0 %	20 %	40 %	40 %	89898945
82	NC_007908	CCGGA	2	10	128263	128272	20 %	0 %	40 %	40 %	89898945
83	NC_007908	TCTGC	2	10	130431	130440	0 %	40 %	20 %	40 %	89898946
84	NC_007908	CAATT	2	10	130634	130643	40 %	40 %	0 %	20 %	89898947
85	NC_007908	CAAAT	2	10	135255	135264	60 %	20 %	0 %	20 %	89898951
86	NC_007908	TGGCG	2	10	136051	136060	0 %	20 %	60 %	20 %	89898951
87	NC_007908	CATCG	2	10	136147	136156	20 %	20 %	20 %	40 %	89898951
88	NC_007908	GGCCG	2	10	137554	137563	0 %	0 %	60 %	40 %	89898952
89	NC_007908	AGGCC	2	10	137737	137746	20 %	0 %	40 %	40 %	89898953
90	NC_007908	GCGTC	2	10	137755	137764	0 %	20 %	40 %	40 %	89898953
91	NC_007908	TGCAC	2	10	139406	139415	20 %	20 %	20 %	40 %	89898955
92	NC_007908	GCGCG	2	10	140572	140581	0 %	0 %	60 %	40 %	89898956
93	NC_007908	CACCG	2	10	141734	141743	20 %	0 %	20 %	60 %	89898958
94	NC_007908	TGCGC	2	10	142741	142750	0 %	20 %	40 %	40 %	89898959
95	NC_007908	CGCAG	2	10	142930	142939	20 %	0 %	40 %	40 %	89898959
96	NC_007908	CGGGG	2	10	143140	143149	0 %	0 %	80 %	20 %	89898959
97	NC_007908	GCCGA	2	10	143703	143712	20 %	0 %	40 %	40 %	89898960
98	NC_007908	CGCGG	2	10	143815	143824	0 %	0 %	60 %	40 %	89898960
99	NC_007908	GCAGC	2	10	143901	143910	20 %	0 %	40 %	40 %	89898960
100	NC_007908	TGCGC	2	10	144178	144187	0 %	20 %	40 %	40 %	89898961
101	NC_007908	CTCGC	2	10	144447	144456	0 %	20 %	20 %	60 %	89898961
102	NC_007908	CGGCG	2	10	144935	144944	0 %	0 %	60 %	40 %	89898961
103	NC_007908	GGCCA	2	10	147344	147353	20 %	0 %	40 %	40 %	89898964
104	NC_007908	GCGCA	2	10	147974	147983	20 %	0 %	40 %	40 %	89898965
105	NC_007908	CGGGG	2	10	148759	148768	0 %	0 %	80 %	20 %	89898966
106	NC_007908	TGGGC	2	10	150038	150047	0 %	20 %	60 %	20 %	89898968
107	NC_007908	CCCGC	2	10	150101	150110	0 %	0 %	20 %	80 %	89898968
108	NC_007908	AGCGC	2	10	151474	151483	20 %	0 %	40 %	40 %	89898970
109	NC_007908	CAGGC	2	10	152470	152479	20 %	0 %	40 %	40 %	89898971
110	NC_007908	CCAGC	2	10	153572	153581	20 %	0 %	20 %	60 %	89898973
111	NC_007908	TGAAA	2	10	154152	154161	60 %	20 %	20 %	0 %	89898974
112	NC_007908	GGAAG	2	10	155592	155601	40 %	0 %	60 %	0 %	89898975
113	NC_007908	CTGAG	2	10	155741	155750	20 %	20 %	40 %	20 %	89898975
114	NC_007908	CCGCA	2	10	158068	158077	20 %	0 %	20 %	60 %	89898977
115	NC_007908	GCTCA	2	10	158710	158719	20 %	20 %	20 %	40 %	89898977
116	NC_007908	AGGCC	2	10	159197	159206	20 %	0 %	40 %	40 %	89898978
117	NC_007908	GACGC	2	10	160565	160574	20 %	0 %	40 %	40 %	89898979
118	NC_007908	GCGCT	2	10	162733	162742	0 %	20 %	40 %	40 %	89898982
119	NC_007908	GCGCG	2	10	162825	162834	0 %	0 %	60 %	40 %	89898982
120	NC_007908	GGTTT	2	10	164500	164509	0 %	60 %	40 %	0 %	89898984
121	NC_007908	CACAC	2	10	166080	166089	40 %	0 %	0 %	60 %	89898985
122	NC_007908	GCGCC	2	10	167142	167151	0 %	0 %	40 %	60 %	89898985
123	NC_007908	AGTGA	2	10	169135	169144	40 %	20 %	40 %	0 %	89898987
124	NC_007908	GTGGC	2	10	170853	170862	0 %	20 %	60 %	20 %	89898988
125	NC_007908	GCGCG	2	10	172654	172663	0 %	0 %	60 %	40 %	89898989
126	NC_007908	GTGTT	2	10	176754	176763	0 %	60 %	40 %	0 %	89898994
127	NC_007908	AATGA	2	10	177394	177403	60 %	20 %	20 %	0 %	89898995
128	NC_007908	ATCTA	2	10	177422	177431	40 %	40 %	0 %	20 %	89898995
129	NC_007908	CTTGC	2	10	182563	182572	0 %	40 %	20 %	40 %	89899002
130	NC_007908	GCTGG	2	10	184153	184162	0 %	20 %	60 %	20 %	89899004
131	NC_007908	TGGCG	2	10	184873	184882	0 %	20 %	60 %	20 %	89899004
132	NC_007908	AAGCC	2	10	187057	187066	40 %	0 %	20 %	40 %	89899007
133	NC_007908	GCGCC	2	10	187841	187850	0 %	0 %	40 %	60 %	89899008
134	NC_007908	GTGAT	2	10	188004	188013	20 %	40 %	40 %	0 %	89899008
135	NC_007908	TCGCC	2	10	189424	189433	0 %	20 %	20 %	60 %	89899009
136	NC_007908	CGGTG	2	10	191115	191124	0 %	20 %	60 %	20 %	89899011
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