MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 chromosome

Total Repeats: 10221

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007908	CACT	2	8	694	701	25 %	25 %	0 %	50 %	89898823
2	NC_007908	TGAT	2	8	713	720	25 %	50 %	25 %	0 %	89898823
3	NC_007908	CGGC	2	8	1210	1217	0 %	0 %	50 %	50 %	89898823
4	NC_007908	TTGA	2	8	1737	1744	25 %	50 %	25 %	0 %	89898824
5	NC_007908	TGAT	2	8	2488	2495	25 %	50 %	25 %	0 %	89898824
6	NC_007908	TCAG	2	8	3053	3060	25 %	25 %	25 %	25 %	89898825
7	NC_007908	TGCA	2	8	3156	3163	25 %	25 %	25 %	25 %	89898825
8	NC_007908	TCAA	2	8	3174	3181	50 %	25 %	0 %	25 %	89898825
9	NC_007908	GCGT	2	8	3498	3505	0 %	25 %	50 %	25 %	89898825
10	NC_007908	GCGT	2	8	3561	3568	0 %	25 %	50 %	25 %	89898825
11	NC_007908	CACC	2	8	3751	3758	25 %	0 %	0 %	75 %	89898825
12	NC_007908	ACCG	2	8	5237	5244	25 %	0 %	25 %	50 %	89898825
13	NC_007908	CGCA	2	8	6362	6369	25 %	0 %	25 %	50 %	89898827
14	NC_007908	CCGA	2	8	6444	6451	25 %	0 %	25 %	50 %	89898827
15	NC_007908	TTGA	2	8	6714	6721	25 %	50 %	25 %	0 %	89898827
16	NC_007908	ACGC	2	8	7189	7196	25 %	0 %	25 %	50 %	89898827
17	NC_007908	TTTC	2	8	7715	7722	0 %	75 %	0 %	25 %	89898827
18	NC_007908	GGCA	2	8	7724	7731	25 %	0 %	50 %	25 %	89898827
19	NC_007908	TCGT	2	8	8137	8144	0 %	50 %	25 %	25 %	89898828
20	NC_007908	TTGA	2	8	8739	8746	25 %	50 %	25 %	0 %	89898829
21	NC_007908	AAGC	2	8	8811	8818	50 %	0 %	25 %	25 %	89898829
22	NC_007908	ATCG	2	8	9119	9126	25 %	25 %	25 %	25 %	89898829
23	NC_007908	TGCC	2	8	9977	9984	0 %	25 %	25 %	50 %	89898829
24	NC_007908	TGCG	2	8	10150	10157	0 %	25 %	50 %	25 %	89898829
25	NC_007908	CCGG	2	8	10602	10609	0 %	0 %	50 %	50 %	89898829
26	NC_007908	CACG	2	8	12367	12374	25 %	0 %	25 %	50 %	89898832
27	NC_007908	AATT	2	8	13656	13663	50 %	50 %	0 %	0 %	89898834
28	NC_007908	GCTG	2	8	13872	13879	0 %	25 %	50 %	25 %	89898834
29	NC_007908	CCAG	2	8	13893	13900	25 %	0 %	25 %	50 %	89898834
30	NC_007908	CAGC	2	8	14958	14965	25 %	0 %	25 %	50 %	89898835
31	NC_007908	AAGC	2	8	15789	15796	50 %	0 %	25 %	25 %	89898836
32	NC_007908	TGGT	2	8	16081	16088	0 %	50 %	50 %	0 %	89898836
33	NC_007908	GCGT	2	8	16408	16415	0 %	25 %	50 %	25 %	89898836
34	NC_007908	TTGG	2	8	17515	17522	0 %	50 %	50 %	0 %	89898837
35	NC_007908	TTCT	2	8	18856	18863	0 %	75 %	0 %	25 %	89898838
36	NC_007908	ACCG	2	8	19139	19146	25 %	0 %	25 %	50 %	89898838
37	NC_007908	TGAT	2	8	19743	19750	25 %	50 %	25 %	0 %	89898839
38	NC_007908	GGGC	2	8	19813	19820	0 %	0 %	75 %	25 %	89898839
39	NC_007908	CCAC	2	8	20244	20251	25 %	0 %	0 %	75 %	89898839
40	NC_007908	CGGT	2	8	20702	20709	0 %	25 %	50 %	25 %	89898840
41	NC_007908	CTGG	2	8	21810	21817	0 %	25 %	50 %	25 %	89898841
42	NC_007908	TTCT	2	8	23042	23049	0 %	75 %	0 %	25 %	89898842
43	NC_007908	GATC	2	8	23566	23573	25 %	25 %	25 %	25 %	89898842
44	NC_007908	GTTT	2	8	23820	23827	0 %	75 %	25 %	0 %	89898843
45	NC_007908	TCAA	2	8	24150	24157	50 %	25 %	0 %	25 %	89898844
46	NC_007908	CGCC	2	8	24343	24350	0 %	0 %	25 %	75 %	89898844
47	NC_007908	TCGG	2	8	24549	24556	0 %	25 %	50 %	25 %	89898844
48	NC_007908	CCGA	2	8	25615	25622	25 %	0 %	25 %	50 %	89898846
49	NC_007908	ATTC	2	8	25851	25858	25 %	50 %	0 %	25 %	89898846
50	NC_007908	CTGG	2	8	25903	25910	0 %	25 %	50 %	25 %	89898846
51	NC_007908	GGCT	2	8	25948	25955	0 %	25 %	50 %	25 %	89898846
52	NC_007908	TGCC	2	8	26580	26587	0 %	25 %	25 %	50 %	89898846
53	NC_007908	GCCG	2	8	26610	26617	0 %	0 %	50 %	50 %	89898846
54	NC_007908	CCAT	2	8	26882	26889	25 %	25 %	0 %	50 %	89898846
55	NC_007908	TGGA	2	8	26998	27005	25 %	25 %	50 %	0 %	89898846
56	NC_007908	CGCC	2	8	27395	27402	0 %	0 %	25 %	75 %	89898846
57	NC_007908	ATGC	2	8	27466	27473	25 %	25 %	25 %	25 %	89898846
58	NC_007908	CAGC	2	8	27900	27907	25 %	0 %	25 %	50 %	89898847
59	NC_007908	CAAG	2	8	27969	27976	50 %	0 %	25 %	25 %	89898847
60	NC_007908	AATA	2	8	28025	28032	75 %	25 %	0 %	0 %	89898847
61	NC_007908	CCAC	2	8	28403	28410	25 %	0 %	0 %	75 %	89898847
62	NC_007908	CCCG	2	8	29235	29242	0 %	0 %	25 %	75 %	89898849
63	NC_007908	CGGG	2	8	29744	29751	0 %	0 %	75 %	25 %	89898850
64	NC_007908	GGCG	2	8	29792	29799	0 %	0 %	75 %	25 %	89898850
65	NC_007908	TGTC	2	8	29915	29922	0 %	50 %	25 %	25 %	89898850
66	NC_007908	CAAT	2	8	30008	30015	50 %	25 %	0 %	25 %	89898850
67	NC_007908	GCAG	2	8	30815	30822	25 %	0 %	50 %	25 %	89898850
68	NC_007908	CACC	2	8	31166	31173	25 %	0 %	0 %	75 %	89898850
69	NC_007908	CGCC	2	8	31406	31413	0 %	0 %	25 %	75 %	89898850
70	NC_007908	GAGC	2	8	32208	32215	25 %	0 %	50 %	25 %	89898850
71	NC_007908	CACC	2	8	32321	32328	25 %	0 %	0 %	75 %	89898850
72	NC_007908	CACT	2	8	35289	35296	25 %	25 %	0 %	50 %	89898852
73	NC_007908	GCGA	2	8	36006	36013	25 %	0 %	50 %	25 %	89898853
74	NC_007908	CGCT	2	8	37368	37375	0 %	25 %	25 %	50 %	89898854
75	NC_007908	GGGC	2	8	37819	37826	0 %	0 %	75 %	25 %	89898854
76	NC_007908	TGCT	2	8	38295	38302	0 %	50 %	25 %	25 %	89898855
77	NC_007908	TCTT	2	8	38906	38913	0 %	75 %	0 %	25 %	89898857
78	NC_007908	TGAT	2	8	41795	41802	25 %	50 %	25 %	0 %	89898859
79	NC_007908	AGCG	2	8	42315	42322	25 %	0 %	50 %	25 %	89898859
80	NC_007908	CGCC	2	8	42660	42667	0 %	0 %	25 %	75 %	89898859
81	NC_007908	GCCA	2	8	43410	43417	25 %	0 %	25 %	50 %	89898861
82	NC_007908	CATG	2	8	44241	44248	25 %	25 %	25 %	25 %	89898862
83	NC_007908	CGAC	2	8	44553	44560	25 %	0 %	25 %	50 %	89898862
84	NC_007908	GTGA	2	8	44729	44736	25 %	25 %	50 %	0 %	89898862
85	NC_007908	GTCG	2	8	44788	44795	0 %	25 %	50 %	25 %	89898862
86	NC_007908	CCAG	2	8	44949	44956	25 %	0 %	25 %	50 %	89898862
87	NC_007908	AGGA	2	8	44960	44967	50 %	0 %	50 %	0 %	89898862
88	NC_007908	GCCG	2	8	45114	45121	0 %	0 %	50 %	50 %	89898862
89	NC_007908	CCAC	2	8	45626	45633	25 %	0 %	0 %	75 %	89898862
90	NC_007908	GTCG	2	8	46916	46923	0 %	25 %	50 %	25 %	89898865
91	NC_007908	ATTC	2	8	47060	47067	25 %	50 %	0 %	25 %	89898865
92	NC_007908	TGGG	2	8	49034	49041	0 %	25 %	75 %	0 %	89898868
93	NC_007908	TGGC	2	8	49592	49599	0 %	25 %	50 %	25 %	89898869
94	NC_007908	CAGC	2	8	49733	49740	25 %	0 %	25 %	50 %	89898869
95	NC_007908	GGCC	2	8	49781	49788	0 %	0 %	50 %	50 %	89898869
96	NC_007908	CATC	2	8	51834	51841	25 %	25 %	0 %	50 %	89898871
97	NC_007908	CGGC	2	8	52149	52156	0 %	0 %	50 %	50 %	89898871
98	NC_007908	CCCG	2	8	52219	52226	0 %	0 %	25 %	75 %	89898871
99	NC_007908	GCAC	2	8	52458	52465	25 %	0 %	25 %	50 %	89898871
100	NC_007908	GCTC	2	8	53166	53173	0 %	25 %	25 %	50 %	89898871
101	NC_007908	GCAG	2	8	53930	53937	25 %	0 %	50 %	25 %	89898872
102	NC_007908	CTGG	2	8	54258	54265	0 %	25 %	50 %	25 %	89898872
103	NC_007908	CCTG	2	8	54303	54310	0 %	25 %	25 %	50 %	89898872
104	NC_007908	GCCC	2	8	55047	55054	0 %	0 %	25 %	75 %	89898873
105	NC_007908	CTGC	2	8	55750	55757	0 %	25 %	25 %	50 %	89898874
106	NC_007908	CACC	2	8	55789	55796	25 %	0 %	0 %	75 %	89898874
107	NC_007908	CCGA	2	8	55823	55830	25 %	0 %	25 %	50 %	89898874
108	NC_007908	GGCG	2	8	56746	56753	0 %	0 %	75 %	25 %	89898875
109	NC_007908	GCTG	2	8	57302	57309	0 %	25 %	50 %	25 %	89898876
110	NC_007908	CTGC	2	8	57549	57556	0 %	25 %	25 %	50 %	89898876
111	NC_007908	TGGT	2	8	57825	57832	0 %	50 %	50 %	0 %	89898876
112	NC_007908	GCCG	2	8	59935	59942	0 %	0 %	50 %	50 %	89898878
113	NC_007908	CGGC	2	8	60056	60063	0 %	0 %	50 %	50 %	89898878
114	NC_007908	CCGG	2	8	60592	60599	0 %	0 %	50 %	50 %	89898879
115	NC_007908	CCAG	2	8	60935	60942	25 %	0 %	25 %	50 %	89898880
116	NC_007908	CCAG	2	8	61027	61034	25 %	0 %	25 %	50 %	89898880
117	NC_007908	TGAC	2	8	61527	61534	25 %	25 %	25 %	25 %	89898881
118	NC_007908	GGCG	2	8	62230	62237	0 %	0 %	75 %	25 %	89898881
119	NC_007908	CTTG	2	8	62560	62567	0 %	50 %	25 %	25 %	89898881
120	NC_007908	GCCA	2	8	63276	63283	25 %	0 %	25 %	50 %	89898882
121	NC_007908	CAGC	2	8	63320	63327	25 %	0 %	25 %	50 %	89898882
122	NC_007908	CGGG	2	8	63829	63836	0 %	0 %	75 %	25 %	89898883
123	NC_007908	CCGG	2	8	63911	63918	0 %	0 %	50 %	50 %	89898883
124	NC_007908	CACC	2	8	64044	64051	25 %	0 %	0 %	75 %	89898883
125	NC_007908	GCTC	2	8	64288	64295	0 %	25 %	25 %	50 %	89898884
126	NC_007908	TTTG	2	8	64588	64595	0 %	75 %	25 %	0 %	89898884
127	NC_007908	CCTT	2	8	65733	65740	0 %	50 %	0 %	50 %	89898884
128	NC_007908	CGGG	2	8	66328	66335	0 %	0 %	75 %	25 %	89898885
129	NC_007908	GATG	2	8	66416	66423	25 %	25 %	50 %	0 %	89898885
130	NC_007908	GGTC	2	8	66597	66604	0 %	25 %	50 %	25 %	89898886
131	NC_007908	TCTA	2	8	68381	68388	25 %	50 %	0 %	25 %	89898887
132	NC_007908	GCCA	2	8	68536	68543	25 %	0 %	25 %	50 %	89898887
133	NC_007908	TCGG	2	8	68693	68700	0 %	25 %	50 %	25 %	89898888
134	NC_007908	CCAG	2	8	69064	69071	25 %	0 %	25 %	50 %	89898888
135	NC_007908	CAGC	2	8	69134	69141	25 %	0 %	25 %	50 %	89898888
136	NC_007908	AGCC	2	8	69432	69439	25 %	0 %	25 %	50 %	89898888
137	NC_007908	CGCC	2	8	69870	69877	0 %	0 %	25 %	75 %	89898889
138	NC_007908	CGCC	2	8	70149	70156	0 %	0 %	25 %	75 %	89898889
139	NC_007908	CTGG	2	8	70780	70787	0 %	25 %	50 %	25 %	89898890
140	NC_007908	GCTT	2	8	72823	72830	0 %	50 %	25 %	25 %	89898893
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