MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 chromosome

Total Repeats: 71883

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007908	CAG	2	6	112	117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898823
2	NC_007908	GAC	2	6	157	162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898823
3	NC_007908	TTG	2	6	182	187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89898823
4	NC_007908	CTG	2	6	244	249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898823
5	NC_007908	GCG	2	6	472	477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898823
6	NC_007908	CGG	2	6	528	533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898823
7	NC_007908	GCT	2	6	579	584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898823
8	NC_007908	TGA	2	6	672	677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898823
9	NC_007908	AAG	2	6	755	760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898823
10	NC_007908	TGA	2	6	809	814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898823
11	NC_007908	CAA	2	6	936	941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898823
12	NC_007908	ACT	2	6	1169	1174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898823
13	NC_007908	TGG	2	6	1302	1307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898823
14	NC_007908	CGG	2	6	1347	1352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898823
15	NC_007908	CAG	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898823
16	NC_007908	ACC	2	6	1650	1655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898824
17	NC_007908	CAC	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898824
18	NC_007908	CAC	2	6	1715	1720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898824
19	NC_007908	GCC	2	6	1794	1799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898824
20	NC_007908	GCC	2	6	1848	1853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898824
21	NC_007908	CTG	2	6	1929	1934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898824
22	NC_007908	CTA	2	6	1973	1978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898824
23	NC_007908	TCG	2	6	1996	2001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898824
24	NC_007908	TGG	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898824
25	NC_007908	CAA	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898824
26	NC_007908	ACC	2	6	2269	2274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898824
27	NC_007908	CAA	2	6	2399	2404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898824
28	NC_007908	GGC	2	6	2448	2453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898824
29	NC_007908	GTG	2	6	2595	2600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898824
30	NC_007908	AGC	2	6	2634	2639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007908	ACA	2	6	2640	2645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007908	GAA	2	6	2663	2668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007908	GAA	2	6	2729	2734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898825
34	NC_007908	CCA	2	6	2826	2831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898825
35	NC_007908	CAC	2	6	2960	2965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898825
36	NC_007908	GGT	2	6	2977	2982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898825
37	NC_007908	GAC	2	6	3020	3025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
38	NC_007908	GAC	2	6	3104	3109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
39	NC_007908	GGC	2	6	3164	3169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898825
40	NC_007908	CCG	2	6	3265	3270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898825
41	NC_007908	CAG	2	6	3298	3303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
42	NC_007908	GGT	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898825
43	NC_007908	CAA	2	6	3490	3495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898825
44	NC_007908	GAC	2	6	3539	3544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
45	NC_007908	TCA	2	6	3582	3587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898825
46	NC_007908	CAA	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898825
47	NC_007908	CGG	2	6	3745	3750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898825
48	NC_007908	TGC	2	6	3772	3777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898825
49	NC_007908	TCA	2	6	3789	3794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898825
50	NC_007908	GAC	2	6	3806	3811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
51	NC_007908	AAG	2	6	3824	3829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898825
52	NC_007908	CAG	2	6	3910	3915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
53	NC_007908	CAG	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
54	NC_007908	GCT	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898825
55	NC_007908	ATC	2	6	4022	4027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898825
56	NC_007908	GCG	2	6	4046	4051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898825
57	NC_007908	GCC	2	6	4064	4069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898825
58	NC_007908	CGC	2	6	4091	4096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898825
59	NC_007908	CCG	2	6	4194	4199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898825
60	NC_007908	GCT	2	6	4294	4299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898825
61	NC_007908	CGG	2	6	4357	4362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898825
62	NC_007908	CGA	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
63	NC_007908	ACC	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898825
64	NC_007908	CAT	4	12	4411	4422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898825
65	NC_007908	GCT	3	9	4459	4467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898825
66	NC_007908	CTT	2	6	4471	4476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89898825
67	NC_007908	TGG	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898825
68	NC_007908	GCC	2	6	4528	4533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898825
69	NC_007908	AGA	2	6	4558	4563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898825
70	NC_007908	TCC	2	6	4599	4604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89898825
71	NC_007908	CAC	2	6	4654	4659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898825
72	NC_007908	CGC	2	6	4904	4909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898825
73	NC_007908	AGC	2	6	4928	4933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
74	NC_007908	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898825
75	NC_007908	GCT	2	6	5095	5100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898825
76	NC_007908	ACC	2	6	5177	5182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898825
77	NC_007908	GCC	2	6	5199	5204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898825
78	NC_007908	TGA	2	6	5221	5226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898825
79	NC_007908	GAT	2	6	5448	5453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898826
80	NC_007908	GTC	2	6	5454	5459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898826
81	NC_007908	TCT	2	6	5528	5533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89898826
82	NC_007908	TCA	2	6	5537	5542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898826
83	NC_007908	ATG	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898826
84	NC_007908	TCA	2	6	5822	5827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898826
85	NC_007908	CGC	2	6	5921	5926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007908	CAG	2	6	5935	5940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007908	TAT	2	6	6019	6024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007908	GCC	2	6	6227	6232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_007908	AAG	2	6	6318	6323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898827
90	NC_007908	GCA	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898827
91	NC_007908	AGC	2	6	6505	6510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898827
92	NC_007908	TTG	2	6	6516	6521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89898827
93	NC_007908	CGG	2	6	6578	6583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898827
94	NC_007908	GCA	2	6	6698	6703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898827
95	NC_007908	GAT	2	6	6747	6752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898827
96	NC_007908	GTG	2	6	6813	6818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898827
97	NC_007908	GCT	2	6	6905	6910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898827
98	NC_007908	ATC	2	6	6918	6923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898827
99	NC_007908	GAT	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898827
100	NC_007908	TGA	2	6	6982	6987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898827
101	NC_007908	CGA	2	6	7022	7027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898827
102	NC_007908	GCG	2	6	7034	7039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898827
103	NC_007908	CCA	2	6	7156	7161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898827
104	NC_007908	AAG	2	6	7243	7248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898827
105	NC_007908	TGA	2	6	7295	7300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898827
106	NC_007908	GGA	2	6	7430	7435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89898827
107	NC_007908	CGC	2	6	7477	7482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898827
108	NC_007908	CTG	2	6	7494	7499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898827
109	NC_007908	AAG	2	6	7515	7520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898827
110	NC_007908	CGG	2	6	7622	7627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898827
111	NC_007908	CAG	2	6	8068	8073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898828
112	NC_007908	GCT	2	6	8145	8150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898828
113	NC_007908	GGC	3	9	8151	8159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898828
114	NC_007908	CAT	2	6	8175	8180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898828
115	NC_007908	GTT	2	6	8271	8276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89898828
116	NC_007908	TCG	2	6	8300	8305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898828
117	NC_007908	CGG	2	6	8320	8325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898828
118	NC_007908	CGG	2	6	8355	8360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898828
119	NC_007908	CTG	2	6	8437	8442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898828
120	NC_007908	AGG	2	6	8473	8478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007908	CAC	2	6	8637	8642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898829
122	NC_007908	GGT	2	6	8660	8665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898829
123	NC_007908	GCC	2	6	8755	8760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898829
124	NC_007908	CCG	2	6	8773	8778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898829
125	NC_007908	TGA	2	6	8782	8787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898829
126	NC_007908	CCG	2	6	8788	8793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898829
127	NC_007908	TTG	2	6	8844	8849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89898829
128	NC_007908	GCT	2	6	8876	8881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898829
129	NC_007908	CTG	2	6	9105	9110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898829
130	NC_007908	CGG	2	6	9148	9153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898829
131	NC_007908	GCG	3	9	9159	9167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898829
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133	NC_007908	GGC	2	6	9221	9226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898829
134	NC_007908	GGC	2	6	9329	9334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898829
135	NC_007908	GGC	2	6	9393	9398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898829
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262	NC_007908	GCT	2	6	17619	17624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898837
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383	NC_007908	GCG	2	6	23522	23527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898842
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