MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfitobacterium hafniense Y51 chromosome

Total Repeats: 301

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007907	TTCCGT	2	12	16912	16923	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007907	TATCTG	2	12	21421	21432	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007907	GATTTG	2	12	48405	48416	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007907	CAGCAC	2	12	58038	58049	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007907	TCAATG	2	12	77314	77325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_007907	CTTTCA	2	12	81338	81349	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007907	ATGCGA	2	12	106569	106580	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_007907	TACTGA	2	12	117249	117260	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007907	ATTTTA	2	12	144634	144645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007907	GATGGT	2	12	162171	162182	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007907	GTATAT	2	12	164194	164205	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007907	GCTGAA	2	12	165654	165665	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_007907	TATAAT	2	12	170673	170684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007907	TTAAAT	2	12	190707	190718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007907	ATAACT	2	12	198785	198796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007907	GGGGTT	2	12	239353	239364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007907	CGGAGC	2	12	239722	239733	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007907	CGCAGG	2	12	241702	241713	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007907	CAAGTG	2	12	250814	250825	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_007907	AGAAAA	2	12	250976	250987	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007907	TAAAAA	2	12	256707	256718	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007907	GGTTAA	2	12	259219	259230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007907	ATATTT	2	12	260648	260659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007907	AAGGGC	2	12	275475	275486	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007907	AGTTTT	2	12	286993	287004	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007907	AAGAGG	2	12	289835	289846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007907	TAATGT	2	12	298688	298699	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007907	GGCAAT	2	12	319619	319630	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_007907	GGGGTT	2	12	331205	331216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007907	CGGAGC	2	12	331574	331585	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007907	CGCAGG	2	12	333554	333565	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007907	AAAAAT	2	12	340452	340463	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007907	GGGGTT	2	12	342908	342919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007907	CGGAGC	2	12	343277	343288	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007907	CGCAGG	2	12	345257	345268	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007907	TGTGAA	2	12	353732	353743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007907	CACATT	2	12	353923	353934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007907	GTGAAA	2	12	353941	353952	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007907	TTAGAA	2	12	427798	427809	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007907	TTTTTG	2	12	429212	429223	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007907	TAAGCT	2	12	436858	436869	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007907	TAAATT	2	12	437222	437233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007907	TAACTT	2	12	443217	443228	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007907	ATATAG	2	12	487615	487626	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007907	CAATGG	2	12	491342	491353	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_007907	TTGCAT	2	12	513385	513396	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_007907	TCTTTA	2	12	561723	561734	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007907	AGAAAA	2	12	611727	611738	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007907	AAGCCA	2	12	657626	657637	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007907	GAAAGA	2	12	665840	665851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007907	GAAAGG	2	12	708369	708380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007907	CAGCAA	2	12	715928	715939	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007907	ACAGAC	2	12	856891	856902	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007907	ATCAAT	2	12	886910	886921	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007907	GTAATG	2	12	922545	922556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007907	CCTTTT	2	12	965625	965636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007907	TGAAAA	2	12	965782	965793	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007907	TTTTTA	2	12	968546	968557	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007907	TTAGAT	2	12	978363	978374	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007907	GATATA	2	12	981111	981122	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007907	CTGTAT	2	12	983404	983415	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007907	GATTGA	2	12	985948	985959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007907	GAGAAG	2	12	1026116	1026127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007907	AATCTA	2	12	1035058	1035069	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007907	TGCAGG	2	12	1039987	1039998	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_007907	AATTAT	2	12	1043512	1043523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007907	AATCAT	2	12	1052950	1052961	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007907	TTTGCT	2	12	1111313	1111324	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007907	ATAGAA	2	12	1119881	1119892	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007907	GTATTC	2	12	1166637	1166648	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007907	ATTAAA	2	12	1213399	1213410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007907	ATTATA	2	12	1217950	1217961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007907	CAGCAT	2	12	1261062	1261073	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007907	GATCAG	2	12	1314745	1314756	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_007907	CTTTTT	2	12	1316498	1316509	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007907	TCGGAA	2	12	1341883	1341894	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_007907	TGAACA	2	12	1433990	1434001	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_007907	TTTATT	2	12	1442838	1442849	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007907	TTTGGG	2	12	1461640	1461651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007907	TCAAAT	2	12	1479628	1479639	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_007907	CTATTG	2	12	1493592	1493603	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007907	GCTTTT	2	12	1494267	1494278	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_007907	GTCGCT	2	12	1545706	1545717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007907	GACTAT	2	12	1557436	1557447	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_007907	AAGTCA	2	12	1619471	1619482	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007907	GAATTA	2	12	1625033	1625044	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007907	CTTTGC	2	12	1635336	1635347	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007907	TCGCTC	2	12	1635956	1635967	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007907	TGCTTT	2	12	1643472	1643483	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_007907	GATTCA	4	24	1659916	1659939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_007907	GTCAAA	2	12	1662477	1662488	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_007907	TCCAAG	2	12	1705301	1705312	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007907	GGCAAT	2	12	1715559	1715570	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_007907	TTTTTA	2	12	1715577	1715588	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007907	CTGTTC	2	12	1727976	1727987	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007907	AAATTA	2	12	1728195	1728206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007907	AAATAA	2	12	1738239	1738250	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007907	GGGGTT	2	12	1741012	1741023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007907	CGGAGC	2	12	1741381	1741392	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007907	CGCAGG	2	12	1743361	1743372	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007907	TTGAAT	2	12	1803664	1803675	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007907	AAGATA	2	12	1811171	1811182	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007907	TGTCTT	2	12	1825603	1825614	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_007907	TCTATT	2	12	1841406	1841417	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_007907	ATATGT	2	12	1871082	1871093	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007907	AAAAGC	2	12	1878372	1878383	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_007907	ATCAAA	2	12	1942257	1942268	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_007907	AAAATG	2	12	1975345	1975356	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007907	CTTGAC	2	12	2002802	2002813	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007907	TCCTTA	2	12	2005106	2005117	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007907	TGCCAG	2	12	2025410	2025421	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007907	CTTCAC	2	12	2025557	2025568	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007907	GCAATT	2	12	2043214	2043225	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_007907	AATATT	2	12	2053063	2053074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007907	AGATAG	2	12	2058464	2058475	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007907	AAAGCT	2	12	2070506	2070517	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_007907	CTTTTC	2	12	2087315	2087326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007907	ATTTTT	2	12	2088536	2088547	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007907	GCCGGC	2	12	2139750	2139761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007907	AATTTT	2	12	2182833	2182844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007907	GCCTAT	2	12	2199920	2199931	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007907	AACATA	2	12	2208432	2208443	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_007907	TCACTT	2	12	2277648	2277659	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007907	CCACTC	2	12	2278108	2278119	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_007907	CCTGCG	2	12	2311959	2311970	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007907	GCTCCG	2	12	2313939	2313950	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007907	CAACCC	2	12	2314307	2314318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_007907	AAGAAT	2	12	2323131	2323142	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007907	TCATTA	2	12	2353074	2353085	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_007907	TCGGCT	2	12	2354914	2354925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007907	TTATCA	2	12	2386769	2386780	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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133	NC_007907	AAATCT	2	12	2439507	2439518	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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250	NC_007907	TTTTTA	2	12	4630792	4630803	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.