MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Desulfitobacterium hafniense Y51 chromosome

Total Repeats: 1770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007907	GATGAG	2	12	2227	2238	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	89892748
2	NC_007907	CTATCT	2	12	2673	2684	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	89892748
3	NC_007907	ATCAGG	2	12	2764	2775	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89892749
4	NC_007907	ACAGGG	2	12	3218	3229	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	89892749
5	NC_007907	TGGAAA	2	12	3472	3483	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	89892749
6	NC_007907	ATGACC	2	12	3735	3746	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89892749
7	NC_007907	ACCAAG	2	12	5272	5283	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	89892751
8	NC_007907	CCCGGG	2	12	5402	5413	0 %	0 %	50 %	50 %	89892751
9	NC_007907	CCGATG	2	12	5753	5764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	89892751
10	NC_007907	CGAGAT	2	12	6790	6801	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89892752
11	NC_007907	ACAGGC	2	12	8918	8929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89892753
12	NC_007907	GAGCTT	2	12	10307	10318	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	89892754
13	NC_007907	CTTTTC	2	12	12443	12454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89892756
14	NC_007907	GTTCCT	2	12	14828	14839	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	89892759
15	NC_007907	TCAATA	2	12	18578	18589	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	89892762
16	NC_007907	ATATCT	2	12	20696	20707	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	89892764
17	NC_007907	TTTTTG	2	12	24364	24375	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	89892769
18	NC_007907	CTTTTC	2	12	29327	29338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89892775
19	NC_007907	CCGTCA	2	12	31394	31405	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	89892776
20	NC_007907	ATACTT	2	12	32002	32013	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	89892776
21	NC_007907	TCCGGC	2	12	37105	37116	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	89892781
22	NC_007907	AGATTG	2	12	37522	37533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89892781
23	NC_007907	ATTTTG	2	12	40977	40988	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	89892784
24	NC_007907	CCGCCA	2	12	44207	44218	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	89892790
25	NC_007907	ACAAGT	2	12	48964	48975	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	89892793
26	NC_007907	GCTTTC	2	12	52091	52102	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	89892796
27	NC_007907	ATTGCG	2	12	52379	52390	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	89892796
28	NC_007907	CCACCG	2	12	64975	64986	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	89892808
29	NC_007907	TGGTAA	2	12	65474	65485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89892808
30	NC_007907	GGATAC	2	12	66221	66232	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89892808
31	NC_007907	GCCACC	2	12	67923	67934	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	89892808
32	NC_007907	CTTTTT	2	12	69860	69871	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	89892810
33	NC_007907	CTTCAG	2	12	72533	72544	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	89892814
34	NC_007907	AAATTG	2	12	76218	76229	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	89892817
35	NC_007907	AGCGAT	2	12	78442	78453	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89892819
36	NC_007907	TGGCGT	2	12	85124	85135	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	89892827
37	NC_007907	TGGTCA	2	12	90201	90212	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	89892833
38	NC_007907	GGTGGA	2	12	96364	96375	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	89892839
39	NC_007907	GAACAT	2	12	103852	103863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	89892846
40	NC_007907	TGAAAA	2	12	106626	106637	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	89892849
41	NC_007907	ACAAGC	2	12	108304	108315	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	89892850
42	NC_007907	ATGACC	3	18	110414	110431	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89892853
43	NC_007907	GGCATG	2	12	111581	111592	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	89892854
44	NC_007907	GGCCAG	2	12	121992	122003	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	89892862
45	NC_007907	GCTCAG	2	12	127424	127435	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	89892867
46	NC_007907	AAGAGC	2	12	130268	130279	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	89892869
47	NC_007907	GTCCTG	2	12	134801	134812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89892874
48	NC_007907	CCTATA	2	12	136428	136439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89892876
49	NC_007907	CGACGG	2	12	136449	136460	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	89892876
50	NC_007907	AGATTA	2	12	137037	137048	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	89892877
51	NC_007907	AAAGGA	2	12	141578	141589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89892881
52	NC_007907	TCCCTT	2	12	144389	144400	0 %	50 %	0 %	50 %	89892884
53	NC_007907	AATGGC	2	12	148588	148599	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89892886
54	NC_007907	AATGGC	2	12	149714	149725	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89892888
55	NC_007907	GGTCTG	2	12	152234	152245	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	89892891
56	NC_007907	AGCTGG	2	12	157744	157755	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	89892895
57	NC_007907	GCCCTG	2	12	166433	166444	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	89892905
58	NC_007907	CGCCTG	2	12	166729	166740	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	89892905
59	NC_007907	GAGCCG	2	12	177520	177531	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	89892913
60	NC_007907	TGGCGG	2	12	179606	179617	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	89892916
61	NC_007907	GCTGAG	2	12	190076	190087	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	89892923
62	NC_007907	CCAGCC	2	12	190108	190119	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	89892923
63	NC_007907	CCCTTG	2	12	191048	191059	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	89892924
64	NC_007907	TGCCAC	2	12	192417	192428	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	89892926
65	NC_007907	GAAAAT	2	12	193471	193482	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	89892927
66	NC_007907	CTCCAG	2	12	198265	198276	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	89892931
67	NC_007907	ATTCCG	2	12	200381	200392	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	89892932
68	NC_007907	GTCTAT	2	12	204531	204542	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	89892935
69	NC_007907	CAAGGC	2	12	204923	204934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89892935
70	NC_007907	GGCATG	2	12	206921	206932	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	89892936
71	NC_007907	AAAGCC	2	12	207653	207664	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	89892936
72	NC_007907	TGGCTC	2	12	220055	220066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89892948
73	NC_007907	TGCCAA	2	12	220092	220103	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89892948
74	NC_007907	ATTTTT	2	12	220937	220948	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	89892949
75	NC_007907	TGCAGA	2	12	221149	221160	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89892950
76	NC_007907	ACCGAT	2	12	223103	223114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89892951
77	NC_007907	TTAGCT	2	12	224240	224251	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	89892952
78	NC_007907	CATTGA	2	12	226223	226234	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	89892955
79	NC_007907	TGGAGA	2	12	226385	226396	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	89892955
80	NC_007907	GATGTG	2	12	227345	227356	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	89892956
81	NC_007907	TGCAGG	2	12	229161	229172	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	89892959
82	NC_007907	GAGGAA	2	12	234679	234690	50 %	0 %	50 %	0 %	89892964
83	NC_007907	CTGAGG	2	12	245395	245406	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	89892967
84	NC_007907	AGTGGA	2	12	258369	258380	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	89892976
85	NC_007907	AAATTG	2	12	263757	263768	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	89892981
86	NC_007907	TATGAA	2	12	263939	263950	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	89892981
87	NC_007907	GATCAG	2	12	267589	267600	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89892984
88	NC_007907	AGGGGT	2	12	271883	271894	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	89892987
89	NC_007907	TTGCCA	2	12	275248	275259	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	89892989
90	NC_007907	GAGGAA	2	12	277042	277053	50 %	0 %	50 %	0 %	89892990
91	NC_007907	GGGGCG	2	12	283158	283169	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	89892996
92	NC_007907	GATCAG	2	12	283753	283764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89892997
93	NC_007907	CAAGAT	2	12	284505	284516	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	89892997
94	NC_007907	AAAAGA	2	12	284628	284639	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	89892997
95	NC_007907	CAGCTG	2	12	285116	285127	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	89892998
96	NC_007907	TTCCTT	2	12	286283	286294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89892999
97	NC_007907	GAGGCG	2	12	292382	292393	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	89893007
98	NC_007907	AATTTG	2	12	294069	294080	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	89893007
99	NC_007907	AAAATA	2	12	298428	298439	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	89893012
100	NC_007907	TAAGGT	2	12	299190	299201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89893013
101	NC_007907	ATGATT	2	12	299329	299340	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	89893013
102	NC_007907	AGCGTA	2	12	299500	299511	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89893014
103	NC_007907	AAGGTT	2	12	301538	301549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89893017
104	NC_007907	GCCGGG	2	12	314995	315006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89893028
105	NC_007907	TGGAGG	2	12	315388	315399	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	89893028
106	NC_007907	ATTTGG	2	12	316688	316699	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	89893029
107	NC_007907	AAGAAA	2	12	319172	319183	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	89893030
108	NC_007907	TTTACC	2	12	321819	321830	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	89893032
109	NC_007907	AACAGC	2	12	322395	322406	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	89893032
110	NC_007907	TCGGGA	2	12	324433	324444	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	89893034
111	NC_007907	TTTTTA	2	12	354385	354396	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	89893051
112	NC_007907	TGCACC	2	12	355218	355229	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	89893051
113	NC_007907	TGGCTC	2	12	362602	362613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89893058
114	NC_007907	TCATTC	2	12	362645	362656	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	89893058
115	NC_007907	AATATT	2	12	368197	368208	50 %	50 %	0 %	0 %	89893064
116	NC_007907	CCTTTT	2	12	368564	368575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89893064
117	NC_007907	CCCCGT	2	12	375309	375320	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	89893068
118	NC_007907	ATTGGT	2	12	377525	377536	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	89893069
119	NC_007907	AGGAAG	2	12	379769	379780	50 %	0 %	50 %	0 %	89893071
120	NC_007907	AGGAAG	2	12	382942	382953	50 %	0 %	50 %	0 %	89893074
121	NC_007907	CCAGCT	2	12	384363	384374	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	89893075
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232	NC_007907	GGACCT	2	12	707587	707598	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	89893359
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450	NC_007907	CTGGAT	2	12	1389241	1389252	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	89893921
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452	NC_007907	CCTTTG	2	12	1403151	1403162	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	89893930
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454	NC_007907	GATCGG	2	12	1410089	1410100	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	89893937
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461	NC_007907	GAACTG	2	12	1431292	1431303	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89893958
462	NC_007907	TCCGTT	2	12	1435716	1435727	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	89893963
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