MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 plasmid1

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007901	CGGCTA	2	12	2245	2256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	89885734
2	NC_007901	TTGAAT	2	12	4622	4633	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	89885736
3	NC_007901	CCGTAC	2	12	6974	6985	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	89885739
4	NC_007901	CCAGTC	2	12	14352	14363	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	89885745
5	NC_007901	AGCCCA	2	12	22775	22786	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	89885753
6	NC_007901	CAATGC	2	12	29173	29184	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89885760
7	NC_007901	TTGCCG	2	12	35562	35573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885765
8	NC_007901	AGCAAA	2	12	40010	40021	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	89885768
9	NC_007901	GCCTCG	2	12	48604	48615	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	89885776
10	NC_007901	CTTTTT	2	12	48917	48928	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	89885776
11	NC_007901	TTGGTG	2	12	73193	73204	0 %	50 %	50 %	0 %	89885793
12	NC_007901	TGCAAG	2	12	78331	78342	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89885799
13	NC_007901	GGCGCC	2	12	82013	82024	0 %	0 %	50 %	50 %	89885804
14	NC_007901	GCCTCA	2	12	83933	83944	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	89885805
15	NC_007901	TTGCCA	2	12	86946	86957	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	89885809
16	NC_007901	GCTGGC	2	12	95100	95111	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	89885816
17	NC_007901	TGCAGC	2	12	96135	96146	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	89885819
18	NC_007901	CCCGAA	2	12	112639	112650	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	89885835
19	NC_007901	ATCTGG	2	12	120816	120827	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	89885842
20	NC_007901	TTGCGC	2	12	122363	122374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885844
21	NC_007901	CTGCCG	2	12	130683	130694	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	89885850
22	NC_007901	GCGCCA	2	12	130698	130709	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	89885850
23	NC_007901	TCAGCG	2	12	131565	131576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	89885851
24	NC_007901	TGCCGT	2	12	135953	135964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885856
25	NC_007901	TATCGG	2	12	137507	137518	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	89885856
26	NC_007901	GGCAAT	2	12	140386	140397	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89885860
27	NC_007901	GCGCTG	2	12	148785	148796	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	89885869
28	NC_007901	CCGCAG	2	12	149762	149773	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	89885871
29	NC_007901	ATCGAC	2	12	152032	152043	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89885873
30	NC_007901	CGCAGG	2	12	153086	153097	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	89885873
31	NC_007901	TTGGTG	2	12	153377	153388	0 %	50 %	50 %	0 %	89885874
32	NC_007901	ACCCCC	2	12	155619	155630	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	89885877
33	NC_007901	GCCTGC	2	12	156570	156581	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	89885878
34	NC_007901	CGTCGC	2	12	157401	157412	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	89885878
35	NC_007901	ATGCCA	2	12	160192	160203	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89885880
36	NC_007901	GAATTG	2	12	163542	163553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885884
37	NC_007901	CAACGA	2	12	168958	168969	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	89885888
38	NC_007901	CCCAAC	2	12	179613	179624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885899
39	NC_007901	GATGTA	2	12	180411	180422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885899
40	NC_007901	CCAAAA	2	12	187450	187461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885908
41	NC_007901	CAGCAT	2	12	188640	188651	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89885910
42	NC_007901	ACTTGC	2	12	194153	194164	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	89885914
43	NC_007901	ACTTTG	2	12	194637	194648	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	89885914
44	NC_007901	CGAACA	2	12	195122	195133	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	89885914
45	NC_007901	GAACCA	2	12	196472	196483	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	89885916
46	NC_007901	GTATCA	2	12	200489	200500	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	89885921
47	NC_007901	TCAACG	2	12	203461	203472	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89885927
48	NC_007901	CTGCAT	2	12	207847	207858	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	89885935
49	NC_007901	TGATTT	2	12	213427	213438	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	89885945
50	NC_007901	GGCCAG	2	12	218606	218617	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	89885951
51	NC_007901	ATCAAG	2	12	219285	219296	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	89885952
52	NC_007901	TGGATC	2	12	222025	222036	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	89885955
53	NC_007901	GTTGGC	2	12	223096	223107	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	89885955
54	NC_007901	CATTGC	2	12	224893	224904	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	89885957
55	NC_007901	GCATCC	2	12	225113	225124	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	89885957
56	NC_007901	GCACCG	2	12	227642	227653	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	89885958
57	NC_007901	GCAATG	2	12	229452	229463	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89885959
58	NC_007901	TCGCCC	2	12	230436	230447	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	89885961
59	NC_007901	GCACTG	2	12	236216	236227	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	89885964
60	NC_007901	GGCGCT	2	12	236841	236852	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	89885965
61	NC_007901	TTTGAC	2	12	237040	237051	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	89885965
62	NC_007901	CCATGA	2	12	240420	240431	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89885969
63	NC_007901	GCCAGC	2	12	240950	240961	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	89885969
64	NC_007901	ACTCCG	2	12	251255	251266	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	89885975

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.