MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 plasmid1

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007901	ACACA	2	10	12380	12389	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_007901	TGGCT	2	10	26097	26106	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007901	TGTTT	2	10	26216	26225	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007901	GTTTT	2	10	27219	27228	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007901	TCCCC	2	10	28993	29002	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
6	NC_007901	CGGGT	2	10	32398	32407	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007901	CGGCT	2	10	36862	36871	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_007901	CGTTT	2	10	37326	37335	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_007901	CGGGT	2	10	46725	46734	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007901	AAGAC	2	10	55510	55519	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007901	AAGAC	2	10	55766	55775	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007901	AAGAC	2	10	55965	55974	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007901	AAATG	2	10	62029	62038	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007901	ATAAA	2	10	63237	63246	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007901	ACCTG	2	10	76148	76157	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_007901	GGAAT	2	10	88493	88502	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007901	TCAAA	2	10	95990	95999	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007901	TGCTC	2	10	128844	128853	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_007901	CTGAC	2	10	130293	130302	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_007901	GGGTT	2	10	132797	132806	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007901	CGGGG	2	10	150464	150473	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007901	TGAAA	2	10	176893	176902	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007901	GGTGC	2	10	184095	184104	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007901	CCATT	2	10	186023	186032	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_007901	GTCTG	2	10	186359	186368	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_007901	TCCTT	2	10	187164	187173	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_007901	CAAGC	2	10	207073	207082	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_007901	ATTCC	2	10	207250	207259	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_007901	TCCCG	2	10	209256	209265	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_007901	TTTCA	2	10	215179	215188	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007901	GCGCT	2	10	217938	217947	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_007901	TGCGC	2	10	238863	238872	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_007901	GACTG	2	10	240261	240270	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007901	TTGAC	2	10	240306	240315	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007901	TTTGC	2	10	245499	245508	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007901	CCTTG	2	10	245531	245540	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_007901	GAGCA	2	10	245781	245790	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007901	TGGGT	2	10	246030	246039	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007901	GCTGG	2	10	246246	246255	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_007901	TCAAG	2	10	248256	248265	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.