MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 plasmid1

Total Repeats: 608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007901	CGCA	2	8	475	482	25 %	0 %	25 %	50 %	89885733
2	NC_007901	CCAT	2	8	683	690	25 %	25 %	0 %	50 %	89885733
3	NC_007901	GATA	2	8	728	735	50 %	25 %	25 %	0 %	89885733
4	NC_007901	GAAC	2	8	1910	1917	50 %	0 %	25 %	25 %	89885734
5	NC_007901	GCAA	2	8	2179	2186	50 %	0 %	25 %	25 %	89885734
6	NC_007901	AACG	2	8	2576	2583	50 %	0 %	25 %	25 %	89885734
7	NC_007901	GGCA	2	8	3432	3439	25 %	0 %	50 %	25 %	89885735
8	NC_007901	TTCT	2	8	3943	3950	0 %	75 %	0 %	25 %	89885736
9	NC_007901	ACGA	2	8	4136	4143	50 %	0 %	25 %	25 %	89885736
10	NC_007901	CTGT	2	8	4379	4386	0 %	50 %	25 %	25 %	89885736
11	NC_007901	ACGA	2	8	4607	4614	50 %	0 %	25 %	25 %	89885736
12	NC_007901	AGCG	2	8	5639	5646	25 %	0 %	50 %	25 %	89885738
13	NC_007901	TGGC	2	8	5742	5749	0 %	25 %	50 %	25 %	89885738
14	NC_007901	TTGT	2	8	6447	6454	0 %	75 %	25 %	0 %	89885738
15	NC_007901	TGAT	2	8	7190	7197	25 %	50 %	25 %	0 %	89885739
16	NC_007901	ACTG	2	8	8413	8420	25 %	25 %	25 %	25 %	89885740
17	NC_007901	ATGA	2	8	9183	9190	50 %	25 %	25 %	0 %	89885741
18	NC_007901	GGTC	2	8	9324	9331	0 %	25 %	50 %	25 %	89885741
19	NC_007901	ATTG	2	8	9673	9680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007901	CCGG	2	8	9924	9931	0 %	0 %	50 %	50 %	89885742
21	NC_007901	AATT	2	8	11191	11198	50 %	50 %	0 %	0 %	89885742
22	NC_007901	AACC	2	8	11555	11562	50 %	0 %	0 %	50 %	89885742
23	NC_007901	ATAC	2	8	11685	11692	50 %	25 %	0 %	25 %	89885742
24	NC_007901	AACG	2	8	11809	11816	50 %	0 %	25 %	25 %	89885742
25	NC_007901	ACAG	2	8	11853	11860	50 %	0 %	25 %	25 %	89885742
26	NC_007901	ATTG	2	8	12012	12019	25 %	50 %	25 %	0 %	89885743
27	NC_007901	TGAC	2	8	12128	12135	25 %	25 %	25 %	25 %	89885743
28	NC_007901	ACCA	2	8	12218	12225	50 %	0 %	0 %	50 %	89885743
29	NC_007901	GGCT	2	8	12501	12508	0 %	25 %	50 %	25 %	89885744
30	NC_007901	GACG	2	8	12574	12581	25 %	0 %	50 %	25 %	89885744
31	NC_007901	TGAG	2	8	12612	12619	25 %	25 %	50 %	0 %	89885744
32	NC_007901	TTTG	2	8	12681	12688	0 %	75 %	25 %	0 %	89885744
33	NC_007901	CTTT	2	8	12788	12795	0 %	75 %	0 %	25 %	89885744
34	NC_007901	TCCA	2	8	14579	14586	25 %	25 %	0 %	50 %	89885745
35	NC_007901	CATT	2	8	15609	15616	25 %	50 %	0 %	25 %	89885746
36	NC_007901	CAGG	2	8	15966	15973	25 %	0 %	50 %	25 %	89885747
37	NC_007901	TTTC	2	8	16029	16036	0 %	75 %	0 %	25 %	89885747
38	NC_007901	TCAA	2	8	16184	16191	50 %	25 %	0 %	25 %	89885747
39	NC_007901	TCGT	2	8	16525	16532	0 %	50 %	25 %	25 %	89885747
40	NC_007901	AAAG	2	8	16689	16696	75 %	0 %	25 %	0 %	89885747
41	NC_007901	GTCT	2	8	17923	17930	0 %	50 %	25 %	25 %	89885747
42	NC_007901	ACAA	2	8	18788	18795	75 %	0 %	0 %	25 %	89885749
43	NC_007901	TCAA	2	8	18938	18945	50 %	25 %	0 %	25 %	89885750
44	NC_007901	GCCG	2	8	18960	18967	0 %	0 %	50 %	50 %	89885750
45	NC_007901	CGTT	2	8	19254	19261	0 %	50 %	25 %	25 %	89885750
46	NC_007901	AGAA	2	8	19429	19436	75 %	0 %	25 %	0 %	89885750
47	NC_007901	ATCT	2	8	19843	19850	25 %	50 %	0 %	25 %	89885750
48	NC_007901	TCTT	2	8	20122	20129	0 %	75 %	0 %	25 %	89885751
49	NC_007901	TCCA	2	8	20148	20155	25 %	25 %	0 %	50 %	89885751
50	NC_007901	CAAA	2	8	20165	20172	75 %	0 %	0 %	25 %	89885751
51	NC_007901	ACCA	2	8	20188	20195	50 %	0 %	0 %	50 %	89885751
52	NC_007901	CGAT	2	8	21034	21041	25 %	25 %	25 %	25 %	89885752
53	NC_007901	GACC	2	8	21174	21181	25 %	0 %	25 %	50 %	89885752
54	NC_007901	GTAA	2	8	21567	21574	50 %	25 %	25 %	0 %	89885753
55	NC_007901	CGGC	2	8	22417	22424	0 %	0 %	50 %	50 %	89885753
56	NC_007901	CGAC	2	8	23617	23624	25 %	0 %	25 %	50 %	89885754
57	NC_007901	CAGA	2	8	24310	24317	50 %	0 %	25 %	25 %	89885754
58	NC_007901	CGAA	2	8	24629	24636	50 %	0 %	25 %	25 %	89885754
59	NC_007901	CCCG	2	8	25367	25374	0 %	0 %	25 %	75 %	89885755
60	NC_007901	TGGG	2	8	25713	25720	0 %	25 %	75 %	0 %	89885756
61	NC_007901	CTCG	2	8	25721	25728	0 %	25 %	25 %	50 %	89885756
62	NC_007901	TCAG	2	8	25744	25751	25 %	25 %	25 %	25 %	89885756
63	NC_007901	TTGG	2	8	26191	26198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007901	CGAC	2	8	26502	26509	25 %	0 %	25 %	50 %	89885757
65	NC_007901	GCTT	2	8	27242	27249	0 %	50 %	25 %	25 %	89885758
66	NC_007901	CGCT	2	8	28076	28083	0 %	25 %	25 %	50 %	89885758
67	NC_007901	TTGC	2	8	28644	28651	0 %	50 %	25 %	25 %	89885759
68	NC_007901	AGGG	2	8	29007	29014	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007901	TTCT	2	8	29040	29047	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007901	CCGT	2	8	30069	30076	0 %	25 %	25 %	50 %	89885760
71	NC_007901	ATGA	2	8	30499	30506	50 %	25 %	25 %	0 %	89885760
72	NC_007901	TGCG	2	8	30570	30577	0 %	25 %	50 %	25 %	89885760
73	NC_007901	CCTT	2	8	31174	31181	0 %	50 %	0 %	50 %	89885761
74	NC_007901	ATCA	2	8	31849	31856	50 %	25 %	0 %	25 %	89885761
75	NC_007901	GTTT	2	8	32001	32008	0 %	75 %	25 %	0 %	89885761
76	NC_007901	AAGG	2	8	32550	32557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007901	GCCG	2	8	33315	33322	0 %	0 %	50 %	50 %	89885763
78	NC_007901	TCAA	2	8	34095	34102	50 %	25 %	0 %	25 %	89885763
79	NC_007901	TGTC	2	8	34140	34147	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007901	TGTT	2	8	34166	34173	0 %	75 %	25 %	0 %	89885764
81	NC_007901	ACCC	2	8	35594	35601	25 %	0 %	0 %	75 %	89885765
82	NC_007901	AGAA	2	8	36811	36818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007901	AAAC	2	8	37135	37142	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007901	TTCG	2	8	37902	37909	0 %	50 %	25 %	25 %	89885767
85	NC_007901	CAGG	2	8	38074	38081	25 %	0 %	50 %	25 %	89885767
86	NC_007901	CACG	2	8	38887	38894	25 %	0 %	25 %	50 %	89885768
87	NC_007901	TTTC	2	8	40118	40125	0 %	75 %	0 %	25 %	89885768
88	NC_007901	GACT	2	8	40242	40249	25 %	25 %	25 %	25 %	89885769
89	NC_007901	GCCT	2	8	40321	40328	0 %	25 %	25 %	50 %	89885769
90	NC_007901	CGTC	2	8	40526	40533	0 %	25 %	25 %	50 %	89885769
91	NC_007901	GATG	2	8	40600	40607	25 %	25 %	50 %	0 %	89885769
92	NC_007901	CTGG	2	8	40792	40799	0 %	25 %	50 %	25 %	89885769
93	NC_007901	GCCA	2	8	40886	40893	25 %	0 %	25 %	50 %	89885769
94	NC_007901	CCCA	2	8	41233	41240	25 %	0 %	0 %	75 %	89885770
95	NC_007901	AGTA	2	8	41928	41935	50 %	25 %	25 %	0 %	89885771
96	NC_007901	CATC	2	8	41953	41960	25 %	25 %	0 %	50 %	89885771
97	NC_007901	GTCC	2	8	42115	42122	0 %	25 %	25 %	50 %	89885771
98	NC_007901	TTCA	2	8	42874	42881	25 %	50 %	0 %	25 %	89885772
99	NC_007901	TTTG	2	8	43144	43151	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007901	TATT	2	8	43736	43743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007901	TTTG	2	8	44993	45000	0 %	75 %	25 %	0 %	89885773
102	NC_007901	TAGT	2	8	45193	45200	25 %	50 %	25 %	0 %	89885773
103	NC_007901	AAAG	2	8	45564	45571	75 %	0 %	25 %	0 %	89885773
104	NC_007901	GATG	2	8	45874	45881	25 %	25 %	50 %	0 %	89885774
105	NC_007901	TGCG	2	8	47316	47323	0 %	25 %	50 %	25 %	89885775
106	NC_007901	GGTG	2	8	47653	47660	0 %	25 %	75 %	0 %	89885775
107	NC_007901	TGCC	2	8	48507	48514	0 %	25 %	25 %	50 %	89885776
108	NC_007901	TCAA	2	8	49527	49534	50 %	25 %	0 %	25 %	89885777
109	NC_007901	ATAA	2	8	49763	49770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007901	GGTG	2	8	50257	50264	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007901	TGCC	2	8	50518	50525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007901	CCGT	2	8	50651	50658	0 %	25 %	25 %	50 %	89885778
113	NC_007901	TCGA	2	8	51175	51182	25 %	25 %	25 %	25 %	89885778
114	NC_007901	AGAA	2	8	51254	51261	75 %	0 %	25 %	0 %	89885778
115	NC_007901	CGGT	2	8	51346	51353	0 %	25 %	50 %	25 %	89885778
116	NC_007901	GTCG	2	8	51775	51782	0 %	25 %	50 %	25 %	89885778
117	NC_007901	CGGC	2	8	52287	52294	0 %	0 %	50 %	50 %	89885778
118	NC_007901	TACA	2	8	53653	53660	50 %	25 %	0 %	25 %	89885780
119	NC_007901	ACAA	2	8	53912	53919	75 %	0 %	0 %	25 %	89885780
120	NC_007901	AAAG	2	8	54733	54740	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007901	GGGA	2	8	55036	55043	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007901	CAAC	2	8	55071	55078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007901	TCAA	2	8	55221	55228	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007901	TCAA	2	8	55370	55377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007901	AACA	2	8	55527	55534	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_007901	TCAA	2	8	55791	55798	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007901	CAAC	2	8	55898	55905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007901	TCAA	2	8	55990	55997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007901	CAAC	2	8	56097	56104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007901	GAAC	2	8	57234	57241	50 %	0 %	25 %	25 %	89885781
131	NC_007901	TGAA	2	8	57564	57571	50 %	25 %	25 %	0 %	89885781
132	NC_007901	CCTG	2	8	57850	57857	0 %	25 %	25 %	50 %	89885781
133	NC_007901	CTCG	2	8	58246	58253	0 %	25 %	25 %	50 %	89885781
134	NC_007901	CTTG	2	8	59103	59110	0 %	50 %	25 %	25 %	89885781
135	NC_007901	GGAC	2	8	60609	60616	25 %	0 %	50 %	25 %	89885781
136	NC_007901	ATTG	2	8	61548	61555	25 %	50 %	25 %	0 %	89885781
137	NC_007901	GGCA	2	8	61692	61699	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_007901	GAAA	2	8	61879	61886	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007901	CTGC	2	8	61977	61984	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007901	GTTC	2	8	62199	62206	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007901	CCCA	2	8	62472	62479	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_007901	AAGG	2	8	62923	62930	50 %	0 %	50 %	0 %	89885782
143	NC_007901	AGAA	2	8	63164	63171	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_007901	CTTG	2	8	64577	64584	0 %	50 %	25 %	25 %	89885784
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