MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 plasmid1

Total Repeats: 2644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007901	CCA	2	6	270	275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885733
2	NC_007901	CGA	2	6	285	290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885733
3	NC_007901	CGC	2	6	324	329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885733
4	NC_007901	GCT	2	6	426	431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885733
5	NC_007901	CCA	2	6	453	458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885733
6	NC_007901	ACA	2	6	468	473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885733
7	NC_007901	TGT	2	6	693	698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885733
8	NC_007901	GTC	2	6	824	829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885733
9	NC_007901	ACC	2	6	857	862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885733
10	NC_007901	CGT	2	6	957	962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885733
11	NC_007901	AAC	2	6	979	984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885733
12	NC_007901	GCC	2	6	991	996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885733
13	NC_007901	TCC	2	6	1190	1195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885733
14	NC_007901	CCT	2	6	1350	1355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885733
15	NC_007901	GGC	2	6	1381	1386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885733
16	NC_007901	ATC	2	6	1421	1426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885733
17	NC_007901	GCA	2	6	1503	1508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885733
18	NC_007901	CGC	2	6	1549	1554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885733
19	NC_007901	CGT	2	6	1672	1677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885733
20	NC_007901	CGC	2	6	1699	1704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885733
21	NC_007901	CCA	2	6	1721	1726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885733
22	NC_007901	CCA	2	6	1740	1745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885733
23	NC_007901	GTT	2	6	2096	2101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885734
24	NC_007901	TTC	2	6	2329	2334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885734
25	NC_007901	GCC	2	6	2452	2457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885734
26	NC_007901	GTA	2	6	2478	2483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885734
27	NC_007901	CCT	2	6	2500	2505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885734
28	NC_007901	CGA	2	6	2522	2527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885734
29	NC_007901	TCG	2	6	2590	2595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885734
30	NC_007901	TTG	2	6	2662	2667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885734
31	NC_007901	AGC	2	6	2710	2715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885734
32	NC_007901	TTC	2	6	2742	2747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885734
33	NC_007901	ATG	2	6	2779	2784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885734
34	NC_007901	ATG	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885734
35	NC_007901	CCA	2	6	2941	2946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885734
36	NC_007901	CCA	2	6	3169	3174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885735
37	NC_007901	CTG	2	6	3182	3187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885735
38	NC_007901	CGC	2	6	3235	3240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885735
39	NC_007901	GTT	2	6	3463	3468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885735
40	NC_007901	GCG	2	6	3470	3475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885735
41	NC_007901	AGC	2	6	3684	3689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885736
42	NC_007901	CCA	2	6	3723	3728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885736
43	NC_007901	GAA	2	6	3748	3753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885736
44	NC_007901	CCG	2	6	3790	3795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885736
45	NC_007901	TGG	2	6	3850	3855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885736
46	NC_007901	GAC	2	6	3912	3917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885736
47	NC_007901	GAA	2	6	4035	4040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885736
48	NC_007901	CTG	2	6	4062	4067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885736
49	NC_007901	AGA	2	6	4072	4077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885736
50	NC_007901	CCT	2	6	4078	4083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885736
51	NC_007901	CAA	2	6	4166	4171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885736
52	NC_007901	ATC	2	6	4179	4184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885736
53	NC_007901	GCC	2	6	4280	4285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885736
54	NC_007901	ACA	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885736
55	NC_007901	CAT	2	6	4636	4641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885736
56	NC_007901	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885736
57	NC_007901	TGA	2	6	4750	4755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885736
58	NC_007901	AAT	2	6	4781	4786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89885736
59	NC_007901	TTG	2	6	5000	5005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885736
60	NC_007901	GTC	2	6	5007	5012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885736
61	NC_007901	TGC	2	6	5029	5034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885736
62	NC_007901	ACA	2	6	5041	5046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89885736
63	NC_007901	AAG	2	6	5322	5327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885737
64	NC_007901	GCG	2	6	5351	5356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885737
65	NC_007901	GCA	2	6	5442	5447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885737
66	NC_007901	CTT	2	6	5450	5455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885737
67	NC_007901	TCA	2	6	5484	5489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885737
68	NC_007901	TTC	2	6	5586	5591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885737
69	NC_007901	TGT	2	6	5623	5628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885738
70	NC_007901	TTG	2	6	5658	5663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885738
71	NC_007901	CAG	2	6	5839	5844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885738
72	NC_007901	ACG	3	9	5901	5909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885738
73	NC_007901	ATG	2	6	5958	5963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885738
74	NC_007901	TGA	2	6	5971	5976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885738
75	NC_007901	GCA	2	6	6039	6044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885738
76	NC_007901	ATC	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885738
77	NC_007901	CGC	2	6	6170	6175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885738
78	NC_007901	GCA	2	6	6291	6296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885738
79	NC_007901	CAT	2	6	6577	6582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885738
80	NC_007901	GGC	2	6	6656	6661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885738
81	NC_007901	TGC	2	6	6665	6670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885738
82	NC_007901	CAG	2	6	6683	6688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885738
83	NC_007901	GGA	2	6	6818	6823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89885739
84	NC_007901	GCC	2	6	6850	6855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885739
85	NC_007901	TGG	3	9	6888	6896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885739
86	NC_007901	AGT	2	6	6913	6918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885739
87	NC_007901	CAC	2	6	6933	6938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885739
88	NC_007901	GTT	2	6	7000	7005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885739
89	NC_007901	AGG	2	6	7168	7173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89885739
90	NC_007901	AAG	2	6	7174	7179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885739
91	NC_007901	GCA	2	6	7266	7271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885739
92	NC_007901	CTG	2	6	7515	7520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885739
93	NC_007901	GAA	2	6	7698	7703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885739
94	NC_007901	CCG	2	6	7711	7716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885739
95	NC_007901	CAG	2	6	7794	7799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885739
96	NC_007901	CGA	2	6	7800	7805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885739
97	NC_007901	GGT	4	12	7856	7867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89885739
98	NC_007901	CCG	2	6	7881	7886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885739
99	NC_007901	GCA	2	6	7961	7966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885739
100	NC_007901	GAA	3	9	7999	8007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89885739
101	NC_007901	CCT	2	6	8174	8179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885740
102	NC_007901	CCA	2	6	8273	8278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885740
103	NC_007901	CAG	2	6	8397	8402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885740
104	NC_007901	TGC	2	6	8423	8428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885740
105	NC_007901	CGG	2	6	8465	8470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885740
106	NC_007901	CGA	2	6	8482	8487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885740
107	NC_007901	TGC	2	6	8621	8626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885740
108	NC_007901	TGT	2	6	8777	8782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885740
109	NC_007901	TGC	2	6	8859	8864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885740
110	NC_007901	TCA	3	9	8906	8914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885740
111	NC_007901	TCC	2	6	9096	9101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885741
112	NC_007901	TGT	2	6	9146	9151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885741
113	NC_007901	GCT	2	6	9366	9371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885741
114	NC_007901	GTC	2	6	9420	9425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885741
115	NC_007901	ATC	2	6	9435	9440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885741
116	NC_007901	CAG	3	9	9476	9484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885741
117	NC_007901	ACC	2	6	9516	9521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89885741
118	NC_007901	GCT	2	6	9633	9638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885741
119	NC_007901	GCA	2	6	10016	10021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885742
120	NC_007901	TCT	2	6	10128	10133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885742
121	NC_007901	GCC	2	6	10144	10149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885742
122	NC_007901	TTG	2	6	10181	10186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885742
123	NC_007901	CGC	2	6	10189	10194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89885742
124	NC_007901	CAT	2	6	10222	10227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885742
125	NC_007901	GCG	2	6	10265	10270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885742
126	NC_007901	GCA	2	6	10290	10295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885742
127	NC_007901	GAT	2	6	10318	10323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885742
128	NC_007901	GAT	2	6	10332	10337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89885742
129	NC_007901	TTC	2	6	10522	10527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89885742
130	NC_007901	GCG	2	6	10747	10752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885742
131	NC_007901	CGG	2	6	10791	10796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885742
132	NC_007901	TTG	2	6	10926	10931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89885742
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259	NC_007901	ATC	2	6	20302	20307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89885751
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262	NC_007901	GCA	3	9	20650	20658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89885752
263	NC_007901	GCG	2	6	20675	20680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89885752
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379	NC_007901	CGT	2	6	30508	30513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89885760
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381	NC_007901	TCC	2	6	30591	30596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89885760
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