MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 plasmid1

Total Repeats: 328

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007901	CG	3	6	883	888	0 %	0 %	50 %	50 %	89885733
2	NC_007901	GT	4	8	1472	1479	0 %	50 %	50 %	0 %	89885733
3	NC_007901	AG	3	6	1596	1601	50 %	0 %	50 %	0 %	89885733
4	NC_007901	TG	3	6	2470	2475	0 %	50 %	50 %	0 %	89885734
5	NC_007901	GC	3	6	2714	2719	0 %	0 %	50 %	50 %	89885734
6	NC_007901	CT	3	6	3332	3337	0 %	50 %	0 %	50 %	89885735
7	NC_007901	TC	3	6	4315	4320	0 %	50 %	0 %	50 %	89885736
8	NC_007901	GC	3	6	4412	4417	0 %	0 %	50 %	50 %	89885736
9	NC_007901	TG	3	6	7763	7768	0 %	50 %	50 %	0 %	89885739
10	NC_007901	CT	3	6	8557	8562	0 %	50 %	0 %	50 %	89885740
11	NC_007901	GT	3	6	9334	9339	0 %	50 %	50 %	0 %	89885741
12	NC_007901	GC	3	6	9551	9556	0 %	0 %	50 %	50 %	89885741
13	NC_007901	TG	3	6	10277	10282	0 %	50 %	50 %	0 %	89885742
14	NC_007901	GC	4	8	10437	10444	0 %	0 %	50 %	50 %	89885742
15	NC_007901	CG	3	6	10644	10649	0 %	0 %	50 %	50 %	89885742
16	NC_007901	CA	3	6	11846	11851	50 %	0 %	0 %	50 %	89885742
17	NC_007901	CG	3	6	13382	13387	0 %	0 %	50 %	50 %	89885745
18	NC_007901	AG	3	6	14740	14745	50 %	0 %	50 %	0 %	89885745
19	NC_007901	TC	3	6	14978	14983	0 %	50 %	0 %	50 %	89885746
20	NC_007901	GC	3	6	15040	15045	0 %	0 %	50 %	50 %	89885746
21	NC_007901	TC	3	6	15136	15141	0 %	50 %	0 %	50 %	89885746
22	NC_007901	AC	3	6	16850	16855	50 %	0 %	0 %	50 %	89885747
23	NC_007901	AT	3	6	18468	18473	50 %	50 %	0 %	0 %	89885748
24	NC_007901	GA	3	6	18856	18861	50 %	0 %	50 %	0 %	89885749
25	NC_007901	GC	4	8	20398	20405	0 %	0 %	50 %	50 %	89885751
26	NC_007901	GC	3	6	21507	21512	0 %	0 %	50 %	50 %	89885753
27	NC_007901	CA	3	6	21644	21649	50 %	0 %	0 %	50 %	89885753
28	NC_007901	CG	3	6	21705	21710	0 %	0 %	50 %	50 %	89885753
29	NC_007901	AT	3	6	21778	21783	50 %	50 %	0 %	0 %	89885753
30	NC_007901	TA	3	6	22185	22190	50 %	50 %	0 %	0 %	89885753
31	NC_007901	CG	3	6	22335	22340	0 %	0 %	50 %	50 %	89885753
32	NC_007901	TC	3	6	22448	22453	0 %	50 %	0 %	50 %	89885753
33	NC_007901	GT	3	6	22753	22758	0 %	50 %	50 %	0 %	89885753
34	NC_007901	CT	3	6	23479	23484	0 %	50 %	0 %	50 %	89885754
35	NC_007901	GC	3	6	24374	24379	0 %	0 %	50 %	50 %	89885754
36	NC_007901	CG	3	6	27108	27113	0 %	0 %	50 %	50 %	89885757
37	NC_007901	CG	3	6	27378	27383	0 %	0 %	50 %	50 %	89885758
38	NC_007901	GC	3	6	27510	27515	0 %	0 %	50 %	50 %	89885758
39	NC_007901	TC	3	6	29084	29089	0 %	50 %	0 %	50 %	89885760
40	NC_007901	AC	3	6	29167	29172	50 %	0 %	0 %	50 %	89885760
41	NC_007901	GA	3	6	29538	29543	50 %	0 %	50 %	0 %	89885760
42	NC_007901	TG	3	6	30360	30365	0 %	50 %	50 %	0 %	89885760
43	NC_007901	CG	3	6	30546	30551	0 %	0 %	50 %	50 %	89885760
44	NC_007901	CG	3	6	31936	31941	0 %	0 %	50 %	50 %	89885761
45	NC_007901	AC	5	10	32788	32797	50 %	0 %	0 %	50 %	89885762
46	NC_007901	TC	3	6	32935	32940	0 %	50 %	0 %	50 %	89885762
47	NC_007901	AG	3	6	33108	33113	50 %	0 %	50 %	0 %	89885763
48	NC_007901	CT	3	6	34781	34786	0 %	50 %	0 %	50 %	89885764
49	NC_007901	CG	3	6	35047	35052	0 %	0 %	50 %	50 %	89885765
50	NC_007901	GT	3	6	36050	36055	0 %	50 %	50 %	0 %	89885766
51	NC_007901	CG	3	6	37640	37645	0 %	0 %	50 %	50 %	89885767
52	NC_007901	GC	3	6	38845	38850	0 %	0 %	50 %	50 %	89885768
53	NC_007901	CG	3	6	39845	39850	0 %	0 %	50 %	50 %	89885768
54	NC_007901	GC	3	6	40712	40717	0 %	0 %	50 %	50 %	89885769
55	NC_007901	CG	3	6	40825	40830	0 %	0 %	50 %	50 %	89885769
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58	NC_007901	AT	3	6	45645	45650	50 %	50 %	0 %	0 %	89885773
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60	NC_007901	AC	4	8	48630	48637	50 %	0 %	0 %	50 %	89885776
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62	NC_007901	CA	3	6	49363	49368	50 %	0 %	0 %	50 %	89885777
63	NC_007901	GC	3	6	51162	51167	0 %	0 %	50 %	50 %	89885778
64	NC_007901	AC	3	6	51187	51192	50 %	0 %	0 %	50 %	89885778
65	NC_007901	GC	3	6	51312	51317	0 %	0 %	50 %	50 %	89885778
66	NC_007901	GC	3	6	51928	51933	0 %	0 %	50 %	50 %	89885778
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69	NC_007901	CT	3	6	56850	56855	0 %	50 %	0 %	50 %	89885781
70	NC_007901	CA	3	6	57087	57092	50 %	0 %	0 %	50 %	89885781
71	NC_007901	GC	3	6	58545	58550	0 %	0 %	50 %	50 %	89885781
72	NC_007901	GC	3	6	59449	59454	0 %	0 %	50 %	50 %	89885781
73	NC_007901	TC	3	6	59732	59737	0 %	50 %	0 %	50 %	89885781
74	NC_007901	AT	3	6	59743	59748	50 %	50 %	0 %	0 %	89885781
75	NC_007901	CG	3	6	60185	60190	0 %	0 %	50 %	50 %	89885781
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92	NC_007901	GC	3	6	76972	76977	0 %	0 %	50 %	50 %	89885798
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102	NC_007901	GA	3	6	82726	82731	50 %	0 %	50 %	0 %	89885804
103	NC_007901	CG	3	6	83438	83443	0 %	0 %	50 %	50 %	89885805
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105	NC_007901	CA	3	6	84699	84704	50 %	0 %	0 %	50 %	89885807
106	NC_007901	CT	3	6	84788	84793	0 %	50 %	0 %	50 %	89885807
107	NC_007901	GC	3	6	85511	85516	0 %	0 %	50 %	50 %	89885808
108	NC_007901	GT	3	6	86103	86108	0 %	50 %	50 %	0 %	89885808
109	NC_007901	TC	3	6	86408	86413	0 %	50 %	0 %	50 %	89885809
110	NC_007901	CG	3	6	87872	87877	0 %	0 %	50 %	50 %	89885811
111	NC_007901	CG	3	6	87899	87904	0 %	0 %	50 %	50 %	89885811
112	NC_007901	CG	4	8	89310	89317	0 %	0 %	50 %	50 %	89885813
113	NC_007901	AC	3	6	89417	89422	50 %	0 %	0 %	50 %	89885813
114	NC_007901	GC	3	6	90057	90062	0 %	0 %	50 %	50 %	89885813
115	NC_007901	AG	3	6	90843	90848	50 %	0 %	50 %	0 %	89885813
116	NC_007901	GC	3	6	92455	92460	0 %	0 %	50 %	50 %	89885813
117	NC_007901	GC	3	6	92818	92823	0 %	0 %	50 %	50 %	89885814
118	NC_007901	CG	3	6	93237	93242	0 %	0 %	50 %	50 %	89885814
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121	NC_007901	GC	3	6	95347	95352	0 %	0 %	50 %	50 %	89885817
122	NC_007901	CA	3	6	96730	96735	50 %	0 %	0 %	50 %	89885819
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124	NC_007901	CG	3	6	97243	97248	0 %	0 %	50 %	50 %	89885820
125	NC_007901	GT	3	6	97898	97903	0 %	50 %	50 %	0 %	89885820
126	NC_007901	GC	3	6	98801	98806	0 %	0 %	50 %	50 %	89885820
127	NC_007901	CA	3	6	99367	99372	50 %	0 %	0 %	50 %	89885821
128	NC_007901	GC	3	6	100247	100252	0 %	0 %	50 %	50 %	89885822
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144	NC_007901	CT	3	6	111697	111702	0 %	50 %	0 %	50 %	89885834
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.