MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydophila felis Fe/C-56 plasmid pCfe1

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007900	AGAA	2	8	243	250	75 %	0 %	25 %	0 %	89898814
2	NC_007900	TTGT	2	8	989	996	0 %	75 %	25 %	0 %	89898814
3	NC_007900	GCAC	2	8	1812	1819	25 %	0 %	25 %	50 %	89898815
4	NC_007900	TTCT	2	8	1942	1949	0 %	75 %	0 %	25 %	89898815
5	NC_007900	CATT	2	8	2058	2065	25 %	50 %	0 %	25 %	89898815
6	NC_007900	AGAA	2	8	2072	2079	75 %	0 %	25 %	0 %	89898815
7	NC_007900	AAAG	2	8	3237	3244	75 %	0 %	25 %	0 %	89898816
8	NC_007900	AGAA	2	8	3628	3635	75 %	0 %	25 %	0 %	89898816
9	NC_007900	GAAT	2	8	4467	4474	50 %	25 %	25 %	0 %	89898817
10	NC_007900	TAAA	2	8	4614	4621	75 %	25 %	0 %	0 %	89898817
11	NC_007900	AATT	2	8	4676	4683	50 %	50 %	0 %	0 %	89898817
12	NC_007900	TGAT	2	8	4998	5005	25 %	50 %	25 %	0 %	89898818
13	NC_007900	GGAA	2	8	5257	5264	50 %	0 %	50 %	0 %	89898818
14	NC_007900	TTTC	2	8	5575	5582	0 %	75 %	0 %	25 %	89898819
15	NC_007900	TAAA	2	8	6251	6258	75 %	25 %	0 %	0 %	89898820
16	NC_007900	GAAA	2	8	6511	6518	75 %	0 %	25 %	0 %	89898820
17	NC_007900	CTAA	2	8	6682	6689	50 %	25 %	0 %	25 %	89898820
18	NC_007900	AAGA	2	8	6813	6820	75 %	0 %	25 %	0 %	89898821
19	NC_007900	GATG	2	8	6827	6834	25 %	25 %	50 %	0 %	89898821
20	NC_007900	ATCA	2	8	7483	7490	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.