MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila felis Fe/C-56

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007899	GTTTTT	2	12	163	174	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007899	TTTAAC	2	12	4669	4680	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007899	TTATGA	2	12	8981	8992	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007899	TAAGGG	2	12	17789	17800	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007899	TAAAAT	2	12	68788	68799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007899	GTTATA	2	12	86109	86120	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007899	TTTTAA	2	12	140249	140260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007899	TAAGGA	2	12	149252	149263	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007899	AAGCGA	2	12	150160	150171	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007899	AGGAGA	2	12	209782	209793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007899	TTTAAT	2	12	254008	254019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007899	GAATTC	2	12	328974	328985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_007899	AGAAAG	2	12	355938	355949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007899	TATTCT	2	12	361959	361970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_007899	AACAGC	2	12	397577	397588	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007899	ACACCC	2	12	414180	414191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_007899	ATGGCT	2	12	437599	437610	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007899	TTAAAA	2	12	449683	449694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007899	ATTTTG	2	12	478910	478921	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007899	TGATTT	2	12	485129	485140	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007899	TAATTT	2	12	494782	494793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007899	AAATAT	2	12	534969	534980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007899	TATGGC	2	12	560298	560309	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007899	AAGATT	2	12	602829	602840	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007899	TTTCAA	2	12	604233	604244	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007899	ATCGCT	2	12	655786	655797	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007899	CATAAA	2	12	685580	685591	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007899	ATTTTT	2	12	692263	692274	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007899	AAAAAC	2	12	696876	696887	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007899	AAAAAC	2	12	700019	700030	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007899	AATTTG	2	12	725306	725317	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007899	TCACTC	2	12	817502	817513	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007899	TAATTC	2	12	821809	821820	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007899	ATAAAA	2	12	823869	823880	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007899	GCCCAC	2	12	846274	846285	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_007899	CTTTCC	2	12	900308	900319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007899	AAATAA	2	12	905366	905377	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007899	TTATAT	2	12	905397	905408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007899	ACCTTA	2	12	937452	937463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007899	TTAAGG	2	12	937944	937955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007899	TAAAAA	2	12	940425	940436	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007899	AATCTT	2	12	971449	971460	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007899	TTTATA	2	12	980932	980943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007899	AAAAAC	2	12	987525	987536	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007899	TCTTTT	2	12	1004014	1004025	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_007899	TAACAA	2	12	1020100	1020111	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_007899	AAAAGG	2	12	1058363	1058374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007899	TTTAAT	2	12	1072532	1072543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007899	TCTTTT	2	12	1079140	1079151	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007899	ATATTT	2	12	1088585	1088596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007899	TATTGG	2	12	1111836	1111847	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007899	TAAAAA	2	12	1126859	1126870	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007899	AAAAAT	2	12	1139559	1139570	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.