MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydophila felis Fe/C-56

Total Repeats: 756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007899	TACCT	2	10	3277	3286	20 %	40 %	0 %	40 %	89897811
2	NC_007899	TAATT	2	10	7392	7401	40 %	60 %	0 %	0 %	89897814
3	NC_007899	AGCAA	2	10	8490	8499	60 %	0 %	20 %	20 %	89897815
4	NC_007899	CAAAA	2	10	10671	10680	80 %	0 %	0 %	20 %	89897818
5	NC_007899	GGAGT	2	10	12309	12318	20 %	20 %	60 %	0 %	89897819
6	NC_007899	AAGAT	2	10	12352	12361	60 %	20 %	20 %	0 %	89897819
7	NC_007899	CTTTT	2	10	17532	17541	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007899	GAAAT	2	10	20387	20396	60 %	20 %	20 %	0 %	89897829
9	NC_007899	GCTAA	2	10	22614	22623	40 %	20 %	20 %	20 %	89897831
10	NC_007899	CTTTT	2	10	23232	23241	0 %	80 %	0 %	20 %	89897832
11	NC_007899	TTTTC	2	10	23305	23314	0 %	80 %	0 %	20 %	89897832
12	NC_007899	TTTTA	2	10	25508	25517	20 %	80 %	0 %	0 %	89897832
13	NC_007899	GTTTT	2	10	25787	25796	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007899	GAGAA	2	10	33164	33173	60 %	0 %	40 %	0 %	89897839
15	NC_007899	CTCCC	2	10	33535	33544	0 %	20 %	0 %	80 %	89897840
16	NC_007899	TTGGA	2	10	33729	33738	20 %	40 %	40 %	0 %	89897840
17	NC_007899	TGACT	2	10	35142	35151	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007899	TTCTT	2	10	35384	35393	0 %	80 %	0 %	20 %	89897841
19	NC_007899	TAAAG	2	10	36083	36092	60 %	20 %	20 %	0 %	89897842
20	NC_007899	TTTGT	2	10	36734	36743	0 %	80 %	20 %	0 %	89897843
21	NC_007899	GTTTT	2	10	37405	37414	0 %	80 %	20 %	0 %	89897844
22	NC_007899	CTTTT	2	10	39297	39306	0 %	80 %	0 %	20 %	89897846
23	NC_007899	TTTTC	2	10	39350	39359	0 %	80 %	0 %	20 %	89897846
24	NC_007899	AGTCT	2	10	39895	39904	20 %	40 %	20 %	20 %	89897847
25	NC_007899	CTTTA	2	10	41931	41940	20 %	60 %	0 %	20 %	89897849
26	NC_007899	GCTTT	2	10	44150	44159	0 %	60 %	20 %	20 %	89897851
27	NC_007899	AGGCT	2	10	49382	49391	20 %	20 %	40 %	20 %	89897854
28	NC_007899	AAGCA	2	10	50057	50066	60 %	0 %	20 %	20 %	89897854
29	NC_007899	CCCAT	2	10	52024	52033	20 %	20 %	0 %	60 %	89897856
30	NC_007899	GATTT	2	10	55388	55397	20 %	60 %	20 %	0 %	89897858
31	NC_007899	TTTTG	2	10	55637	55646	0 %	80 %	20 %	0 %	89897858
32	NC_007899	TTTTA	2	10	59596	59605	20 %	80 %	0 %	0 %	89897861
33	NC_007899	ATCAG	2	10	61089	61098	40 %	20 %	20 %	20 %	89897863
34	NC_007899	AGCTA	2	10	61505	61514	40 %	20 %	20 %	20 %	89897863
35	NC_007899	TTCTT	2	10	61742	61751	0 %	80 %	0 %	20 %	89897864
36	NC_007899	AGTAT	2	10	61754	61763	40 %	40 %	20 %	0 %	89897864
37	NC_007899	TATAA	2	10	62616	62625	60 %	40 %	0 %	0 %	89897864
38	NC_007899	TCTCC	2	10	63014	63023	0 %	40 %	0 %	60 %	89897864
39	NC_007899	CTATG	2	10	64388	64397	20 %	40 %	20 %	20 %	89897865
40	NC_007899	TTGTT	2	10	65804	65813	0 %	80 %	20 %	0 %	89897866
41	NC_007899	TTTGC	2	10	66031	66040	0 %	60 %	20 %	20 %	89897866
42	NC_007899	TTGCT	2	10	66265	66274	0 %	60 %	20 %	20 %	89897867
43	NC_007899	GAGTT	2	10	66903	66912	20 %	40 %	40 %	0 %	89897867
44	NC_007899	TTCTT	2	10	70527	70536	0 %	80 %	0 %	20 %	89897870
45	NC_007899	GGTCT	2	10	72108	72117	0 %	40 %	40 %	20 %	89897872
46	NC_007899	ATCTT	2	10	75864	75873	20 %	60 %	0 %	20 %	89897874
47	NC_007899	GTAAT	2	10	76170	76179	40 %	40 %	20 %	0 %	89897874
48	NC_007899	TTCCG	2	10	76784	76793	0 %	40 %	20 %	40 %	89897874
49	NC_007899	TGCCT	2	10	78681	78690	0 %	40 %	20 %	40 %	89897877
50	NC_007899	AGGAA	2	10	81925	81934	60 %	0 %	40 %	0 %	89897881
51	NC_007899	TTGCG	2	10	82215	82224	0 %	40 %	40 %	20 %	89897882
52	NC_007899	TAGTA	2	10	83381	83390	40 %	40 %	20 %	0 %	89897884
53	NC_007899	AGCAG	2	10	83907	83916	40 %	0 %	40 %	20 %	89897884
54	NC_007899	AAAGA	2	10	84293	84302	80 %	0 %	20 %	0 %	89897885
55	NC_007899	TAGCA	2	10	84585	84594	40 %	20 %	20 %	20 %	89897885
56	NC_007899	GATTT	2	10	86484	86493	20 %	60 %	20 %	0 %	89897887
57	NC_007899	CTTTG	2	10	89105	89114	0 %	60 %	20 %	20 %	89897889
58	NC_007899	TTTTC	2	10	89421	89430	0 %	80 %	0 %	20 %	89897890
59	NC_007899	GATAA	2	10	91112	91121	60 %	20 %	20 %	0 %	89897890
60	NC_007899	GAATA	2	10	91908	91917	60 %	20 %	20 %	0 %	89897890
61	NC_007899	GATGA	2	10	93153	93162	40 %	20 %	40 %	0 %	89897891
62	NC_007899	TCGTT	2	10	94981	94990	0 %	60 %	20 %	20 %	89897893
63	NC_007899	GGGCT	2	10	101828	101837	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007899	TAGCT	2	10	105458	105467	20 %	40 %	20 %	20 %	89897900
65	NC_007899	GCTCT	2	10	106012	106021	0 %	40 %	20 %	40 %	89897900
66	NC_007899	TCACA	2	10	106909	106918	40 %	20 %	0 %	40 %	89897901
67	NC_007899	TGTGG	2	10	108587	108596	0 %	40 %	60 %	0 %	89897902
68	NC_007899	TAAAA	2	10	112499	112508	80 %	20 %	0 %	0 %	89897904
69	NC_007899	GATCT	2	10	115314	115323	20 %	40 %	20 %	20 %	89897905
70	NC_007899	AAAAT	2	10	115927	115936	80 %	20 %	0 %	0 %	89897906
71	NC_007899	AATCA	2	10	117073	117082	60 %	20 %	0 %	20 %	89897906
72	NC_007899	AGGTG	2	10	119531	119540	20 %	20 %	60 %	0 %	89897908
73	NC_007899	AATCA	2	10	120968	120977	60 %	20 %	0 %	20 %	89897909
74	NC_007899	CCTTT	2	10	122678	122687	0 %	60 %	0 %	40 %	89897911
75	NC_007899	TGGTT	2	10	123941	123950	0 %	60 %	40 %	0 %	89897912
76	NC_007899	ACCTG	2	10	128312	128321	20 %	20 %	20 %	40 %	89897917
77	NC_007899	TAAAA	2	10	132112	132121	80 %	20 %	0 %	0 %	89897922
78	NC_007899	TGGAG	2	10	133532	133541	20 %	20 %	60 %	0 %	89897922
79	NC_007899	ACTCT	2	10	134377	134386	20 %	40 %	0 %	40 %	89897924
80	NC_007899	TTGGA	2	10	138018	138027	20 %	40 %	40 %	0 %	89897926
81	NC_007899	GGAAT	2	10	138374	138383	40 %	20 %	40 %	0 %	89897927
82	NC_007899	TGGAA	2	10	138583	138592	40 %	20 %	40 %	0 %	89897927
83	NC_007899	TGTTA	2	10	140037	140046	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007899	ATAAA	2	10	140066	140075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007899	ATCAG	2	10	140530	140539	40 %	20 %	20 %	20 %	89897929
86	NC_007899	AGGAA	2	10	140955	140964	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007899	AGCTT	2	10	142534	142543	20 %	40 %	20 %	20 %	89897931
88	NC_007899	TGAAA	2	10	147460	147469	60 %	20 %	20 %	0 %	89897935
89	NC_007899	ATTTT	2	10	147692	147701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007899	GGAAA	2	10	148294	148303	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007899	TATGT	2	10	149375	149384	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007899	AGTTA	2	10	150115	150124	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007899	AGGTT	2	10	151042	151051	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007899	GTTAC	2	10	152520	152529	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007899	AAAGG	2	10	152810	152819	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007899	TCTTT	2	10	152828	152837	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007899	GGGAT	2	10	155681	155690	20 %	20 %	60 %	0 %	89897937
98	NC_007899	CTATT	2	10	157979	157988	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_007899	TAGCT	2	10	158389	158398	20 %	40 %	20 %	20 %	89897940
100	NC_007899	GAAAA	2	10	158628	158637	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007899	CTATA	2	10	160672	160681	40 %	40 %	0 %	20 %	89897942
102	NC_007899	GTTAG	2	10	160750	160759	20 %	40 %	40 %	0 %	89897942
103	NC_007899	AAATC	2	10	163424	163433	60 %	20 %	0 %	20 %	89897944
104	NC_007899	AATTG	2	10	164460	164469	40 %	40 %	20 %	0 %	89897945
105	NC_007899	AAATA	2	10	164828	164837	80 %	20 %	0 %	0 %	89897945
106	NC_007899	GTATT	2	10	165934	165943	20 %	60 %	20 %	0 %	89897946
107	NC_007899	TTCTT	2	10	167421	167430	0 %	80 %	0 %	20 %	89897946
108	NC_007899	TTTAA	2	10	168264	168273	40 %	60 %	0 %	0 %	89897946
109	NC_007899	TTCCT	2	10	168796	168805	0 %	60 %	0 %	40 %	89897947
110	NC_007899	CTTTT	2	10	169441	169450	0 %	80 %	0 %	20 %	89897947
111	NC_007899	GAAGA	2	10	169455	169464	60 %	0 %	40 %	0 %	89897947
112	NC_007899	TCGTT	2	10	171346	171355	0 %	60 %	20 %	20 %	89897948
113	NC_007899	TGAAG	2	10	172648	172657	40 %	20 %	40 %	0 %	89897948
114	NC_007899	AAGAG	2	10	177130	177139	60 %	0 %	40 %	0 %	89897953
115	NC_007899	GAAAT	2	10	177365	177374	60 %	20 %	20 %	0 %	89897953
116	NC_007899	GAAGA	2	10	177516	177525	60 %	0 %	40 %	0 %	89897953
117	NC_007899	TTTGG	2	10	178558	178567	0 %	60 %	40 %	0 %	89897954
118	NC_007899	TACTT	2	10	179681	179690	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_007899	TCTTA	2	10	179706	179715	20 %	60 %	0 %	20 %	89897955
120	NC_007899	AGAAA	2	10	180031	180040	80 %	0 %	20 %	0 %	89897955
121	NC_007899	TGGCT	2	10	180281	180290	0 %	40 %	40 %	20 %	89897955
122	NC_007899	CTATA	2	10	184703	184712	40 %	40 %	0 %	20 %	89897959
123	NC_007899	GAAGG	2	10	185550	185559	40 %	0 %	60 %	0 %	89897960
124	NC_007899	GTCTT	2	10	186882	186891	0 %	60 %	20 %	20 %	89897960
125	NC_007899	AATAC	2	10	187002	187011	60 %	20 %	0 %	20 %	89897960
126	NC_007899	AAATT	2	10	187830	187839	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007899	TTGGT	2	10	188639	188648	0 %	60 %	40 %	0 %	89897963
128	NC_007899	TTTAG	2	10	191817	191826	20 %	60 %	20 %	0 %	89897967
129	NC_007899	AAAAG	2	10	192315	192324	80 %	0 %	20 %	0 %	89897967
130	NC_007899	CTTGA	2	10	193266	193275	20 %	40 %	20 %	20 %	89897967
131	NC_007899	TATTT	2	10	194106	194115	20 %	80 %	0 %	0 %	89897969
132	NC_007899	CTGAA	2	10	196010	196019	40 %	20 %	20 %	20 %	89897971
133	NC_007899	ACTTT	2	10	202581	202590	20 %	60 %	0 %	20 %	89897977
134	NC_007899	TGGTA	2	10	203442	203451	20 %	40 %	40 %	0 %	89897978
135	NC_007899	TGCTT	2	10	204403	204412	0 %	60 %	20 %	20 %	89897978
136	NC_007899	TCTTT	2	10	206191	206200	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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138	NC_007899	GAAAT	2	10	208364	208373	60 %	20 %	20 %	0 %	89897982
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