MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila felis Fe/C-56

Total Repeats: 329

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007899	TAAA	2	8	90	97	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007899	TCTT	2	8	10838	10845	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007899	TCTT	2	8	26036	26043	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007899	GTGG	2	8	30292	30299	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007899	TTTC	2	8	31914	31921	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007899	AAAT	2	8	36328	36335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007899	TTCT	2	8	50743	50750	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007899	TTTC	2	8	63622	63629	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007899	ATTA	2	8	68826	68833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007899	AATT	2	8	68879	68886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007899	TTTG	2	8	71867	71874	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007899	TTAT	2	8	80588	80595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007899	TAAA	2	8	80638	80645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007899	AATA	2	8	86052	86059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007899	AGGT	2	8	88761	88768	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007899	AGGG	2	8	94241	94248	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007899	ATGT	2	8	96331	96338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007899	TAAT	2	8	102421	102428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007899	ATCG	2	8	103982	103989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007899	CTAA	2	8	105265	105272	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007899	TTTC	2	8	107195	107202	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007899	ATAC	2	8	107209	107216	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007899	GGAA	2	8	108703	108710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007899	TTAT	2	8	115397	115404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007899	TAAT	2	8	115471	115478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007899	ATTA	2	8	147070	147077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007899	TGGG	2	8	148844	148851	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007899	AAAT	2	8	152455	152462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007899	ATTG	2	8	152904	152911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007899	GAAA	2	8	158081	158088	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007899	GTTT	2	8	158591	158598	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007899	AAGA	2	8	170976	170983	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007899	AAAG	2	8	178019	178026	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007899	TATT	2	8	178195	178202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007899	CTTA	2	8	178267	178274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007899	TTAA	2	8	196863	196870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007899	GAAT	2	8	209534	209541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007899	TATT	2	8	217719	217726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007899	TCTT	2	8	217789	217796	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007899	TAAT	2	8	220731	220738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007899	TAAA	2	8	225179	225186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007899	AACA	2	8	225187	225194	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007899	ATTA	2	8	227392	227399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007899	AGCA	2	8	227412	227419	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007899	TTTC	2	8	231390	231397	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007899	ATCC	2	8	233887	233894	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007899	GTTT	2	8	238308	238315	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007899	TATT	2	8	238442	238449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007899	TCTT	2	8	240203	240210	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007899	ATTT	2	8	246278	246285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007899	GTTG	2	8	246327	246334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007899	GTTG	2	8	248675	248682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007899	TTCA	2	8	250999	251006	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007899	CTAA	2	8	251182	251189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007899	TTGT	2	8	254106	254113	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007899	GCAG	2	8	264511	264518	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007899	TGTT	2	8	269147	269154	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007899	AGTT	2	8	270790	270797	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007899	AAGA	2	8	273199	273206	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007899	ATTA	2	8	288795	288802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007899	TCTG	2	8	288928	288935	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007899	GTTT	2	8	291504	291511	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007899	ATTA	2	8	291535	291542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007899	AATT	2	8	291563	291570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007899	GTTT	2	8	296937	296944	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007899	TGAT	2	8	297060	297067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007899	ATAA	2	8	302052	302059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007899	CCTA	2	8	305141	305148	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007899	GCTA	2	8	309588	309595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007899	GATG	2	8	328625	328632	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007899	TCTT	2	8	329056	329063	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007899	TTTA	2	8	329098	329105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007899	AAAG	2	8	335601	335608	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007899	ACTT	2	8	341966	341973	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007899	TTAT	2	8	342002	342009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007899	AGTT	2	8	346853	346860	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007899	TTAA	2	8	350473	350480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007899	TGTT	2	8	355250	355257	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007899	TTTG	2	8	355319	355326	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007899	AACA	2	8	356016	356023	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007899	ACTT	2	8	356169	356176	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_007899	GTAT	2	8	356210	356217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007899	ATTA	2	8	356563	356570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007899	TTTC	2	8	359163	359170	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007899	TAAT	2	8	359376	359383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007899	AAGC	2	8	359720	359727	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007899	TTTA	2	8	374566	374573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007899	CTAA	2	8	375314	375321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007899	AGAA	2	8	393993	394000	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007899	ACCC	2	8	397432	397439	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_007899	TGAA	2	8	397467	397474	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007899	TTTA	2	8	397486	397493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007899	ATTA	2	8	397596	397603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007899	TTTG	2	8	404770	404777	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007899	TATT	2	8	404874	404881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007899	AGAT	2	8	407072	407079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007899	ACGC	2	8	407472	407479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007899	TCAA	2	8	412791	412798	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_007899	ATTG	2	8	414235	414242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007899	TTGC	2	8	414295	414302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007899	TTTA	2	8	419599	419606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007899	ATAA	2	8	426622	426629	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007899	AAAG	2	8	427495	427502	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007899	GCTT	2	8	427559	427566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007899	ATTT	2	8	427761	427768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007899	CTTT	2	8	428688	428695	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007899	TATC	2	8	430430	430437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007899	AGAA	2	8	432723	432730	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007899	AAAG	2	8	432739	432746	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007899	ATAA	2	8	433584	433591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007899	AGAT	2	8	435367	435374	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007899	GAGG	2	8	435386	435393	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007899	TAAC	2	8	435473	435480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007899	TTAT	2	8	437557	437564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007899	GGGA	2	8	439781	439788	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007899	GAAA	2	8	444124	444131	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007899	GACA	2	8	449551	449558	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007899	TGAT	2	8	449574	449581	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007899	AGCA	2	8	450059	450066	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007899	TGTT	2	8	450470	450477	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007899	TAAA	2	8	451020	451027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007899	GTGA	2	8	451039	451046	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007899	TAAA	2	8	455101	455108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007899	TAAC	2	8	462340	462347	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007899	TGAG	2	8	462509	462516	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007899	CTTA	2	8	466347	466354	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007899	TGTT	2	8	475932	475939	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007899	TTTG	2	8	477125	477132	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007899	TACA	2	8	480617	480624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_007899	AAAG	2	8	482010	482017	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007899	ATTT	2	8	482025	482032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007899	TCGA	2	8	487029	487036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007899	TTTC	2	8	489888	489895	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007899	TAAA	2	8	492744	492751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007899	AATA	2	8	495568	495575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007899	AGGG	2	8	495590	495597	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007899	TAAG	2	8	496304	496311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007899	GTTA	2	8	496382	496389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007899	GATT	2	8	497002	497009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007899	AGCA	2	8	497209	497216	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007899	TTTG	2	8	498867	498874	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007899	TAGT	2	8	499552	499559	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007899	TAAA	2	8	499659	499666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007899	TGGG	2	8	499776	499783	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007899	AGAA	2	8	500869	500876	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007899	GGTT	2	8	500951	500958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007899	GGTT	2	8	500963	500970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007899	GGTT	2	8	500975	500982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007899	GGTT	2	8	500987	500994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.