MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila felis Fe/C-56

Total Repeats: 236

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007899	TG	3	6	2235	2240	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007899	GA	3	6	17450	17455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007899	AC	3	6	17683	17688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007899	GA	3	6	33390	33395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007899	CT	3	6	35236	35241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007899	AG	4	8	46876	46883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007899	TA	3	6	54958	54963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007899	AG	4	8	56505	56512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007899	AG	3	6	63714	63719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007899	CT	4	8	71824	71831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007899	TC	3	6	84118	84123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007899	GT	3	6	88700	88705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007899	AT	3	6	94233	94238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007899	GA	4	8	97367	97374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007899	AG	3	6	98791	98796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007899	AG	3	6	136864	136869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007899	CT	3	6	140922	140927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007899	AG	4	8	141015	141022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007899	TA	3	6	147194	147199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007899	GT	3	6	147876	147881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007899	GA	3	6	148004	148009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007899	GT	3	6	148111	148116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007899	AC	3	6	148932	148937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007899	AC	3	6	149101	149106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007899	GA	3	6	149164	149169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007899	AT	3	6	149434	149439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007899	TC	3	6	150345	150350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007899	TA	4	8	150704	150711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007899	GC	3	6	151174	151179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007899	GT	3	6	152218	152223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007899	GT	3	6	152360	152365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007899	CT	3	6	152489	152494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007899	AC	3	6	152561	152566	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007899	TC	3	6	156257	156262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007899	GA	3	6	170944	170949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007899	CT	3	6	178231	178236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007899	GA	3	6	199825	199830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007899	AG	3	6	206163	206168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007899	CT	3	6	206178	206183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007899	TG	3	6	220689	220694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007899	AT	3	6	220740	220745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007899	AT	3	6	227754	227759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007899	GA	3	6	231417	231422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007899	TC	3	6	233795	233800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007899	GA	3	6	239024	239029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007899	AG	3	6	249700	249705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007899	AT	3	6	251316	251321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007899	AC	3	6	256816	256821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007899	TA	3	6	256959	256964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007899	AG	3	6	257022	257027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007899	AT	3	6	258311	258316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007899	TA	3	6	264064	264069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007899	AG	3	6	264249	264254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007899	AT	3	6	272931	272936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007899	AG	3	6	284763	284768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007899	TA	3	6	296916	296921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007899	AG	3	6	296977	296982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007899	AT	3	6	297038	297043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007899	AG	3	6	316769	316774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007899	AT	3	6	318577	318582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007899	TA	3	6	325385	325390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007899	AG	3	6	325437	325442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007899	AG	3	6	325517	325522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007899	GA	3	6	329125	329130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007899	TC	3	6	332045	332050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007899	GA	3	6	332094	332099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007899	GA	4	8	332125	332132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007899	TC	4	8	332141	332148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007899	CT	3	6	342033	342038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007899	AC	3	6	346764	346769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007899	AG	4	8	346872	346879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007899	AT	3	6	354789	354794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007899	AT	3	6	356444	356449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007899	AG	3	6	357517	357522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007899	AG	3	6	357609	357614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007899	GT	3	6	361038	361043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007899	GA	3	6	393925	393930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007899	TG	3	6	394120	394125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007899	CT	3	6	395686	395691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007899	TA	3	6	399839	399844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007899	TA	3	6	404812	404817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007899	GA	3	6	406905	406910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007899	AT	3	6	407322	407327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007899	TG	3	6	414214	414219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007899	AG	3	6	428729	428734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007899	AT	3	6	433675	433680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007899	TG	3	6	435253	435258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007899	CT	3	6	435317	435322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007899	GA	3	6	435461	435466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007899	GA	3	6	444134	444139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007899	TC	3	6	446963	446968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007899	AT	3	6	448542	448547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007899	TC	3	6	449545	449550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007899	TA	3	6	450546	450551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007899	TG	3	6	451110	451115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007899	GA	3	6	480570	480575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007899	CT	3	6	489982	489987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007899	AG	3	6	494719	494724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_007899	AT	3	6	497901	497906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007899	AT	3	6	499582	499587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007899	AT	3	6	500769	500774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007899	TC	3	6	500827	500832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_007899	GA	3	6	507343	507348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007899	TA	3	6	508265	508270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007899	AT	3	6	514991	514996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007899	TA	3	6	517411	517416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007899	CA	3	6	527742	527747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007899	TC	3	6	532892	532897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007899	CT	3	6	533481	533486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007899	AT	3	6	534681	534686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007899	GT	3	6	535015	535020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007899	GA	3	6	537903	537908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007899	TA	3	6	537957	537962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007899	AG	3	6	542537	542542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007899	TG	3	6	550950	550955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007899	TA	3	6	561122	561127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007899	TG	3	6	564172	564177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007899	AT	3	6	574964	574969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007899	AC	3	6	575128	575133	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007899	TC	3	6	575235	575240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007899	GA	3	6	579961	579966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007899	CT	3	6	583113	583118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007899	GA	3	6	583180	583185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007899	TG	3	6	594404	594409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007899	AT	3	6	602872	602877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007899	AT	3	6	607032	607037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007899	TA	3	6	608308	608313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007899	AT	3	6	608375	608380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007899	TA	3	6	611640	611645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_007899	AC	3	6	626918	626923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_007899	TC	3	6	643361	643366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007899	AT	3	6	650071	650076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007899	TA	3	6	650108	650113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007899	AG	3	6	659193	659198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007899	TC	3	6	670841	670846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007899	CT	3	6	674188	674193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_007899	TA	3	6	682027	682032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007899	CT	3	6	682960	682965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_007899	GA	3	6	684426	684431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007899	AC	3	6	685607	685612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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149	NC_007899	TA	3	6	707668	707673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.