MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome

Total Repeats: 914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007880	CAAGAT	2	12	995	1006	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	89255450
2	NC_007880	TATTTC	2	12	3093	3104	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	89255452
3	NC_007880	TAAGAG	2	12	7243	7254	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	89255457
4	NC_007880	TGGTTT	2	12	7675	7686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89255457
5	NC_007880	TAAAGG	2	12	9018	9029	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	89255459
6	NC_007880	GTTGAT	2	12	10107	10118	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	89255461
7	NC_007880	ATTAAG	2	12	14768	14779	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	89255465
8	NC_007880	GTTTTA	2	12	21691	21702	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	89255470
9	NC_007880	AAGGTT	2	12	24666	24677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007880	TCTAGT	2	12	27119	27130	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	89255475
11	NC_007880	CTAAAA	2	12	30679	30690	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	89255476
12	NC_007880	TGGTGA	2	12	32665	32676	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	89255478
13	NC_007880	ACCAAT	2	12	32701	32712	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	89255478
14	NC_007880	ATAAGT	2	12	37881	37892	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007880	TAAATT	2	12	41827	41838	50 %	50 %	0 %	0 %	89255487
16	NC_007880	TACCAG	2	12	45581	45592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89255491
17	NC_007880	TTAATT	2	12	50547	50558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007880	TAAAAA	2	12	56400	56411	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	89255503
19	NC_007880	TTATGT	2	12	58162	58173	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	89255505
20	NC_007880	AAGGAT	2	12	58704	58715	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	89255505
21	NC_007880	TAAATA	2	12	61636	61647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255509
22	NC_007880	GTTATT	2	12	63199	63210	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	89255510
23	NC_007880	CTTGAG	2	12	64455	64466	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007880	ATCTTT	2	12	80660	80671	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	89255525
25	NC_007880	TATGAA	2	12	81775	81786	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	89255526
26	NC_007880	CAGTTA	2	12	85167	85178	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	89255531
27	NC_007880	TGCAAA	2	12	86459	86470	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	89255532
28	NC_007880	TCAAAA	2	12	87500	87511	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	89255533
29	NC_007880	CAGCTT	2	12	88113	88124	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	89255533
30	NC_007880	CTTTCT	2	12	90619	90630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255534
31	NC_007880	ATATAG	2	12	91771	91782	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	89255534
32	NC_007880	AATATC	2	12	95733	95744	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	89255538
33	NC_007880	GTGATT	2	12	95969	95980	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	89255538
34	NC_007880	TCCAGC	2	12	97693	97704	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	89255539
35	NC_007880	AAAAAG	2	12	98250	98261	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007880	GTTTTA	2	12	100624	100635	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	89255544
37	NC_007880	AGCTTT	2	12	102042	102053	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	89255545
38	NC_007880	TTTTGA	2	12	103067	103078	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	89255548
39	NC_007880	TTTATC	2	12	103539	103550	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	89255549
40	NC_007880	TAGTAT	2	12	105418	105429	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	89255550
41	NC_007880	TCATTA	2	12	105961	105972	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	89255551
42	NC_007880	GATAAG	2	12	107809	107820	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	89255553
43	NC_007880	ATTAAA	2	12	107974	107985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255553
44	NC_007880	CATTTG	2	12	109643	109654	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	89255553
45	NC_007880	CTATTT	2	12	110465	110476	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	89255553
46	NC_007880	CTTTCA	2	12	112637	112648	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	89255555
47	NC_007880	TCATTA	3	18	113879	113896	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	89255556
48	NC_007880	TTTATA	2	12	117540	117551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255559
49	NC_007880	TTTATA	2	12	123741	123752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255563
50	NC_007880	AGAATA	2	12	126212	126223	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007880	TGAAAT	2	12	128518	128529	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007880	GATGGT	2	12	130099	130110	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	89255564
53	NC_007880	GTTTTA	2	12	130958	130969	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	89255565
54	NC_007880	ATCAAT	2	12	134616	134627	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	89255569
55	NC_007880	TTTTAT	2	12	137076	137087	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007880	AATACC	2	12	139441	139452	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	89255570
57	NC_007880	CTGATA	2	12	139707	139718	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	89255570
58	NC_007880	TTATAA	2	12	142839	142850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007880	TTGAGA	2	12	144321	144332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255575
60	NC_007880	TTAGGC	2	12	145178	145189	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	89255575
61	NC_007880	TATTTT	2	12	148416	148427	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	89255579
62	NC_007880	TAAGTA	2	12	149360	149371	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	89255580
63	NC_007880	ATAAAT	2	12	149774	149785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007880	GATCTA	2	12	153328	153339	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	89255584
65	NC_007880	AAATAT	2	12	156204	156215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255585
66	NC_007880	ACAGGT	2	12	158381	158392	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89255588
67	NC_007880	ACTTTT	2	12	158724	158735	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	89255589
68	NC_007880	GTTTTA	2	12	159349	159360	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	89255590
69	NC_007880	ACCTTA	2	12	160175	160186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007880	GCCATT	2	12	160840	160851	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	89255591
71	NC_007880	ACTGTT	2	12	162243	162254	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	89255592
72	NC_007880	TAATTA	2	12	163866	163877	50 %	50 %	0 %	0 %	89255593
73	NC_007880	ATCAAT	2	12	165502	165513	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	89255595
74	NC_007880	AAACTT	2	12	165907	165918	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_007880	TATCAA	2	12	172610	172621	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	89255602
76	NC_007880	AATTAT	2	12	172874	172885	50 %	50 %	0 %	0 %	89255602
77	NC_007880	ATTTAA	2	12	173086	173097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007880	GCTTTG	2	12	177116	177127	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	89255607
79	NC_007880	TAAAAA	2	12	178957	178968	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	89255611
80	NC_007880	TAGCTT	2	12	179631	179642	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	89255612
81	NC_007880	CCAGCT	2	12	180463	180474	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	89255612
82	NC_007880	GACAAA	2	12	180994	181005	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	89255613
83	NC_007880	GTTTTA	2	12	184663	184674	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	89255619
84	NC_007880	CAAATT	2	12	190045	190056	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	89255623
85	NC_007880	TTTTAT	2	12	190730	190741	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	89255624
86	NC_007880	TTAAGT	2	12	191471	191482	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	89255624
87	NC_007880	ATTATA	2	12	196742	196753	50 %	50 %	0 %	0 %	89255629
88	NC_007880	CACCAA	2	12	198516	198527	50 %	0 %	0 %	50 %	89255631
89	NC_007880	ACTAGT	2	12	205904	205915	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	89255640
90	NC_007880	AAGATG	2	12	210438	210449	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	89255644
91	NC_007880	TACTGC	2	12	211054	211065	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	89255644
92	NC_007880	TTTAGC	2	12	211252	211263	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	89255644
93	NC_007880	ATTAGT	2	12	211855	211866	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	89255644
94	NC_007880	ATAAGT	2	12	212940	212951	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	89255646
95	NC_007880	TAGCTT	2	12	215861	215872	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	89255649
96	NC_007880	ATTTTT	2	12	216114	216125	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007880	TTTTGT	2	12	216631	216642	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007880	CATCAC	2	12	219120	219131	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	89255652
99	NC_007880	TTTTGA	2	12	219133	219144	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	89255652
100	NC_007880	TTATGG	2	12	222180	222191	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	89255655
101	NC_007880	ATTTTT	2	12	224471	224482	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	89255657
102	NC_007880	TGAAGC	2	12	225433	225444	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89255658
103	NC_007880	AAAGAA	2	12	226538	226549	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	89255659
104	NC_007880	AAAAGA	2	12	228021	228032	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	89255661
105	NC_007880	TGGTGT	2	12	229050	229061	0 %	50 %	50 %	0 %	89255663
106	NC_007880	GTTTTT	2	12	229750	229761	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	89255663
107	NC_007880	TGAAGT	2	12	231541	231552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255667
108	NC_007880	GCAAGA	2	12	232017	232028	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	89255668
109	NC_007880	CTGTTG	2	12	233099	233110	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	89255668
110	NC_007880	AGGTTG	2	12	233708	233719	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	89255668
111	NC_007880	AAGGGT	2	12	234754	234765	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	89255670
112	NC_007880	GTAAAG	2	12	238422	238433	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	89255677
113	NC_007880	TGGGTG	2	12	239972	239983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255682
114	NC_007880	TTGGTG	2	12	241101	241112	0 %	50 %	50 %	0 %	89255684
115	NC_007880	GTTTTA	2	12	248221	248232	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	89255697
116	NC_007880	GGTATG	2	12	253498	253509	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	89255700
117	NC_007880	TGATAA	2	12	260432	260443	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	89255706
118	NC_007880	AAATGC	2	12	261129	261140	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_007880	CATTAG	2	12	261566	261577	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	89255707
120	NC_007880	CTAAAG	2	12	262395	262406	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	89255708
121	NC_007880	ATAACA	2	12	262967	262978	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	89255709
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356	NC_007880	TAAAAT	2	12	805989	806000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89256186
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465	NC_007880	ATCAGT	2	12	1049253	1049264	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	89256430
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467	NC_007880	ATATCA	2	12	1059645	1059656	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
468	NC_007880	GCAGGT	2	12	1060843	1060854	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	89256441
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470	NC_007880	AGTTGA	2	12	1062946	1062957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89256442
471	NC_007880	CAAAAT	2	12	1067000	1067011	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	89256446
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473	NC_007880	AGATGG	2	12	1069068	1069079	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	89256448
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