MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007880	AAGGTT	2	12	24666	24677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007880	ATAAGT	2	12	37881	37892	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007880	TTAATT	2	12	50547	50558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007880	CTTGAG	2	12	64455	64466	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_007880	AAAAAG	2	12	98250	98261	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007880	AGAATA	2	12	126212	126223	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007880	TGAAAT	2	12	128518	128529	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007880	TTTTAT	2	12	137076	137087	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007880	TTATAA	2	12	142839	142850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007880	ATAAAT	2	12	149774	149785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007880	ACCTTA	2	12	160175	160186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007880	AAACTT	2	12	165907	165918	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_007880	ATTTAA	2	12	173086	173097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007880	ATTTTT	2	12	216114	216125	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007880	TTTTGT	2	12	216631	216642	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007880	AAATGC	2	12	261129	261140	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_007880	ATTTTA	2	12	277103	277114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007880	TAGTTT	2	12	328861	328872	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007880	TTAGAT	2	12	337724	337735	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007880	ATATTT	2	12	340354	340365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007880	ATTGAT	2	12	355504	355515	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007880	TTTAAA	2	12	376999	377010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007880	AGTAAC	2	12	408153	408164	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007880	AGAATA	2	12	417233	417244	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007880	TGAAAT	2	12	419539	419550	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007880	TAAAAT	2	12	424275	424286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007880	ATTTTT	2	12	424854	424865	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007880	AAGTTA	2	12	445811	445822	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007880	TAATGA	2	12	489660	489671	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007880	AGTTGG	2	12	490062	490073	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007880	TAGAAG	2	12	495060	495071	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007880	TAAATT	2	12	525506	525517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007880	ATTAAG	2	12	545927	545938	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007880	ACTTTA	2	12	559043	559054	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007880	TTTGTA	2	12	606004	606015	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007880	TGGATT	2	12	608573	608584	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007880	TTAATG	2	12	612683	612694	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007880	TAAAAA	2	12	633049	633060	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007880	ATGTTA	2	12	641821	641832	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007880	ATTTTG	2	12	748527	748538	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007880	TTAAAA	2	12	749879	749890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007880	ACAGGT	2	12	762410	762421	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007880	TTGCAG	2	12	764187	764198	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007880	TCCCAC	2	12	766571	766582	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_007880	ATGAAA	2	12	767328	767339	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007880	TAGTTT	2	12	771393	771404	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007880	AACAAA	2	12	779359	779370	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007880	GATTAT	2	12	779382	779393	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007880	GTGAAT	2	12	799902	799913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007880	TAATTT	2	12	805254	805265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007880	TATAAT	2	12	822570	822581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007880	TTAGTT	2	12	823984	823995	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007880	TAAATA	2	12	836873	836884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007880	TATAGT	2	12	866686	866697	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007880	AAAATA	2	12	868009	868020	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007880	TAACAG	2	12	885719	885730	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007880	ATATTT	2	12	889533	889544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007880	TTATAT	2	12	906255	906266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007880	TTTACT	2	12	913890	913901	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_007880	TTAGTT	2	12	928979	928990	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007880	TTTAAA	2	12	937041	937052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007880	ATTAGA	2	12	939727	939738	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007880	TATAAT	4	24	958399	958422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007880	GTTTTA	2	12	961133	961144	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007880	AAGAAA	2	12	990300	990311	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007880	TTGATT	2	12	991365	991376	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007880	AAAATT	2	12	995863	995874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007880	AGTATT	2	12	1010918	1010929	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007880	CCAAAT	2	12	1012046	1012057	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007880	TCCATC	2	12	1034213	1034224	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007880	TTTGGC	2	12	1037261	1037272	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007880	TTGATA	2	12	1042452	1042463	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007880	AGATAT	2	12	1042629	1042640	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007880	ATTAAT	2	12	1043240	1043251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007880	ACATTA	2	12	1043418	1043429	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007880	GTACTT	2	12	1043683	1043694	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_007880	TTTAGA	2	12	1048518	1048529	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007880	TCAAAT	2	12	1048701	1048712	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_007880	ATATCA	2	12	1059645	1059656	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_007880	TAAGAA	2	12	1068190	1068201	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007880	AGCTTT	2	12	1096681	1096692	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007880	AGAATA	2	12	1120851	1120862	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007880	TGAAAT	2	12	1123157	1123168	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007880	ACAATT	2	12	1125285	1125296	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_007880	AGATTA	2	12	1162437	1162448	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007880	CTAAAT	2	12	1164885	1164896	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_007880	ATAAAG	2	12	1166302	1166313	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007880	TAATTA	2	12	1184018	1184029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007880	AATTTA	2	12	1210333	1210344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007880	CTTATT	2	12	1210703	1210714	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_007880	TATAGG	2	12	1210915	1210926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007880	ATATTA	2	12	1221238	1221249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007880	CGGTGC	2	12	1231827	1231838	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007880	AGAATC	2	12	1259228	1259239	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_007880	TATAGA	2	12	1259741	1259752	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007880	TAATTT	2	12	1260004	1260015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007880	TACGAT	2	12	1260391	1260402	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_007880	TTTATT	2	12	1260653	1260664	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007880	TATTTT	4	24	1261435	1261458	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007880	AAAATC	2	12	1263831	1263842	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007880	TAAATC	2	12	1271838	1271849	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_007880	TAAAAA	2	12	1272565	1272576	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007880	GTATAT	2	12	1301902	1301913	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007880	ATATTG	2	12	1306841	1306852	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007880	GATTTA	2	12	1313921	1313932	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007880	TAAAAA	2	12	1335937	1335948	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007880	TATTTT	2	12	1338760	1338771	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007880	ATCAAA	2	12	1390719	1390730	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_007880	ATCAAA	2	12	1394633	1394644	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_007880	TTTTGT	2	12	1414321	1414332	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007880	TATAAA	2	12	1417626	1417637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007880	TTATTT	2	12	1420548	1420559	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007880	ATATTT	2	12	1423043	1423054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007880	CTAAAG	2	12	1439317	1439328	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_007880	TTTATG	2	12	1447574	1447585	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007880	ATCTTT	2	12	1447591	1447602	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_007880	TAAAGC	2	12	1451725	1451736	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_007880	TTATTT	2	12	1460862	1460873	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007880	ATTTTT	2	12	1490284	1490295	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007880	ATGCAA	2	12	1490379	1490390	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_007880	GTGCTT	2	12	1492331	1492342	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_007880	GATTTT	2	12	1508921	1508932	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007880	AAATTA	2	12	1529382	1529393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007880	AATTAA	2	12	1550031	1550042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007880	TAAACT	2	12	1568262	1568273	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_007880	GCACTA	2	12	1581222	1581233	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007880	ATTGAT	2	12	1611081	1611092	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007880	TTATAA	2	12	1616031	1616042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007880	CAAAAT	2	12	1624088	1624099	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_007880	TATATT	2	12	1624751	1624762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007880	AACCTA	2	12	1628247	1628258	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007880	GCTATA	2	12	1628444	1628455	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_007880	AAAATA	2	12	1649451	1649462	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.