MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome

Total Repeats: 5275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007880	ATTA	2	8	129	136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007880	ACTT	2	8	153	160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007880	TTAT	2	8	173	180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007880	GCAA	2	8	892	899	50 %	0 %	25 %	25 %	89255450
5	NC_007880	TGAT	2	8	1044	1051	25 %	50 %	25 %	0 %	89255450
6	NC_007880	GTAC	2	8	1331	1338	25 %	25 %	25 %	25 %	89255450
7	NC_007880	GCTT	2	8	1427	1434	0 %	50 %	25 %	25 %	89255450
8	NC_007880	ATGC	2	8	1658	1665	25 %	25 %	25 %	25 %	89255450
9	NC_007880	TAAA	2	8	1748	1755	75 %	25 %	0 %	0 %	89255450
10	NC_007880	AGTT	2	8	1960	1967	25 %	50 %	25 %	0 %	89255451
11	NC_007880	TGAT	2	8	2043	2050	25 %	50 %	25 %	0 %	89255451
12	NC_007880	AGCA	2	8	2157	2164	50 %	0 %	25 %	25 %	89255451
13	NC_007880	TCTA	2	8	2801	2808	25 %	50 %	0 %	25 %	89255451
14	NC_007880	GTTT	2	8	2859	2866	0 %	75 %	25 %	0 %	89255451
15	NC_007880	GAAT	2	8	2935	2942	50 %	25 %	25 %	0 %	89255452
16	NC_007880	TCAA	2	8	4008	4015	50 %	25 %	0 %	25 %	89255453
17	NC_007880	CAAC	2	8	4047	4054	50 %	0 %	0 %	50 %	89255453
18	NC_007880	ATTA	2	8	4175	4182	50 %	50 %	0 %	0 %	89255453
19	NC_007880	TGTT	2	8	4598	4605	0 %	75 %	25 %	0 %	89255454
20	NC_007880	GGTA	2	8	4608	4615	25 %	25 %	50 %	0 %	89255454
21	NC_007880	ATTT	2	8	5248	5255	25 %	75 %	0 %	0 %	89255455
22	NC_007880	TTGA	2	8	5398	5405	25 %	50 %	25 %	0 %	89255455
23	NC_007880	TTTC	2	8	5535	5542	0 %	75 %	0 %	25 %	89255455
24	NC_007880	TTTA	2	8	5698	5705	25 %	75 %	0 %	0 %	89255455
25	NC_007880	ATTA	2	8	5764	5771	50 %	50 %	0 %	0 %	89255455
26	NC_007880	TAGC	2	8	6443	6450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007880	ATTA	2	8	6693	6700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007880	ATGA	2	8	6844	6851	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007880	GTTT	2	8	7263	7270	0 %	75 %	25 %	0 %	89255457
30	NC_007880	AAAT	2	8	7470	7477	75 %	25 %	0 %	0 %	89255457
31	NC_007880	TATG	2	8	7558	7565	25 %	50 %	25 %	0 %	89255457
32	NC_007880	TGTA	2	8	7567	7574	25 %	50 %	25 %	0 %	89255457
33	NC_007880	ATTA	2	8	8846	8853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007880	AGCA	2	8	9325	9332	50 %	0 %	25 %	25 %	89255460
35	NC_007880	TCTT	2	8	9371	9378	0 %	75 %	0 %	25 %	89255460
36	NC_007880	AGCA	2	8	9753	9760	50 %	0 %	25 %	25 %	89255460
37	NC_007880	CAAG	2	8	10281	10288	50 %	0 %	25 %	25 %	89255461
38	NC_007880	TTAT	2	8	10567	10574	25 %	75 %	0 %	0 %	89255461
39	NC_007880	AAAT	2	8	10769	10776	75 %	25 %	0 %	0 %	89255461
40	NC_007880	AAAT	2	8	10998	11005	75 %	25 %	0 %	0 %	89255462
41	NC_007880	AGTT	2	8	11302	11309	25 %	50 %	25 %	0 %	89255462
42	NC_007880	ATTT	2	8	11401	11408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007880	GCAG	2	8	12610	12617	25 %	0 %	50 %	25 %	89255464
44	NC_007880	CATA	2	8	12789	12796	50 %	25 %	0 %	25 %	89255464
45	NC_007880	TTGG	2	8	12807	12814	0 %	50 %	50 %	0 %	89255464
46	NC_007880	ATTT	2	8	12986	12993	25 %	75 %	0 %	0 %	89255464
47	NC_007880	TATT	2	8	13239	13246	25 %	75 %	0 %	0 %	89255465
48	NC_007880	GGTT	2	8	13324	13331	0 %	50 %	50 %	0 %	89255465
49	NC_007880	CTAT	2	8	13341	13348	25 %	50 %	0 %	25 %	89255465
50	NC_007880	TAGA	2	8	14286	14293	50 %	25 %	25 %	0 %	89255465
51	NC_007880	AATG	2	8	14521	14528	50 %	25 %	25 %	0 %	89255465
52	NC_007880	TCAA	2	8	16906	16913	50 %	25 %	0 %	25 %	89255466
53	NC_007880	CAAC	2	8	16945	16952	50 %	0 %	0 %	50 %	89255466
54	NC_007880	ATTA	2	8	17073	17080	50 %	50 %	0 %	0 %	89255466
55	NC_007880	AACT	2	8	18007	18014	50 %	25 %	0 %	25 %	89255468
56	NC_007880	ATCT	2	8	18680	18687	25 %	50 %	0 %	25 %	89255468
57	NC_007880	TAAT	2	8	18961	18968	50 %	50 %	0 %	0 %	89255468
58	NC_007880	CAAA	2	8	19492	19499	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007880	CAAA	2	8	19567	19574	75 %	0 %	0 %	25 %	89255469
60	NC_007880	ATAG	2	8	19811	19818	50 %	25 %	25 %	0 %	89255469
61	NC_007880	GCTG	2	8	20330	20337	0 %	25 %	50 %	25 %	89255469
62	NC_007880	TAAA	2	8	20747	20754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007880	TAAC	2	8	20769	20776	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007880	ACCA	2	8	20907	20914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007880	TTAA	2	8	21230	21237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007880	TAAT	2	8	21412	21419	50 %	50 %	0 %	0 %	89255470
67	NC_007880	GTTG	2	8	21540	21547	0 %	50 %	50 %	0 %	89255470
68	NC_007880	ATTG	2	8	21578	21585	25 %	50 %	25 %	0 %	89255470
69	NC_007880	AGTT	2	8	22467	22474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007880	TTTA	2	8	22526	22533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007880	AAGA	2	8	22934	22941	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007880	TTTG	2	8	23759	23766	0 %	75 %	25 %	0 %	89255471
73	NC_007880	TAAA	2	8	24439	24446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007880	TAAT	2	8	24501	24508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007880	TTAA	2	8	24563	24570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007880	TTTA	2	8	24902	24909	25 %	75 %	0 %	0 %	89255472
77	NC_007880	TTTA	2	8	25065	25072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007880	ATTA	2	8	25173	25180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007880	TCAG	2	8	25300	25307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007880	TAAA	2	8	26225	26232	75 %	25 %	0 %	0 %	89255474
81	NC_007880	TCTA	2	8	26537	26544	25 %	50 %	0 %	25 %	89255475
82	NC_007880	AGTG	2	8	26778	26785	25 %	25 %	50 %	0 %	89255475
83	NC_007880	TATT	2	8	27313	27320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007880	TTAC	2	8	27822	27829	25 %	50 %	0 %	25 %	89255476
85	NC_007880	CATT	2	8	28189	28196	25 %	50 %	0 %	25 %	89255476
86	NC_007880	TAGA	2	8	28264	28271	50 %	25 %	25 %	0 %	89255476
87	NC_007880	ATCA	2	8	28415	28422	50 %	25 %	0 %	25 %	89255476
88	NC_007880	CTTT	2	8	29002	29009	0 %	75 %	0 %	25 %	89255476
89	NC_007880	TCTT	2	8	29279	29286	0 %	75 %	0 %	25 %	89255476
90	NC_007880	ATCT	2	8	29327	29334	25 %	50 %	0 %	25 %	89255476
91	NC_007880	TGGT	2	8	30981	30988	0 %	50 %	50 %	0 %	89255477
92	NC_007880	CAGA	2	8	31059	31066	50 %	0 %	25 %	25 %	89255477
93	NC_007880	ATTT	2	8	31415	31422	25 %	75 %	0 %	0 %	89255477
94	NC_007880	TACG	2	8	31514	31521	25 %	25 %	25 %	25 %	89255477
95	NC_007880	ATTA	2	8	32276	32283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007880	AGAT	2	8	32689	32696	50 %	25 %	25 %	0 %	89255478
97	NC_007880	ATCT	2	8	34120	34127	25 %	50 %	0 %	25 %	89255479
98	NC_007880	TTGT	2	8	34167	34174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007880	ACTA	2	8	34190	34197	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_007880	TGAT	2	8	34466	34473	25 %	50 %	25 %	0 %	89255480
101	NC_007880	ACTT	2	8	35263	35270	25 %	50 %	0 %	25 %	89255480
102	NC_007880	TAAT	2	8	35664	35671	50 %	50 %	0 %	0 %	89255481
103	NC_007880	AGTA	2	8	36047	36054	50 %	25 %	25 %	0 %	89255481
104	NC_007880	ATTG	2	8	36460	36467	25 %	50 %	25 %	0 %	89255481
105	NC_007880	CTTA	2	8	36475	36482	25 %	50 %	0 %	25 %	89255481
106	NC_007880	ATTT	2	8	36808	36815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007880	TATT	2	8	37206	37213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007880	GAAT	2	8	37973	37980	50 %	25 %	25 %	0 %	89255483
109	NC_007880	TGAT	2	8	38195	38202	25 %	50 %	25 %	0 %	89255483
110	NC_007880	GATA	2	8	38415	38422	50 %	25 %	25 %	0 %	89255483
111	NC_007880	TAAA	2	8	38671	38678	75 %	25 %	0 %	0 %	89255484
112	NC_007880	AAAC	2	8	38745	38752	75 %	0 %	0 %	25 %	89255484
113	NC_007880	TTTA	2	8	38954	38961	25 %	75 %	0 %	0 %	89255484
114	NC_007880	CCTT	2	8	39291	39298	0 %	50 %	0 %	50 %	89255484
115	NC_007880	TTTC	2	8	39727	39734	0 %	75 %	0 %	25 %	89255485
116	NC_007880	CTTT	2	8	39880	39887	0 %	75 %	0 %	25 %	89255485
117	NC_007880	TTAT	2	8	40604	40611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007880	GTAA	2	8	40891	40898	50 %	25 %	25 %	0 %	89255486
119	NC_007880	ATTG	2	8	40915	40922	25 %	50 %	25 %	0 %	89255486
120	NC_007880	TTAG	2	8	41919	41926	25 %	50 %	25 %	0 %	89255487
121	NC_007880	TCTT	2	8	42898	42905	0 %	75 %	0 %	25 %	89255489
122	NC_007880	AATA	2	8	43408	43415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007880	GTAT	2	8	43439	43446	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007880	CTTG	2	8	44210	44217	0 %	50 %	25 %	25 %	89255490
125	NC_007880	CTTC	2	8	45406	45413	0 %	50 %	0 %	50 %	89255491
126	NC_007880	AAAT	2	8	46023	46030	75 %	25 %	0 %	0 %	89255491
127	NC_007880	AAAT	2	8	46125	46132	75 %	25 %	0 %	0 %	89255491
128	NC_007880	ATTT	2	8	46598	46605	25 %	75 %	0 %	0 %	89255491
129	NC_007880	CAAG	2	8	46900	46907	50 %	0 %	25 %	25 %	89255491
130	NC_007880	CCAG	2	8	46959	46966	25 %	0 %	25 %	50 %	89255491
131	NC_007880	TTCT	2	8	47468	47475	0 %	75 %	0 %	25 %	89255491
132	NC_007880	ACCT	2	8	47687	47694	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_007880	AGTT	2	8	47778	47785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007880	GTAG	2	8	48530	48537	25 %	25 %	50 %	0 %	89255492
135	NC_007880	ATTT	2	8	48973	48980	25 %	75 %	0 %	0 %	89255493
136	NC_007880	AGTT	2	8	49297	49304	25 %	50 %	25 %	0 %	89255493
137	NC_007880	CTTT	2	8	49707	49714	0 %	75 %	0 %	25 %	89255494
138	NC_007880	CCAT	2	8	49764	49771	25 %	25 %	0 %	50 %	89255494
139	NC_007880	GTTT	2	8	49802	49809	0 %	75 %	25 %	0 %	89255494
140	NC_007880	CCTA	2	8	49933	49940	25 %	25 %	0 %	50 %	89255495
141	NC_007880	CTAG	2	8	50120	50127	25 %	25 %	25 %	25 %	89255495
142	NC_007880	ATTT	2	8	50758	50765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007880	ATCT	2	8	50784	50791	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_007880	TTTA	2	8	51166	51173	25 %	75 %	0 %	0 %	89255496
145	NC_007880	TAAT	2	8	51450	51457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_007880	AAAT	2	8	51608	51615	75 %	25 %	0 %	0 %	89255497
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