MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome

Total Repeats: 4348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007880	AT	3	6	70	75	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007880	TA	3	6	2977	2982	50 %	50 %	0 %	0 %	89255452
3	NC_007880	AT	3	6	3296	3301	50 %	50 %	0 %	0 %	89255452
4	NC_007880	TA	3	6	3795	3800	50 %	50 %	0 %	0 %	89255453
5	NC_007880	TA	3	6	3837	3842	50 %	50 %	0 %	0 %	89255453
6	NC_007880	GT	3	6	4526	4531	0 %	50 %	50 %	0 %	89255454
7	NC_007880	AT	3	6	4647	4652	50 %	50 %	0 %	0 %	89255454
8	NC_007880	TA	3	6	4864	4869	50 %	50 %	0 %	0 %	89255454
9	NC_007880	TA	4	8	5032	5039	50 %	50 %	0 %	0 %	89255455
10	NC_007880	CT	3	6	5053	5058	0 %	50 %	0 %	50 %	89255455
11	NC_007880	TA	3	6	5511	5516	50 %	50 %	0 %	0 %	89255455
12	NC_007880	TA	3	6	6118	6123	50 %	50 %	0 %	0 %	89255455
13	NC_007880	AT	3	6	6581	6586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007880	TA	3	6	6636	6641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007880	TC	3	6	7021	7026	0 %	50 %	0 %	50 %	89255456
16	NC_007880	AT	3	6	7044	7049	50 %	50 %	0 %	0 %	89255456
17	NC_007880	GA	3	6	7406	7411	50 %	0 %	50 %	0 %	89255457
18	NC_007880	GA	3	6	7737	7742	50 %	0 %	50 %	0 %	89255457
19	NC_007880	CT	3	6	8073	8078	0 %	50 %	0 %	50 %	89255457
20	NC_007880	TA	3	6	8678	8683	50 %	50 %	0 %	0 %	89255458
21	NC_007880	TA	3	6	8941	8946	50 %	50 %	0 %	0 %	89255459
22	NC_007880	CA	3	6	9432	9437	50 %	0 %	0 %	50 %	89255460
23	NC_007880	AT	3	6	9972	9977	50 %	50 %	0 %	0 %	89255461
24	NC_007880	TC	3	6	10955	10960	0 %	50 %	0 %	50 %	89255462
25	NC_007880	AT	3	6	11254	11259	50 %	50 %	0 %	0 %	89255462
26	NC_007880	AC	3	6	12548	12553	50 %	0 %	0 %	50 %	89255464
27	NC_007880	TG	3	6	14477	14482	0 %	50 %	50 %	0 %	89255465
28	NC_007880	AG	3	6	15891	15896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007880	TA	3	6	16735	16740	50 %	50 %	0 %	0 %	89255466
30	NC_007880	TA	3	6	17227	17232	50 %	50 %	0 %	0 %	89255467
31	NC_007880	AT	3	6	18318	18323	50 %	50 %	0 %	0 %	89255468
32	NC_007880	TC	3	6	18629	18634	0 %	50 %	0 %	50 %	89255468
33	NC_007880	AG	3	6	20606	20611	50 %	0 %	50 %	0 %	89255469
34	NC_007880	AT	3	6	20670	20675	50 %	50 %	0 %	0 %	89255469
35	NC_007880	CT	3	6	20835	20840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007880	TA	3	6	21752	21757	50 %	50 %	0 %	0 %	89255470
37	NC_007880	TA	3	6	21794	21799	50 %	50 %	0 %	0 %	89255470
38	NC_007880	TA	3	6	22260	22265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007880	AT	3	6	22284	22289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007880	GA	3	6	23660	23665	50 %	0 %	50 %	0 %	89255471
41	NC_007880	TA	3	6	24456	24461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007880	AT	3	6	24749	24754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007880	GA	3	6	24966	24971	50 %	0 %	50 %	0 %	89255472
44	NC_007880	TA	3	6	25078	25083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007880	TA	3	6	25126	25131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007880	AT	3	6	25233	25238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007880	AG	3	6	25429	25434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007880	TA	3	6	25679	25684	50 %	50 %	0 %	0 %	89255473
49	NC_007880	TA	3	6	26324	26329	50 %	50 %	0 %	0 %	89255474
50	NC_007880	TC	3	6	26595	26600	0 %	50 %	0 %	50 %	89255475
51	NC_007880	AG	3	6	26838	26843	50 %	0 %	50 %	0 %	89255475
52	NC_007880	TA	3	6	26863	26868	50 %	50 %	0 %	0 %	89255475
53	NC_007880	AT	3	6	27427	27432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007880	CT	3	6	28214	28219	0 %	50 %	0 %	50 %	89255476
55	NC_007880	GA	3	6	28919	28924	50 %	0 %	50 %	0 %	89255476
56	NC_007880	AT	3	6	29169	29174	50 %	50 %	0 %	0 %	89255476
57	NC_007880	TA	3	6	29657	29662	50 %	50 %	0 %	0 %	89255476
58	NC_007880	TC	3	6	29896	29901	0 %	50 %	0 %	50 %	89255476
59	NC_007880	CT	3	6	30802	30807	0 %	50 %	0 %	50 %	89255477
60	NC_007880	TG	3	6	31697	31702	0 %	50 %	50 %	0 %	89255477
61	NC_007880	AT	4	8	32149	32156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007880	AT	3	6	32266	32271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007880	AT	3	6	32524	32529	50 %	50 %	0 %	0 %	89255478
64	NC_007880	CA	3	6	32591	32596	50 %	0 %	0 %	50 %	89255478
65	NC_007880	AT	3	6	33842	33847	50 %	50 %	0 %	0 %	89255479
66	NC_007880	CA	3	6	34009	34014	50 %	0 %	0 %	50 %	89255479
67	NC_007880	AG	3	6	34489	34494	50 %	0 %	50 %	0 %	89255480
68	NC_007880	AT	3	6	34563	34568	50 %	50 %	0 %	0 %	89255480
69	NC_007880	AC	3	6	34828	34833	50 %	0 %	0 %	50 %	89255480
70	NC_007880	GT	3	6	35190	35195	0 %	50 %	50 %	0 %	89255480
71	NC_007880	CT	3	6	36484	36489	0 %	50 %	0 %	50 %	89255481
72	NC_007880	CT	3	6	36510	36515	0 %	50 %	0 %	50 %	89255481
73	NC_007880	AT	3	6	36609	36614	50 %	50 %	0 %	0 %	89255481
74	NC_007880	TC	3	6	36821	36826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007880	AT	3	6	37093	37098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007880	AT	3	6	37651	37656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007880	GA	3	6	38341	38346	50 %	0 %	50 %	0 %	89255483
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81	NC_007880	AT	3	6	39985	39990	50 %	50 %	0 %	0 %	89255485
82	NC_007880	TC	3	6	40215	40220	0 %	50 %	0 %	50 %	89255485
83	NC_007880	TA	3	6	40359	40364	50 %	50 %	0 %	0 %	89255485
84	NC_007880	AT	4	8	40420	40427	50 %	50 %	0 %	0 %	89255485
85	NC_007880	TA	4	8	41128	41135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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87	NC_007880	AT	3	6	41672	41677	50 %	50 %	0 %	0 %	89255487
88	NC_007880	TA	3	6	42814	42819	50 %	50 %	0 %	0 %	89255489
89	NC_007880	TA	3	6	42906	42911	50 %	50 %	0 %	0 %	89255489
90	NC_007880	AT	3	6	43293	43298	50 %	50 %	0 %	0 %	89255489
91	NC_007880	TA	3	6	43628	43633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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93	NC_007880	TC	3	6	44826	44831	0 %	50 %	0 %	50 %	89255491
94	NC_007880	TG	4	8	45278	45285	0 %	50 %	50 %	0 %	89255491
95	NC_007880	TA	3	6	45993	45998	50 %	50 %	0 %	0 %	89255491
96	NC_007880	TG	3	6	46058	46063	0 %	50 %	50 %	0 %	89255491
97	NC_007880	TC	3	6	46248	46253	0 %	50 %	0 %	50 %	89255491
98	NC_007880	AT	3	6	46850	46855	50 %	50 %	0 %	0 %	89255491
99	NC_007880	TA	3	6	46974	46979	50 %	50 %	0 %	0 %	89255491
100	NC_007880	TA	3	6	47222	47227	50 %	50 %	0 %	0 %	89255491
101	NC_007880	AT	3	6	47714	47719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007880	AT	3	6	47865	47870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007880	AT	3	6	47920	47925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007880	TG	3	6	48344	48349	0 %	50 %	50 %	0 %	89255492
105	NC_007880	AT	3	6	49229	49234	50 %	50 %	0 %	0 %	89255493
106	NC_007880	AC	3	6	49410	49415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007880	AT	3	6	50359	50364	50 %	50 %	0 %	0 %	89255495
108	NC_007880	AT	4	8	50445	50452	50 %	50 %	0 %	0 %	89255495
109	NC_007880	AC	4	8	51143	51150	50 %	0 %	0 %	50 %	89255496
110	NC_007880	TA	4	8	51319	51326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007880	AT	3	6	51988	51993	50 %	50 %	0 %	0 %	89255497
112	NC_007880	AT	3	6	51997	52002	50 %	50 %	0 %	0 %	89255497
113	NC_007880	AT	3	6	52381	52386	50 %	50 %	0 %	0 %	89255498
114	NC_007880	AT	3	6	53856	53861	50 %	50 %	0 %	0 %	89255500
115	NC_007880	AT	3	6	54176	54181	50 %	50 %	0 %	0 %	89255500
116	NC_007880	AT	3	6	54231	54236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007880	TA	3	6	54909	54914	50 %	50 %	0 %	0 %	89255501
118	NC_007880	CT	3	6	55504	55509	0 %	50 %	0 %	50 %	89255502
119	NC_007880	TA	3	6	55579	55584	50 %	50 %	0 %	0 %	89255502
120	NC_007880	TA	3	6	56499	56504	50 %	50 %	0 %	0 %	89255503
121	NC_007880	TA	3	6	57161	57166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007880	TA	3	6	57284	57289	50 %	50 %	0 %	0 %	89255504
123	NC_007880	AT	4	8	58687	58694	50 %	50 %	0 %	0 %	89255505
124	NC_007880	TA	3	6	59171	59176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007880	AT	3	6	59390	59395	50 %	50 %	0 %	0 %	89255506
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128	NC_007880	TA	3	6	60515	60520	50 %	50 %	0 %	0 %	89255508
129	NC_007880	TA	3	6	60587	60592	50 %	50 %	0 %	0 %	89255508
130	NC_007880	AG	3	6	60607	60612	50 %	0 %	50 %	0 %	89255508
131	NC_007880	AG	3	6	60740	60745	50 %	0 %	50 %	0 %	89255508
132	NC_007880	TA	4	8	60882	60889	50 %	50 %	0 %	0 %	89255508
133	NC_007880	TA	3	6	61001	61006	50 %	50 %	0 %	0 %	89255508
134	NC_007880	AT	3	6	61114	61119	50 %	50 %	0 %	0 %	89255508
135	NC_007880	AT	3	6	61259	61264	50 %	50 %	0 %	0 %	89255508
136	NC_007880	AT	3	6	61288	61293	50 %	50 %	0 %	0 %	89255508
137	NC_007880	TA	3	6	61307	61312	50 %	50 %	0 %	0 %	89255508
138	NC_007880	AT	3	6	61717	61722	50 %	50 %	0 %	0 %	89255509
139	NC_007880	AC	3	6	61756	61761	50 %	0 %	0 %	50 %	89255509
140	NC_007880	TA	3	6	61923	61928	50 %	50 %	0 %	0 %	89255509
141	NC_007880	AT	3	6	62432	62437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007880	AT	3	6	62480	62485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007880	AT	3	6	62500	62505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_007880	TA	3	6	63482	63487	50 %	50 %	0 %	0 %	89255510
146	NC_007880	TA	3	6	63600	63605	50 %	50 %	0 %	0 %	89255510
147	NC_007880	TA	3	6	64064	64069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007880	AT	3	6	64200	64205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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