MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Jannaschia sp. CCS1 plasmid1

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007801	TGGT	2	8	31	38	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007801	TGGG	2	8	58	65	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007801	CCAT	2	8	382	389	25 %	25 %	0 %	50 %	89057700
4	NC_007801	TCCA	2	8	549	556	25 %	25 %	0 %	50 %	89057700
5	NC_007801	AGGT	2	8	937	944	25 %	25 %	50 %	0 %	89057700
6	NC_007801	GCGG	2	8	963	970	0 %	0 %	75 %	25 %	89057700
7	NC_007801	ACGG	2	8	1112	1119	25 %	0 %	50 %	25 %	89057700
8	NC_007801	ATCT	2	8	2348	2355	25 %	50 %	0 %	25 %	89057701
9	NC_007801	CTGA	2	8	2826	2833	25 %	25 %	25 %	25 %	89057702
10	NC_007801	CGCC	2	8	3157	3164	0 %	0 %	25 %	75 %	89057702
11	NC_007801	TCGG	2	8	3297	3304	0 %	25 %	50 %	25 %	89057702
12	NC_007801	AGGC	2	8	4443	4450	25 %	0 %	50 %	25 %	89057703
13	NC_007801	GCCC	2	8	4575	4582	0 %	0 %	25 %	75 %	89057703
14	NC_007801	GCCC	2	8	4644	4651	0 %	0 %	25 %	75 %	89057703
15	NC_007801	CGCC	2	8	4974	4981	0 %	0 %	25 %	75 %	89057703
16	NC_007801	GCGG	2	8	5173	5180	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007801	CACC	2	8	6802	6809	25 %	0 %	0 %	75 %	89057704
18	NC_007801	AGCA	2	8	6833	6840	50 %	0 %	25 %	25 %	89057704
19	NC_007801	TCAT	2	8	7039	7046	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007801	GCGG	2	8	7752	7759	0 %	0 %	75 %	25 %	89057706
21	NC_007801	AGAT	2	8	8034	8041	50 %	25 %	25 %	0 %	89057706
22	NC_007801	CAGT	2	8	8496	8503	25 %	25 %	25 %	25 %	89057706
23	NC_007801	CCCG	2	8	8722	8729	0 %	0 %	25 %	75 %	89057707
24	NC_007801	ACCA	2	8	8820	8827	50 %	0 %	0 %	50 %	89057707
25	NC_007801	TTCG	2	8	9364	9371	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007801	TGGC	2	8	9444	9451	0 %	25 %	50 %	25 %	89057709
27	NC_007801	GAGG	2	8	10322	10329	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007801	GGCG	2	8	10606	10613	0 %	0 %	75 %	25 %	89057712
29	NC_007801	GATC	2	8	11197	11204	25 %	25 %	25 %	25 %	89057712
30	NC_007801	CGGG	2	8	11266	11273	0 %	0 %	75 %	25 %	89057712
31	NC_007801	CCGG	2	8	11492	11499	0 %	0 %	50 %	50 %	89057712
32	NC_007801	ATCG	2	8	11806	11813	25 %	25 %	25 %	25 %	89057712
33	NC_007801	GGCA	2	8	12036	12043	25 %	0 %	50 %	25 %	89057712
34	NC_007801	GCGG	2	8	12124	12131	0 %	0 %	75 %	25 %	89057712
35	NC_007801	CAAG	2	8	12931	12938	50 %	0 %	25 %	25 %	89057712
36	NC_007801	ACCC	2	8	13018	13025	25 %	0 %	0 %	75 %	89057712
37	NC_007801	AGGA	2	8	13170	13177	50 %	0 %	50 %	0 %	89057712
38	NC_007801	CCCA	2	8	13522	13529	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_007801	ACCT	2	8	14170	14177	25 %	25 %	0 %	50 %	89057713
40	NC_007801	GGAC	2	8	14380	14387	25 %	0 %	50 %	25 %	89057714
41	NC_007801	TCAT	2	8	15519	15526	25 %	50 %	0 %	25 %	89057716
42	NC_007801	GCTG	2	8	15563	15570	0 %	25 %	50 %	25 %	89057716
43	NC_007801	TTAC	2	8	16145	16152	25 %	50 %	0 %	25 %	89057716
44	NC_007801	TCTG	2	8	16957	16964	0 %	50 %	25 %	25 %	89057717
45	NC_007801	TCGC	2	8	16989	16996	0 %	25 %	25 %	50 %	89057717
46	NC_007801	CCCT	2	8	17016	17023	0 %	25 %	0 %	75 %	89057717
47	NC_007801	CGTC	2	8	17696	17703	0 %	25 %	25 %	50 %	89057717
48	NC_007801	GCCG	2	8	18164	18171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007801	CATT	2	8	18702	18709	25 %	50 %	0 %	25 %	89057718
50	NC_007801	CTGC	2	8	19021	19028	0 %	25 %	25 %	50 %	89057718
51	NC_007801	ATCA	2	8	19252	19259	50 %	25 %	0 %	25 %	89057719
52	NC_007801	CCGC	2	8	19436	19443	0 %	0 %	25 %	75 %	89057719
53	NC_007801	GACC	2	8	19560	19567	25 %	0 %	25 %	50 %	89057719
54	NC_007801	ACCC	2	8	19719	19726	25 %	0 %	0 %	75 %	89057719
55	NC_007801	ATTC	2	8	20582	20589	25 %	50 %	0 %	25 %	89057720
56	NC_007801	GGCC	2	8	21587	21594	0 %	0 %	50 %	50 %	89057721
57	NC_007801	ACCA	2	8	21937	21944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007801	CAGC	2	8	23201	23208	25 %	0 %	25 %	50 %	89057722
59	NC_007801	CCGC	2	8	23861	23868	0 %	0 %	25 %	75 %	89057722
60	NC_007801	GATC	2	8	24200	24207	25 %	25 %	25 %	25 %	89057722
61	NC_007801	CGGG	2	8	24873	24880	0 %	0 %	75 %	25 %	89057723
62	NC_007801	CGAG	2	8	24935	24942	25 %	0 %	50 %	25 %	89057723
63	NC_007801	TGTC	2	8	25147	25154	0 %	50 %	25 %	25 %	89057723
64	NC_007801	ACAA	2	8	25162	25169	75 %	0 %	0 %	25 %	89057723
65	NC_007801	CCCG	2	8	25972	25979	0 %	0 %	25 %	75 %	89057724
66	NC_007801	ACCA	2	8	26765	26772	50 %	0 %	0 %	50 %	89057724
67	NC_007801	TGCG	2	8	27185	27192	0 %	25 %	50 %	25 %	89057725
68	NC_007801	AACC	2	8	27681	27688	50 %	0 %	0 %	50 %	89057725
69	NC_007801	TTGA	2	8	28057	28064	25 %	50 %	25 %	0 %	89057725
70	NC_007801	TGGC	2	8	28145	28152	0 %	25 %	50 %	25 %	89057725
71	NC_007801	CGAT	2	8	28343	28350	25 %	25 %	25 %	25 %	89057725
72	NC_007801	ACCG	2	8	28757	28764	25 %	0 %	25 %	50 %	89057726
73	NC_007801	GACG	2	8	29881	29888	25 %	0 %	50 %	25 %	89057727
74	NC_007801	ACCC	2	8	30162	30169	25 %	0 %	0 %	75 %	89057727
75	NC_007801	TGAG	2	8	30552	30559	25 %	25 %	50 %	0 %	89057728
76	NC_007801	GCCA	2	8	30953	30960	25 %	0 %	25 %	50 %	89057728
77	NC_007801	GACG	2	8	31151	31158	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_007801	ACGG	2	8	31936	31943	25 %	0 %	50 %	25 %	89057729
79	NC_007801	TGGC	2	8	32001	32008	0 %	25 %	50 %	25 %	89057729
80	NC_007801	TGGC	2	8	32316	32323	0 %	25 %	50 %	25 %	89057729
81	NC_007801	TCTG	2	8	32702	32709	0 %	50 %	25 %	25 %	89057729
82	NC_007801	GGCG	2	8	32773	32780	0 %	0 %	75 %	25 %	89057729
83	NC_007801	TGCC	2	8	33889	33896	0 %	25 %	25 %	50 %	89057730
84	NC_007801	TGGT	2	8	33910	33917	0 %	50 %	50 %	0 %	89057730
85	NC_007801	ATGT	2	8	34247	34254	25 %	50 %	25 %	0 %	89057731
86	NC_007801	CGCT	2	8	34877	34884	0 %	25 %	25 %	50 %	89057731
87	NC_007801	GCGG	2	8	34970	34977	0 %	0 %	75 %	25 %	89057731
88	NC_007801	CTTC	2	8	34984	34991	0 %	50 %	0 %	50 %	89057731
89	NC_007801	CCCG	2	8	35002	35009	0 %	0 %	25 %	75 %	89057731
90	NC_007801	CGGG	2	8	35152	35159	0 %	0 %	75 %	25 %	89057732
91	NC_007801	GGCC	2	8	35263	35270	0 %	0 %	50 %	50 %	89057732
92	NC_007801	TGGC	2	8	36113	36120	0 %	25 %	50 %	25 %	89057732
93	NC_007801	TGGA	2	8	36165	36172	25 %	25 %	50 %	0 %	89057732
94	NC_007801	CCCG	2	8	36182	36189	0 %	0 %	25 %	75 %	89057732
95	NC_007801	ACCA	2	8	37127	37134	50 %	0 %	0 %	50 %	89057734
96	NC_007801	CCAA	2	8	38422	38429	50 %	0 %	0 %	50 %	89057735
97	NC_007801	GAAA	2	8	38632	38639	75 %	0 %	25 %	0 %	89057736
98	NC_007801	TTTC	2	8	38648	38655	0 %	75 %	0 %	25 %	89057736
99	NC_007801	CAAC	2	8	39309	39316	50 %	0 %	0 %	50 %	89057736
100	NC_007801	GGTC	2	8	39630	39637	0 %	25 %	50 %	25 %	89057737
101	NC_007801	CAAT	2	8	40702	40709	50 %	25 %	0 %	25 %	89057738
102	NC_007801	AGCC	2	8	41604	41611	25 %	0 %	25 %	50 %	89057738
103	NC_007801	AATG	2	8	41861	41868	50 %	25 %	25 %	0 %	89057738
104	NC_007801	TCAG	2	8	42034	42041	25 %	25 %	25 %	25 %	89057738
105	NC_007801	CGCC	2	8	42608	42615	0 %	0 %	25 %	75 %	89057739
106	NC_007801	TCTG	2	8	44570	44577	0 %	50 %	25 %	25 %	89057740
107	NC_007801	CTGG	2	8	44714	44721	0 %	25 %	50 %	25 %	89057740
108	NC_007801	CTGC	2	8	44912	44919	0 %	25 %	25 %	50 %	89057740
109	NC_007801	GGCG	2	8	45034	45041	0 %	0 %	75 %	25 %	89057740
110	NC_007801	TGCA	2	8	45132	45139	25 %	25 %	25 %	25 %	89057740
111	NC_007801	GGCC	2	8	45525	45532	0 %	0 %	50 %	50 %	89057741
112	NC_007801	ATCA	2	8	45968	45975	50 %	25 %	0 %	25 %	89057741
113	NC_007801	CATC	2	8	46818	46825	25 %	25 %	0 %	50 %	89057742
114	NC_007801	AACC	2	8	47817	47824	50 %	0 %	0 %	50 %	89057743
115	NC_007801	ACCC	2	8	47908	47915	25 %	0 %	0 %	75 %	89057743
116	NC_007801	AGAA	2	8	48660	48667	75 %	0 %	25 %	0 %	89057743
117	NC_007801	AAAC	2	8	49264	49271	75 %	0 %	0 %	25 %	89057744
118	NC_007801	CAGC	2	8	49537	49544	25 %	0 %	25 %	50 %	89057744
119	NC_007801	CGTT	2	8	50119	50126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007801	CCAC	2	8	50211	50218	25 %	0 %	0 %	75 %	89057745
121	NC_007801	CGCT	2	8	51218	51225	0 %	25 %	25 %	50 %	89057746
122	NC_007801	GTCA	2	8	51819	51826	25 %	25 %	25 %	25 %	89057747
123	NC_007801	GCCT	2	8	52482	52489	0 %	25 %	25 %	50 %	89057748
124	NC_007801	ACGG	2	8	53499	53506	25 %	0 %	50 %	25 %	89057748
125	NC_007801	GGCT	2	8	54403	54410	0 %	25 %	50 %	25 %	89057748
126	NC_007801	CGAT	2	8	54417	54424	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007801	AATG	2	8	54677	54684	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007801	TTGA	2	8	55339	55346	25 %	50 %	25 %	0 %	89057749
129	NC_007801	TCGA	2	8	55411	55418	25 %	25 %	25 %	25 %	89057749
130	NC_007801	AAGG	2	8	55738	55745	50 %	0 %	50 %	0 %	89057749
131	NC_007801	CAAC	2	8	56138	56145	50 %	0 %	0 %	50 %	89057749
132	NC_007801	TGGG	2	8	56302	56309	0 %	25 %	75 %	0 %	89057749
133	NC_007801	GCAA	2	8	56773	56780	50 %	0 %	25 %	25 %	89057749
134	NC_007801	TGGC	2	8	57398	57405	0 %	25 %	50 %	25 %	89057749
135	NC_007801	CTTG	2	8	57801	57808	0 %	50 %	25 %	25 %	89057749
136	NC_007801	GGTC	2	8	57849	57856	0 %	25 %	50 %	25 %	89057749
137	NC_007801	GACG	2	8	58017	58024	25 %	0 %	50 %	25 %	89057749
138	NC_007801	CGCC	2	8	59293	59300	0 %	0 %	25 %	75 %	89057751
139	NC_007801	TAGT	2	8	60684	60691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007801	GGCA	2	8	60911	60918	25 %	0 %	50 %	25 %	89057752
141	NC_007801	TTTC	2	8	60950	60957	0 %	75 %	0 %	25 %	89057752
142	NC_007801	GGGC	2	8	61101	61108	0 %	0 %	75 %	25 %	89057752
143	NC_007801	GGGT	2	8	61875	61882	0 %	25 %	75 %	0 %	89057752
144	NC_007801	CTCC	2	8	62415	62422	0 %	25 %	0 %	75 %	89057754
145	NC_007801	CCGA	2	8	63509	63516	25 %	0 %	25 %	50 %	89057754
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.