MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007799	TAAAAA	2	12	35614	35625	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007799	AAAAAT	2	12	42207	42218	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007799	ATAAAC	2	12	45079	45090	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_007799	ATGTAA	2	12	66516	66527	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007799	TTTTTA	2	12	73844	73855	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007799	TTTTTA	2	12	79867	79878	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007799	TCTGGT	2	12	85994	86005	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_007799	TTTAAT	2	12	93608	93619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007799	TATTGT	2	12	101471	101482	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007799	TATTGT	2	12	103755	103766	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007799	TATTGT	2	12	106034	106045	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007799	ATTTTT	2	12	111327	111338	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007799	TGTATA	2	12	113027	113038	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007799	ATTGTA	2	12	148643	148654	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007799	TTTATA	2	12	159244	159255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007799	TTATAA	2	12	181485	181496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007799	ATATTT	2	12	189150	189161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007799	AGTATA	2	12	202623	202634	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007799	AATTTA	2	12	219470	219481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007799	TGATAT	2	12	223606	223617	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007799	TAGGAG	2	12	243221	243232	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007799	TATTCT	2	12	243287	243298	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007799	TAAACA	2	12	257268	257279	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007799	TTTAAT	2	12	263268	263279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007799	CAGGAG	2	12	263307	263318	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007799	AATATT	2	12	282312	282323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007799	ATTAAT	2	12	286256	286267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007799	ATATAC	2	12	292974	292985	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_007799	TGAGTA	2	12	305178	305189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007799	TAAGTA	2	12	353788	353799	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007799	TCTGTT	2	12	355896	355907	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007799	ATTTTT	2	12	363399	363410	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007799	TTTATA	2	12	369508	369519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007799	ATTCTA	2	12	409652	409663	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007799	CTGAAA	2	12	451307	451318	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_007799	AAGTGT	2	12	465085	465096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007799	ATTGTG	2	12	470587	470598	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007799	TGAGGT	2	12	478176	478187	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007799	ATTGTT	2	12	480918	480929	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007799	TGATAA	2	12	493660	493671	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007799	TAGGTA	2	12	502855	502866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007799	TTAATA	2	12	504814	504825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007799	ATATCT	2	12	535173	535184	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007799	AGCATT	2	12	550928	550939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007799	AATATA	2	12	553053	553064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007799	TATTTT	2	12	573016	573027	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007799	GCTTTT	2	12	580635	580646	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007799	TACTAT	2	12	588399	588410	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_007799	TTAATT	2	12	590973	590984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007799	TTTTTG	2	12	597421	597432	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007799	AATAGT	2	12	603869	603880	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007799	TATAAA	2	12	604467	604478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007799	TCTTTA	2	12	626066	626077	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_007799	ATAACT	2	12	633776	633787	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007799	ATAGTT	2	12	642909	642920	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007799	TAAAAT	2	12	642997	643008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007799	ATATAA	2	12	674393	674404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007799	ATATTA	2	12	674435	674446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007799	ATTTAA	2	12	691175	691186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007799	ATATTA	2	12	704561	704572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007799	CTTCTA	2	12	710575	710586	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007799	ACAATA	2	12	716185	716196	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007799	ACAATA	2	12	718821	718832	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007799	ACAATA	2	12	721447	721458	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007799	ATCAAA	2	12	725777	725788	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_007799	AATATA	2	12	726578	726589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007799	ATAAAT	2	12	739674	739685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007799	AATTAT	2	12	739719	739730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007799	TACTAA	2	12	743182	743193	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_007799	AGAAAT	2	12	746667	746678	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007799	CATTAG	2	12	753866	753877	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007799	GTACTT	2	12	785650	785661	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007799	GCATAC	2	12	802465	802476	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007799	ACACAA	2	12	805565	805576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007799	TAATAC	2	12	808061	808072	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007799	TAAATA	2	12	867322	867333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007799	ATAATT	2	12	887876	887887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007799	AATATA	2	12	906778	906789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007799	GTTACA	2	12	910707	910718	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_007799	AATCAA	2	12	925153	925164	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_007799	TATTTT	2	12	931671	931682	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007799	ATAAAA	2	12	942067	942078	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007799	ACTAAC	2	12	953234	953245	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007799	ATACTT	2	12	956653	956664	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_007799	TACTTA	2	12	956747	956758	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007799	ATATTA	2	12	970181	970192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007799	ATATTA	2	12	970324	970335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007799	ACTAAA	2	12	983155	983166	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_007799	ATTTAC	2	12	1020753	1020764	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_007799	TTAAAT	2	12	1033795	1033806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007799	TTAAAC	2	12	1036153	1036164	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_007799	TAGCAA	2	12	1040175	1040186	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_007799	GCCTAA	2	12	1075696	1075707	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007799	TTGTAT	2	12	1087215	1087226	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007799	AAACAC	2	12	1138215	1138226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007799	CATATT	2	12	1168172	1168183	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.