MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Neorickettsia sennetsu str. Miyayama chromosome

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007798	TATTT	2	10	7897	7906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007798	TACTT	2	10	12374	12383	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007798	CGCTG	2	10	15109	15118	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_007798	TGTCG	2	10	21533	21542	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007798	TCCTC	2	10	23743	23752	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_007798	AATAA	2	10	27319	27328	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007798	GCCCA	2	10	27608	27617	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_007798	TAGTT	2	10	31268	31277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007798	TCGTG	2	10	37292	37301	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007798	TATGG	2	10	37434	37443	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007798	GGTGG	2	10	37693	37702	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007798	AATCT	2	10	43871	43880	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007798	TTTGA	2	10	55084	55093	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007798	CTAAC	2	10	59290	59299	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_007798	AGAAA	2	10	60890	60899	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007798	TTGAA	2	10	62850	62859	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007798	TTAAT	2	10	63915	63924	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007798	TTTCC	2	10	66367	66376	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_007798	GATTG	2	10	66615	66624	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007798	GTATA	2	10	71185	71194	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007798	GCATT	2	10	71220	71229	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007798	CTTTT	2	10	71911	71920	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007798	GTAGC	2	10	76707	76716	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007798	TTTTC	2	10	79100	79109	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007798	GTGTT	2	10	85923	85932	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007798	TTGGT	2	10	91818	91827	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007798	ATCCT	2	10	94623	94632	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_007798	TATCC	2	10	119100	119109	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_007798	AGTCG	2	10	119793	119802	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_007798	TAGAT	2	10	123144	123153	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007798	TAAAG	2	10	127324	127333	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007798	TTAGT	2	10	131507	131516	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007798	TTTAG	2	10	145251	145260	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007798	GTGGG	2	10	167847	167856	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007798	CTCTT	2	10	180497	180506	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_007798	TTACT	2	10	189389	189398	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007798	TAGAG	2	10	192399	192408	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007798	ATTTG	2	10	199153	199162	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007798	CGTGA	2	10	214374	214383	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_007798	GAAAT	2	10	263603	263612	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007798	GTTTG	2	10	263883	263892	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007798	TACTT	2	10	273353	273362	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_007798	CTTTC	2	10	276412	276421	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_007798	TGAGT	2	10	282159	282168	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007798	GCTTA	2	10	341040	341049	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007798	AGTTG	2	10	359124	359133	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007798	AGTTT	2	10	381816	381825	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007798	TGATG	2	10	385962	385971	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007798	AAGCA	2	10	392279	392288	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007798	TGAGA	2	10	402168	402177	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007798	AAATA	2	10	419320	419329	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007798	TTTTC	2	10	431414	431423	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_007798	AATAT	2	10	440745	440754	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007798	AAACT	2	10	473586	473595	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_007798	ATTTC	2	10	478703	478712	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007798	TTCAA	2	10	487017	487026	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007798	GAGTA	2	10	508020	508029	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007798	AAATA	2	10	510396	510405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007798	TGCAT	2	10	510702	510711	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_007798	TAAAG	2	10	518791	518800	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007798	AGACC	2	10	519017	519026	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_007798	TTTCT	2	10	536188	536197	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007798	ACACA	2	10	569817	569826	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_007798	GTAAA	2	10	573671	573680	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007798	AAATC	2	10	575108	575117	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_007798	CCACA	2	10	583985	583994	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_007798	AAAAC	2	10	609598	609607	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_007798	TTCTA	2	10	614828	614837	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_007798	GCAAA	2	10	616490	616499	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_007798	GTAAA	2	10	621009	621018	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007798	CACGA	2	10	629998	630007	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_007798	AGCAT	2	10	630932	630941	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_007798	ATGAT	2	10	631073	631082	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007798	CTGTT	2	10	665816	665825	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_007798	TAAGT	2	10	671871	671880	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007798	AGGAA	2	10	702858	702867	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007798	GACAA	2	10	704219	704228	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007798	TTCAA	2	10	714613	714622	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007798	CAAGA	2	10	720063	720072	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_007798	TTGCT	2	10	733364	733373	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_007798	ACCAC	2	10	737090	737099	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
82	NC_007798	TTTTA	2	10	739054	739063	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007798	AAGAA	2	10	741639	741648	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007798	ACTCA	2	10	756022	756031	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_007798	ACACC	2	10	773674	773683	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_007798	CTTAT	2	10	773937	773946	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_007798	TGGGT	2	10	793555	793564	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007798	GGTTT	2	10	803799	803808	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007798	AGAAA	2	10	806571	806580	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007798	AGAAC	2	10	817497	817506	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_007798	GAAAA	2	10	818214	818223	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007798	AGAGG	2	10	823957	823966	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007798	GATTG	2	10	827731	827740	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007798	GATCT	2	10	847242	847251	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007798	ATTTT	2	10	851590	851599	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.