MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Neorickettsia sennetsu str. Miyayama chromosome

Total Repeats: 2138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007798	CTTT	2	8	430	437	0 %	75 %	0 %	25 %	88608392
2	NC_007798	TATG	2	8	635	642	25 %	50 %	25 %	0 %	88608392
3	NC_007798	AGTT	2	8	1453	1460	25 %	50 %	25 %	0 %	88608502
4	NC_007798	CTTT	2	8	2940	2947	0 %	75 %	0 %	25 %	88608550
5	NC_007798	GTTC	2	8	2980	2987	0 %	50 %	25 %	25 %	88608550
6	NC_007798	GGGA	2	8	3662	3669	25 %	0 %	75 %	0 %	88608480
7	NC_007798	TGGA	2	8	3869	3876	25 %	25 %	50 %	0 %	88608480
8	NC_007798	ATAG	2	8	3882	3889	50 %	25 %	25 %	0 %	88608480
9	NC_007798	AGAT	2	8	4273	4280	50 %	25 %	25 %	0 %	88608480
10	NC_007798	ATTT	2	8	4681	4688	25 %	75 %	0 %	0 %	88608480
11	NC_007798	TTGA	2	8	5880	5887	25 %	50 %	25 %	0 %	88608833
12	NC_007798	AGGG	2	8	7393	7400	25 %	0 %	75 %	0 %	88608802
13	NC_007798	GAAA	2	8	7409	7416	75 %	0 %	25 %	0 %	88608802
14	NC_007798	AGTA	2	8	7452	7459	50 %	25 %	25 %	0 %	88608802
15	NC_007798	CAAT	2	8	7738	7745	50 %	25 %	0 %	25 %	88608802
16	NC_007798	ATGT	2	8	8004	8011	25 %	50 %	25 %	0 %	88608655
17	NC_007798	CAGC	2	8	8185	8192	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007798	TTGA	2	8	8586	8593	25 %	50 %	25 %	0 %	88608412
19	NC_007798	GTAA	2	8	8738	8745	50 %	25 %	25 %	0 %	88608412
20	NC_007798	TGTT	2	8	9179	9186	0 %	75 %	25 %	0 %	88608358
21	NC_007798	TGGT	2	8	9625	9632	0 %	50 %	50 %	0 %	88608862
22	NC_007798	TCCG	2	8	9664	9671	0 %	25 %	25 %	50 %	88608862
23	NC_007798	TGTT	2	8	10412	10419	0 %	75 %	25 %	0 %	88608689
24	NC_007798	AGGA	2	8	10838	10845	50 %	0 %	50 %	0 %	88608767
25	NC_007798	CTTT	2	8	11388	11395	0 %	75 %	0 %	25 %	88608767
26	NC_007798	ATTC	2	8	11429	11436	25 %	50 %	0 %	25 %	88608767
27	NC_007798	TCCT	2	8	11868	11875	0 %	50 %	0 %	50 %	88608767
28	NC_007798	TTTG	3	12	11948	11959	0 %	75 %	25 %	0 %	88608767
29	NC_007798	ATTT	2	8	12013	12020	25 %	75 %	0 %	0 %	88608767
30	NC_007798	TGCT	2	8	12204	12211	0 %	50 %	25 %	25 %	88608767
31	NC_007798	TTTC	2	8	12283	12290	0 %	75 %	0 %	25 %	88608767
32	NC_007798	TGGA	2	8	12351	12358	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007798	TTGC	2	8	12615	12622	0 %	50 %	25 %	25 %	88608294
34	NC_007798	TGGG	2	8	13365	13372	0 %	25 %	75 %	0 %	88608023
35	NC_007798	TTTC	2	8	13735	13742	0 %	75 %	0 %	25 %	88608023
36	NC_007798	GGTA	2	8	14105	14112	25 %	25 %	50 %	0 %	88608023
37	NC_007798	TTCT	2	8	14594	14601	0 %	75 %	0 %	25 %	88608674
38	NC_007798	AACC	2	8	14765	14772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007798	GACC	2	8	14827	14834	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007798	TCTT	2	8	16353	16360	0 %	75 %	0 %	25 %	88608598
41	NC_007798	GCCT	2	8	16908	16915	0 %	25 %	25 %	50 %	88608598
42	NC_007798	CTCC	2	8	16984	16991	0 %	25 %	0 %	75 %	88608598
43	NC_007798	CGCC	2	8	17065	17072	0 %	0 %	25 %	75 %	88608598
44	NC_007798	TGTT	2	8	17167	17174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007798	CTGG	2	8	17336	17343	0 %	25 %	50 %	25 %	88608581
46	NC_007798	TGGT	2	8	17891	17898	0 %	50 %	50 %	0 %	88608581
47	NC_007798	TAAG	2	8	18048	18055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007798	TTCT	2	8	18595	18602	0 %	75 %	0 %	25 %	88608828
49	NC_007798	TGCT	2	8	20055	20062	0 %	50 %	25 %	25 %	88608147
50	NC_007798	ATGT	2	8	20538	20545	25 %	50 %	25 %	0 %	88608147
51	NC_007798	GGGT	2	8	21090	21097	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007798	TTGT	2	8	21184	21191	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007798	GTCT	2	8	21729	21736	0 %	50 %	25 %	25 %	88608498
54	NC_007798	GCCT	2	8	22613	22620	0 %	25 %	25 %	50 %	88608045
55	NC_007798	AGCA	2	8	23039	23046	50 %	0 %	25 %	25 %	88608045
56	NC_007798	TTTC	2	8	23056	23063	0 %	75 %	0 %	25 %	88608045
57	NC_007798	TCAT	2	8	23480	23487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007798	AGGA	2	8	24047	24054	50 %	0 %	50 %	0 %	88608746
59	NC_007798	CTGA	2	8	24403	24410	25 %	25 %	25 %	25 %	88608187
60	NC_007798	TGCA	2	8	24467	24474	25 %	25 %	25 %	25 %	88608187
61	NC_007798	GAAA	2	8	24666	24673	75 %	0 %	25 %	0 %	88608187
62	NC_007798	AAAC	2	8	25191	25198	75 %	0 %	0 %	25 %	88607996
63	NC_007798	AAAG	2	8	25421	25428	75 %	0 %	25 %	0 %	88607996
64	NC_007798	GCTC	2	8	26214	26221	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007798	GAGT	2	8	27146	27153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007798	CAAA	2	8	27238	27245	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007798	CATT	2	8	27680	27687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007798	AGAT	2	8	27727	27734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007798	AATT	2	8	29172	29179	50 %	50 %	0 %	0 %	88608219
70	NC_007798	GAAA	2	8	29531	29538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007798	CTTT	2	8	29878	29885	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007798	GTAG	2	8	30278	30285	25 %	25 %	50 %	0 %	88608206
73	NC_007798	CAAT	2	8	30910	30917	50 %	25 %	0 %	25 %	88608739
74	NC_007798	AGGT	2	8	32778	32785	25 %	25 %	50 %	0 %	88608009
75	NC_007798	GTAT	2	8	32823	32830	25 %	50 %	25 %	0 %	88608009
76	NC_007798	TATG	2	8	33294	33301	25 %	50 %	25 %	0 %	88608009
77	NC_007798	TTCA	2	8	33426	33433	25 %	50 %	0 %	25 %	88608009
78	NC_007798	ATCT	2	8	35120	35127	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007798	CACC	2	8	35161	35168	25 %	0 %	0 %	75 %	88608780
80	NC_007798	AGTA	2	8	35501	35508	50 %	25 %	25 %	0 %	88608798
81	NC_007798	CCAT	2	8	35619	35626	25 %	25 %	0 %	50 %	88608798
82	NC_007798	GGTA	2	8	35991	35998	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007798	CGGT	2	8	36188	36195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007798	AGTA	2	8	36213	36220	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007798	GAAC	2	8	36295	36302	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_007798	AGGG	2	8	37236	37243	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007798	GCTA	2	8	37477	37484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_007798	TTTA	2	8	37764	37771	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007798	CTTT	2	8	37809	37816	0 %	75 %	0 %	25 %	88608119
90	NC_007798	TGCT	2	8	37961	37968	0 %	50 %	25 %	25 %	88608119
91	NC_007798	TGGC	2	8	38026	38033	0 %	25 %	50 %	25 %	88608119
92	NC_007798	TTTC	2	8	38045	38052	0 %	75 %	0 %	25 %	88608119
93	NC_007798	GTAA	2	8	38139	38146	50 %	25 %	25 %	0 %	88608119
94	NC_007798	CTTA	2	8	38196	38203	25 %	50 %	0 %	25 %	88608119
95	NC_007798	TTAT	2	8	38267	38274	25 %	75 %	0 %	0 %	88608060
96	NC_007798	ACTG	2	8	38570	38577	25 %	25 %	25 %	25 %	88608193
97	NC_007798	GTGA	2	8	38844	38851	25 %	25 %	50 %	0 %	88608193
98	NC_007798	AGAA	2	8	39437	39444	75 %	0 %	25 %	0 %	88608193
99	NC_007798	TTCG	2	8	39852	39859	0 %	50 %	25 %	25 %	88608193
100	NC_007798	CTTA	2	8	39917	39924	25 %	50 %	0 %	25 %	88608193
101	NC_007798	TTTA	2	8	40063	40070	25 %	75 %	0 %	0 %	88608193
102	NC_007798	AGAA	2	8	40241	40248	75 %	0 %	25 %	0 %	88608193
103	NC_007798	AAAT	2	8	40573	40580	75 %	25 %	0 %	0 %	88608506
104	NC_007798	AAGA	2	8	40593	40600	75 %	0 %	25 %	0 %	88608506
105	NC_007798	AACA	2	8	40866	40873	75 %	0 %	0 %	25 %	88608506
106	NC_007798	AACA	3	12	41103	41114	75 %	0 %	0 %	25 %	88608506
107	NC_007798	GTGG	2	8	42411	42418	0 %	25 %	75 %	0 %	88608626
108	NC_007798	TAAG	2	8	42426	42433	50 %	25 %	25 %	0 %	88608626
109	NC_007798	CTTT	2	8	42598	42605	0 %	75 %	0 %	25 %	88608626
110	NC_007798	TGTT	2	8	42613	42620	0 %	75 %	25 %	0 %	88608626
111	NC_007798	ATTC	2	8	43370	43377	25 %	50 %	0 %	25 %	88608626
112	NC_007798	AGCA	2	8	44001	44008	50 %	0 %	25 %	25 %	88608576
113	NC_007798	TGGC	2	8	44282	44289	0 %	25 %	50 %	25 %	88608010
114	NC_007798	TACA	2	8	44746	44753	50 %	25 %	0 %	25 %	88608010
115	NC_007798	TGAA	2	8	44951	44958	50 %	25 %	25 %	0 %	88608010
116	NC_007798	AAAT	2	8	44960	44967	75 %	25 %	0 %	0 %	88608010
117	NC_007798	AAAC	2	8	46854	46861	75 %	0 %	0 %	25 %	88608314
118	NC_007798	TCTT	2	8	46947	46954	0 %	75 %	0 %	25 %	88608314
119	NC_007798	GGTG	2	8	47009	47016	0 %	25 %	75 %	0 %	88608314
120	NC_007798	GCCT	2	8	47375	47382	0 %	25 %	25 %	50 %	88608109
121	NC_007798	TTAT	2	8	47557	47564	25 %	75 %	0 %	0 %	88608109
122	NC_007798	GCGT	2	8	47569	47576	0 %	25 %	50 %	25 %	88608109
123	NC_007798	ATTG	2	8	48307	48314	25 %	50 %	25 %	0 %	161511033
124	NC_007798	TTCA	2	8	48480	48487	25 %	50 %	0 %	25 %	161511033
125	NC_007798	TTCA	2	8	48774	48781	25 %	50 %	0 %	25 %	161511033
126	NC_007798	TGGA	2	8	49035	49042	25 %	25 %	50 %	0 %	161511033
127	NC_007798	AAAG	2	8	49500	49507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007798	CTAC	2	8	49877	49884	25 %	25 %	0 %	50 %	88608486
129	NC_007798	CCAG	2	8	50405	50412	25 %	0 %	25 %	50 %	88608486
130	NC_007798	TTCT	2	8	51068	51075	0 %	75 %	0 %	25 %	88608486
131	NC_007798	TTAT	2	8	52160	52167	25 %	75 %	0 %	0 %	88608422
132	NC_007798	ACTT	2	8	52477	52484	25 %	50 %	0 %	25 %	88608580
133	NC_007798	TACA	2	8	53238	53245	50 %	25 %	0 %	25 %	88608580
134	NC_007798	CACT	2	8	53984	53991	25 %	25 %	0 %	50 %	88607969
135	NC_007798	TAAC	2	8	54257	54264	50 %	25 %	0 %	25 %	88607969
136	NC_007798	AAGA	2	8	55705	55712	75 %	0 %	25 %	0 %	88608594
137	NC_007798	AGTT	2	8	56110	56117	25 %	50 %	25 %	0 %	88608594
138	NC_007798	TCGA	2	8	56392	56399	25 %	25 %	25 %	25 %	88608332
139	NC_007798	TAGA	2	8	57306	57313	50 %	25 %	25 %	0 %	88608332
140	NC_007798	GGTT	2	8	57319	57326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007798	CAAT	2	8	57581	57588	50 %	25 %	0 %	25 %	88608292
142	NC_007798	CTAT	2	8	58126	58133	25 %	50 %	0 %	25 %	88608292
143	NC_007798	CTAT	2	8	58460	58467	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_007798	CTTA	2	8	58499	58506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007798	TTTA	2	8	58513	58520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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