MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Neorickettsia sennetsu str. Miyayama chromosome

Total Repeats: 331

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007798	CAGC	2	8	8185	8192	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007798	TGGA	2	8	12351	12358	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007798	AACC	2	8	14765	14772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007798	GACC	2	8	14827	14834	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007798	TGTT	2	8	17167	17174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007798	TAAG	2	8	18048	18055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007798	GGGT	2	8	21090	21097	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007798	TTGT	2	8	21184	21191	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007798	TCAT	2	8	23480	23487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_007798	GCTC	2	8	26214	26221	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007798	GAGT	2	8	27146	27153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007798	CAAA	2	8	27238	27245	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007798	CATT	2	8	27680	27687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007798	AGAT	2	8	27727	27734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007798	GAAA	2	8	29531	29538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007798	CTTT	2	8	29878	29885	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007798	ATCT	2	8	35120	35127	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007798	GGTA	2	8	35991	35998	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007798	CGGT	2	8	36188	36195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007798	AGTA	2	8	36213	36220	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007798	GAAC	2	8	36295	36302	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007798	AGGG	2	8	37236	37243	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007798	GCTA	2	8	37477	37484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007798	TTTA	2	8	37764	37771	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007798	AAAG	2	8	49500	49507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007798	GGTT	2	8	57319	57326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007798	CTAT	2	8	58460	58467	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007798	CTTA	2	8	58499	58506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007798	TTTA	2	8	58513	58520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007798	CATC	2	8	59214	59221	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007798	CCAA	2	8	60945	60952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007798	ATAA	2	8	61147	61154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007798	GGTA	2	8	61171	61178	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007798	CTTC	2	8	63077	63084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007798	GTTT	2	8	64445	64452	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007798	GTAC	2	8	64497	64504	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007798	GTTT	2	8	64724	64731	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007798	TCCT	2	8	66600	66607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007798	TAGG	2	8	66890	66897	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007798	GGTT	2	8	66961	66968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007798	ACTA	2	8	68136	68143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_007798	TGAG	2	8	68239	68246	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007798	TGTA	2	8	68352	68359	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007798	TGCT	2	8	69533	69540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007798	TAAT	2	8	69821	69828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007798	ACGA	2	8	70088	70095	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007798	ATAG	2	8	71234	71241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007798	TAAG	2	8	71265	71272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007798	TAAT	2	8	71335	71342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007798	TTTA	2	8	71384	71391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007798	TTTG	3	12	71404	71415	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007798	TATT	2	8	74322	74329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007798	TTTA	2	8	76042	76049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007798	GTTT	2	8	80392	80399	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007798	TCGA	2	8	84203	84210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007798	GGTT	2	8	84617	84624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007798	AATT	2	8	84742	84749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007798	AATG	2	8	85985	85992	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007798	TAAC	2	8	86102	86109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007798	ATAA	2	8	88361	88368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007798	TATC	2	8	89326	89333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007798	TCTA	2	8	89479	89486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007798	ATAA	2	8	90653	90660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007798	TGGC	2	8	91549	91556	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007798	TTAG	2	8	91994	92001	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007798	TCTG	2	8	97362	97369	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007798	ATTG	2	8	97490	97497	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007798	TAAA	2	8	104542	104549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007798	GTTT	2	8	106716	106723	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007798	TACT	2	8	107774	107781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007798	ATTG	2	8	113495	113502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007798	CATA	2	8	116916	116923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007798	GCTG	2	8	120029	120036	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007798	TGAG	2	8	120522	120529	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007798	TCTT	2	8	124531	124538	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007798	GCAG	2	8	127359	127366	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007798	TAAT	2	8	131582	131589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007798	AAAG	2	8	139549	139556	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007798	TCCT	2	8	140901	140908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007798	GTAT	2	8	143641	143648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007798	GAAA	2	8	143670	143677	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007798	CATT	2	8	145232	145239	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_007798	TTTA	2	8	148034	148041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007798	GTTT	2	8	150879	150886	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007798	ACTT	2	8	159728	159735	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_007798	AAGA	2	8	161389	161396	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007798	CATT	2	8	161435	161442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_007798	GTTT	2	8	161457	161464	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007798	TTAA	2	8	167712	167719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007798	AGTA	2	8	170237	170244	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007798	ATTT	2	8	170368	170375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007798	TTAG	2	8	173141	173148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007798	GGAA	2	8	181545	181552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007798	TTGC	2	8	185230	185237	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007798	TTGA	2	8	189380	189387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007798	ATTT	2	8	189425	189432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007798	GTTT	2	8	189455	189462	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007798	ATAA	2	8	193608	193615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007798	AAAG	2	8	196264	196271	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007798	TAAG	2	8	199074	199081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007798	TTTG	2	8	205851	205858	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007798	TCCA	2	8	207459	207466	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007798	CAGA	2	8	214398	214405	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007798	TCCT	2	8	223011	223018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007798	GGGA	2	8	223897	223904	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007798	TAAA	2	8	241430	241437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007798	GGTA	2	8	247912	247919	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007798	TTCT	2	8	248039	248046	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007798	ATTT	2	8	262536	262543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007798	TTTG	2	8	267950	267957	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007798	TTGT	2	8	273690	273697	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007798	ATCT	2	8	273723	273730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_007798	TTGT	2	8	273796	273803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007798	AAAT	2	8	276435	276442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007798	AGGT	2	8	279812	279819	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007798	TGAT	2	8	282755	282762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007798	TTGC	2	8	282788	282795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007798	CTAT	2	8	283070	283077	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007798	CAAG	2	8	284924	284931	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007798	ATTG	2	8	289978	289985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007798	GAAT	2	8	290692	290699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007798	AGAA	2	8	292949	292956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007798	TATG	2	8	305767	305774	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007798	ATAC	2	8	306022	306029	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007798	AAAC	2	8	319588	319595	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_007798	GGTG	2	8	320759	320766	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007798	TTTA	2	8	322023	322030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007798	TCGT	2	8	322125	322132	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007798	TTAA	2	8	326050	326057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007798	TCGG	2	8	326083	326090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_007798	TCTT	2	8	334343	334350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007798	AAGG	2	8	336100	336107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007798	CTTT	2	8	339090	339097	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007798	AGCA	2	8	340033	340040	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_007798	AAGT	2	8	344955	344962	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007798	AAGA	2	8	351764	351771	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007798	TTTG	2	8	361434	361441	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007798	TAAG	2	8	362765	362772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007798	TTGA	2	8	362811	362818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007798	CGAT	2	8	368474	368481	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007798	AGAT	2	8	374188	374195	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007798	AATG	2	8	375170	375177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007798	TAGT	2	8	376547	376554	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007798	GTTT	2	8	377460	377467	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007798	TTTG	2	8	378298	378305	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007798	AGTT	2	8	382991	382998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007798	CTTA	2	8	389994	390001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_007798	AACT	2	8	391561	391568	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_007798	GTAT	2	8	391598	391605	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007798	TTAT	2	8	391630	391637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007798	CTAT	2	8	396126	396133	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_007798	ATTT	2	8	397322	397329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007798	AACT	2	8	397361	397368	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.