MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Neorickettsia sennetsu str. Miyayama chromosome

Total Repeats: 10743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007798	GAA	2	6	106	111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608392
2	NC_007798	ATA	2	6	142	147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88608392
3	NC_007798	TAG	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608392
4	NC_007798	AGA	2	6	318	323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608392
5	NC_007798	CGA	2	6	348	353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88608392
6	NC_007798	AGA	2	6	462	467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608392
7	NC_007798	GAA	2	6	899	904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608502
8	NC_007798	TAC	2	6	924	929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608502
9	NC_007798	TCT	2	6	930	935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608502
10	NC_007798	AAC	2	6	998	1003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88608502
11	NC_007798	CCA	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88608502
12	NC_007798	AGG	3	9	1148	1156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88608502
13	NC_007798	CAT	2	6	1208	1213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608502
14	NC_007798	GAC	2	6	1214	1219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88608502
15	NC_007798	TGT	2	6	1343	1348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608502
16	NC_007798	CTT	2	6	1668	1673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608502
17	NC_007798	TCT	2	6	1811	1816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608502
18	NC_007798	GTT	2	6	1846	1851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608502
19	NC_007798	GAT	2	6	1959	1964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608502
20	NC_007798	AGG	2	6	1984	1989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88608502
21	NC_007798	TAG	2	6	2084	2089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608502
22	NC_007798	GCG	2	6	2241	2246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	88608550
23	NC_007798	ACG	2	6	2277	2282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88608550
24	NC_007798	CCT	2	6	2293	2298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88608550
25	NC_007798	CGT	2	6	2371	2376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608550
26	NC_007798	TTA	2	6	2509	2514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88608550
27	NC_007798	GTT	2	6	2649	2654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608550
28	NC_007798	GTT	2	6	2717	2722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608550
29	NC_007798	AAT	2	6	2782	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88608550
30	NC_007798	CTG	2	6	2830	2835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608550
31	NC_007798	TAT	2	6	2858	2863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88608550
32	NC_007798	TCT	2	6	2931	2936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608550
33	NC_007798	TCT	2	6	3144	3149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608550
34	NC_007798	ACT	2	6	3168	3173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608550
35	NC_007798	GAA	2	6	3201	3206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608550
36	NC_007798	TTG	2	6	3258	3263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608550
37	NC_007798	TGC	2	6	3478	3483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608550
38	NC_007798	AGT	2	6	3531	3536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608550
39	NC_007798	GTA	2	6	3651	3656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608480
40	NC_007798	GAA	2	6	3712	3717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608480
41	NC_007798	GAA	2	6	4153	4158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608480
42	NC_007798	AAG	2	6	4293	4298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608480
43	NC_007798	TCA	2	6	4314	4319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608480
44	NC_007798	TTG	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608480
45	NC_007798	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608480
46	NC_007798	TAA	2	6	4475	4480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88608480
47	NC_007798	ATT	2	6	4755	4760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88608480
48	NC_007798	AAC	2	6	4869	4874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88608480
49	NC_007798	GAC	2	6	4876	4881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88608480
50	NC_007798	ACT	2	6	4929	4934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608833
51	NC_007798	TGA	2	6	4999	5004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608833
52	NC_007798	ACA	2	6	5060	5065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88608833
53	NC_007798	GTA	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608833
54	NC_007798	TGG	2	6	5362	5367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88608833
55	NC_007798	GAT	2	6	5471	5476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608833
56	NC_007798	TGG	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88608833
57	NC_007798	GGA	2	6	5658	5663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88608833
58	NC_007798	CTG	2	6	5718	5723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608833
59	NC_007798	TCC	2	6	5840	5845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88608833
60	NC_007798	GAA	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608833
61	NC_007798	AAC	2	6	5866	5871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88608833
62	NC_007798	CCT	2	6	5990	5995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88608671
63	NC_007798	TCT	2	6	6034	6039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608671
64	NC_007798	CAA	2	6	6048	6053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88608671
65	NC_007798	GCA	2	6	6054	6059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88608671
66	NC_007798	ATC	2	6	6111	6116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608671
67	NC_007798	GAC	3	9	6129	6137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88608671
68	NC_007798	TCA	2	6	6138	6143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608671
69	NC_007798	GTT	2	6	6215	6220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608671
70	NC_007798	ATA	2	6	6279	6284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88608671
71	NC_007798	ATC	2	6	6450	6455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608671
72	NC_007798	AAG	2	6	6644	6649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608802
73	NC_007798	TAG	2	6	6793	6798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608802
74	NC_007798	GCC	2	6	6804	6809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	88608802
75	NC_007798	TCT	2	6	6810	6815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608802
76	NC_007798	GAA	2	6	6851	6856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608802
77	NC_007798	CTT	2	6	6975	6980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608802
78	NC_007798	GGC	2	6	7196	7201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	88608802
79	NC_007798	ACA	2	6	7525	7530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88608802
80	NC_007798	GAA	2	6	7569	7574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608802
81	NC_007798	AAG	2	6	7689	7694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608802
82	NC_007798	TAG	2	6	7795	7800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608802
83	NC_007798	TAA	2	6	7806	7811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88608802
84	NC_007798	TGT	2	6	7888	7893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007798	CCA	2	6	7925	7930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88608655
86	NC_007798	GCA	2	6	8203	8208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007798	TAG	2	6	8230	8235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608412
88	NC_007798	TTC	2	6	8236	8241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608412
89	NC_007798	GAA	2	6	8313	8318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608412
90	NC_007798	AAG	2	6	8350	8355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608412
91	NC_007798	AAG	2	6	8569	8574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608412
92	NC_007798	ACC	2	6	8818	8823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007798	CTT	2	6	8877	8882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007798	TCT	2	6	9014	9019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608358
95	NC_007798	GTT	2	6	9031	9036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608358
96	NC_007798	TGT	2	6	9048	9053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608358
97	NC_007798	CTT	2	6	9089	9094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608358
98	NC_007798	CTT	2	6	9139	9144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608358
99	NC_007798	ATG	2	6	9190	9195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608358
100	NC_007798	GAT	2	6	9205	9210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608358
101	NC_007798	ATG	2	6	9299	9304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608358
102	NC_007798	AGT	2	6	9393	9398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608358
103	NC_007798	GGT	2	6	9465	9470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88608358
104	NC_007798	TCT	2	6	9490	9495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608358
105	NC_007798	GTA	2	6	9858	9863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608443
106	NC_007798	GTA	2	6	9916	9921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608443
107	NC_007798	CTT	2	6	9922	9927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608443
108	NC_007798	AGG	2	6	9938	9943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88608443
109	NC_007798	GTT	2	6	10008	10013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608443
110	NC_007798	TAA	2	6	10055	10060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88608443
111	NC_007798	GTT	2	6	10110	10115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007798	TGG	2	6	10211	10216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007798	GTG	2	6	10291	10296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88608689
114	NC_007798	TTG	2	6	10403	10408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608689
115	NC_007798	TGC	2	6	10489	10494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608767
116	NC_007798	TCT	2	6	10499	10504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608767
117	NC_007798	GTT	2	6	10634	10639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608767
118	NC_007798	GAA	2	6	10684	10689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608767
119	NC_007798	CTT	2	6	10817	10822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608767
120	NC_007798	ATT	2	6	10961	10966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88608767
121	NC_007798	GCA	2	6	11135	11140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88608767
122	NC_007798	CTG	2	6	11151	11156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608767
123	NC_007798	TCT	2	6	11164	11169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608767
124	NC_007798	GAT	2	6	11276	11281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608767
125	NC_007798	TGC	2	6	11332	11337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608767
126	NC_007798	ACT	2	6	11401	11406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608767
127	NC_007798	TGG	2	6	11440	11445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88608767
128	NC_007798	TCT	2	6	11487	11492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608767
129	NC_007798	ATG	2	6	11504	11509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608767
130	NC_007798	TAA	2	6	11571	11576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88608767
131	NC_007798	TCC	2	6	11579	11584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88608767
132	NC_007798	GCT	2	6	11656	11661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608767
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256	NC_007798	TAC	2	6	22536	22541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608045
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